<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL954314.8	1	AAGCTTAGATTTGTCCTCCTGCATGTTTTAGACCATATGGGGCACAGCAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	85560	AAGCTTAGATTTGTCCTCCTGCATGTTTTAGACCATATGGGGCACAGCAT	85609

AL954314.8	51	GTGTTTTAGGATATAACTCAGGTTTTTGAGCACACTTCGTTATTATTGTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	85610	GTGTTTTAGGATATAACTCAGGTTTTTGAGCACACTTCGTTATTATTGTT	85659

AL954314.8	101	CATTTATTCGTTTGTGGGAAATTAGAACTGAATTTAGAAATAGTTTTGAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	85660	CATTTATTCGTTTGTGGGAAATTAGAACTGAATTTAGAAATAGTTTTGAA	85709

AL954314.8	151	ACGAATATTTGCGCTTAACAAACAAAATTATTTATTTATAGACTAATTGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	85710	ACGAATATTTGCGCTTAACAAACAAAATTATTTATTTATAGACTAATTGA	85759

AL954314.8	201	ATTGTTTATTCTCAAAACACACCTATAACTCATTAAGAAAATAAACTCAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	85760	ATTGTTTATTCTCAAAACACACCTATAACTCATTAAGAAAATAAACTCAA	85809

AL954314.8	251	CCCTTTTAGACCATGCGCCACGGCGCAAAGCGGATTTTCCCGTCCTTAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	85810	CCCTTTTAGACCATGCGCCACGGCGCAAAGCGGATTTTCCCGTCCTTAAA	85859

AL954314.8	301	TTAGCAAAATTGCGTTCTGACACGCCCTGAAAGTGTTTGCGCCCTGCATT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	85860	TTAGCAAAATTGCGTTCTGACACGCCCTGAAAGTGTTTGCGCCCTGCATT	85909

AL954314.8	351	TTGCGCTCTGCGCATGGACCGTCAAAATAGAGCCCTATGTGTCAAGCCCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	85910	TTGCGCTCTGCGCATGGACCGTCAAAATAGAGCCCTATGTGTCAAGCCCA	85959

AL954314.8	401	TTTTTATGACCATTAGCCATCAAAGACATTAGCATTGAATTTTTGTTTAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	85960	TTTTTATGACCATTAGCCATCAAAGACATTAGCATTGAATTTTTGTTTAG	86009

AL954314.8	451	TATAATAAAGTTTTAAAGATTCGCTATCAATTTATGATTCTTGAAAGTGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	86010	TATAATAAAGTTTTAAAGATTCGCTATCAATTTATGATTCTTGAAAGTGA	86059

AL954314.8	501	TCAAGAAGTAGTTACTTTCAGAAGAGCATTAAAGATGATTTTTACCTGAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	86060	TCAAGAAGTAGTTACTTTCAGAAGAGCATTAAAGATGATTTTTACCTGAA	86109

AL954314.8	551	ACTGTCGTTCTTTGTTATTTTGAGAAATCTTTGACTGAGATTTTGAGAAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	86110	ACTGTCGTTCTTTGTTATTTTGAGAAATCTTTGACTGAGATTTTGAGAAA	86159

AL954314.8	601	AAACACAGAGGCAATACAAAATTAATACCTGATGATCAGGTCTTATGAAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	86160	AAACACAGAGGCAATACAAAATTAATACCTGATGATCAGGTCTTATGAAG	86209

AL954314.8	651	CAAAGCCATCAAACTGTGCAAGAAACTGAATATTATTTACAACATTTCTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	86210	CAAAGCCATCAAACTGTGCAAGAAACTGAATATTATTTACAACATTTCTA	86259

AL954314.8	701	GCCCAGCTTCAGTGAATATCCCTGAACCAGATCACAACAGTTCACAGCAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	86260	GCCCAGCTTCAGTGAATATCCCTGAACCAGATCACAACAGTTCACAGCAT	86309

AL954314.8	751	GCAACTTTGAGTGAACTACTGCTTTAAAGAGATAGTATCCTCACCATTTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	86310	GCAACTTTGAGTGAACTACTGCTTTAAAGAGATAGTATCCTCACCATTTC	86359

AL954314.8	801	CTCAAGTGATTCTGAAATTTTACGGATTTCTTTCTTCTGTTGAACCAAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	86360	CTCAAGTGATTCTGAAATTTTACGGATTTCTTTCTTCTGTTGAACCAAAA	86409

AL954314.8	851	ACAATCTATTTTGAAGAATATTGTACGATGGAGAAAACATTCAAACTCCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	86410	ACAATCTATTTTGAAGAATATTGTACGATGGAGAAAACATTCAAACTCCA	86459

AL954314.8	901	GACAGAAATGTTAACTGGCTCAGCCAGGACCCGAACCAGCGACCTTCAGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	86460	GACAGAAATGTTAACTGGCTCAGCCAGGACCCGAACCAGCGACCTTCAGA	86509

AL954314.8	951	TTTGCTGAAGCTCAATAAATAAATGCACCAATAAAGTTAATAATTGTCCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	86510	TTTGCTGAAGCTCAATAAATAAATGCACCAATAAAGTTAATAATTGTCCC	86559

AL954314.8	1001	TCTTCATGTGTGTCCAAGAAGTGAGTTTACAGATGTGTGGTTTACTCACA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	86560	TCTTCATGTGTGTCCAAGAAGTGAGTTTACAGATGTGTGGTTTACTCACA	86609

