<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX511214.8	1	AAGCTTAAACTTTGCAACGCATTGAACTGCGAAACTTTACGCACGAACGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	75034	AAGCTTAAACTTTGCAACGCATTGAACTGCGAAACTTTACGCACGAACGT	75083

BX511214.8	51	TTCCGGTCTGACACATTCGTCTATGAAAGGAAGTCTATGGGGAGAAAAGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	75084	TTCCGGTCTGACACATTCGTCTATGAAAGGAAGTCTATGGGGAGAAAAGT	75133

BX511214.8	101	CCAGTGTGACCGTGGCTCAAGTGCAAGTGAATGGTTTCTCTCCTGTGTGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	75134	CCAGTGTGACCGTGGCTCAAGTGCAAGTGAATGGTTTCTCTCCTGTGTGG	75183

BX511214.8	151	CTTACCATGTGTATATTAAGGCATGATGATTGACTGAATATCATACCACA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	75184	CTTACCATGTGTATATTAAGGCATGATGATTGACTGAATATCATACCACA	75233

BX511214.8	201	CTAAGTGCAAGAGAATGGTTCCTCTCCAGTGTGGTTCCTCATGTGTCGAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	75234	CTAAGTGCAAGAGAATGGTTCCTCTCCAGTGTGGTTCCTCATGTGTCGAT	75283

BX511214.8	251	TAAGGTTTGATGAGCAGTTAAAACTCTTCCCACACTTAGTGCATGTGAAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	75284	TAAGGTTTGATGAGCAGTTAAAACTCTTCCCACACTTAGTGCATGTGAAT	75333

BX511214.8	301	GGTTTCTCCCCAGTGTGGATCCTCATGTGTTTATTAAGAGATGTTGATTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	75334	GGTTTCTCCCCAGTGTGGATCCTCATGTGTTTATTAAGAGATGTTGATTG	75383

BX511214.8	351	GCTGAAACTCTTCCCACACAGAGTGCATGTAAATGGTTTCTCTCCAGTGT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	75384	GCTGAAACTCTTCCCACACAGAGTGCATGTAAATGGTTTCTCTCCAGTGT	75433

BX511214.8	401	GGACCCTCAAGTGTAGATTAAGGGATGATGATATGCTAAAACTCTTCCCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	75434	GGACCCTCAAGTGTAGATTAAGGGATGATGATATGCTAAAACTCTTCCCA	75483

BX511214.8	451	CACTGAGTGCATGTGTATGGTTTCTCTCCAGTGTGGATCCTCATGTGTAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	75484	CACTGAGTGCATGTGTATGGTTTCTCTCCAGTGTGGATCCTCATGTGTAG	75533

BX511214.8	501	ATTAAAGTTGAATGACTGACTGAAACTCTTCCCACACTGAGTGCATGTGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	75534	ATTAAAGTTGAATGACTGACTGAAACTCTTCCCACACTGAGTGCATGTGA	75583

BX511214.8	551	ATGGTTTCTTTCCAGTGTGGATCCTCTTGTGTTTATTAAGGTTTGATGAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	75584	ATGGTTTCTTTCCAGTGTGGATCCTCTTGTGTTTATTAAGGTTTGATGAG	75633

BX511214.8	601	CAGTTAAAACTCTTCCCACACTGAGTGCATGTGAATGGTTTCTCTCCGGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	75634	CAGTTAAAACTCTTCCCACACTGAGTGCATGTGAATGGTTTCTCTCCGGT	75683

BX511214.8	651	GTGGATCCTCATGTGTTCATTAAGGTGTTCTGATCGGTTGAAACTCTTCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	75684	GTGGATCCTCATGTGTTCATTAAGGTGTTCTGATCGGTTGAAACTCTTCC	75733

BX511214.8	701	CACACTGAGAGCATGTGAATGGTTTCTCTCCAGTGTGGATCCTCATGTGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	75734	CACACTGAGAGCATGTGAATGGTTTCTCTCCAGTGTGGATCCTCATGTGA	75783

BX511214.8	751	ATCTTAAGAATGTCTTTTCTTCCAAAACTCTTTCCACACTGAGTGCAGGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	75784	ATCTTAAGAATGTCTTTTCTTCCAAAACTCTTTCCACACTGAGTGCAGGT	75833

BX511214.8	801	GAAGCGATTTGTGTCTCTCCTTTTAAAAATACCATCAGTCTGTAAATGAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	75834	GAAGCGATTTGTGTCTCTCCTTTTAAAAATACCATCAGTCTGTAAATGAT	75883

BX511214.8	851	TTTTTTCCTCAATTTTGACATGATGTTCCTCCTCTTTACTCCCCTCGTAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	75884	TTTTTTCCTCAATTTTGACATGATGTTCCTCCTCTTTACTCCCCTCGTAC	75933

BX511214.8	901	TCTTCAATTAGGTCTGAAATTAAAAAAAAAATTAGTTTTCATTAAGTCTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	75934	TCTTCAATTAGGTCTGAAATTAAAAAAAAAATTAGTTTTCATTAAGTCTT	75983

BX511214.8	951	TAAAACTCTCATCAAAAGCTGAAAAGTGAAAAGACACTGGAAACATTGGC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	75984	TAAAACTCTCATCAAAAGCTGAAAAGTGAAAAGACACTGGAAACATTGGC	76033

BX511214.8	1001	TACACACACTAATTTTGATGCACATTAAATGTAAAATAAATGAGATCATA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	76034	TACACACACTAATTTTGATGCACATTAAATGTAAAATAAATGAGATCATA	76083

BX511214.8	1051	TTGTGTTTGGTCCATTAGCGTGTATACATTTAAGCAGATTCAAGTCATCT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	76084	TTGTGTTTGGTCCATTAGCGTGTATACATTTAAGCAGATTCAAGTCATCT	76133

