<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX539342.9	1	GGGTGACTGTGAGCACACCAGCATACACACAGCAGCTCACACTCACCTTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	212394	GGGTGACTGTGAGCACACCAGCATACACACAGCAGCTCACACTCACCTTC	212443

BX539342.9	51	TCTCTCAAGAATACTGAAGACTGGGGTATAGCTCAGTTGAAAGAGTGCTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	212444	TCTCTCAAGAATACTGAAGACTGGGGTATAGCTCAGTTGAAAGAGTGCTT	212493

BX539342.9	101	GCCTAGCATTCGTGAGACCCTGAGCTCAATCCCTATCACACAAAACTCAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	212494	GCCTAGCATTCGTGAGACCCTGAGCTCAATCCCTATCACACAAAACTCAG	212543

BX539342.9	151	GTATGGTGGCCCACACGTATAACTCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAAGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	212544	GTATGGTGGCCCACACGTATAACTCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAAGA	212593

BX539342.9	201	AGATCAGAAGTTCATGATCACCTTCAACTACACAGAAATTTGAGGCCAGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	212594	AGATCAGAAGTTCATGATCACCTTCAACTACACAGAAATTTGAGGCCAGC	212643

BX539342.9	251	CTTGGCTACTGGGATTCTGACTTTGTGTGTAAGATACCTTCTACCAATCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	212644	CTTGGCTACTGGGATTCTGACTTTGTGTGTAAGATACCTTCTACCAATCC	212693

BX539342.9	301	CTAAACATTCTAGGCAGCATTAGGTGGAAGGAAGGAAGCAAGGAAGGAAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	212694	CTAAACATTCTAGGCAGCATTAGGTGGAAGGAAGGAAGCAAGGAAGGAAG	212743

BX539342.9	351	GGAGGGAGGAAATTGTAAGTTAGAAAGAGAAAAAACAAACAAACAAACAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	212744	GGAGGGAGGAAATTGTAAGTTAGAAAGAGAAAAAACAAACAAACAAACAA	212793

BX539342.9	401	ACACAACTCTAGATAAGAATATTGTGGGCACTCAAAAACGCACAAGGCTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	212794	ACACAACTCTAGATAAGAATATTGTGGGCACTCAAAAACGCACAAGGCTG	212843

BX539342.9	451	CAGAGGGTGGCCCCACAGTCAACAGGACTAGACACAATACTAGATTTCTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	212844	CAGAGGGTGGCCCCACAGTCAACAGGACTAGACACAATACTAGATTTCTG	212893

BX539342.9	501	ATGAGGAGAGAGAAACAGATCATGAAACGACATATAGAATGTTTCAGACA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	212894	ATGAGGAGAGAGAAACAGATCATGAAACGACATATAGAATGTTTCAGACA	212943

BX539342.9	551	AAATCGAAGAGTATTAAAGAAATTAAGGCTAGACAGGGTGTCATACAGCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	212944	AAATCGAAGAGTATTAAAGAAATTAAGGCTAGACAGGGTGTCATACAGCT	212993

BX539342.9	601	TTAGTCACAGAGTCTGGGGTCTGTGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	212994	TTAGTCACAGAGTCTGGGGTCTGTGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACAT	213043

BX539342.9	651	AATGAGTTTCAGGACATCCAGGGCTACACAGGAAGACCCTGTCTCAAAAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	213044	AATGAGTTTCAGGACATCCAGGGCTACACAGGAAGACCCTGTCTCAAAAG	213093

BX539342.9	701	GAAAAAGAGAGAAAGGAATGAAGGAAAGACAAACCCCAAGTCAGTGGCTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	213094	GAAAAAGAGAGAAAGGAATGAAGGAAAGACAAACCCCAAGTCAGTGGCTA	213143

BX539342.9	751	ATCATCAGTGTCAAGTACTCCACTTGAGGAAGAACTACTGAGCTATGCTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	213144	ATCATCAGTGTCAAGTACTCCACTTGAGGAAGAACTACTGAGCTATGCTG	213193

BX539342.9	801	GGGTCACTGGTAACTCTAAGACACCAGATAAGCAAGAGCAGTCCATGATG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	213194	GGGTCACTGGTAACTCTAAGACACCAGATAAGCAAGAGCAGTCCATGATG	213243

BX539342.9	851	TGAGGAGCTCTGAGCTCTGAAGGGGTCTTGTAATTGTGTGGCTGGGCACA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	213244	TGAGGAGCTCTGAGCTCTGAAGGGGTCTTGTAATTGTGTGGCTGGGCACA	213293

BX539342.9	901	ATATCCAAGATATTAAAATCAACATAGCTGGTCCCAAAGCCACGAATACC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	213294	ATATCCAAGATATTAAAATCAACATAGCTGGTCCCAAAGCCACGAATACC	213343

BX539342.9	951	AACGTCCTTCCACATAGACCCTCAACAATGGCTGGTTTTAAAAACTGGAC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	213344	AACGTCCTTCCACATAGACCCTCAACAATGGCTGGTTTTAAAAACTGGAC	213393

