<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  BX640587.7	192743	GAATTCTGGGAATACTAAGTTAAGTTAAAATCTTGCAAAGATATAGTAAA	192694
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	80019	GAATTCTGGGAATACTAAGTTAAGTTAAAATCTTGCAAAGATATAGTAAA	80068

C  BX640587.7	192693	AAATAAACTTAGCCGGGTCACTTTAGACCCATGTTGTGCATCAAAAGGTT	192644
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	80069	AAATAAACTTAGCCGGGTCACTTTAGACCCATGTTGTGCATCAAAAGGTT	80118

C  BX640587.7	192643	AAACAGACCATGCAGATTATGTATATGTTATGTAGGGTGGATAAGGTTCT	192594
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	80119	AAACAGACCATGCAGATTATGTATATGTTATGTAGGGTGGATAAGGTTCT	80168

C  BX640587.7	192593	GGGGCTCCAATTTGGGGAAATAAAAGTCTTCAGAACAGATCATGTTAAAG	192544
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	80169	GGGGCTCCAATTTGGGGAAATAAAAGTCTTCAGAACAGATCATGTTAAAG	80218

C  BX640587.7	192543	TGCTATGGCTGTTCCTCAGGATAATTATTGTTCAACAACAGAAAAAATAA	192494
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	80219	TGCTATGGCTGTTCCTCAGGATAATTATTGTTCAACAACAGAAAAAATAA	80268

C  BX640587.7	192493	TTTGCGGGGTTTAATCTGTAGCAAATAATGCATCTTTGCCACTTTCAGAA	192444
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	80269	TTTGCGGGGTTTAATCTGTAGCAAATAATGCATCTTTGCCACTTTCAGAA	80318

C  BX640587.7	192443	AGCAGCCGGGCATTCTAAACTGGTGAGAGAAGGGGGGGGGGGGGGGTCAA	192394
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	80319	AGCAGCCGGGCATTCTAAACTGGTGAGAGAAGGGGGGGGGGGGGGGTCAA	80368

C  BX640587.7	192393	TCAAGGGTGACCTCCAACCAACATGTCTAGAGCAAAGAATGAGAACCACT	192344
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	80369	TCAAGGGTGACCTCCAACCAACATGTCTAGAGCAAAGAATGAGAACCACT	80418

C  BX640587.7	192343	GGGTTAAATGACCTTTATGAAAGGACAAGAAAAACCTAGACCTGTTAGTG	192294
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	80419	GGGTTAAATGACCTTTATGAAAGGACAAGAAAAACCTAGACCTGTTAGTG	80468

C  BX640587.7	192293	ACGGCTTCCAACTGAATCACTCAGAAATTGGAGCAGTGAAATTATCCAAT	192244
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	80469	ACGGCTTCCAACTGAATCACTCAGAAATTGGAGCAGTGAAATTATCCAAT	80518

C  BX640587.7	192243	TAGACAAACCAGAAAAACAACATTAACTCTGCTTCTTTGCCCTTAGCTTT	192194
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	80519	TAGACAAACCAGAAAAACAACATTAACTCTGCTTCTTTGCCCTTAGCTTT	80568

C  BX640587.7	192193	AATACAAATGAGCAGCATGTTAGTATAATTGTAAAATGAAGCAGAGTCGT	192144
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	80569	AATACAAATGAGCAGCATGTTAGTATAATTGTAAAATGAAGCAGAGTCGT	80618

C  BX640587.7	192143	TTCACTTGCTTGTGTGTCAAAACAAATGACACATCATGAAGACTGATTAA	192094
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	80619	TTCACTTGCTTGTGTGTCAAAACAAATGACACATCATGAAGACTGATTAA	80668

C  BX640587.7	192093	GAATTTCTGACACCACAATGACCTTTAAACTGTTGCAACCGCTCTAACAT	192044
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	80669	GAATTTCTGACACCACAATGACCTTTAAACTGTTGCAACCGCTCTAACAT	80718

C  BX640587.7	192043	GCAGGAAAAACCCGAGAAAATCAGTTTCCTGTTATGGATCTTAACACCAA	191994
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	80719	GCAGGAAAAACCCGAGAAAATCAGTTTCCTGTTATGGATCTTAACACCAA	80768

