<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX470142.4	56290	AAGCTTCGAAAGCAGCCATCACTAATGTTTGTGTCAGTGTGTCTGAGTAC	56339
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	1	AAGCTTCGAAAGCAGCCATCACTAATGTTTGTGTCAGTGTGTCTGAGTAC	50

BX470142.4	56340	CTGTTTTGAGCTGGATATCACTACTGTCTGAGGTGGTCTCTGCTGTAAAA	56389
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	51	CTGTTTTGAGCTGGATATCACTACTGTCTGAGGTGGTCTCTGCTGTAAAA	100

BX470142.4	56390	CATTTCGGATAAATTAAGTAAATTAAGAATTTGATGAAAAAATTAATAGT	56439
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	101	CATTTCGGATAAATTAAGTAAATTAAGAATTTGATGAAAAAATTAATAGT	150

BX470142.4	56440	ATTAAAATTATTTTTATTATTTTTTCAACTATAAGTCTAGAAGAAACAGA	56489
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	151	ATTAAAATTATTTTTATTATTTTTTCAACTATAAGTCTAGAAGAAACAGA	200

BX470142.4	56490	AAAGTTACAAAATTTTCAGCGATTTTGTTTGTTTTACGCCATATACATTT	56539
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	201	AAAGTTACAAAATTTTCAGCGATTTTGTTTGTTTTACGCCATATACATTT	250

BX470142.4	56540	TCTCACCTCTTTTTAAGCGTCGACGGGCAAGTTTAATCTGATCTTGCAGA	56589
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	251	TCTCACCTCTTTTTAAGCGTCGACGGGCAAGTTTAATCTGATCTTGCAGA	300

BX470142.4	56590	ATCTGGACCCAATCTCTTGGGCCAGGAAGCTTTTCAATTCCATTGGCAGT	56639
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	301	ATCTGGACCCAATCTCTTGGGCCAGGAAGCTTTTCAATTCCATTGGCAGT	350

BX470142.4	56640	GCAATACTTTTCTGTGAAAACTAAACACACACACACACGCACGCAAGCAC	56689
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	351	GCAATACTTTTCTGTGAAAACTAAACACACACACACACGCACGCAAGCAC	400

BX470142.4	56690	GCACGCACGCACGCACACACGCACACACACACACACACACACACACACAC	56739
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	401	GCACGCACGCACGCACACACGCACACACACACACACACACACACACACAC	450

BX470142.4	56740	ACACACACACACACACACACACACACACAGACAAATGAGTTTTTTTCATT	56789
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	451	ACACACACACACACACACACACACACACAGACAAATGAGTTTTTTTCATT	500

BX470142.4	56790	TACTGATCAAATAAGAAAAGAGGCCTTCTGGCATCAAAACAATAAATGAT	56839
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	501	TACTGATCAAATAAGAAAAGAGGCCTTCTGGCATCAAAACAATAAATGAT	550

BX470142.4	56840	TAAAGCATCTTTAATTTTTGGGCTGTGTACATTGAACTGGGTACTTTAAT	56889
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	551	TAAAGCATCTTTAATTTTTGGGCTGTGTACATTGAACTGGGTACTTTAAT	600

BX470142.4	56890	TATGTTTTTCTTTGTTTGTTTGCTTGATTTTTCAGAGCAAAGAATAATTA	56939
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	601	TATGTTTTTCTTTGTTTGTTTGCTTGATTTTTCAGAGCAAAGAATAATTA	650

BX470142.4	56940	ATACTACTTTACAAAAGACACACACTAAAATGTTCCTCAGACAACAAGAA	56989
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	651	ATACTACTTTACAAAAGACACACACTAAAATGTTCCTCAGACAACAAGAA	700

BX470142.4	56990	CAGTTTATATACTGAAAAGTCTTGTAATGCATATTTAGGACAAGATAGAT	57039
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	701	CAGTTTATATACTGAAAAGTCTTGTAATGCATATTTAGGACAAGATAGAT	750

BX470142.4	57040	CTGATGGGGCGACACGGTAGCTCAGTGGTGAGCACTGTCCTGTTGCCTCA	57089
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	751	CTGATGGGGCGACACGGTAGCTCAGTGGTGAGCACTGTCCTGTTGCCTCA	800

BX470142.4	57090	AAGCAAGAAGGTCTCTGGTTCCCGGCTGGGTCAGTTGGCATTTCTGTGTG	57139
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	801	AAGCAAGAAGGTCTCTGGTTCCCGGCTGGGTCAGTTGGCATTTCTGTGTG	850

BX470142.4	57140	GAGTTTGCATGTTCTTCCTGTGTTCGTGGGGCTGGAAGGGCATCAGCTGT	57189
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	851	GAGTTTGCATGTTCTTCCTGTGTTCGTGGGGCTGGAAGGGCATCAGCTGT	900

BX470142.4	57190	GTAAAACATATGCTGGATAAGTTGGCGGTTCATTCCTCTGTGGCGACCCC	57239
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	901	GTAAAACATATGCTGGATAAGTTGGCGGTTCATTCCTCTGTGGCGACCCC	950

BX470142.4	57240	TGATGAATAAAGGGACTAAGCCGAAGAAAAATGATTGAATGAATGAATGA	57289
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	951	TGATGAATAAAGGGACTAAGCCGAAGAAAAATGATTGAATGAATGAATGA	1000

BX470142.4	57290	ATAGGTCAGATGGCATATTAAAAGACTCTGCTCTACTTTAATACTAATCC	57339
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	1001	ATAGGTCAGATGGCATATTAAAAGACTCTGCTCTACTTTAATACTAATCC	1050

