<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX571976.11	1	GAGAGGCTATGGTGAGGTTCAAGGCTTGACACTTTTTAGGGCACCAGGTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	151140	GAGAGGCTATGGTGAGGTTCAAGGCTTGACACTTTTTAGGGCACCAGGTT	151189

BX571976.11	51	TCATCTGGCTGGCCTGCTTGAATCTCCTCACTACCCTCCGGGCAGACAGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	151190	TCATCTGGCTGGCCTGCTTGAATCTCCTCACTACCCTCCGGGCAGACAGG	151239

BX571976.11	101	TGTCATGCACAGGGCATGGCTGGAGCTACGGCGGAAAAAGGCCCCGGTCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	151240	TGTCATGCACAGGGCATGGCTGGAGCTACGGCGGAAAAAGGCCCCGGTCA	151289

BX571976.11	151	TGTGATCCTGTGGTTCGGGACGAATGTAACTTTCCAGGAAGCTGAAATCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	151290	TGTGATCCTGTGGTTCGGGACGAATGTAACTTTCCAGGAAGCTGAAATCA	151339

BX571976.11	201	CAGTTGTAGAGATTGAGTAGAAGGTCTCGGTAGGCTCCCAGAAGAGCTCT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	151340	CAGTTGTAGAGATTGAGTAGAAGGTCTCGGTAGGCTCCCAGAAGAGCTCT	151389

BX571976.11	251	ACCATCCAGAGCCCTTTGCAGGCGGCTACTAGAATTGGTGAAAGCCTGCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	151390	ACCATCCAGAGCCCTTTGCAGGCGGCTACTAGAATTGGTGAAAGCCTGCT	151439

BX571976.11	301	GCACGTGATAAAGAGGCTCAAAAAGGTAAAATATGCCTGGATGTTGATTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	151440	GCACGTGATAAAGAGGCTCAAAAAGGTAAAATATGCCTGGATGTTGATTA	151489

BX571976.11	351	AAAAGCTGTCCAGTAAATGAGGAGCCACTGCGGGTTTGTGCAAACAGAAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	151490	AAAAGCTGTCCAGTAAATGAGGAGCCACTGCGGGTTTGTGCAAACAGAAG	151539

BX571976.11	401	GATGTGCTTCCGAGCTGCAGCACCACTAGTTTCTGCAAGGACACGGCTGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	151540	GATGTGCTTCCGAGCTGCAGCACCACTAGTTTCTGCAAGGACACGGCTGT	151589

BX571976.11	451	CATCGCACAGAGATTTCCATCTTTGCTCTGGGGAAGAGAAGTAGAGAAAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	151590	CATCGCACAGAGATTTCCATCTTTGCTCTGGGGAAGAGAAGTAGAGAAAT	151639

BX571976.11	501	TGAGATAATACGGCACTCTGAAACCACAGAGGACATTATAAGGCCACAGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	151640	TGAGATAATACGGCACTCTGAAACCACAGAGGACATTATAAGGCCACAGA	151689

BX571976.11	551	AGACCCAATTAGTTCAGCTTCATCTTTAATCAATCAGTTATTTGGGTAAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	151690	AGACCCAATTAGTTCAGCTTCATCTTTAATCAATCAGTTATTTGGGTAAG	151739

BX571976.11	601	AAATACCTGGAGCTTCAGTTAGGGGGGGGAAAACAGAGTACAATCTTAAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	151740	AAATACCTGGAGCTTCAGTTAGGGGGGGGAAAACAGAGTACAATCTTAAC	151789

BX571976.11	651	TAACTCTTTATTAAAGTCCAACACAATTCAGAAACCTTTTCTCCCTGCTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	151790	TAACTCTTTATTAAAGTCCAACACAATTCAGAAACCTTTTCTCCCTGCTG	151839

BX571976.11	701	AGAGGGAATGTGCAGCAACAATAGTGCTATTTTGAAGATCTGGATTGCTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	151840	AGAGGGAATGTGCAGCAACAATAGTGCTATTTTGAAGATCTGGATTGCTT	151889

BX571976.11	751	CCTCTTGTGGTGGTAATCATTTCACCGTTTTGGGGAAATACATAAAACTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	151890	CCTCTTGTGGTGGTAATCATTTCACCGTTTTGGGGAAATACATAAAACTG	151939

BX571976.11	801	AAAAATGAACAATCCACATACTGCACATACAAAAAAAGATTATGGGACTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	151940	AAAAATGAACAATCCACATACTGCACATACAAAAAAAGATTATGGGACTT	151989

BX571976.11	851	TCGCTCAAAATGAACAATTACTATATATAGCAGGAGGGTGGGAGAGACTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	151990	TCGCTCAAAATGAACAATTACTATATATAGCAGGAGGGTGGGAGAGACTG	152039

BX571976.11	901	ATAACGCTTGTAATTACGGCTGATGAAAGACTGATTGCGCGTGGCACATT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	152040	ATAACGCTTGTAATTACGGCTGATGAAAGACTGATTGCGCGTGGCACATT	152089

BX571976.11	951	AGGTTGTGCGAGTCGACGCTTGCTGGAAGTGCAAACAGCTGGTCCTTGAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	152090	AGGTTGTGCGAGTCGACGCTTGCTGGAAGTGCAAACAGCTGGTCCTTGAG	152139

BX571976.11	1001	GACATAATACAGCAGATTAATGATGAGATAATTGTAGAATTAATTATTGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	152140	GACATAATACAGCAGATTAATGATGAGATAATTGTAGAATTAATTATTGA	152189

