<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX005045.10	159813	AACATTTGTTTGGAACATTAATAAAAAGAAAAAAACCCACCAGTGAGCTC	159862
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	1	AACATTTGTTTGGAACATTAATAAAAAGAAAAAAACCCACCAGTGAGCTC	50

BX005045.10	159863	AGAAACACCAAAAGACTTGGAAGACCATGGAAAACAACTGTGGTGTATGA	159912
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	51	AGAAACACCAAAAGACTTGGAAGACCATGGAAAACAACTGTGGTGTATGA	100

BX005045.10	159913	CCGAAAAGTTCTTTCCCTGGTGAAGAAAACACCTTTCACAACAGTTGGCC	159962
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	101	CCGAAAAGTTCTTTCCCTGGTGAAGAAAACACCTTTCACAACAGTTGGCC	150

BX005045.10	159963	AGATCAAGAACACTTCTCAGGAGGTAGGTGTATGTGTGTTGGAGTCAACA	160012
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	151	AGATCAAGAACACTTCTCAGGAGGTAGGTGTATGTGTGTTGGAGTCAACA	200

BX005045.10	160013	ATCAAGAGAAGTCTACACCAGAGTAAATACAGAGGGTTCACCACAAGATG	160062
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	201	ATCAAGAGAAGTCTACACCAGAGTAAATACAGAGGGTTCACCACAAGATG	250

BX005045.10	160063	TAAACCATTGGTGAGCCTCAAAAACATGAAGGCCAGATTAGAGTTCTAAA	160112
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	251	TAAACCATTGGTGAGCCTCAAAAACATGAAGGCCAGATTAGAGTTCTAAA	300

BX005045.10	160113	AAAGCCTTCATAATGCTGGAACGACATCTTTTGGACCGATGAGATCAAGA	160162
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	301	AAAGCCTTCATAATGCTGGAACGACATCTTTTGGACCGATGAGATCAAGA	350

BX005045.10	160163	TCAACCTGTACCAGAGAAGAGAAGAGTATGGAGAAGGAAACGAACAGCTC	160212
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	351	TCAACCTGTACCAGAGAAGAGAAGAGTATGGAGAAGGAAACGAACAGCTC	400

BX005045.10	160213	ATGATCCTATTGAGGCATGATGGTAGTAATGACATGGCAAAGATTTGTAT	160262
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	401	ATGATCCTATTGAGGCATGATGGTAGTAATGACATGGCAAAGATTTGTAT	450

BX005045.10	160263	GGCTGTCAATGGAACTGGTTCTCTTGTATTTATTGATGATGTGACTGCTG	160312
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	451	GGCTGTCAATGGAACTGGTTCTCTTGTATTTATTGATGATGTGACTGCTG	500

BX005045.10	160313	ACAAAAGCAGCAGGATGAATTCTGAAGTGTTTCATGCAATATTTCTGCTT	160362
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	501	ACAAAAGCAGCAGGATGAATTCTGAAGTGTTTCATGCAATATTTCTGCTT	550

BX005045.10	160363	ATATTAAGCCAAATGCTTCAGAAGTCATTGGACAGTGCTTCACCGTGCAG	160412
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	551	ATATTAAGCCAAATGCTTCAGAAGTCATTGGACAGTGCTTCACCGTGCAG	600

BX005045.10	160413	ATGGAGAATGACCCAAAGAAACTGCAAAAGCGACCAAAGAGTTTTTAAAG	160462
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	601	ATGGAGAATGACCCAAAGAAACTGCAAAAGCGACCAAAGAGTTTTTAAAG	650

BX005045.10	160463	GGAAAGACGTGGAATGTTATGCAATGGCCAAATCAATCACCTGATCTGAA	160512
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	651	GGAAAGACGTGGAATGTTATGCAATGGCCAAATCAATCACCTGATCTGAA	700

BX005045.10	160513	TCCTATTGAGCTTGCATTTCACTTGCTGAAGAAAAAAACTGAAAGAAAAA	160562
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	701	TCCTATTGAGCTTGCATTTCACTTGCTGAAGAAAAAAACTGAAAGAAAAA	750

