<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX927199.5	1	TCGCAATCTCTAGAAATGTATATTTTCTACATTTTTAGAATGTGTCTATG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	148366	TCGCAATCTCTAGAAATGTATATTTTCTACATTTTTAGAATGTGTCTATG	148415

BX927199.5	51	TTAAATATCTTTATCAAACAAAATCTTTTAATGATGTAATGGCTGTAAAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	148416	TTAAATATCTTTATCAAACAAAATCTTTTAATGATGTAATGGCTGTAAAC	148465

BX927199.5	101	TTTGTATCTTTACGATAATGCTGCAGGATAGGTGAAATACGGTAATTTCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	148466	TTTGTATCTTTACGATAATGCTGCAGGATAGGTGAAATACGGTAATTTCC	148515

BX927199.5	151	AGTCATACGCTGCCTGTATGAAAGGAGTGGCAGTTGTGAGGAGGAAATGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	148516	AGTCATACGCTGCCTGTATGAAAGGAGTGGCAGTTGTGAGGAGGAAATGT	148565

BX927199.5	201	AGCATGCATGCCAAGCAGATAACACAGAGCAGACAATGCAGACAAATTAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	148566	AGCATGCATGCCAAGCAGATAACACAGAGCAGACAATGCAGACAAATTAA	148615

BX927199.5	251	TGAAAGTTAAGCAGAGTCAATGTTCTTTTAGGTAAAGTTAAGTTTGAATA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	148616	TGAAAGTTAAGCAGAGTCAATGTTCTTTTAGGTAAAGTTAAGTTTGAATA	148665

BX927199.5	301	ATCATGTATATGATGCTTTAAGTGGGGTGTTACAGTATATGACGTTTTAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	148666	ATCATGTATATGATGCTTTAAGTGGGGTGTTACAGTATATGACGTTTTAA	148715

BX927199.5	351	GTGGGGTGATGCATGTAATCAAGTGTATTGGGATACCTGAAGGTGCTAAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	148716	GTGGGGTGATGCATGTAATCAAGTGTATTGGGATACCTGAAGGTGCTAAT	148765

BX927199.5	401	GCTGAGTAGCAGTTATTGTAGCTGTGTCCAGGTATGTGATTAATTACTAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	148766	GCTGAGTAGCAGTTATTGTAGCTGTGTCCAGGTATGTGATTAATTACTAA	148815

BX927199.5	451	AATACATGTTTGTTACATGCTGTTTATTTGTTATAGTATTGTGTATGGAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	148816	AATACATGTTTGTTACATGCTGTTTATTTGTTATAGTATTGTGTATGGAT	148865

BX927199.5	501	ATTGCATGGGGTTGTCTTTGATGTATAAAAGGTTTGTGATGAATGTTGTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	148866	ATTGCATGGGGTTGTCTTTGATGTATAAAAGGTTTGTGATGAATGTTGTA	148915

BX927199.5	551	TTTGAAACGTTTTATGCTTAGATATTGATGGTAGTGTAATAAGGGTGTCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	148916	TTTGAAACGTTTTATGCTTAGATATTGATGGTAGTGTAATAAGGGTGTCT	148965

BX927199.5	601	TTTCTGGCTCTGTTTCAAGAGTTGGCTTATGTCACTGTTTTGAGTCACTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	148966	TTTCTGGCTCTGTTTCAAGAGTTGGCTTATGTCACTGTTTTGAGTCACTA	149015

BX927199.5	651	TATAAGAAATGAGGAGTAGTAATGTATTGCATATTTGCACATTATCTAAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	149016	TATAAGAAATGAGGAGTAGTAATGTATTGCATATTTGCACATTATCTAAG	149065

BX927199.5	701	AGCCGGGTATAACCCAAATTGCCTTAAGAGTATTGCACGTTTGCACCTGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	149066	AGCCGGGTATAACCCAAATTGCCTTAAGAGTATTGCACGTTTGCACCTGA	149115

BX927199.5	751	CCTGATATGAAAGCTTTGTGATTATTGTGCTCACCTGCTACCAACGTGGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	149116	CCTGATATGAAAGCTTTGTGATTATTGTGCTCACCTGCTACCAACGTGGT	149165

BX927199.5	801	TTTCTATATGTTAATTGTTTGAAATCCCTTTTTGCGTAATTAATAAAGGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	149166	TTTCTATATGTTAATTGTTTGAAATCCCTTTTTGCGTAATTAATAAAGGT	149215

BX927199.5	851	TATTTATATGAAAGTCCATTTTCCTTATTGTCTAACGAACTAGGGGTTAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	149216	TATTTATATGAAAGTCCATTTTCCTTATTGTCTAACGAACTAGGGGTTAC	149265

BX927199.5	901	AATATTCTCTTTAATAAGCTCTAATTTAATATTCTATTGATTTTTATCTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	149266	AATATTCTCTTTAATAAGCTCTAATTTAATATTCTATTGATTTTTATCTT	149315

BX927199.5	951	AAAAATAAAACTGATCATTCTGACAATGTGTTTTTTGGTAATTGCCAAAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	149316	AAAAATAAAACTGATCATTCTGACAATGTGTTTTTTGGTAATTGCCAAAT	149365

BX927199.5	1001	ACAAACCTGTGCAACATACAACTTGTTTTGTGGTTCAGGGTCACATACAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	149366	ACAAACCTGTGCAACATACAACTTGTTTTGTGGTTCAGGGTCACATACAC	149415

BX927199.5	1051	CATGGTCAAAGGCATATGCAAAAAAAGAAGGCAATGCTTGGTAGAACAAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	149416	CATGGTCAAAGGCATATGCAAAAAAAGAAGGCAATGCTTGGTAGAACAAT	149465