BX571976.11	1051	TATTCCATCACTCGTTCCTTTGCAGCGGATGATGGGGGAATTTCTGGGTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	152190	TATTCCATCACTCGTTCCTTTGCAGCGGATGATGGGGGAATTTCTGGGTT	152239

BX571976.11	1101	GCATTTCTACAGGTTCTCTTTTCATTTCTTTCCATACAAACTCGCTTATT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	152240	GCATTTCTACAGGTTCTCTTTTCATTTCTTTCCATACAAACTCGCTTATT	152289

BX571976.11	1151	AAAGAAGTGATGACCTGAGAGTGATAAGCCTATAGAGATAATGTCATTTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	152290	AAAGAAGTGATGACCTGAGAGTGATAAGCCTATAGAGATAATGTCATTTA	152339

BX571976.11	1201	GATCCTCCAGAATTTTCTTGTCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACAGCTAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	152340	GATCCTCCAGAATTTTCTTGTCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACAGCTAA	152389

BX571976.11	1251	AGCTACATCCATAACCAAACATGAATTATAATTAAATTTGAGTCTCTATG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	152390	AGCTACATCCATAACCAAACATGAATTATAATTAAATTTGAGTCTCTATG	152439

BX571976.11	1301	CAAACTATAATTTAATGGAGGGCTTAAACTGTGCATAAAAATGCAGCCTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	152440	CAAACTATAATTTAATGGAGGGCTTAAACTGTGCATAAAAATGCAGCCTG	152489

BX571976.11	1351	GCATATGGACTTGAATGCAGATGAAACTGACTGCACATCAATAGATTGGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	152490	GCATATGGACTTGAATGCAGATGAAACTGACTGCACATCAATAGATTGGT	152539

BX571976.11	1401	TATTGCTGCTATACAGAATTGGGGCTCTAAAAATGCTGTAAAGTTTAGGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	152540	TATTGCTGCTATACAGAATTGGGGCTCTAAAAATGCTGTAAAGTTTAGGG	152589

BX571976.11	1451	AAGAAACTACACTACCTGACAAAATCTTGTCGTTAATTTCAGTTGTAAGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	152590	AAGAAACTACACTACCTGACAAAATCTTGTCGTTAATTTCAGTTGTAAGG	152639

BX571976.11	1501	GCAACAATAACTGGATTTCTGGTTGATCATTTGGAAAAGTGGAAGATGGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	152640	GCAACAATAACTGGATTTCTGGTTGATCATTTGGAAAAGTGGAAGATGGT	152689

BX571976.11	1551	AGATTTTTTCGATGAATCATCTGTTGAGCTGCGTCCCAATCATCTCAAAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	152690	AGATTTTTTCGATGAATCATCTGTTGAGCTGCGTCCCAATCATCTCAAAT	152739

BX571976.11	1601	ACTGCAGAAGACCCACATGGGCCCAGGATTCTCGCAGAAATCAGTCGTTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	152740	ACTGCAGAAGACCCACATGGGCCCAGGATTCTCGCAGAAATCAGTCGTTT	152789

BX571976.11	1651	GGTGAAGGAAAAATCGTGGTTTGGGGTTACATTCTGTATGGAGGTGTGCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	152790	GGTGAAGGAAAAATCGTGGTTTGGGGTTACATTCTGTATGGAGGTGTGCA	152839

BX571976.11	1701	AGGGATCTGCAGAGTGGATGGCAACATCAACAGCCTGAGGTATCAAGACA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	152840	AGGGATCTGCAGAGTGGATGGCAACATCAACAGCCTGAGGTATCAAGACA	152889

BX571976.11	1751	TTTGCGCTGCCCATTACAGTACAAACCACAGTAGAGGACAAATTCTTAAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	152890	TTTGCGCTGCCCATTACAGTACAAACCACAGTAGAGGACAAATTCTTAAG	152939

BX571976.11	1801	CAGGATAGCGCTCCTTCTCATACTTCAGCCTCCACATCAAAGTTTCTAAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	152940	CAGGATAGCGCTCCTTCTCATACTTCAGCCTCCACATCAAAGTTTCTAAA	152989

BX571976.11	1851	AGCAAAGAAAGTCAAGGTGCTCCAGGATTGGCCAGCCCATTCACCAGACA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	152990	AGCAAAGAAAGTCAAGGTGCTCCAGGATTGGCCAGCCCATTCACCAGACA	153039

BX571976.11	1901	TGAACATTACTGAGCATGTTTGGGGTAAAAATAAAGGAGGAGGCATTGAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	153040	TGAACATTACTGAGCATGTTTGGGGTAAAAATAAAGGAGGAGGCATTGAA	153089

BX571976.11	1951	GATGAATCTAAATGTTCTTGATGAACTGGATGAGTCCTGCATGAAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571971.4	153090	GATGAATCTAAATGTTCTTGATGAACTGGATGAGTCCTGCATGAAAGCTT	153139

Overview

Query
BX571976.11 - 183462 bps
Hit
BX571971.4 - 153139 bps
Total alignments
20
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100197620001200011511401531391
279.383101084127217128300-1528263581
395.524331273059733701643167411
483.239191714582374-133093340091
582.4147611194771748835-138043391681
684.6151110154053141545138143391681
784.4218035727613117158400587521
891.2190287174081174367165532658151
985.911783411252512865-191003913571
1081.4115135727613117-196211965651
1184.6117634127613101-11019121022491
1286.1547587414912364-11111031119831
1387.974507244090841631-11165501172811
1486.882915005813358632-11167791172811
1585.37270496478474834211167811172791
1687.62123737503975411-11176671180451
1784.221633461253012875-11367071370611
1889.831963017511675416-11367091370031
1991.77183243124311478131480551
2088.21157246124611485331487781
Short-link