<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX677663.6	1	AAGCTTATGAATATTACACTGCAAAAAATGTAAGAAGGGTCTGGCTACAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	79706	AAGCTTATGAATATTACACTGCAAAAAATGTAAGAAGGGTCTGGCTACAC	79755

BX677663.6	51	TGCAAAAAATGCTTTTCTTACTTAGATTTTTTTTTTGTCTTGTTTCTAGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	79756	TGCAAAAAATGCTTTTCTTACTTAGATTTTTTTTTTGTCTTGTTTCTAGT	79805

BX677663.6	101	CCAAATATCTAAAAATTCTTAATTCGAGAAGAATTTTTCTAGACAAGCAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	79806	CCAAATATCTAAAAATTCTTAATTCGAGAAGAATTTTTCTAGACAAGCAA	79855

BX677663.6	151	AACATTTTGTCTAGTTTTAAGAAACAATCTGCTGATATTTGGACAACAAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	79856	AACATTTTGTCTAGTTTTAAGAAACAATCTGCTGATATTTGGACAACAAC	79905

BX677663.6	201	CAAGACACAAAATCTAAGTAAGAAAAGCATTTTTTTGCAGTGTACAGACC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	79906	CAAGACACAAAATCTAAGTAAGAAAAGCATTTTTTTGCAGTGTACAGACC	79955

BX677663.6	251	GGATGCAGATGAGCTGCATGCAGCACTTATAATGCGCACACCTAACTCTA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	79956	GGATGCAGATGAGCTGCATGCAGCACTTATAATGCGCACACCTAACTCTA	80005

BX677663.6	301	CCCCTCACAGTGATGTCACTAATTCCATTGAGTGCACTGTGTCTGAGACT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	80006	CCCCTCACAGTGATGTCACTAATTCCATTGAGTGCACTGTGTCTGAGACT	80055

BX677663.6	351	GCGTATCTGAGCTTGCATATGCAAGTCTGCAGCCAGATACTATTGAAAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	80056	GCGTATCTGAGCTTGCATATGCAAGTCTGCAGCCAGATACTATTGAAAAA	80105

BX677663.6	401	TACTTTTCTTACTTTTTTTTTTTATTTCTAGTCCTAATGTCAAAGAAAAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	80106	TACTTTTCTTACTTTTTTTTTTTATTTCTAGTCCTAATGTCAAAGAAAAC	80155

BX677663.6	451	TTAAATCAAGAAGCATAGATTGAAAAAAAAAATATTGTTTTGTTTTCTGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	80156	TTAAATCAAGAAGCATAGATTGAAAAAAAAAATATTGTTTTGTTTTCTGA	80205

BX677663.6	501	AATGATTTATTGATTTTTTAAAAATTTCTCTGGCAATAGGGTAAGTAAAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	80206	AATGATTTATTGATTTTTTAAAAATTTCTCTGGCAATAGGGTAAGTAAAA	80255

BX677663.6	551	TAATCTTATTTCAAACCAAAACAAGATCATTTTATTTACCCCATTGGCAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	80256	TAATCTTATTTCAAACCAAAACAAGATCATTTTATTTACCCCATTGGCAT	80305

BX677663.6	601	ATTATTTTGTTTGTTTAAAGGGGAAACCCACTTAAAGGAGCAGTAGTTGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	80306	ATTATTTTGTTTGTTTAAAGGGGAAACCCACTTAAAGGAGCAGTAGTTGA	80355

BX677663.6	651	TCTGCCAGAATGCTAATGTTAGCATCGTTTTGAAAATTTATGTCCCTACA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	80356	TCTGCCAGAATGCTAATGTTAGCATCGTTTTGAAAATTTATGTCCCTACA	80405

BX677663.6	701	TCAGACTTACCCTCATTTTGAAAATTTACATCCAAAGCTACACTTCCTTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	80406	TCAGACTTACCCTCATTTTGAAAATTTACATCCAAAGCTACACTTCCTTA	80455

BX677663.6	751	AGTCATGAACGCGTGAACGCAAACCAAATAGATGACGATTCGATGATGAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	80456	AGTCATGAACGCGTGAACGCAAACCAAATAGATGACGATTCGATGATGAT	80505

BX677663.6	801	AGACCATCTTATATAACACTAAATCATGTCATTCATCAGTTAGAAAACTC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	80506	AGACCATCTTATATAACACTAAATCATGTCATTCATCAGTTAGAAAACTC	80555

BX677663.6	851	TGTTTAGACTTACATTTTGTCCAGCATAGTTGTTGACAGGCCAGCAGGTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	80556	TGTTTAGACTTACATTTTGTCCAGCATAGTTGTTGACAGGCCAGCAGGTG	80605

BX677663.6	901	CAGGCTGACATTGGGGTAAAGTTGGTTCTGCTAATGACTTTAAAATACAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	80606	CAGGCTGACATTGGGGTAAAGTTGGTTCTGCTAATGACTTTAAAATACAA	80655

BX677663.6	951	CATTTTTCACAGTCAATTAAGTTAGGTCATACCTACACACTATTTCAGAC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	80656	CATTTTTCACAGTCAATTAAGTTAGGTCATACCTACACACTATTTCAGAC	80705

BX677663.6	1001	CCAATATTCAAAGTAATGTTAGAGAGGGAGTGTGTCACAGGTTGAAACTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	80706	CCAATATTCAAAGTAATGTTAGAGAGGGAGTGTGTCACAGGTTGAAACTG	80755

