<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX649514.8	1	GAATTCCATTCACTCATTTAATCAACTATTTGTTCAATTAGTCATTAATT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	142524	GAATTCCATTCACTCATTTAATCAACTATTTGTTCAATTAGTCATTAATT	142573

BX649514.8	51	TATTAATTACTATTAATTCAACTGTTCATTCATTCAATTAATTATTCATT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	142574	TATTAATTACTATTAATTCAACTGTTCATTCATTCAATTAATTATTCATT	142623

BX649514.8	101	CCATTATTGATTTAATTATCCATTATTTCATCCAGTTTTTCATTCATTCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	142624	CCATTATTGATTTAATTATCCATTATTTCATCCAGTTTTTCATTCATTCA	142673

BX649514.8	151	TTCCATTGTTAATTTATTTATTTATTCATTAATTCACCCATTGTTTATCC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	142674	TTCCATTGTTAATTTATTTATTTATTCATTAATTCACCCATTGTTTATCC	142723

BX649514.8	201	ATTTAATCAACTATTCATTTAATCATTCATTCAATTATTCAATTATTAAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	142724	ATTTAATCAACTATTCATTTAATCATTCATTCAATTATTCAATTATTAAT	142773

BX649514.8	251	TTAATTATTAATTAATTCAATTATTCATTCATTCTTTCTTTCAACCATTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	142774	TTAATTATTAATTAATTCAATTATTCATTCATTCTTTCTTTCAACCATTC	142823

BX649514.8	301	ATTCACTTCATCTCATTTTCTTTTTGTAAACAAAAAAGGTTAACCTGGCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	142824	ATTCACTTCATCTCATTTTCTTTTTGTAAACAAAAAAGGTTAACCTGGCC	142873

BX649514.8	351	TAAATAAAAGATGCCGTGTGAGTTGAGCGGCAGACCAGACGCGCGTGACG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	142874	TAAATAAAAGATGCCGTGTGAGTTGAGCGGCAGACCAGACGCGCGTGACG	142923

BX649514.8	401	TCAGACGCTGGCTGTCAATCAAAGCCCCATAAGCGCAACTACAGTAGAAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	142924	TCAGACGCTGGCTGTCAATCAAAGCCCCATAAGCGCAACTACAGTAGAAG	142973

BX649514.8	451	CTTATCGTTGAGGAGAGCGCAGCGTGTTCGCATTTCAGCCCGTAGTTTAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	142974	CTTATCGTTGAGGAGAGCGCAGCGTGTTCGCATTTCAGCCCGTAGTTTAT	143023

BX649514.8	501	GCATAGGCGTCGAAAAAACCCCGTTGTCTGCACTCGGATCCCTGGCATCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	143024	GCATAGGCGTCGAAAAAACCCCGTTGTCTGCACTCGGATCCCTGGCATCT	143073

BX649514.8	551	CTCGTTTTCCTCGGACTCCTGCCTTTATGAGATGGAGAAGAGGGCGCTTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	143074	CTCGTTTTCCTCGGACTCCTGCCTTTATGAGATGGAGAAGAGGGCGCTTT	143123

BX649514.8	601	GGTCATCCTGTTATTTTGTGCGCTTTGTAACGCTTTTTCTCTGCGCACGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	143124	GGTCATCCTGTTATTTTGTGCGCTTTGTAACGCTTTTTCTCTGCGCACGA	143173

BX649514.8	651	GCCTCAGGAAACCTGCCACAGTGTAAAGAGGTAAACGACATGTTAAAAAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	143174	GCCTCAGGAAACCTGCCACAGTGTAAAGAGGTAAACGACATGTTAAAAAA	143223

BX649514.8	701	ACATACAATTCTAAACCAATCATAATCTAGAATAGCTTTATTTCTGCATG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	143224	ACATACAATTCTAAACCAATCATAATCTAGAATAGCTTTATTTCTGCATG	143273

