<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX119906.16	1	GAATTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAACAAGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	32517	GAATTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAACAAGC	32566

BX119906.16	51	AAACAAAAATACCCATTACAATGTTGTTTTAAGATTGTTGTATATCAACT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	32567	AAACAAAAATACCCATTACAATGTTGTTTTAAGATTGTTGTATATCAACT	32616

BX119906.16	101	GGGCATGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCGAGGCG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	32617	GGGCATGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCGAGGCG	32666

BX119906.16	151	GACAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	32667	GACAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAA	32716

BX119906.16	201	ACCCCATCTCTAGTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGGGCT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	32717	ACCCCATCTCTAGTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGGGCT	32766

BX119906.16	251	CCTGTAATCCTAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	32767	CCTGTAATCCTAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACC	32816

BX119906.16	301	CGGGAGGTAGAGGTTGCGGTGAGCTGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	32817	CGGGAGGTAGAGGTTGCGGTGAGCTGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCC	32866

BX119906.16	351	TGGGTGACAAGAGCAAAACTCCGTCTCAAAAAAATAAAAAATTTAAAAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	32867	TGGGTGACAAGAGCAAAACTCCGTCTCAAAAAAATAAAAAATTTAAAAAA	32916

BX119906.16	401	ATAAAGAACTCGACCTCCCAAAGGTATTGGCTAACTCCACGGGCAAAAAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	32917	ATAAAGAACTCGACCTCCCAAAGGTATTGGCTAACTCCACGGGCAAAAAA	32966

BX119906.16	451	ACCATACCCATTACAATGCTGTTTTAAGATTGTTGACCTGGTGCGGTGGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	32967	ACCATACCCATTACAATGCTGTTTTAAGATTGTTGACCTGGTGCGGTGGC	33016

BX119906.16	501	TCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGACGAATCATGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	33017	TCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGACGAATCATGA	33066

BX119906.16	551	GGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACGCCATCTCTA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	33067	GGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACGCCATCTCTA	33116

BX119906.16	601	CTAAAAATACAAAAAAAAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	33117	CTAAAAATACAAAAAAAAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTG	33166

BX119906.16	651	TAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAGTTGCTTGAACCAGGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	33167	TAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAGTTGCTTGAACCAGGA	33216

BX119906.16	701	GGCGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACTGTAGTCCAGCCAGGGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	33217	GGCGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACTGTAGTCCAGCCAGGGC	33266

BX119906.16	751	GACAAGAGTGAAACTCCATGTCAAAAAATTTAAAAAAATTAAATAAAAGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	33267	GACAAGAGTGAAACTCCATGTCAAAAAATTTAAAAAAATTAAATAAAAGA	33316

BX119906.16	801	ACTCCACCTCCCAAAGGTATTGGCTAACTCCACGGGCAAAAAAAAAAAAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	33317	ACTCCACCTCCCAAAGGTATTGGCTAACTCCACGGGCAAAAAAAAAAAAC	33366

BX119906.16	851	CATACCCCTTACAATGCCGTTTTAAGATTCTTACGTATCTCTTCGAACTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	33367	CATACCCCTTACAATGCCGTTTTAAGATTCTTACGTATCTCTTCGAACTC	33416

BX119906.16	901	CAACCTGTCACCGTTTTAGATCCAAACCCACCAATCACGAACCTAAGGAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	33417	CAACCTGTCACCGTTTTAGATCCAAACCCACCAATCACGAACCTAAGGAT	33466

BX119906.16	951	GAAAGCAAAGGCTCAGCAGTTGACCTGGGACCTTAACAGAAATGTGACCG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	33467	GAAAGCAAAGGCTCAGCAGTTGACCTGGGACCTTAACAGAAATGTGACCG	33516

BX119906.16	1001	ATATCGAGTGTGTTAAAGACGCCGACTATTCTATGCCGGTAAATCATACT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	33517	ATATCGAGTGTGTTAAAGACGCCGACTATTCTATGCCGGTAAATCATACT	33566