BX005045.10	160563	TGCCCTAAGAACAAGCAGGAACTGAAGAGAGTTTCTGTAGAGGCCTGGCA	160612
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	751	TGCCCTAAGAACAAGCAGGAACTGAAGAGAGTTTCTGTAGAGGCCTGGCA	800

BX005045.10	160613	GCGCACCACCAGGAATGAAGCTAAGCTTCTAGTGATGTCTATGCGTTAAA	160662
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	801	GCGCACCACCAGGAATGAAGCTAAGCTTCTAGTGATGTCTATGCGTTAAA	850

BX005045.10	160663	GACTTCAAGTTGTAATTGACTGCATTTGCAACCAAGTATTAAGAAGTGAA	160712
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	851	GACTTCAAGTTGTAATTGACTGCATTTGCAACCAAGTATTAAGAAGTGAA	900

BX005045.10	160713	AGTTTTATTTTTGATTATTATTCTGTCCAATTACTTTTGGTTCCTTAACA	160762
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	901	AGTTTTATTTTTGATTATTATTCTGTCCAATTACTTTTGGTTCCTTAACA	950

BX005045.10	160763	AGTGGGAGGCACATATGCAAACTGTTGTAATTGCTAAAGCGTTCACTTGA	160812
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	951	AGTGGGAGGCACATATGCAAACTGTTGTAATTGCTAAAGCGTTCACTTGA	1000

BX005045.10	160813	TTTGGATGTACAGTAAATACTCTCAAATTAAAGCTGACCGTCTGCCGTTG	160862
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	1001	TTTGGATGTACAGTAAATACTCTCAAATTAAAGCTGACCGTCTGCCGTTG	1050

BX005045.10	160863	AAGCACATCTTGTTGTTTAATTTCAAATAAATTGTGTTTGCGCATAAAGC	160912
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	1051	AAGCACATCTTGTTGTTTAATTTCAAATAAATTGTGTTTGCGCATAAAGC	1100

BX005045.10	160913	CAAAAATGTTAGAATTGTGTCGATGTCCAAATATTTATGGACCTAACTGT	160962
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	1101	CAAAAATGTTAGAATTGTGTCGATGTCCAAATATTTATGGACCTAACTGT	1150

BX005045.10	160963	ACAGTAGGGAAACTTACTCTTACACACAGATTTTACAGTACAATTTATAC	161012
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	1151	ACAGTAGGGAAACTTACTCTTACACACAGATTTTACAGTACAATTTATAC	1200

BX005045.10	161013	ATTTATTTACAGTTAAAAACACAATTCTTTATTTACCGTAAGCAGAAAGT	161062
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	1201	ATTTATTTACAGTTAAAAACACAATTCTTTATTTACCGTAAGCAGAAAGT	1250

BX005045.10	161063	GATTTAAAAAGAAAAAAAAATCATTGAGATCATCTGAAAGTAAGAATAAA	161112
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	1251	GATTTAAAAAGAAAAAAAAATCATTGAGATCATCTGAAAGTAAGAATAAA	1300

BX005045.10	161113	AATGTGATGTCATGTAAATGTGATGTCAGGAGAGTTTAAAATGTTCTGCT	161162
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	1301	AATGTGATGTCATGTAAATGTGATGTCAGGAGAGTTTAAAATGTTCTGCT	1350

BX005045.10	161163	GTGCTGCATTTTTGTTTTTGTATGCAGCATATTATCTGTTTGTTTCTAAG	161212
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	1351	GTGCTGCATTTTTGTTTTTGTATGCAGCATATTATCTGTTTGTTTCTAAG	1400

BX005045.10	161213	AAGTATGATGACTAACACATTCAAATATGCACAAAGAGTTTAACAGGTCT	161262
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	1401	AAGTATGATGACTAACACATTCAAATATGCACAAAGAGTTTAACAGGTCT	1450

