<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX901897.6	1	AAGCTTGAACTTTGCACCTTAGCAACCTGCGAAACTTGACGCATTTGCGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	138290	AAGCTTGAACTTTGCACCTTAGCAACCTGCGAAACTTGACGCATTTGCGT	138339

BX901897.6	51	ACGTAGGAATGGAAGTCTATGGGGAGACAAGTCCAGTGTGACCGCAGCTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	138340	ACGTAGGAATGGAAGTCTATGGGGAGACAAGTCCAGTGTGACCGCAGCTT	138389

BX901897.6	101	TACCTGTAGGTTTTAAACAAGCCTGAAGGACTCAATTAGTTTGATCAGGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	138390	TACCTGTAGGTTTTAAACAAGCCTGAAGGACTCAATTAGTTTGATCAGGT	138439

BX901897.6	151	GTGTTTAATTAGGGTTGGAACAGTTTAAAATCCCTGTCATAAGAAAAAAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	138440	GTGTTTAATTAGGGTTGGAACAGTTTAAAATCCCTGTCATAAGAAAAAAA	138489

BX901897.6	201	CATCCACTCCTGCAGGTGGAGACATTTCTGCAGAAAGTTGCTGGGTTTCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	138490	CATCCACTCCTGCAGGTGGAGACATTTCTGCAGAAAGTTGCTGGGTTTCA	138539

BX901897.6	251	GAATCAACATGTAACCTGGCACAGGTAAAGAGCTTTTCTAGCCTATTCTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	138540	GAATCAACATGTAACCTGGCACAGGTAAAGAGCTTTTCTAGCCTATTCTC	138589

BX901897.6	301	AATTCACAGTGTTTTAGCATAAAAAAATAATCGAGAGAACCAGATTTTTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	138590	AATTCACAGTGTTTTAGCATAAAAAAATAATCGAGAGAACCAGATTTTTG	138639

BX901897.6	351	ATTGATTTTCTGATGGTATCTTCATCAGTGGTCCAGTTCTGCAGACAGTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	138640	ATTGATTTTCTGATGGTATCTTCATCAGTGGTCCAGTTCTGCAGACAGTG	138689

BX901897.6	401	GTTCAGTTCCAAACAGTGCAAGCGCTCTCCTGGCTGGGAAGGGTGGAGTC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	138690	GTTCAGTTCCAAACAGTGCAAGCGCTCTCCTGGCTGGGAAGGGTGGAGTC	138739

BX901897.6	451	TTTGTTACGGGAGGCTGGGTTAAACCCACTGCCAAAGAAAGGATTATTTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	138740	TTTGTTACGGGAGGCTGGGTTAAACCCACTGCCAAAGAAAGGATTATTTG	138789

BX901897.6	501	TGGGTGGAGTTCGAGTGAAGAATATTACAGAAGGAGGTGAGTGTCAATCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	138790	TGGGTGGAGTTCGAGTGAAGAATATTACAGAAGGAGGTGAGTGTCAATCA	138839

BX901897.6	551	TATCTGTTTTATATATCTATTCCATACAGTTTTGAGAAAAAAACAAATAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	138840	TATCTGTTTTATATATCTATTCCATACAGTTTTGAGAAAAAAACAAATAA	138889

BX901897.6	601	AACTTTGGGTGTATCTATATTTGTAAAATACACATCTATACATATTTTTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	138890	AACTTTGGGTGTATCTATATTTGTAAAATACACATCTATACATATTTTTT	138939

BX901897.6	651	GGCAATATTATATTTATTGTTTTATCTAGATCTGTTCAGTTTTCTGCAAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	138940	GGCAATATTATATTTATTGTTTTATCTAGATCTGTTCAGTTTTCTGCAAA	138989

BX901897.6	701	TAAATGCTTCCTTTACATGCCTTGTATCCAGAGAATCAATAATAACTTTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	138990	TAAATGCTTCCTTTACATGCCTTGTATCCAGAGAATCAATAATAACTTTG	139039

BX901897.6	751	AAACAGTCTCTTTTTTTCCTAGAACTGAATATGGAGCATATAAAATATTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	139040	AAACAGTCTCTTTTTTTCCTAGAACTGAATATGGAGCATATAAAATATTG	139089

BX901897.6	801	TTAACTTAAAGGTGCTGTATGTAAATTTTTGACTCTTCTAAAGGATAAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	139090	TTAACTTAAAGGTGCTGTATGTAAATTTTTGACTCTTCTAAAGGATAAAA	139139

BX901897.6	851	TTATGTGTTTGCAGATATTTAAGAAACATGCTAAGTGAACATATTAGTTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	139140	TTATGTGTTTGCAGATATTTAAGAAACATGCTAAGTGAACATATTAGTTT	139189

BX901897.6	901	ATCTGAAAAACAATGCTGAAGTCAGATATTCTGCTTTGAAAATGTGTTTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	139190	ATCTGAAAAACAATGCTGAAGTCAGATATTCTGCTTTGAAAATGTGTTTT	139239

BX901897.6	951	CCGTGTCGGAACGCTGTCTTTGTTTTGGTTCTTTTAACCCGCCCAATGCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	139240	CCGTGTCGGAACGCTGTCTTTGTTTTGGTTCTTTTAACCCGCCCAATGCC	139289

BX901897.6	1001	AGTTTAGCCAAGCTTATTTCAGCACCTGGGTTGCCTTGGTGGAAAACCAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	139290	AGTTTAGCCAAGCTTATTTCAGCACCTGGGTTGCCTTGGTGGAAAACCAC	139339

BX901897.6	1051	ATATTTCATTCATTCATTCAGAAAGATTCTGAAAGCAAGCGTCCAAAATG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	139340	ATATTTCATTCATTCATTCAGAAAGATTCTGAAAGCAAGCGTCCAAAATG	139389