BX119906.16	1051	CTCTATTGTTTTTTTATTTTTATTTTATTTATTTATGTATTTATGTATTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	33567	CTCTATTGTTTTTTTATTTTTATTTTATTTATTTATGTATTTATGTATTT	33616

BX119906.16	1101	ATTTATTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGACTGCGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	33617	ATTTATTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGACTGCGG	33666

BX119906.16	1151	TGACCCGATCTCCGCTCTCTGCAACCTCCACCTCCCAGGTCCATGCCATT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	33667	TGACCCGATCTCCGCTCTCTGCAACCTCCACCTCCCAGGTCCATGCCATT	33716

BX119906.16	1201	CTCCTGCCTCAACCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	33717	CTCCTGCCTCAACCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCAT	33766

BX119906.16	1251	GCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	33767	GCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTT	33816

BX119906.16	1301	AGCCAGGAGGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCGGCCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	33817	AGCCAGGAGGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCGGCCT	33866

BX119906.16	1351	CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGTCACCGCGCATGGCCCAGACTC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	33867	CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGTCACCGCGCATGGCCCAGACTC	33916

BX119906.16	1401	TCTAATGTTGACGAACAAGACGTTTCCGTCTTCTGCAGGAATCTCAGAAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	33917	TCTAATGTTGACGAACAAGACGTTTCCGTCTTCTGCAGGAATCTCAGAAC	33966

BX119906.16	1451	CAATACTGCTCCCATCGCTGGTGTCATGACTACCTGGTTTCTGCCCCGAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	33967	CAATACTGCTCCCATCGCTGGTGTCATGACTACCTGGTTTCTGCCCCGAA	34016

BX119906.16	1501	GTCAGGTGTGGGATTTGAAGTGACTTTGGAGGGTCTGGTTCCCCGTCCGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	34017	GTCAGGTGTGGGATTTGAAGTGACTTTGGAGGGTCTGGTTCCCCGTCCGC	34066

BX119906.16	1551	GGGACATCTAAGATGGCACACACTGGACAGGGTGGATGTGAAAGTGAAAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	34067	GGGACATCTAAGATGGCACACACTGGACAGGGTGGATGTGAAAGTGAAAT	34116

BX119906.16	1601	GAGGCTAAGCTATGACTGGTGCGAAACCCAACCCCACGCTGGGCGTGGTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	34117	GAGGCTAAGCTATGACTGGTGCGAAACCCAACCCCACGCTGGGCGTGGTG	34166

BX119906.16	1651	GCTCACGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCGGATCAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	34167	GCTCACGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCGGATCAT	34216

BX119906.16	1701	GAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGTCTGGCCAACACGGTGAAACGCTGTCTC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	34217	GAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGTCTGGCCAACACGGTGAAACGCTGTCTC	34266

BX119906.16	1751	TGCTAAAAATACGAAAGTTAGCCGGGCACAGTGGCTCACACCAGCACTTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	34267	TGCTAAAAATACGAAAGTTAGCCGGGCACAGTGGCTCACACCAGCACTTT	34316

BX119906.16	1801	GAGAGGCTGAGGCGGATGGATCACCTGGGGCCAGGAGTTCGAGACTAGTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	34317	GAGAGGCTGAGGCGGATGGATCACCTGGGGCCAGGAGTTCGAGACTAGTC	34366

BX119906.16	1851	TGGGCAACATGGTGAAACCCCGCCTCCACTAAAAATATAAAAATTAGCTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	34367	TGGGCAACATGGTGAAACCCCGCCTCCACTAAAAATATAAAAATTAGCTG	34416

BX119906.16	1901	GGCATGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGTTACTTGGGAGGCTGAGGCAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	34417	GGCATGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGTTACTTGGGAGGCTGAGGCAG	34466

BX119906.16	1951	GAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCATTGAGCCGAGACTGTG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX901885.7	34467	GAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCATTGAGCCGAGACTGTG	34516

Overview

Query
BX119906.16 - 35666 bps
Hit
BX901885.7 - 34516 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link