<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX572081.6	1	ACCAAGCCAGATTCCTTTCCACTCCCACACATGGTTTTGATAGGGTAGAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	200462	ACCAAGCCAGATTCCTTTCCACTCCCACACATGGTTTTGATAGGGTAGAA	200511

BX572081.6	51	TCAGCCAGGTTTGTGTCAAAGCTTGATGCACCAGTGACTTTCCAAAGACT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	200512	TCAGCCAGGTTTGTGTCAAAGCTTGATGCACCAGTGACTTTCCAAAGACT	200561

BX572081.6	101	GATGCATATCATACTCAGAGGTATGCCCAACTGTAATATCTACCTAGATG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	200562	GATGCATATCATACTCAGAGGTATGCCCAACTGTAATATCTACCTAGATG	200611

BX572081.6	151	ACATCGTTATCTACTCTGAGTCCTAGGAAGACCATCTAAAGACCATGAAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	200612	ACATCGTTATCTACTCTGAGTCCTAGGAAGACCATCTAAAGACCATGAAA	200661

BX572081.6	201	GTGGTGTTTGAGAAGTTAAATGGTGCCTCTAACCTTAAACCTTGCCAAGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	200662	GTGGTGTTTGAGAAGTTAAATGGTGCCTCTAACCTTAAACCTTGCCAAGT	200711

BX572081.6	251	GTGAGATTGGCAAAGCCACTGTAACCTATCTAGGGAAGAAGGTAGGACAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	200712	GTGAGATTGGCAAAGCCACTGTAACCTATCTAGGGAAGAAGGTAGGACAC	200761

BX572081.6	301	GGTTGGATCAAACCTGTTGATGCCAAAGTTAAAGCCATCCTCGACTTTCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	200762	GGTTGGATCAAACCTGTTGATGCCAAAGTTAAAGCCATCCTCGACTTTCC	200811

BX572081.6	351	TAAACCCCACAACAAGCGTGAGCTTCGAAGGTTCCTAGGAATGGCTGGCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	200812	TAAACCCCACAACAAGCGTGAGCTTCGAAGGTTCCTAGGAATGGCTGGCT	200861

BX572081.6	401	ATTATAGAGGATTCTGTAGAAACTTTTCATCTTTTGTTTTACCCCTCACA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	200862	ATTATAGAGGATTCTGTAGAAACTTTTCATCTTTTGTTTTACCCCTCACA	200911

BX572081.6	451	AACTTGTTAAGCTTAACAAGAGTTTTCCAGTGGAATGCTGTCTGTACCCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	200912	AACTTGTTAAGCTTAACAAGAGTTTTCCAGTGGAATGCTGTCTGTACCCA	200961

BX572081.6	501	TGGTTTTTAAAGCGGCCAAAGATCTTCTCAGCTATGCTCCTATTCTTGCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	200962	TGGTTTTTAAAGCGGCCAAAGATCTTCTCAGCTATGCTCCTATTCTTGCA	201011

BX572081.6	551	GCACCTGACTTTAACCTTCCTGTCAAATTGCAAGTGGATGCCAGCCACTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	201012	GCACCTGACTTTAACCTTCCTGTCAAATTGCAAGTGGATGCCAGCCACTT	201061

BX572081.6	601	TGGTGCAGGAGCTTTTCTTGTACAGAAAGATGCTGAAGGCATTGAACATC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	201062	TGGTGCAGGAGCTTTTCTTGTACAGAAAGATGCTGAAGGCATTGAACATC	201111

BX572081.6	651	CGGTGTCCTACTTTTCACGAAAGTTACAGCACTTTTGAAAAGGAAGCTTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	201112	CGGTGTCCTACTTTTCACGAAAGTTACAGCACTTTTGAAAAGGAAGCTTT	201161

BX572081.6	701	GTCTTTACTCTGAGCTGTACAGCACTTTGAAGTCTACCTCAGTAGTACTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	201162	GTCTTTACTCTGAGCTGTACAGCACTTTGAAGTCTACCTCAGTAGTACTG	201211

BX572081.6	751	CTCAGCCAATCATTGTTTACACAGACCACAATCCACTAACTTTCCTGTCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	201212	CTCAGCCAATCATTGTTTACACAGACCACAATCCACTAACTTTCCTGTCC	201261

BX572081.6	801	AACATGTCCTCCTCAAACCAGCGTTTGTTACATTGGGCCTTGAAGTTACA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	201262	AACATGTCCTCCTCAAACCAGCGTTTGTTACATTGGGCCTTGAAGTTACA	201311

BX572081.6	851	AGACTTTAACATCCAAATCCAGGATATCAAGGGGGCCAACAATGTTGTAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	201312	AGACTTTAACATCCAAATCCAGGATATCAAGGGGGCCAACAATGTTGTAG	201361

BX572081.6	901	CAGATGCATTATCAATATCTGTGGATGACACTGCTTAAGTGGTGAAAAGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	201362	CAGATGCATTATCAATATCTGTGGATGACACTGCTTAAGTGGTGAAAAGG	201411

BX572081.6	951	TGGGATAGTAATTTTATTGAACTCTGGACTGTGTTCTCTATGGTTGAGTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	201412	TGGGATAGTAATTTTATTGAACTCTGGACTGTGTTCTCTATGGTTGAGTG	201461

BX572081.6	1001	TTACAGTCAAAACGTAATTGTGTGTGTAGGCTTTGCATATTGAGTTGTGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	201462	TTACAGTCAAAACGTAATTGTGTGTGTAGGCTTTGCATATTGAGTTGTGC	201511

BX572081.6	1051	TCCACCCTGCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTAGTTTGAAGCTTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	201512	TCCACCCTGCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTAGTTTGAAGCTTT	201561

BX572081.6	1101	CTGTTTGTTGTTTTAGAATATACTCACTCAGTTTTGACTTCTAGTTTCTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	201562	CTGTTTGTTGTTTTAGAATATACTCACTCAGTTTTGACTTCTAGTTTCTG	201611

BX572081.6	1151	TTAAAATTTTATATTTGTATTAAATAAATTCTTATGATTATTTTTTCTAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	201612	TTAAAATTTTATATTTGTATTAAATAAATTCTTATGATTATTTTTTCTAA	201661

BX572081.6	1201	ATTTTGTGTTGACTCTTCACTCTGGGTCTGAGGATTAAAGTGTGTTCTCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	201662	ATTTTGTGTTGACTCTTCACTCTGGGTCTGAGGATTAAAGTGTGTTCTCT	201711

BX572081.6	1251	ACGTTTATCTTCTTTTTTTAATTAGTTGCAATTCAATATTATTTACCAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	201712	ACGTTTATCTTCTTTTTTTAATTAGTTGCAATTCAATATTATTTACCAAA	201761

BX572081.6	1301	TTTTTGTCTTCTTTGTATATGCACGAGTCAATCGCTGCCCATTCTTGGCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	201762	TTTTTGTCTTCTTTGTATATGCACGAGTCAATCGCTGCCCATTCTTGGCC	201811

BX572081.6	1351	CTTACTTATTGATTGTATATTTATACATGTATATTCACATATATGTATAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	201812	CTTACTTATTGATTGTATATTTATACATGTATATTCACATATATGTATAT	201861

BX572081.6	1401	ATATTTACATACATACTCTCCTTTTCTTCTTTCCGGCTTCAAATTCCTCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	201862	ATATTTACATACATACTCTCCTTTTCTTCTTTCCGGCTTCAAATTCCTCC	201911

BX572081.6	1451	GCCTGGCAATTATTTGCCCTTTCTTTACTTCCTTACAGCGTTGACTGCTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	201912	GCCTGGCAATTATTTGCCCTTTCTTTACTTCCTTACAGCGTTGACTGCTT	201961

BX572081.6	1501	ACGTTAACTTTTACCCCTTCCTTTTATCTCCTCCCTTATCTCCTTATTCC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	201962	ACGTTAACTTTTACCCCTTCCTTTTATCTCCTCCCTTATCTCCTTATTCC	202011

BX572081.6	1551	TTAATTCCACCACTAATTTATTTTTCCAGCGTCAAGTTTTCTCCGATGTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	202012	TTAATTCCACCACTAATTTATTTTTCCAGCGTCAAGTTTTCTCCGATGTA	202061

BX572081.6	1601	TTCTTTCAGCGTTGATTATTCCGCTACTTACTTACTTCCGCTTAGACCCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	202062	TTCTTTCAGCGTTGATTATTCCGCTACTTACTTACTTCCGCTTAGACCCT	202111

BX572081.6	1651	CAATCTCCAGCTCTAACTCCCGCAGGTGTCACTAAAATGAGCTTCAACTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	202112	CAATCTCCAGCTCTAACTCCCGCAGGTGTCACTAAAATGAGCTTCAACTC	202161

BX572081.6	1701	CCGCAGGAGTTCATGCCCACCTCACCCCCTCTCATGCAGGAGTCTTCACT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	202162	CCGCAGGAGTTCATGCCCACCTCACCCCCTCTCATGCAGGAGTCTTCACT	202211

BX572081.6	1751	GCCCAAAACCTTTCCTGACACCTGCTAGAGCCTACCCAACCCCAGCTCTC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	202212	GCCCAAAACCTTTCCTGACACCTGCTAGAGCCTACCCAACCCCAGCTCTC	202261

BX572081.6	1801	ACTCTAAAGCCCCCGCTTACACTCCAGCAGGAGTCTTCTTTCCTTTGCCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	202262	ACTCTAAAGCCCCCGCTTACACTCCAGCAGGAGTCTTCTTTCCTTTGCCC	202311

BX572081.6	1851	CCACTCTTCCTTAGCTATAAACGTTATATCCAGCAGCCGGATATAGCATT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	202312	CCACTCTTCCTTAGCTATAAACGTTATATCCAGCAGCCGGATATAGCATT	202361

BX572081.6	1901	GTTACATCTGCTGTATAAGGTCACGAGCTATATAAGGCATTTTGGGGAGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	202362	GTTACATCTGCTGTATAAGGTCACGAGCTATATAAGGCATTTTGGGGAGT	202411

BX572081.6	1951	TCTCGAGATCTACCCGGGCTCTCTCCCGGGACAGAATGCCAAACAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572634.7	202412	TCTCGAGATCTACCCGGGCTCTCTCCCGGGACAGAATGCCAAACAAGCTT	202461

Overview

Query
BX572081.6 - 152148 bps
Hit
BX572634.7 - 202461 bps
Total alignments
20
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100195920001200012004622024611
289.1851684674528297-123504243621
395.3426434462446587-124518248601
481.16153512115764116275-138114386121
579.36131533119374119906-138118386451
691.275718035094651748-139337401501
798.312202364959849833-140150403861
889.951371988279882995141830420281
992.99123157123817123973-146584467401
1085.72125240123211123450-197390976201
1189.6566710161412261422411997141007571
1292.797901086324413352611025541036211
1389.862934488116081607-11065151069581
1489.715158028018280983-11069571077821
1591.49605876495985047311558761567451
1689.5124208505855079211567891570071
1792.13700936508105174511575961585361
1896.193193672317823544-11646761650421
1995.055216272248523111-11650461656721
2090.572413587452780911663341666941
Short-link