BX901897.6	1101	CGACCTCCGGTGGATAGACAGTAGCAGACTCAAAGTAAGACAGACTTAGT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	139390	CGACCTCCGGTGGATAGACAGTAGCAGACTCAAAGTAAGACAGACTTAGT	139439

BX901897.6	1151	TCAACATAAGGTTATTAATTGGCAAATGATATAAATATTATGAAAGTAAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	139440	TCAACATAAGGTTATTAATTGGCAAATGATATAAATATTATGAAAGTAAC	139489

BX901897.6	1201	CATTAGGTGAGCAGGTTAACCTCGTAACCTCGTGTCCTAACAACATGCTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	139490	CATTAGGTGAGCAGGTTAACCTCGTAACCTCGTGTCCTAACAACATGCTT	139539

BX901897.6	1251	CGTGATGAGATATGCAGTGATAAGCAGTAAGGCTGTTTGCACCAGACGAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	139540	CGTGATGAGATATGCAGTGATAAGCAGTAAGGCTGTTTGCACCAGACGAA	139589

BX901897.6	1301	ACACAACAGAAATTTAAATACAGCCATTCAGAAGCACAGAATATGCCCTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	139590	ACACAACAGAAATTTAAATACAGCCATTCAGAAGCACAGAATATGCCCTC	139639

BX901897.6	1351	ACTCACAAAATGGTAAGCCTTATAATCTAATTAATACATATTAAACCTCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	139640	ACTCACAAAATGGTAAGCCTTATAATCTAATTAATACATATTAAACCTCT	139689

BX901897.6	1401	TTACCATTATTAAATGTACTTGCTTAATCACTGATATATGTTTAGTTCTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	139690	TTACCATTATTAAATGTACTTGCTTAATCACTGATATATGTTTAGTTCTA	139739

BX901897.6	1451	AAGTTTATATTCAAAGGGTTTATTTTATTTTCAAGATCTGAGGTTAACTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	139740	AAGTTTATATTCAAAGGGTTTATTTTATTTTCAAGATCTGAGGTTAACTC	139789

BX901897.6	1501	ATTTTATTGTGGAAAATATCGGGTGCCTTTGCTTTTATTTGGAACACGAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	139790	ATTTTATTGTGGAAAATATCGGGTGCCTTTGCTTTTATTTGGAACACGAT	139839

BX901897.6	1551	TTATATAAGCCTTTAGGCTCGATTGTCAGACTCGCTCCTGTCCTCAATCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	139840	TTATATAAGCCTTTAGGCTCGATTGTCAGACTCGCTCCTGTCCTCAATCT	139889

BX901897.6	1601	GGCAACCTGCGCTTGCGTTTGTTTCAAGTGGTGGTGCTGCAGAGCCATTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	139890	GGCAACCTGCGCTTGCGTTTGTTTCAAGTGGTGGTGCTGCAGAGCCATTT	139939

BX901897.6	1651	GGGCAGAGCTGAGCTCCAGCGAGGGGGAGCATGAGCTCTTGCTCCTCTTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	139940	GGGCAGAGCTGAGCTCCAGCGAGGGGGAGCATGAGCTCTTGCTCCTCTTT	139989

BX901897.6	1701	TCTTGCACTTCTTCTACGAGTGATGTCACTGGGGGTAGGGTTAGGTGTGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	139990	TCTTGCACTTCTTCTACGAGTGATGTCACTGGGGGTAGGGTTAGGTGTGG	140039

BX901897.6	1751	GGTTGGTTTACGCATTAAAACAGCTTATAGGAGGATGAGCGAGAGCTCAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	140040	GGTTGGTTTACGCATTAAAACAGCTTATAGGAGGATGAGCGAGAGCTCAT	140089

BX901897.6	1801	GCTCCCCCTCGCTGGAGCTCAGCTCTGCTCAAATGGCTCTGCAGCGAGCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	140090	GCTCCCCCTCGCTGGAGCTCAGCTCTGCTCAAATGGCTCTGCAGCGAGCA	140139

BX901897.6	1851	CCGTCTCGTTTGTTTTGATCCAGGAGTGCTATACCTTGTTCTACCACTGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	140140	CCGTCTCGTTTGTTTTGATCCAGGAGTGCTATACCTTGTTCTACCACTGG	140189

BX901897.6	1901	GTGTGAAACTTACAAACTGCACCTTTAACTTTTTGCATGGGCTCCTAAAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	140190	GTGTGAAACTTACAAACTGCACCTTTAACTTTTTGCATGGGCTCCTAAAG	140239

BX901897.6	1951	TTTGTGAAATATAGTTTTACTCACACCTTATGTAAGTTTTGGAACAAACT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901912.10	140240	TTTGTGAAATATAGTTTTACTCACACCTTATGTAAGTTTTGGAACAAACT	140289

Overview

Query
BX901897.6 - 180979 bps
Hit
BX901912.10 - 140289 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100196220001200011382901402891
286.42083704756447933113751
385.07196373128276128648113751
484.7418035889179274-193751
587.5417628812871812900513796671
684.9814627585758849-13936651
786.1426047335314003114668151361
884401808128198129005127508283201
982.6538790384409342-127530284511
1085.671383016696267262142211425241
1178.691886688606486731142538431801
1293.411782558527485528163233634901
1390.321682475213952385173907741541
1483.74117257121544121800173913741641
1589.821232125180552016-177157773721
1684.54276539128467129005191285918271
1784.7721241684348849-191550919761
1884.79176369891348950211104221107891
1986.2319436054185777-11104281107901
2086.7520235954195777-11248461252071
2183.981623615214352503-11248461252071
Short-link