BX511214.8	1101	TTATTTATCTAATGCTTTTACAGTGTTAATTGTGTCAAAGCCGCTTAACA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	76134	TTATTTATCTAATGCTTTTACAGTGTTAATTGTGTCAAAGCCGCTTAACA	76183

BX511214.8	1151	TAGAAGTTATAGTGAATTGAAACCATGTCAGTTCAGTTTTCCAAATCTAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	76184	TAGAAGTTATAGTGAATTGAAACCATGTCAGTTCAGTTTTCCAAATCTAT	76233

BX511214.8	1201	CTCCTATGCACGATGTCGCGATACTAGGATGGAGGCGAGGGGGAGTGAAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	76234	CTCCTATGCACGATGTCGCGATACTAGGATGGAGGCGAGGGGGAGTGAAG	76283

BX511214.8	1251	GCTGCACAGCACACAAGCCACTATTTCACTATACGAAGAAATGCTGTAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	76284	GCTGCACAGCACACAAGCCACTATTTCACTATACGAAGAAATGCTGTAAA	76333

BX511214.8	1301	ACTCCATCTCTGCCTCTCTCTCACTTTGGACACATGACCTGCTGCACTGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	76334	ACTCCATCTCTGCCTCTCTCTCACTTTGGACACATGACCTGCTGCACTGG	76383

BX511214.8	1351	CCTGTTTGTAAGGTAACTTTTCCTCTCCTCTTGTCTGTTTAAGCAATAAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	76384	CCTGTTTGTAAGGTAACTTTTCCTCTCCTCTTGTCTGTTTAAGCAATAAT	76433

BX511214.8	1401	TTTGGATCCGGACACGGGAGTGCCAGTGGTGCGAGTTTTCTCCACTGTGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	76434	TTTGGATCCGGACACGGGAGTGCCAGTGGTGCGAGTTTTCTCCACTGTGT	76483

BX511214.8	1451	CTATTACGGATTACCTGTGATAACAGTGTATTATGTGTGTTAAAGCACTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	76484	CTATTACGGATTACCTGTGATAACAGTGTATTATGTGTGTTAAAGCACTG	76533

BX511214.8	1501	GCACTCTTGCTCATTGTATTAAAATAAACCACTGAGGGGTTTATAATTAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	76534	GCACTCTTGCTCATTGTATTAAAATAAACCACTGAGGGGTTTATAATTAT	76583

BX511214.8	1551	GTTTCTGTGTATTATGGTACTGTAGTGATAATGTCATGTTTACATGCTTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	76584	GTTTCTGTGTATTATGGTACTGTAGTGATAATGTCATGTTTACATGCTTT	76633

BX511214.8	1601	ACGTCTCCACATTATACTGTTGATATTCATTGTTGCTACGCAACAATGTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	76634	ACGTCTCCACATTATACTGTTGATATTCATTGTTGCTACGCAACAATGTG	76683

BX511214.8	1651	CGCTCAACAATGTGCATAGACTGTAACCGCGGCTGTTCTTCCCGCCATCG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	76684	CGCTCAACAATGTGCATAGACTGTAACCGCGGCTGTTCTTCCCGCCATCG	76733

BX511214.8	1701	GTGAACAGCGCTTTCATTTCTAAAGCTGATCGCACCTTTTCTGTTGAGAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	76734	GTGAACAGCGCTTTCATTTCTAAAGCTGATCGCACCTTTTCTGTTGAGAA	76783

BX511214.8	1751	GGTGAAGACAATAACCAAAAATCAGAAAATATTATATAAAAATCTGAAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	76784	GGTGAAGACAATAACCAAAAATCAGAAAATATTATATAAAAATCTGAAAA	76833

BX511214.8	1801	TATGAAGTGTAAGACCAACTTAATTAAAAACAATCAAAATAAAACATTTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	76834	TATGAAGTGTAAGACCAACTTAATTAAAAACAATCAAAATAAAACATTTT	76883

BX511214.8	1851	AGAATACTAAATTATAGCAATAAGCCATTAAATATTTCATTTAACACCGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	76884	AGAATACTAAATTATAGCAATAAGCCATTAAATATTTCATTTAACACCGT	76933

BX511214.8	1901	AATATACACATTTTCTTTTCTTCCTTTTTTTCCATTTTCTTTCTTTTCTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	76934	AATATACACATTTTCTTTTCTTCCTTTTTTTCCATTTTCTTTCTTTTCTT	76983

BX511214.8	1951	TCTTTTATTTTTTTTACAATAAAATCTAAATCAAGTGAATTAGTGCAACA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571692.5	76984	TCTTTTATTTTTTTTACAATAAAATCTAAATCAAGTGAATTAGTGCAACA	77033

Overview

Query
BX511214.8 - 211331 bps
Hit
BX571692.5 - 77033 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001955200012000175034770331
286.954117659322593989-1158423571
384.57296695113055113749-1195626681
479.9821883611370411453919333101711
582.935091141133280134420112052131821
686.03255501155256155756-172561730541
787.478561521153401154921-173334748491
891.71259373103499103871-173857742301
982.82387941210391211331174103750391
1087.17408678101688102365-175105757821
1183.18263547203749175152756981
1283.62332678101304101981-175153758301
1384.92336630101520102149-175153757821
1482.9318684101550102233-175153758361
1583.28304628101268101895-175155757821
1684.24322628101436102063-175155757821
1784.02260513101130101642-175156756681
1884.72317602101718102319-175235758361
1983.18263547119665175236757821
2086.04286516101802102317-175321758361
2184.27357760150743151502-175442762231
Short-link