BX539342.9	1001	AACAAAACTCCTATCAGCAAATTTTTGCAACTGTCTTTTGTTATTATCAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	213394	AACAAAACTCCTATCAGCAAATTTTTGCAACTGTCTTTTGTTATTATCAG	213443

BX539342.9	1051	TGGCTCTCTGTATAACAGGATTTTGCCCTTTTCTATTTTCTTTCCTTGAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	213444	TGGCTCTCTGTATAACAGGATTTTGCCCTTTTCTATTTTCTTTCCTTGAC	213493

BX539342.9	1101	AATAAACTAGGACCCTTTAATAAGATAGCTGCAATGCTTCCTTATTAACT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	213494	AATAAACTAGGACCCTTTAATAAGATAGCTGCAATGCTTCCTTATTAACT	213543

BX539342.9	1151	GGCCTCTTTCACTGGATAGACTGTACACAAAAACACTGCGTAGAGCCACA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	213544	GGCCTCTTTCACTGGATAGACTGTACACAAAAACACTGCGTAGAGCCACA	213593

BX539342.9	1201	GAGTTCTCCCACAGCTGTTGGTGAATGCTAATATACCCGATGGTTCTCGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	213594	GAGTTCTCCCACAGCTGTTGGTGAATGCTAATATACCCGATGGTTCTCGA	213643

BX539342.9	1251	GAGCACGCCTTACAAAGAAGACAGGAGCCAAGTGAGTTCCCTACAAACCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	213644	GAGCACGCCTTACAAAGAAGACAGGAGCCAAGTGAGTTCCCTACAAACCT	213693

BX539342.9	1301	ATATTAAGAGCAGTGACTCAAGAGCCAACCTGCTCGGCTCAGTACTCAGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	213694	ATATTAAGAGCAGTGACTCAAGAGCCAACCTGCTCGGCTCAGTACTCAGG	213743

BX539342.9	1351	ATCATCCCTCTCTGCTCCTGTGACCTTGGACAGGCTACTTAATATCTCTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	213744	ATCATCCCTCTCTGCTCCTGTGACCTTGGACAGGCTACTTAATATCTCTG	213793

BX539342.9	1401	TATCTGTTTCTTTGTAAAAGTTAGATAATAATAGAACCCATCTCACAGAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	213794	TATCTGTTTCTTTGTAAAAGTTAGATAATAATAGAACCCATCTCACAGAG	213843

BX539342.9	1451	CTGACATGAGGCTTAAATGAGTTAGTGTGAAAACATTCAGCACCATGCCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	213844	CTGACATGAGGCTTAAATGAGTTAGTGTGAAAACATTCAGCACCATGCCT	213893

BX539342.9	1501	GTTTCTCACTCACTACTACGGGAACACCAATGCCCTCAGATGTACAGGTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	213894	GTTTCTCACTCACTACTACGGGAACACCAATGCCCTCAGATGTACAGGTT	213943

BX539342.9	1551	TGCATTGCTTCCTTTGATATTAAAGTGTAAAAATCTAGTAATATGAAATA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	213944	TGCATTGCTTCCTTTGATATTAAAGTGTAAAAATCTAGTAATATGAAATA	213993

BX539342.9	1601	AAGGCGATACTACAGTCATTTTTTATTATACAGCTTTAGTGGCCCTTAGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	213994	AAGGCGATACTACAGTCATTTTTTATTATACAGCTTTAGTGGCCCTTAGA	214043

BX539342.9	1651	ACTCACTTTGTAGACCAGGATGGCCTCGAACTCAGAAATCCGCCTGCCTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	214044	ACTCACTTTGTAGACCAGGATGGCCTCGAACTCAGAAATCCGCCTGCCTT	214093

BX539342.9	1701	TGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGCGCCACCACGCTTGGCATAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	214094	TGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGCGCCACCACGCTTGGCATAG	214143

BX539342.9	1751	CAGATCATCCTTTTTTCTTGTGTGGAGGGAGTGTTTAAGAGATTTTCCTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	214144	CAGATCATCCTTTTTTCTTGTGTGGAGGGAGTGTTTAAGAGATTTTCCTG	214193

BX539342.9	1801	GTTCATGATATCTAGACTCATGGCTCTAATAAAAAGACAAACCGTCACCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	214194	GTTCATGATATCTAGACTCATGGCTCTAATAAAAAGACAAACCGTCACCT	214243

BX539342.9	1851	TCCTATTCTTCCTTCCTTTGGCTGAAAGAGCAGTTAGGCTTCAGGCAGCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	214244	TCCTATTCTTCCTTCCTTTGGCTGAAAGAGCAGTTAGGCTTCAGGCAGCA	214293

BX539342.9	1901	CTCCAGCTACTGCTTAGTCCAATACGATTTAATTACTTAATATATTATTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	214294	CTCCAGCTACTGCTTAGTCCAATACGATTTAATTACTTAATATATTATTC	214343

BX539342.9	1951	TTTTTCTTTGAGACAAGTCTCACTATGTGGCTCTGGCTGTCTTGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537302.12	214344	TTTTTCTTTGAGACAAGTCTCACTATGTGGCTCTGGCTGTCTTGGAATTC	214393

Overview

Query
BX539342.9 - 155752 bps
Hit
BX537302.12 - 214393 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link