BX005045.10	161263	GTGCGCACCATATAAGGATGGCACTGATAGACCAGCCCTGGTCAGTGTGG	161312
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	1451	GTGCGCACCATATAAGGATGGCACTGATAGACCAGCCCTGGTCAGTGTGG	1500

BX005045.10	161313	TTCTCTCAGCATCTGCTAATGTTTTCCCATCTGTCTTTTATTAAACCTTT	161362
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	1501	TTCTCTCAGCATCTGCTAATGTTTTCCCATCTGTCTTTTATTAAACCTTT	1550

BX005045.10	161363	GTTTTCACAGGGATCAAGAGATGTGAAAAACGCTTGAACGCAATTGTCAT	161412
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	1551	GTTTTCACAGGGATCAAGAGATGTGAAAAACGCTTGAACGCAATTGTCAT	1600

BX005045.10	161413	TGTTCTACTAAATTAATAATTAAGCATGACAGGACTCTTTTTCAGGAACA	161462
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	1601	TGTTCTACTAAATTAATAATTAAGCATGACAGGACTCTTTTTCAGGAACA	1650

BX005045.10	161463	GCTGGCACAACATTAATGTTTAAAGATCAAGGAATCAGAGATAGAATTTC	161512
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	1651	GCTGGCACAACATTAATGTTTAAAGATCAAGGAATCAGAGATAGAATTTC	1700

BX005045.10	161513	AGAAGTCATCAAAATCTCATCGCCCTAAAGGTATCGACTTAATTTTGGGA	161562
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	1701	AGAAGTCATCAAAATCTCATCGCCCTAAAGGTATCGACTTAATTTTGGGA	1750

BX005045.10	161563	TGGGTACTATAAAAGAAACCCAGACGTGACCTTAAATTCATTGTTTTTCC	161612
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	1751	TGGGTACTATAAAAGAAACCCAGACGTGACCTTAAATTCATTGTTTTTCC	1800

BX005045.10	161613	TCAAAATGCTGACTTTAAAGCCAAACAAAGCTCTCACCTAGTTCATGTGC	161662
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	1801	TCAAAATGCTGACTTTAAAGCCAAACAAAGCTCTCACCTAGTTCATGTGC	1850

BX005045.10	161663	GGTGGTGAAGGCTGAAGGGAGGCCATCATCTTCAATAACCGAGCAGCTTC	161712
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	1851	GGTGGTGAAGGCTGAAGGGAGGCCATCATCTTCAATAACCGAGCAGCTTC	1900

BX005045.10	161713	TCTTAGGATCACACATGGTGCCCACGTCAGCCATACCAAGAGTGTCACAC	161762
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	1901	TCTTAGGATCACACATGGTGCCCACGTCAGCCATACCAAGAGTGTCACAC	1950

BX005045.10	161763	GTAGTGGCCCCACACAGGTCCTGTGAAGAGGATGATTGTAGTGTGAATTC	161812
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX469904.11	1951	GTAGTGGCCCCACACAGGTCCTGTGAAGAGGATGATTGTAGTGTGAATTC	2000

Overview

Query
BX005045.10 - 161812 bps
Hit
BX469904.11 - 124514 bps
Total alignments
23
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100195420001598131618121120001
287.243085521729717848116345169081
387.71294500113224113723116347168511
485.84170345147410147754119791201221
592.891481997372873926-119926201221
691.85265375147378147752128133285121
783.971653566055760912128144285111
892.691612167373073945-128294285121
983.951433258248882812134288346111
1082.82172460132092132551-134288347411
1189.16135205112808113012135617358191
1283.77142300113176113475135953362541
1387.841663021753817839144651449461
1489.7913422382948516-144724449481
1583.212846571408914745157036577081
1688.521272177372973945161327615351
1781.3131354147396147749-161332616681
1885.62166313116365116677163048633531
1984.82132276147454147729-163048633171
2084.69172365147389147753-163862642141
2183.331703656054860912-163864642231
2286.4192369147389147757-11097001100521
2389.43139218737287394511097031099291
Short-link