BX649514.8	751	TGATGTAAGTAGGCTAATTAAAATGAATCCTGACACCATGTTATATGGAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	143274	TGATGTAAGTAGGCTAATTAAAATGAATCCTGACACCATGTTATATGGAT	143323

BX649514.8	801	GGTATGATTGTGAGCTTCTAAAATGACTTTAACGCATGTTATTATTATTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	143324	GGTATGATTGTGAGCTTCTAAAATGACTTTAACGCATGTTATTATTATTG	143373

BX649514.8	851	TTATAACATATATATTTTGTCTACTCAATTATGGCTATGTATGCTGAAAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	143374	TTATAACATATATATTTTGTCTACTCAATTATGGCTATGTATGCTGAAAA	143423

BX649514.8	901	TGCGGTGTGAAAAATCAAAAAGTACATCTTGTTATGGACATTACAATGAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	143424	TGCGGTGTGAAAAATCAAAAAGTACATCTTGTTATGGACATTACAATGAT	143473

BX649514.8	951	CAGAGCCAAGAGGAGCGAGGATCCTATAATATGATGACGCAGCGCAGCTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	143474	CAGAGCCAAGAGGAGCGAGGATCCTATAATATGATGACGCAGCGCAGCTG	143523

BX649514.8	1001	ACCAATCAGATGGCGGCTCGATTGTTGTGTGTTATTATGCGCCTCGGTTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	143524	ACCAATCAGATGGCGGCTCGATTGTTGTGTGTTATTATGCGCCTCGGTTG	143573

BX649514.8	1051	TGTGTTGGAGCTTGTAAAAAGATTTGTTTTATTATTAACTTCAAACATTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	143574	TGTGTTGGAGCTTGTAAAAAGATTTGTTTTATTATTAACTTCAAACATTT	143623

BX649514.8	1101	TAACGCAACGTGAATGTCTGTTCTTCCTGCGTTTGAGTTGAAAGGCTGTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	143624	TAACGCAACGTGAATGTCTGTTCTTCCTGCGTTTGAGTTGAAAGGCTGTG	143673

BX649514.8	1151	CTGCTGATTTGCGTCATCCGTGTTTACATAAAAAGATGAAATTTAAAGGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	143674	CTGCTGATTTGCGTCATCCGTGTTTACATAAAAAGATGAAATTTAAAGGG	143723

BX649514.8	1201	CCACTGCGCCGGAAAATGAAGAATGGATGCTGGGCAGAATGACAGCCTCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	143724	CCACTGCGCCGGAAAATGAAGAATGGATGCTGGGCAGAATGACAGCCTCA	143773

BX649514.8	1251	GTTACCATTTTCTTTTTATGTATAGAAATTAAAAATTTGTATGTAAACAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	143774	GTTACCATTTTCTTTTTATGTATAGAAATTAAAAATTTGTATGTAAACAT	143823

BX649514.8	1301	TTAGCTTCAGCTTTCTTAAATTTGGAACAACATCAGGTGACTGGGCCAGC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	143824	TTAGCTTCAGCTTTCTTAAATTTGGAACAACATCAGGTGACTGGGCCAGC	143873

BX649514.8	1351	TGTCAACCCTCACAATTTAGGCAAGACAAGTTTATATGTATAGAACATTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	143874	TGTCAACCCTCACAATTTAGGCAAGACAAGTTTATATGTATAGAACATTT	143923

BX649514.8	1401	CATACACAATGTTAATTCAAAATGCTTTACATAAACGAGAATAAAAGAAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	143924	CATACACAATGTTAATTCAAAATGCTTTACATAAACGAGAATAAAAGAAA	143973

BX649514.8	1451	CAAGACAATAAAATAGTTAAAGAATTAAAAATGAATAAAAAATAGATTAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	143974	CAAGACAATAAAATAGTTAAAGAATTAAAAATGAATAAAAAATAGATTAA	144023