BX927199.5	1101	GGCATTATTGACTTACTACTTAATGGCACAATAGGTTGACCATCCAGAGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	149466	GGCATTATTGACTTACTACTTAATGGCACAATAGGTTGACCATCCAGAGG	149515

BX927199.5	1151	TGATGAACTCTTACACTTTAATGTCATTTATAGCTCCTAACAGGCTGTTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	149516	TGATGAACTCTTACACTTTAATGTCATTTATAGCTCCTAACAGGCTGTTA	149565

BX927199.5	1201	CTTTAAGGAATTCATTAATTTGTTTTTCTTCAGCTTAGTCCCTAAATTCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	149566	CTTTAAGGAATTCATTAATTTGTTTTTCTTCAGCTTAGTCCCTAAATTCA	149615

BX927199.5	1251	TTAGGGGTTGCCACAGTGGAATGAACCACCAAATTTTCTAGCATATGTGT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	149616	TTAGGGGTTGCCACAGTGGAATGAACCACCAAATTTTCTAGCATATGTGT	149665

BX927199.5	1301	TACACACAGGATGCCCTTCCACCTGCAACCCAGTAAACATCCATACATAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	149666	TACACACAGGATGCCCTTCCACCTGCAACCCAGTAAACATCCATACATAC	149715

BX927199.5	1351	ATCATTCACACACATACACTACTGCTCAATTCACCTATAGAGCATGTCTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	149716	ATCATTCACACACATACACTACTGCTCAATTCACCTATAGAGCATGTCTT	149765

BX927199.5	1401	TGGACTGTAGGGGAAACCTACTCGAACATGGGGAGAACATGCAAACTTCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	149766	TGGACTGTAGGGGAAACCTACTCGAACATGGGGAGAACATGCAAACTTCA	149815

BX927199.5	1451	CAAAGAAATGTCAACTGACCCAGCCAGGACTCAAACCAGTTACCTTCTTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	149816	CAAAGAAATGTCAACTGACCCAGCCAGGACTCAAACCAGTTACCTTCTTG	149865

BX927199.5	1501	ATGTGAGGTGACAGTGCTAACCAGTGAGCCACCCTGTCACCTCATTTTTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	149866	ATGTGAGGTGACAGTGCTAACCAGTGAGCCACCCTGTCACCTCATTTTTG	149915

BX927199.5	1551	GGAATGATCAATATTAAAATAAAAAGATGTCTGTGTGCAGGTTCAGTTGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	149916	GGAATGATCAATATTAAAATAAAAAGATGTCTGTGTGCAGGTTCAGTTGA	149965

BX927199.5	1601	TTTAATTTATAATACACCTCTTTCTCTGTTGCTTGTGTGCTAGTTGGCAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	149966	TTTAATTTATAATACACCTCTTTCTCTGTTGCTTGTGTGCTAGTTGGCAG	150015

BX927199.5	1651	GTCACCTGATCAGCTCCTCACAAAATATGTTCACAGAAATAATTAATAAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	150016	GTCACCTGATCAGCTCCTCACAAAATATGTTCACAGAAATAATTAATAAG	150065

BX927199.5	1701	TGGAATTGAAATGTGCATGAAATGGACAATGGAACCAGTGCTCGATCAAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	150066	TGGAATTGAAATGTGCATGAAATGGACAATGGAACCAGTGCTCGATCAAT	150115

BX927199.5	1751	TTTTCTATAGTGCAATAACTAGTCCTAATTAAAAGTAGTGAAATTTAATT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	150116	TTTTCTATAGTGCAATAACTAGTCCTAATTAAAAGTAGTGAAATTTAATT	150165

BX927199.5	1801	GAATAAAATTGTTTTCTAAATCAAATTTTAGAAAATGTTTGATCCCCGAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	150166	GAATAAAATTGTTTTCTAAATCAAATTTTAGAAAATGTTTGATCCCCGAC	150215

BX927199.5	1851	ATTAAAAGATTGTGTCTTAAATTTTATTAAGCTTTTAAAAACTTGAATAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	150216	ATTAAAAGATTGTGTCTTAAATTTTATTAAGCTTTTAAAAACTTGAATAA	150265

BX927199.5	1901	CTACATTTTCAAAACACTGATGCTGCGTCTAAAATTGCACACTTCCATTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	150266	CTACATTTTCAAAACACTGATGCTGCGTCTAAAATTGCACACTTCCATTC	150315

BX927199.5	1951	TGTAAAGTACACTAAAAACAGTATGTGAGCCAAGTAGTATGTCTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663494.4	150316	TGTAAAGTACACTAAAAACAGTATGTGAGCCAAGTAGTATGTCTGAATTC	150365

Overview

Query
BX927199.5 - 84981 bps
Hit
BX663494.4 - 150365 bps
Total alignments
19
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100192920001200011483661503651
280.581264762261523090-1622367061
389.564286507868979338114077147371
486.892504451828118725124209246581
582.831252892917929467-127463277591
610037771735217428165700657761
710036756993670010-165702657761
885.551573507038370732-175213755581
984.8261214311496616396-178992804141
1087.271863445283253175180451807881
1185.821192617042270682-198429986891
1286.171933492915729505-11104871108401
1387.38175294291622945511290101293021
1483.821703452709227436-11290271293661
1590.4144737073170803-11379991380711
1679.77196662528515351211415041421951
1788.894888705347062111434751435641
1882.5255151233442349411439831441251
1979.91274001685017249-11477451481471
Short-link