<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX649210.7	1	CAGCCAGGCTTTATCTTCCACCCATGTTAAGATTCAGTAGGTGGACCAAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	66686	CAGCCAGGCTTTATCTTCCACCCATGTTAAGATTCAGTAGGTGGACCAAG	66735

BX649210.7	51	GAATAAAAGTGGACATTTGTCCTTGCTCACCTAAGTGGAATTTGTTCATC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	66736	GAATAAAAGTGGACATTTGTCCTTGCTCACCTAAGTGGAATTTGTTCATC	66785

BX649210.7	101	TCTGGAATTTGGAATTTTTATACTTTTGGATCTATGGTTCATTAAAATAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	66786	TCTGGAATTTGGAATTTTTATACTTTTGGATCTATGGTTCATTAAAATAT	66835

BX649210.7	151	TAAAAATAAGATTATTTTCCAGTTTATCCATTTAGTTTAGTCTATATTTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	66836	TAAAAATAAGATTATTTTCCAGTTTATCCATTTAGTTTAGTCTATATTTT	66885

BX649210.7	201	TTGTTCTTATATTACTAGTGACAATTCTTGTAATTTTCTACCTCCTAACT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	66886	TTGTTCTTATATTACTAGTGACAATTCTTGTAATTTTCTACCTCCTAACT	66935

BX649210.7	251	GGCATTATGGTTAATGGTTTTTTCCCAATCCATGTTGATAATCCCACATA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	66936	GGCATTATGGTTAATGGTTTTTTCCCAATCCATGTTGATAATCCCACATA	66985

BX649210.7	301	ACTTACTTAAAGCCCTGTATATTATTCTTTTTTATGGCTATACCACAATT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	66986	ACTTACTTAAAGCCCTGTATATTATTCTTTTTTATGGCTATACCACAATT	67035

BX649210.7	351	TACCTTTCTTCTATCTAAATATTAAAAATGTTTCTTTTCCCTCCTGTTAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	67036	TACCTTTCTTCTATCTAAATATTAAAAATGTTTCTTTTCCCTCCTGTTAC	67085

BX649210.7	401	ATTTTTTATATGTAATCATGGACATACAAAGTAAAATGTATCGAGACTGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	67086	ATTTTTTATATGTAATCATGGACATACAAAGTAAAATGTATCGAGACTGT	67135

BX649210.7	451	AAAAGTCTGGAGTGGAAATACTGTATTATCCAAACTACTCACGGGGTTAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	67136	AAAAGTCTGGAGTGGAAATACTGTATTATCCAAACTACTCACGGGGTTAC	67185

BX649210.7	501	ACCTATATATGCTCACAGTGCTCCACACAGCACCGAATGTCATCCTGCAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	67186	ACCTATATATGCTCACAGTGCTCCACACAGCACCGAATGTCATCCTGCAA	67235

BX649210.7	551	TGTGCTGTCACTTCACATACTGCATAGTTTTTATGATGTACAAAAGTTTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	67236	TGTGCTGTCACTTCACATACTGCATAGTTTTTATGATGTACAAAAGTTTT	67285

BX649210.7	601	CTAATCAAGACAAATTTTCAGTTTTTCTTTTAGAATTTGGAAATGTTTTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	67286	CTAATCAAGACAAATTTTCAGTTTTTCTTTTAGAATTTGGAAATGTTTTT	67335

BX649210.7	651	GTTATTCCGTACTGTGGCTCAAAAAACGACAAATTTTATGTCTCCCTGGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	67336	GTTATTCCGTACTGTGGCTCAAAAAACGACAAATTTTATGTCTCCCTGGG	67385

BX649210.7	701	CTCATGTAAGATTGTTTAAGACAGATGTTTAGAATGGTTTTTTTGTTGTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	67386	CTCATGTAAGATTGTTTAAGACAGATGTTTAGAATGGTTTTTTTGTTGTT	67435

BX649210.7	751	TTCATCTAGCATGTAACAATTGCATTTTGAGTTTTAATAGATATTCCCGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	67436	TTCATCTAGCATGTAACAATTGCATTTTGAGTTTTAATAGATATTCCCGC	67485

BX649210.7	801	ACTGCCATCCACTCGCAATCCTAATAATATGAGAGAATCTATTCCCATAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	67486	ACTGCCATCCACTCGCAATCCTAATAATATGAGAGAATCTATTCCCATAG	67535

BX649210.7	851	AATCTTCTAAATCCTTGATTTTAAAACAAACTATTTTACTTGCCAATTTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	67536	AATCTTCTAAATCCTTGATTTTAAAACAAACTATTTTACTTGCCAATTTT	67585

BX649210.7	901	GCTGGGGGAGAAATAGTTTATTACATTGCTGTTTGAATTTGAATTTTTCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	67586	GCTGGGGGAGAAATAGTTTATTACATTGCTGTTTGAATTTGAATTTTTCC	67635

