<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX663615.15	1	GCCTTTATAGTGTCCTATTAAATTGCGTTGGGGTGTAAAGAATGTTTCCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	157634	GCCTTTATAGTGTCCTATTAAATTGCGTTGGGGTGTAAAGAATGTTTCCA	157683

BX663615.15	51	TTTCTTTGATCATCATGGCAATGTTATTACCTCAAATCTTAAACGTGCGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	157684	TTTCTTTGATCATCATGGCAATGTTATTACCTCAAATCTTAAACGTGCGC	157733

BX663615.15	101	ATATGAAAACCACTGCACAAACTACAAAATAATATTAAGATTATCGTGCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	157734	ATATGAAAACCACTGCACAAACTACAAAATAATATTAAGATTATCGTGCC	157783

BX663615.15	151	GGTGGAGCACATCACCTGTTTGTTATATAACTTACTTTATCAGTAGGCTA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	157784	GGTGGAGCACATCACCTGTTTGTTATATAACTTACTTTATCAGTAGGCTA	157833

BX663615.15	201	TTTATTATTTATTACAGGCTATGTTACAAATATTTGACCAACTGCCACTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	157834	TTTATTATTTATTACAGGCTATGTTACAAATATTTGACCAACTGCCACTA	157883

BX663615.15	251	CATGTAAAACACTCTCATGCACTCAGAACTAGTGGCAGTTATGAATTAGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	157884	CATGTAAAACACTCTCATGCACTCAGAACTAGTGGCAGTTATGAATTAGA	157933

BX663615.15	301	TAAATGGGCATATCAGCACACAAAGTGAGCTGCATATTATTTATCATCTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	157934	TAAATGGGCATATCAGCACACAAAGTGAGCTGCATATTATTTATCATCTG	157983

BX663615.15	351	TTCATTTTCTTCATGTACCAAAACTATTAAACAAATACCTAAAGTTTTAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	157984	TTCATTTTCTTCATGTACCAAAACTATTAAACAAATACCTAAAGTTTTAA	158033

BX663615.15	401	TTGGCGTCATTTACTCACCCGTTAGTTGGTCCAAATCTTTACTTCTGTAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	158034	TTGGCGTCATTTACTCACCCGTTAGTTGGTCCAAATCTTTACTTCTGTAG	158083

BX663615.15	451	TTTCTATCTTGTTAAATACAAAAGAAGAAATTTTTTAAAAGTGTGAAAAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	158084	TTTCTATCTTGTTAAATACAAAAGAAGAAATTTTTTAAAAGTGTGAAAAT	158133

BX663615.15	501	CTTTGACACAATCTGGGATGGGAAATGGGAATGGGAATAAAGCAGCTTAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	158134	CTTTGACACAATCTGGGATGGGAAATGGGAATGGGAATAAAGCAGCTTAA	158183

BX663615.15	551	CAAATCAAGTTCTAGTGATTTGAAACTGCAGTTTTCACAGTTGAAGTTCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	158184	CAAATCAAGTTCTAGTGATTTGAAACTGCAGTTTTCACAGTTGAAGTTCA	158233

BX663615.15	601	GTTTAGTTTAAGAACCATTGAACCATAAGAACCATTGATTGTTTTTGAGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	158234	GTTTAGTTTAAGAACCATTGAACCATAAGAACCATTGATTGTTTTTGAGG	158283

BX663615.15	651	ATTTGTTTTTCATATATGGAAGTATGATTACAGGTTTTCAGCTTTCTTTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	158284	ATTTGTTTTTCATATATGGAAGTATGATTACAGGTTTTCAGCTTTCTTTA	158333

BX663615.15	701	AAATATCTTCTTCTGTGTTTTAAACAGAAGACACAAACTCATAAAGTTTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	158334	AAATATCTTCTTCTGTGTTTTAAACAGAAGACACAAACTCATAAAGTTTT	158383

BX663615.15	751	AAAACCACTTAAGGGTGAATAAATGGTGAGTAAATAAAAATGTTGTGGTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	158384	AAAACCACTTAAGGGTGAATAAATGGTGAGTAAATAAAAATGTTGTGGTC	158433

BX663615.15	801	AACTATCCCTTTAAATTCTAATTTGGTGTGACGCAAACATTCAACGCATC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	158434	AACTATCCCTTTAAATTCTAATTTGGTGTGACGCAAACATTCAACGCATC	158483

BX663615.15	851	TTCCGTGCAAACAACTGAATAATACTTGAGCTAAAAATTCGAATGAGGTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	158484	TTCCGTGCAAACAACTGAATAATACTTGAGCTAAAAATTCGAATGAGGTG	158533

BX663615.15	901	AAAAACATCCTGTAGGTAAACTAGAGCAAGTGAGCCCAAGAAAACACACC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	158534	AAAAACATCCTGTAGGTAAACTAGAGCAAGTGAGCCCAAGAAAACACACC	158583

BX663615.15	951	TAATGTGGTCGACAAAACAATGTTGTTTCAATGATTGTGTGTTCAGCTCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	158584	TAATGTGGTCGACAAAACAATGTTGTTTCAATGATTGTGTGTTCAGCTCA	158633

BX663615.15	1001	ATAATTTTAATCGTAAGGATTTTGCATTCTTGTTAAAGAGAGACAGTTGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	158634	ATAATTTTAATCGTAAGGATTTTGCATTCTTGTTAAAGAGAGACAGTTGT	158683

BX663615.15	1051	GTCTCTGTAATGCAGTGGTTTGGACGGCACTAGGCAGAGGGAGATATTAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	158684	GTCTCTGTAATGCAGTGGTTTGGACGGCACTAGGCAGAGGGAGATATTAA	158733