BX649514.8	1501	AATGTGTTTTTAAAAATGTGATAAAAGACATAATAGTGTGATCTGTCGGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	144024	AATGTGTTTTTAAAAATGTGATAAAAGACATAATAGTGTGATCTGTCGGT	144073

BX649514.8	1551	CGGTGCACAGTGCTCAATTTAGTAAAGAAAAAGATGCGATTTCAGTGTTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	144074	CGGTGCACAGTGCTCAATTTAGTAAAGAAAAAGATGCGATTTCAGTGTTG	144123

BX649514.8	1601	ATTTGAATGTGCCTAAAGTTGTGCCTAATTTATTAAAAAATCTGTTTGTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	144124	ATTTGAATGTGCCTAAAGTTGTGCCTAATTTATTAAAAAATCTGTTTGTT	144173

BX649514.8	1651	TCATTATTTCACTTTCAGATGAGAAAATATTCAATATTTCATGCTGAAAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	144174	TCATTATTTCACTTTCAGATGAGAAAATATTCAATATTTCATGCTGAAAT	144223

BX649514.8	1701	AAGCATGCATGTGCATGTTTATCAATTCAATTCAGTACTAAAACAGTGTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	144224	AAGCATGCATGTGCATGTTTATCAATTCAATTCAGTACTAAAACAGTGTG	144273

BX649514.8	1751	ATAAGGGCAAAAGGTTCAATATAGTTTAGATTTTTTCAACAATATATTTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	144274	ATAAGGGCAAAAGGTTCAATATAGTTTAGATTTTTTCAACAATATATTTT	144323

BX649514.8	1801	GCTGTTGACATCTTAATGCACTGAATACAGGCCCATAGCCAGGGTGAACT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	144324	GCTGTTGACATCTTAATGCACTGAATACAGGCCCATAGCCAGGGTGAACT	144373

BX649514.8	1851	CGGGTGGTTTGAAAGACCCACCACTCACTGACAAAGGTCCAAAATTTGTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	144374	CGGGTGGTTTGAAAGACCCACCACTCACTGACAAAGGTCCAAAATTTGTC	144423

BX649514.8	1901	CAATACTTCAGCACATTTGTCCTATTTTGACTGCTATGCCAACATTGTGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	144424	CAATACTTCAGCACATTTGTCCTATTTTGACTGCTATGCCAACATTGTGA	144473

BX649514.8	1951	AAATACATTAATTAATTTTCTTTTCGGCTTATTAGTCCCTTTATTAATCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470236.11	144474	AAATACATTAATTAATTTTCTTTTCGGCTTATTAGTCCCTTTATTAATCT	144523

Overview

Query
BX649514.8 - 152488 bps
Hit
BX470236.11 - 144523 bps
Total alignments
32
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100192420001200011425241445231
288.092394446303663479-160410481
386.34201412128333128744160410131
478.876426662718629831237026341
583.04601711176051177751246426341
685.03691671143901145561246826341
786.61591271160701161961250826341
890.6662108142945143052-1252826341
990.5355951152721153661254026341
101004662142947143008-1691769781
11100466262724627851691769781
1210046621144651145261691769781
1310046621152711153321691769781
1410048641161371162001691769801
1510046621176321176931691769781
1698.844786147241147326-1844085251
1798.8443851472361473201844085251
1897.673986147037147122-1844485291
1910044841139001139831844585281
2098.8539874687646962-1844685321
2197.8737968452784622-1844685391
2210040838530085382-1844685281
2396.9435101113882113982-1844685431
24100408346879469611844685281
25100408384537846191844685281
2698.85398785311853971844685321
2798.837839968999771-1844785291
28100398199693997731845085301
2994.922132561024110496137631378861
3085.921112059635696560-156110563151
3181.235130133304133433157242573581
3298.61357211389911397011196191196901
Short-link