BX677663.6	1051	TTCAAAAATGAACAAATGTGCGAATATAAACCAAACTTCACTTCAGCAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	80756	TTCAAAAATGAACAAATGTGCGAATATAAACCAAACTTCACTTCAGCAAA	80805

BX677663.6	1101	GCTGGTTAAGTGGAAGAGCGCTATTAACTTATGTTTCTTTATTCAACGAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	80806	GCTGGTTAAGTGGAAGAGCGCTATTAACTTATGTTTCTTTATTCAACGAA	80855

BX677663.6	1151	ATAAAAATCAGATCCAATAACAGCTAAAAACAGAAATAGACTGTAATCTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	80856	ATAAAAATCAGATCCAATAACAGCTAAAAACAGAAATAGACTGTAATCTT	80905

BX677663.6	1201	TTTACATTACACTTATGTTACCATTACAAAGAGTTACTTTTCATTTTCAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	80906	TTTACATTACACTTATGTTACCATTACAAAGAGTTACTTTTCATTTTCAA	80955

BX677663.6	1251	TTGTGCTCGCTGATCCTCATACATCGCTGGTATTTTCTCCTTTTACACTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	80956	TTGTGCTCGCTGATCCTCATACATCGCTGGTATTTTCTCCTTTTACACTT	81005

BX677663.6	1301	GAACAACTAAATGAATGCTTAGGTCTATTTAACTGACTATATTATCAATG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	81006	GAACAACTAAATGAATGCTTAGGTCTATTTAACTGACTATATTATCAATG	81055

BX677663.6	1351	CTGTAAAAGGTACTCCATGAACTTTTAGTCTTTTGATGCTCATTTTAATT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	81056	CTGTAAAAGGTACTCCATGAACTTTTAGTCTTTTGATGCTCATTTTAATT	81105

BX677663.6	1401	GGCTGAAACACACCTCTGTGCAAATAAACCTATTCATAAACAAGAACACA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	81106	GGCTGAAACACACCTCTGTGCAAATAAACCTATTCATAAACAAGAACACA	81155

BX677663.6	1451	GTCTACTTAAGCTTTGCGGGACTAAAATAGTTTTAAAACATACCTGTCTA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	81156	GTCTACTTAAGCTTTGCGGGACTAAAATAGTTTTAAAACATACCTGTCTA	81205

BX677663.6	1501	AAAGTAATACTTCTGCCATGGTGTCATCCTTCTGATCATTATTTTGAACT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	81206	AAAGTAATACTTCTGCCATGGTGTCATCCTTCTGATCATTATTTTGAACT	81255

BX677663.6	1551	GCATAACGTCTTTGAAAAACCATCTTTCTTTTCATGGATACAAGGCCACG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	81256	GCATAACGTCTTTGAAAAACCATCTTTCTTTTCATGGATACAAGGCCACG	81305

BX677663.6	1601	TTAGTCTTTCAGAAAGAAGTTGAGGTTTATGCTGAGTTTACGTTTTAGTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	81306	TTAGTCTTTCAGAAAGAAGTTGAGGTTTATGCTGAGTTTACGTTTTAGTT	81355

BX677663.6	1651	TTAAAATGGCGTTTTAGAAGGAAAATGATCCACATCCACACTGGCGTTTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	81356	TTAAAATGGCGTTTTAGAAGGAAAATGATCCACATCCACACTGGCGTTTC	81405

BX677663.6	1701	ACCTAGCATTTCTAAACAGCTCTCTGTCCACACTATACTGCTGAAAAACG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	81406	ACCTAGCATTTCTAAACAGCTCTCTGTCCACACTATACTGCTGAAAAACG	81455

BX677663.6	1751	CACATCACGTCACCATACACACACACACACACACACACTCTGGCATGCGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	81456	CACATCACGTCACCATACACACACACACACACACACACTCTGGCATGCGC	81505

BX677663.6	1801	TGCAGCGATGAGAGCTGTGCACATCAGACTGTTCATCAAGGATTCTGTAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	81506	TGCAGCGATGAGAGCTGTGCACATCAGACTGTTCATCAAGGATTCTGTAC	81555

BX677663.6	1851	CGCTGGATCTAATCTCACTATATTTGTTAAACGTGATATTTAATTCATCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	81556	CGCTGGATCTAATCTCACTATATTTGTTAAACGTGATATTTAATTCATCT	81605

BX677663.6	1901	TGTTGTCTATATCTAATGACATATCCCCCCGACTTTGGTCTTCTCAATCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	81606	TGTTGTCTATATCTAATGACATATCCCCCCGACTTTGGTCTTCTCAATCT	81655

BX677663.6	1951	ATTACTTGTTCTCAGATAATGTGTTTTGGCTGAGTGGAAAGATACGTTAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649495.8	81656	ATTACTTGTTCTCAGATAATGTGTTTTGGCTGAGTGGAAAGATACGTTAA	81705

Overview

Query
BX677663.6 - 143503 bps
Hit
BX649495.8 - 81705 bps
Total alignments
15
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001928200012000179706817051
288.72851341639177216177491
385.2118741218272238183112291
482.9599216132475132690-1438345991
583.25811931296661298581439045921
6100591227813478255112125122461
7100591227813478255-112141122621
810040617849078550-114777148371
975.11964988647686973116286167711
1084.9550938710087192116893169851
1174.65453498061580963-117124174821
1291.771191588035580512-117588177451
1384.0756125101402101526-138219383311
1492.68324176387678-143130431701
151004389115150115238-174116742041
Short-link