AL954314.8	1051	TCTCCAGCCAGTTAATCCATCGCAACTACAAACCCTCTCTAATTTCCTTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	86610	TCTCCAGCCAGTTAATCCATCGCAACTACAAACCCTCTCTAATTTCCTTC	86659

AL954314.8	1101	AGCCGCTTTCATACGTTTATCACCATATTATTATCAGTTCTGTTTTGTGC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	86660	AGCCGCTTTCATACGTTTATCACCATATTATTATCAGTTCTGTTTTGTGC	86709

AL954314.8	1151	CTCTTTGTGAATTTGAAGAGTGTTTGTTGTTTGCTGGTTGCTACTTCTGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	86710	CTCTTTGTGAATTTGAAGAGTGTTTGTTGTTTGCTGGTTGCTACTTCTGA	86759

AL954314.8	1201	TGTCTGTATGACCTTCATTATGACACATGCAAATCACGAGGCTGATAGCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	86760	TGTCTGTATGACCTTCATTATGACACATGCAAATCACGAGGCTGATAGCA	86809

AL954314.8	1251	TTTCCATCATCAGCAGACAGAGGCGTCTTTCCTCGATCTGCACACACTGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	86810	TTTCCATCATCAGCAGACAGAGGCGTCTTTCCTCGATCTGCACACACTGA	86859

AL954314.8	1301	GATCTTCACTTCGGTCAGTGACACACTGCAGATGCATTCATATATTGTTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	86860	GATCTTCACTTCGGTCAGTGACACACTGCAGATGCATTCATATATTGTTT	86909

AL954314.8	1351	CTTACACTGACAGGACAGTATATGATATTTAGTGGAGGTAAAAAGCTTTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	86910	CTTACACTGACAGGACAGTATATGATATTTAGTGGAGGTAAAAAGCTTTT	86959

AL954314.8	1401	GAATACAAAAGTCAAACTATAAAGAAATATAGGAATAAATGCATTAGCAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	86960	GAATACAAAAGTCAAACTATAAAGAAATATAGGAATAAATGCATTAGCAA	87009

AL954314.8	1451	AATGATGTGCAAGGAAACTGTTTGTTTTTATAATTGTACCTGTTTATATA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	87010	AATGATGTGCAAGGAAACTGTTTGTTTTTATAATTGTACCTGTTTATATA	87059

AL954314.8	1501	AGAGTTTATATGATTACACTGTAATTTGATTATCATTTATGACCACATTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	87060	AGAGTTTATATGATTACACTGTAATTTGATTATCATTTATGACCACATTG	87109

AL954314.8	1551	ACAGAATTTGAGTCCTTAATTTTTTTATTTACTTTAATTTATTTTAAAAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	87110	ACAGAATTTGAGTCCTTAATTTTTTTATTTACTTTAATTTATTTTAAAAT	87159

AL954314.8	1601	ATTTTATTATACTTTTGTTTATTTTATTATACTTTGATTTGAGAAATTAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	87160	ATTTTATTATACTTTTGTTTATTTTATTATACTTTGATTTGAGAAATTAA	87209

AL954314.8	1651	CTGTATTTTTACTTCATTTATTTTTTCTTCTCCTCTCTGGATTCTTTTGC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	87210	CTGTATTTTTACTTCATTTATTTTTTCTTCTCCTCTCTGGATTCTTTTGC	87259

AL954314.8	1701	TCCATAGTTTTGTATATCCAGTTTAAAAAGCGCTGTGTATCCTGAATCTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	87260	TCCATAGTTTTGTATATCCAGTTTAAAAAGCGCTGTGTATCCTGAATCTA	87309

AL954314.8	1751	CATGTAAATGTTGAAATGAACGCAATAAAAATCTAAATGATCAAAAATAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	87310	CATGTAAATGTTGAAATGAACGCAATAAAAATCTAAATGATCAAAAATAA	87359

AL954314.8	1801	AAGTGCATTTGTGTACTTCATTAGTACACAAGTAATTAATGTTTGATATT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	87360	AAGTGCATTTGTGTACTTCATTAGTACACAAGTAATTAATGTTTGATATT	87409

AL954314.8	1851	TTGTTATATACTGTAGTGACTTGATCTAAATCAGACATAATTTATGATTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	87410	TTGTTATATACTGTAGTGACTTGATCTAAATCAGACATAATTTATGATTT	87459

AL954314.8	1901	TGGGGATTTTTAATGTATATTATTCCACCAAACACACAAACATAGTATAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	87460	TGGGGATTTTTAATGTATATTATTCCACCAAACACACAAACATAGTATAA	87509

AL954314.8	1951	TATGTATACATCAAATTTTATGACATCTGTGTTTAATCAAATAATACCTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571814.10	87510	TATGTATACATCAAATTTTATGACATCTGTGTTTAATCAAATAATACCTC	87559

Overview

Query
AL954314.8 - 81294 bps
Hit
BX571814.10 - 87559 bps
Total alignments
20
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001911200012000185560875591
287.511823060277605061151217431
385.532134882653727024-1152019961
483.461443884587146258-1152019001
586.8316129671947489-1705573731
686.0219737741622419981705674201
789.4110917147439476091705672251
884.918718847663478501719573731
985.241523534587146223-118671190291
1086.352244732650626978-118679191541
1193.811542088106881275-118855190641
1286.471012105042650635-118909191151
1393.11822023637536576-124538247401
1484.52841715928459454128850290171
1591.3991384773647873137170373071
1690.172794042443324836138046384521
1785.372275122650427015139263397681
1892.831882646052360786-139301395651
1992.691552198106581283139354395721
2087.379617171807350-167904680851
Short-link