C  BX640587.7	191993	AGGTATCTGTAACAGTTTGACAGCTTAAAACACACCCAGACATTAAATAC	191944
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	80769	AGGTATCTGTAACAGTTTGACAGCTTAAAACACACCCAGACATTAAATAC	80818

C  BX640587.7	191943	ATTTGATTAAAACAGACACATGCCAGCCATACAGCTTTCAATGGGAAATC	191894
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	80819	ATTTGATTAAAACAGACACATGCCAGCCATACAGCTTTCAATGGGAAATC	80868

C  BX640587.7	191893	TGGCTGGAGCCACAACATGCAAACACTGCAGCACTGCATTAGCAGGTATG	191844
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	80869	TGGCTGGAGCCACAACATGCAAACACTGCAGCACTGCATTAGCAGGTATG	80918

C  BX640587.7	191843	CGTCTGCAAGCATGCACGATCATGGAGCTGCAGTGAAAGCATTAGAACGC	191794
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	80919	CGTCTGCAAGCATGCACGATCATGGAGCTGCAGTGAAAGCATTAGAACGC	80968

C  BX640587.7	191793	AAATCCAATGCAATAAAATGCGCTCAAGCTAATGAAAGACAAAGAAAGTT	191744
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	80969	AAATCCAATGCAATAAAATGCGCTCAAGCTAATGAAAGACAAAGAAAGTT	81018

C  BX640587.7	191743	TGCCTTCCACTGCAGTGACTGCACAGGCTGTCTGCCACACTCAATTTAGC	191694
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	81019	TGCCTTCCACTGCAGTGACTGCACAGGCTGTCTGCCACACTCAATTTAGC	81068

C  BX640587.7	191693	GCCAGTCATCAGACTGAACAAATGACATTTCACTTACATGAGACGACTGG	191644
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	81069	GCCAGTCATCAGACTGAACAAATGACATTTCACTTACATGAGACGACTGG	81118

C  BX640587.7	191643	TGTTTCTATGAATCTTAAACAGCAAATCAACAAGTAAAGCGTCCAAATCG	191594
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	81119	TGTTTCTATGAATCTTAAACAGCAAATCAACAAGTAAAGCGTCCAAATCG	81168

C  BX640587.7	191593	ACAGCATTAGTGATGAGATCAGGAATGCAATGCTGCATAAGTCCATTGTA	191544
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	81169	ACAGCATTAGTGATGAGATCAGGAATGCAATGCTGCATAAGTCCATTGTA	81218

C  BX640587.7	191543	AATGCCCATACCTGGTAGACGTGCCCTTCCGTACATCACAGATGCTGCAT	191494
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	81219	AATGCCCATACCTGGTAGACGTGCCCTTCCGTACATCACAGATGCTGCAT	81268

C  BX640587.7	191493	TTGAAGGCTTCAGCACTGTTTCTGAAAGTGCACACGCTACAGTCCCAAAA	191444
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	81269	TTGAAGGCTTCAGCACTGTTTCTGAAAGTGCACACGCTACAGTCCCAAAA	81318

C  BX640587.7	191443	TCCGTTGTCCGCTGTCGGTTTGGCTTGTCTTTTTGGCCTTTAATGACAAG	191394
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	81319	TCCGTTGTCCGCTGTCGGTTTGGCTTGTCTTTTTGGCCTTTAATGACAAG	81368

C  BX640587.7	191393	AGAAGCTCAAATTATTAAGGTCAACTTTCACGTTTGCCCCCTAACATCCG	191344
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	81369	AGAAGCTCAAATTATTAAGGTCAACTTTCACGTTTGCCCCCTAACATCCG	81418

C  BX640587.7	191343	TCGACTCGAATGCGTTTAACCGAAGCGAAGTGGCACAGAAAGTGACAGAA	191294
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	81419	TCGACTCGAATGCGTTTAACCGAAGCGAAGTGGCACAGAAAGTGACAGAA	81468

C  BX640587.7	191293	AATCCGACACATGACGCGCGAGGACGGTTTATTAGAACCGGAAAATACTG	191244
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	81469	AATCCGACACATGACGCGCGAGGACGGTTTATTAGAACCGGAAAATACTG	81518