BX649210.7	951	GTTCATTGGTGAGTTTCAGCAAATATTTATATTTATTGACTACTGGAAGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	67636	GTTCATTGGTGAGTTTCAGCAAATATTTATATTTATTGACTACTGGAAGA	67685

BX649210.7	1001	TTCTCTTCTATAGTCGGTCTTTATCCTTTGCCCAATTTTCTGTGGCATTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	67686	TTCTCTTCTATAGTCGGTCTTTATCCTTTGCCCAATTTTCTGTGGCATTT	67735

BX649210.7	1051	CCATTAATTTATTGATTGATTAGTTAACAATTTTTTTTTTTTTTTGACGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	67736	CCATTAATTTATTGATTGATTAGTTAACAATTTTTTTTTTTTTTTGACGG	67785

BX649210.7	1101	AGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGGTTCAGTGGCGCGATCTGGGCTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	67786	AGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGGTTCAGTGGCGCGATCTGGGCTC	67835

BX649210.7	1151	ACTGCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	67836	ACTGCAAACTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCTTCAGCCTCT	67885

BX649210.7	1201	CGAATAGCTGGGACTATAGGCGCCCGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	67886	CGAATAGCTGGGACTATAGGCGCCCGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTTT	67935

BX649210.7	1251	TGTATTTTTAGTAGAGACGGGGATTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	67936	TGTATTTTTAGTAGAGACGGGGATTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTC	67985

BX649210.7	1301	GATCTCCTGACTTCGTGATCAGCCCACCTCGGCCTCCTAAAGTGCTGGGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	67986	GATCTCCTGACTTCGTGATCAGCCCACCTCGGCCTCCTAAAGTGCTGGGA	68035

BX649210.7	1351	TTACAGGCGTGAGCCTCCGCGCCTGGCCAACAATTTTTTTTATAAGAAAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	68036	TTACAGGCGTGAGCCTCCGCGCCTGGCCAACAATTTTTTTTATAAGAAAG	68085

BX649210.7	1401	TTATCCCATTGTCTGCCTTATATGATCAAAATTTTTCCTGAGCTTCATAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	68086	TTATCCCATTGTCTGCCTTATATGATCAAAATTTTTCCTGAGCTTCATAT	68135

BX649210.7	1451	ACTTCTTTTAATTTTGTGATTTTCTTCATGCAAAGAAATCAGTAATTTTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	68136	ACTTCTTTTAATTTTGTGATTTTCTTCATGCAAAGAAATCAGTAATTTTC	68185

BX649210.7	1501	TTTTCTGTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTGAGGCGGAGTCTCTCTCTGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	68186	TTTTCTGTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTGAGGCGGAGTCTCTCTCTGT	68235

BX649210.7	1551	CGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTACGATCTCAGCTCACTGCAAACTCCGC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	68236	CGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTACGATCTCAGCTCACTGCAAACTCCGC	68285

BX649210.7	1601	CTCCCGGATTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAATAGCTGGGAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	68286	CTCCCGGATTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAATAGCTGGGAC	68335

BX649210.7	1651	TACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAACTTTTTGTGTTTTTAGTAGGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	68336	TACAGGCGCCTGCCACCACGCCTGGCTAACTTTTTGTGTTTTTAGTAGGG	68385

BX649210.7	1701	ATGGGGTTTCACCTTGTTAGTCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACGTCGTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	68386	ATGGGGTTTCACCTTGTTAGTCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACGTCGTG	68435

BX649210.7	1751	ATCCGCCCACCTCGGTCTCCCAAAGTGCAGGGATTACAGGCGTGAGCCAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	68436	ATCCGCCCACCTCGGTCTCCCAAAGTGCAGGGATTACAGGCGTGAGCCAC	68485

BX649210.7	1801	CGCAGCCGGCCAGAAATCAGTAATTTTCTTGCAATATTGTTTTCATTTGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	68486	CGCAGCCGGCCAGAAATCAGTAATTTTCTTGCAATATTGTTTTCATTTGT	68535

BX649210.7	1851	GTCTTCTGGATTTTGTCTTGCTTACCAACTCTTATTTTTTAAAAAAGAAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	68536	GTCTTCTGGATTTTGTCTTGCTTACCAACTCTTATTTTTTAAAAAAGAAT	68585

BX649210.7	1901	TATTTTGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	68586	TATTTTGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA	68635

BX649210.7	1951	GGCTGAGGTGGGCAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTGAGACCAGCCTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571807.5	68636	GGCTGAGGTGGGCAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTGAGACCAGCCTGGCC	68685

Overview

Query
BX649210.7 - 11133 bps
Hit
BX571807.5 - 68685 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link