<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 516 bps / non-identical: 50 bps

Full alignment

  BX470223.14	247129	GAATTCTCCATGGAGCATTGTGAACAGAAGAACCCCAAGAGAATAGACCG	247178
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  BX784038.11	195221	GAATTCTCCATGGAGCATTGTGAACAGAAGAACCCCAAGAGAATAGACCG	195172

  BX470223.14	247179	TCGCTGGTTTGGCCCGGTAGCATCCTTTTTCATAAAACTCTGGCGGGATG	247228
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  BX784038.11	195171	TCGCTGGTTTGGCCCGGTAGCATCCTTTTTCATAAAACTCTGGCGGGATG	195122

  BX470223.14	247229	TACGCTTCTGTGCCTGGAGGAGAGACGTTTAGTTTAGCATCATGTTGAAT	247278
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  BX784038.11	195121	TACGCTTCTGTGCCTGGAGGAGAGACGTTTAGTTTAGCATCATGTTGAAT	195072

  BX470223.14	247279	ATATATACCAGATGGGCTTCAGCTGTGCTAATTAACCAGCTTTCAATACG	247328
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  BX784038.11	195071	ATATATACCAGATGGGCTTCAGCTGTGCTAATTAACCAGCTTTCAATACG	195022

  BX470223.14	247329	TATATTAATAATGCTTATGCACATTCATAACTAGTGTTGTCAAAAGTATC	247378
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  BX784038.11	195021	TATATTAATAATGCTTATGCACATTCATAACTAGTGTTGTCAAAAGTATC	194972

  BX470223.14	247379	AACTACCAATCGATACCGACACTCATCACAGTCATATTTGCTGAGCATGT	247428
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  BX784038.11	194971	AACTACCAATCGATACCGACACTCATCACAGTCATATTTGCTGAGCATGT	194922

  BX470223.14	247429	GAACACCAATGGCCAATCAGTGGTGTTTAACAGCGCTCAAATTGACTTGT	247478
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  BX784038.11	194921	GAACACCAATGGCCAATCAGTGGTGTTTAACAGCGCTCAAATTGACTTGT	194872

  BX470223.14	247479	TAAATGTCAGAATCGATTGGTACCGAAGTCGATACTTTTGACCACACTAT	247528
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  BX784038.11	194871	TAAATGTCAGAATCGATTGGTACCGAAGTCGATACTTTTGACCACACTAT	194822

  BX470223.14	247529	TCAAAACACCTACCAGAGAAGATACTGTAGGCTGATTCCATCATGAAGTC	247578
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  BX784038.11	194821	TCAAAACACCTACCAGAGAAGATACTGTAGGCTGATTCCATCATGAAGTC	194772

  BX470223.14	247579	TCCACACCCAAAGTCGATCAGCTTGACTTCCAGTGTGTCAGGGTTCACCA	247628
			||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
C  BX784038.11	194771	TCCACACCCGAAGTCGATCAGCTTGACTTCCAGTGTGTCGGGGTTCACCA	194722

  BX470223.14	247629	GCAGGTTTTGAAGCTT	247644
			||||||||||||||||
C  BX784038.11	194721	GCAGGTTTTGAAGCTT	194706

Compact alignment

skip 450 bps 100% identity alignment

  BX470223.14	247579	TCCACACCCAAAGTCGATCAGCTTGACTTCCAGTGTGTCAGGGTTCACCA	247628
			||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
C  BX784038.11	194771	TCCACACCCGAAGTCGATCAGCTTGACTTCCAGTGTGTCGGGGTTCACCA	194722

skip 16 bps 100% identity alignment

Overview

Query
BX470223.14 - 247644 bps
Hit
BX784038.11 - 195221 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 516 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
199.6105162471292476441194706195221-1
Short-link