C  BX640587.7	191243	GAAACGCACGCTAACCAGCTAACTAGCCACGGTTATTCTCCACAGCTTCT	191194
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	81519	GAAACGCACGCTAACCAGCTAACTAGCCACGGTTATTCTCCACAGCTTCT	81568

C  BX640587.7	191193	AGTCACCAGAGACATGTAATTCACTTAAAGGGTCTAGATTGGTGTCCGCT	191144
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	81569	AGTCACCAGAGACATGTAATTCACTTAAAGGGTCTAGATTGGTGTCCGCT	81618

C  BX640587.7	191143	GGCACGGCAGCTAGCGTTAGCCAGAGAGCTAAAGATATCGCGTCGGTGAA	191094
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	81619	GGCACGGCAGCTAGCGTTAGCCAGAGAGCTAAAGATATCGCGTCGGTGAA	81668

C  BX640587.7	191093	CGGCGTGAAATCGAATGTCAAAAAACGTCCGTTTAACGGCTAACTTCGAT	191044
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	81669	CGGCGTGAAATCGAATGTCAAAAAACGTCCGTTTAACGGCTAACTTCGAT	81718

C  BX640587.7	191043	TAAAAACCCCGTCCGAAGAGGCCAGGCGTATCCCGTAGGAGAAAAATCTC	190994
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	81719	TAAAAACCCCGTCCGAAGAGGCCAGGCGTATCCCGTAGGAGAAAAATCTC	81768

C  BX640587.7	190993	TTTGTCTGAGAGGCACTGAGTCGTGTTTAGAGTCCTCTGTAAAGAAGAGA	190944
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	81769	TTTGTCTGAGAGGCACTGAGTCGTGTTTAGAGTCCTCTGTAAAGAAGAGA	81818

C  BX640587.7	190943	AAGCCGCCATAGCTGCGCTTGTTTCTGAGAGAAAGGAGAAACACTCCTCG	190894
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	81819	AAGCCGCCATAGCTGCGCTTGTTTCTGAGAGAAAGGAGAAACACTCCTCG	81868

C  BX640587.7	190893	AGAAAAGCATCCGAATATCCACCGAGCGAAAAAACAGCCGCGCGGACACC	190844
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	81869	AGAAAAGCATCCGAATATCCACCGAGCGAAAAAACAGCCGCGCGGACACC	81918

C  BX640587.7	190843	AAAATCGCCTCAGAAACTACCGACTGTTGACGCTTTCTTACCTGGTCGGG	190794
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	81919	AAAATCGCCTCAGAAACTACCGACTGTTGACGCTTTCTTACCTGGTCGGG	81968

C  BX640587.7	190793	CTCTTTTTGTCGCCCATTGTGGAAAAATAGACTCCCAGAAGACCGAAACG	190744
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX571677.10	81969	CTCTTTTTGTCGCCCATTGTGGAAAAATAGACTCCCAGAAGACCGAAACG	82018

Overview

Query
BX640587.7 - 192743 bps
Hit
BX571677.10 - 82018 bps
Total alignments
37
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
110019782000190744192743-180019820181
297.739881674161675031160716931
3100316334359344211160816701
4100347047100471691160816771
510031631597081597701160816701
697.73988167416167503-1160816941
710038781176521177291160916861
81003878117652117729-1161516921
910034704710047169-1162416931
1010031633435934421-1163116931
1198.513567159704159770-1163316991
1285.9858107139368139474-1182519311
131003061167449167509-1897990391
14100356534363344271898190451
1597.06316847110471771898190481
1610030611597121597721898190411
171003061117650117710-1898190411
181003061155030155090-1898190411
1994.445872145208145279114824148951
2087.7461105179216179320114929150341
2197.223236151367151402-114995150301
2292.1677102105999106100117781178821
2383.4346110859850499588117888189551
2497.7541894525245340122006220941
2597.7541899181791905122006220941
2697.754189150347150435-122006220941
27100408382188300-122012220941
2884.91341693172204172896-126671273791
29891322025601256213142661428601
3090.393134118420118553-142727428601
3185.792093835647056852143032434111
3282.8341998393084028-144754448521
331003030160214160243-144754447831
3484.7576184159909160092144935451111
3587.01941878364783833-144935451111
3686.8177154179870180023144968451111
3796.7240618649786557179620796801
Short-link