BX663615.15	1101	TCTGAATTGGCTCTTTGTGTGAAGTTTGTATCCCTGATGTGTGTACGTCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	158734	TCTGAATTGGCTCTTTGTGTGAAGTTTGTATCCCTGATGTGTGTACGTCT	158783

BX663615.15	1151	GTTCAAGTGCCCTTTTGGAATTTGCTTGTTATTTGTTAAATGTTACACAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	158784	GTTCAAGTGCCCTTTTGGAATTTGCTTGTTATTTGTTAAATGTTACACAA	158833

BX663615.15	1201	CAGAATTATTAAACAGTAAATAATGTCTCACTCAGAGGAAAAAACTTCAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	158834	CAGAATTATTAAACAGTAAATAATGTCTCACTCAGAGGAAAAAACTTCAT	158883

BX663615.15	1251	GTTGTATATTAAACACTTTCAATAAAGGAAATTATTTGTTTCTTCCGTCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	158884	GTTGTATATTAAACACTTTCAATAAAGGAAATTATTTGTTTCTTCCGTCT	158933

BX663615.15	1301	CATATTTGTCTTATTTTTTCACTTGATTTTGATTGTCAAATTTTCCGTCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	158934	CATATTTGTCTTATTTTTTCACTTGATTTTGATTGTCAAATTTTCCGTCT	158983

BX663615.15	1351	GATCTACTGAGTTTTTTGTTTCTTGGGAAGAAACAAATATTTCCTTTCAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	158984	GATCTACTGAGTTTTTTGTTTCTTGGGAAGAAACAAATATTTCCTTTCAA	159033

BX663615.15	1401	ATTAAATATGTAAAAATGCAACATTGCATTATTAATCAGTTTTTTGTTAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	159034	ATTAAATATGTAAAAATGCAACATTGCATTATTAATCAGTTTTTTGTTAG	159083

BX663615.15	1451	ATATAATTTTTTTTTCTTATGTTAAACTGTTTCAGAAGCCTTTTCTCCAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	159084	ATATAATTTTTTTTTCTTATGTTAAACTGTTTCAGAAGCCTTTTCTCCAG	159133

BX663615.15	1501	TCTTTGGTGTCATATGATCCTTTAAAATACAATTTTAACATGCTGGATTA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	159134	TCTTTGGTGTCATATGATCCTTTAAAATACAATTTTAACATGCTGGATTA	159183

BX663615.15	1551	GTTCTAAAGGAGCATCATAGTTAGAGAAAACATGTTATTTTGTGTACATT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	159184	GTTCTAAAGGAGCATCATAGTTAGAGAAAACATGTTATTTTGTGTACATT	159233

BX663615.15	1601	TTTTAAAAAACAGCATGTTGTTGGAGGAAATACGTACAGACTCCAAACCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	159234	TTTTAAAAAACAGCATGTTGTTGGAGGAAATACGTACAGACTCCAAACCT	159283

BX663615.15	1651	TTAAAAAAGGAATCATTGATGTATACATGAAAGAATGGTAATGTTAATTA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	159284	TTAAAAAAGGAATCATTGATGTATACATGAAAGAATGGTAATGTTAATTA	159333

BX663615.15	1701	CATTCATATTTTTACTTTTTGTCAGATCCTATGTACATGAAGTGCAGATT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	159334	CATTCATATTTTTACTTTTTGTCAGATCCTATGTACATGAAGTGCAGATT	159383

BX663615.15	1751	AGTGAAGTAATGATTGAGAATAAAGACTGTGCAACAGTCAGATGTTTAAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	159384	AGTGAAGTAATGATTGAGAATAAAGACTGTGCAACAGTCAGATGTTTAAG	159433

BX663615.15	1801	GGCAACCTTCATTAATAGCAATGAATTTCAGCGTTACTATAGAGACATGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	159434	GGCAACCTTCATTAATAGCAATGAATTTCAGCGTTACTATAGAGACATGA	159483

BX663615.15	1851	GCCGTTTTCAGAGTTTAGGCATGGGTAGTGGGATGAAACCATGACTACCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	159484	GCCGTTTTCAGAGTTTAGGCATGGGTAGTGGGATGAAACCATGACTACCA	159533

BX663615.15	1901	ATATATTTACATGTCGAAAAGCATTTTCTTGCCAAGTTAAATACTGTTTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	159534	ATATATTTACATGTCGAAAAGCATTTTCTTGCCAAGTTAAATACTGTTTT	159583

BX663615.15	1951	GTTTTCAGAAATGGGTCAAAATGAAGTGAGTTTTTCCCTAAAACAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX664714.16	159584	GTTTTCAGAAATGGGTCAAAATGAAGTGAGTTTTTCCCTAAAACAAGCTT	159633

Overview

Query
BX663615.15 - 212543 bps
Hit
BX664714.16 - 159633 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100190420001200011576341596331
286.782334736805468526127550280181
387.22207404164408164811127550279561
4872334622533125792127551280121
583.55213447128984129430-158059585141
690.71243352209353209704161563619281
793.5693712183661337830-167579687891
892.6489712037832979531167579687891
991.8586512115223453444-167582687961
1090.54523810116905117714-167997687891
1192.1188912253661237836-198477996931
1294.1695512087832679533198480996941
1391.4784712045224153444-198486996921
1488.16468812116903117714-198901996941
1590.282153177253872854-11120191123371
1692.24826887172172408-11125941132721
1787.53301496165220165715-11274141279021
1879.942177085271153418-11408811415381
1993.7646557416531216588511521001526761
2086.1523842012734812776711522441526761
2183.7631970815762515833211547771554901
Short-link