BX470142.4	57340	ATTGTCAATTTAAATTATTTTGAAACTTTGCCAATTTCCGTCAAACTGCT	57389
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	1051	ATTGTCAATTTAAATTATTTTGAAACTTTGCCAATTTCCGTCAAACTGCT	1100

BX470142.4	57390	GGGTTTTACCCATTTGTCAGGAAGGTTTTGATCATGTTTTTTTAAATGAG	57439
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	1101	GGGTTTTACCCATTTGTCAGGAAGGTTTTGATCATGTTTTTTTAAATGAG	1150

BX470142.4	57440	ATAAACTTGTGCATTATCACTTATATTTGAATAAGTCTAGGTCAGAATAT	57489
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	1151	ATAAACTTGTGCATTATCACTTATATTTGAATAAGTCTAGGTCAGAATAT	1200

BX470142.4	57490	TAAATATCTGTTACACTGAAAGACCACTACGTCCGATTTCATGATCTATT	57539
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	1201	TAAATATCTGTTACACTGAAAGACCACTACGTCCGATTTCATGATCTATT	1250

BX470142.4	57540	CCTTATTTTCTGTTTTTGCATTTTTTAAATTATTTTATTGCTTTGTTTTG	57589
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	1251	CCTTATTTTCTGTTTTTGCATTTTTTAAATTATTTTATTGCTTTGTTTTG	1300

BX470142.4	57590	CTGCAAAATATATAAACTTTATATAAGTAGCTAGCTGGCAGCTAGCAGTC	57639
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	1301	CTGCAAAATATATAAACTTTATATAAGTAGCTAGCTGGCAGCTAGCAGTC	1350

BX470142.4	57640	CACTGAAGCTAAGCAGTGCTGCGCCTGGTCAGTACTTGGATGGGAGACCA	57689
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	1351	CACTGAAGCTAAGCAGTGCTGCGCCTGGTCAGTACTTGGATGGGAGACCA	1400

BX470142.4	57690	GATGGAAAAGCTAGGTTGCTGCCGGAAGTGGTGTTAGTGAGGGCAGCATG	57739
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	1401	GATGGAAAAGCTAGGTTGCTGCCGGAAGTGGTGTTAGTGAGGGCAGCATG	1450

BX470142.4	57740	GGTGCTCAACCTGCGGTCTGTGTGGGCCCTTATGCCCCAGTATAGTGAAG	57789
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	1451	GGTGCTCAACCTGCGGTCTGTGTGGGCCCTTATGCCCCAGTATAGTGAAG	1500

BX470142.4	57790	GGGACAATATACTGCTTAGTCAGTCACATCTTTCAACTGAGATGTTAAAC	57839
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	1501	GGGACAATATACTGCTTAGTCAGTCACATCTTTCAACTGAGATGTTAAAC	1550

BX470142.4	57840	TCTTTGTTCGTTACAAATCTCAGGATGTTCCTCGAAAAAGAGTAGGGGTT	57889
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	1551	TCTTTGTTCGTTACAAATCTCAGGATGTTCCTCGAAAAAGAGTAGGGGTT	1600

BX470142.4	57890	TAACCCTGGCCAAATTTGCCCTCTGTCCTTCATGGCCATCTAACCATCCC	57939
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	1601	TAACCCTGGCCAAATTTGCCCTCTGTCCTTCATGGCCATCTAACCATCCC	1650

BX470142.4	57940	CATATCATAATTAGCTTCATCACTCTGTCTCCTGATGGATTCAGATTTCT	57989
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	1651	CATATCATAATTAGCTTCATCACTCTGTCTCCTGATGGATTCAGATTTCT	1700

BX470142.4	57990	GCCTTCCAATCTGTCCCAGCATGCATCAACATTTATCCTTTTTCCCATTA	58039
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	1701	GCCTTCCAATCTGTCCCAGCATGCATCAACATTTATCCTTTTTCCCATTA	1750

BX470142.4	58040	CTTTATTAGTATGATTATTTGACTAATGAATAAAGTGAACAAATTGTTTA	58089
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	1751	CTTTATTAGTATGATTATTTGACTAATGAATAAAGTGAACAAATTGTTTA	1800

BX470142.4	58090	ATATAAGAATGTTCAGTGCATTTGCCCGTCTCTTTGTAACTATTTTCAGG	58139
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	1801	ATATAAGAATGTTCAGTGCATTTGCCCGTCTCTTTGTAACTATTTTCAGG	1850

BX470142.4	58140	AGCCACCAATCTACAGTAGATCAGAGGTCCTGGAGACCTCGAGCAAACTT	58189
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	1851	AGCCACCAATCTACAGTAGATCAGAGGTCCTGGAGACCTCGAGCAAACTT	1900

BX470142.4	58190	AACGGCTGGATGACTGAAAACAACAGTTTTCCTATTTGTATAATTATGTG	58239
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	1901	AACGGCTGGATGACTGAAAACAACAGTTTTCCTATTTGTATAATTATGTG	1950

BX470142.4	58240	TCAATACTGTTAAATGTGATTTTGATATTATTGTTATTATGTGTATATTC	58289
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470186.11	1951	TCAATACTGTTAAATGTGATTTTGATATTATTGTTATTATGTGTATATTC	2000

Overview

Query
BX470142.4 - 58289 bps
Hit
BX470186.11 - 131089 bps
Total alignments
15
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001957200056290582891120001
283.48441091908919197-17578651
391.6831174133341449-18819991
479.9111646526467269311938898551
590441005667356772115811159101
679.91792112080221012-124438246511
784.58651622646926630192003921641
889.81001462075920904-11180081181541
997.736871677016856-11186131186991
1010030621012107311186131186741
1197.673686167601684511186141186991
121004082180281810911186141186951
1310045861802418109-11186181187031
14100306110131073-11186391186991
1585.3472145190341917811299421300911
Short-link