<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX510936.5	144288	AAGCTTAGTTACTGGACTTTGTATGAAATAAATCATTGTATTGTTGAGTT	144337
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	1	AAGCTTAGTTACTGGACTTTGTATGAAATAAATCATTGTATTGTTGAGTT	50

BX510936.5	144338	TTTAAAAAATGCAAAGCATTTTGTCAAAATAAAAGAATTGTCACCAAAAA	144387
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	51	TTTAAAAAATGCAAAGCATTTTGTCAAAATAAAAGAATTGTCACCAAAAA	100

BX510936.5	144388	TCATTCTGCTAGCTGAAACAAAAGCAGAAAAGTTATTGCCAAATTAAGAC	144437
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	101	TCATTCTGCTAGCTGAAACAAAAGCAGAAAAGTTATTGCCAAATTAAGAC	150

BX510936.5	144438	TCAAAATCAACCCAGAGTGAATGAAAACATACCTAACAGTACATACAGTT	144487
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	151	TCAAAATCAACCCAGAGTGAATGAAAACATACCTAACAGTACATACAGTT	200

BX510936.5	144488	TAAAAGAGTTTCTCAGTATTTGTACCTAAGCGATCCTTCTTTCTTAGATT	144537
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	201	TAAAAGAGTTTCTCAGTATTTGTACCTAAGCGATCCTTCTTTCTTAGATT	250

BX510936.5	144538	ATTTTGTGACATCATCAACCGCCAAAGTTTAGCTCTAAAACTAAAAGGCT	144587
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	251	ATTTTGTGACATCATCAACCGCCAAAGTTTAGCTCTAAAACTAAAAGGCT	300

BX510936.5	144588	GATAGATCTGAGGATGCTTGAGAGAACCACACTTTAAACACTTAAAGCGT	144637
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	301	GATAGATCTGAGGATGCTTGAGAGAACCACACTTTAAACACTTAAAGCGT	350

BX510936.5	144638	GTTTATTTGCTAAAATTCATATTAAAATCTGTTTTCTTTGTATTGTGCGA	144687
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	351	GTTTATTTGCTAAAATTCATATTAAAATCTGTTTTCTTTGTATTGTGCGA	400

BX510936.5	144688	AGTATCTTTGTAAGGCTTCTGCGCATGTCATATACAGTTGAAGTCAAAAT	144737
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	401	AGTATCTTTGTAAGGCTTCTGCGCATGTCATATACAGTTGAAGTCAAAAT	450

BX510936.5	144738	TATTAGCCCCCCTTTGAATTTATTTTTCTTTTTTTAATATTTCCCAAATG	144787
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	451	TATTAGCCCCCCTTTGAATTTATTTTTCTTTTTTTAATATTTCCCAAATG	500

BX510936.5	144788	ATGTTTAACAGAGCAAAAAAAAAATTACAGTATATGTCTGATAATATTTT	144837
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	501	ATGTTTAACAGAGCAAAAAAAAAATTACAGTATATGTCTGATAATATTTT	550

BX510936.5	144838	TTTCTTCTGGAGAATAAAAGATTTCTCTAGAATAAAAGCAGCTTTTAATT	144887
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	551	TTTCTTCTGGAGAATAAAAGATTTCTCTAGAATAAAAGCAGCTTTTAATT	600

BX510936.5	144888	TTTTAATAAACATTTTAAAGTCAAAATTATTAGCCCCTTTAAGCTATACT	144937
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	601	TTTTAATAAACATTTTAAAGTCAAAATTATTAGCCCCTTTAAGCTATACT	650

BX510936.5	144938	TTTATGATAGTCTACAGAACAAACCATCATTATACAATAACTTGCCTAAT	144987
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	651	TTTATGATAGTCTACAGAACAAACCATCATTATACAATAACTTGCCTAAT	700

BX510936.5	144988	TACCCTAACCTCCATAGTTACCCTAATTAACCTTGTTAAGCTTTTAAATG	145037
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	701	TACCCTAACCTCCATAGTTACCCTAATTAACCTTGTTAAGCTTTTAAATG	750

BX510936.5	145038	TCACTTTAAGCCATATAGAAGCGTCTTGAAAAATATTTAGTAAAATATTA	145087
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	751	TCACTTTAAGCCATATAGAAGCGTCTTGAAAAATATTTAGTAAAATATTA	800

BX510936.5	145088	TTTACTGTCATCATGGTAAAGATAAAATAAATTAGTTAATATAATTGAGT	145137
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	801	TTTACTGTCATCATGGTAAAGATAAAATAAATTAGTTAATATAATTGAGT	850

BX510936.5	145138	TAATAAAACTATTATGTTTAGAAATGTGTTGAAAAAATCTCTCCGTTAAA	145187
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	851	TAATAAAACTATTATGTTTAGAAATGTGTTGAAAAAATCTCTCCGTTAAA	900

BX510936.5	145188	CGGAAAAAAATAATGGGGGCTAATAATTCAGGGGGGCTAATTCTGACTTC	145237
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	901	CGGAAAAAAATAATGGGGGCTAATAATTCAGGGGGGCTAATTCTGACTTC	950

BX510936.5	145238	AACTGTATATGAAAAAGGAATGTATCAATAAATCATTGTATGAACGCTGT	145287
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	951	AACTGTATATGAAAAAGGAATGTATCAATAAATCATTGTATGAACGCTGT	1000

BX510936.5	145288	AATGTTTCAATCATTTTCCTTTAAAATGCGTGAAGGTCATGTGACCATCA	145337
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	1001	AATGTTTCAATCATTTTCCTTTAAAATGCGTGAAGGTCATGTGACCATCA	1050

BX510936.5	145338	GGAGGAATGTGGCATCTCATTTCTCACAGGATGAATTCTGTGTTCTTCCA	145387
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	1051	GGAGGAATGTGGCATCTCATTTCTCACAGGATGAATTCTGTGTTCTTCCA	1100

BX510936.5	145388	AGGGAACTTGGCATTAGAATGCAAATCCATTCTCTGCTTTTTTTGAAATT	145437
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	1101	AGGGAACTTGGCATTAGAATGCAAATCCATTCTCTGCTTTTTTTGAAATT	1150

BX510936.5	145438	GAGAAACAGCCATGAAAAGACCTATTTTGACTTCTTCATCTCAACAGTTA	145487
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	1151	GAGAAACAGCCATGAAAAGACCTATTTTGACTTCTTCATCTCAACAGTTA	1200

BX510936.5	145488	CTATAGAGCATTGTATAATAAATGATATGTAGGATATTATGAGCTGAAAC	145537
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	1201	CTATAGAGCATTGTATAATAAATGATATGTAGGATATTATGAGCTGAAAC	1250

BX510936.5	145538	TTCACAGATGCATTCTGGGGATACCTGAGACATATTACATCTTGTGAAAA	145587
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	1251	TTCACAGATGCATTCTGGGGATACCTGAGACATATTACATCTTGTGAAAA	1300

BX510936.5	145588	TGAATATAATAGGACCCAATTTAAGGGCAAGTGCAGCTGAAAACATTACC	145637
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	1301	TGAATATAATAGGACCCAATTTAAGGGCAAGTGCAGCTGAAAACATTACC	1350

BX510936.5	145638	ATTCTCAATACTGAAAGCATGCCACACATTGTAGATGTTAGGCGTGATGC	145687
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	1351	ATTCTCAATACTGAAAGCATGCCACACATTGTAGATGTTAGGCGTGATGC	1400

BX510936.5	145688	TATTGTTCTGGATTAGAAAGAGAGTGTGTCATGCTCATCACTGATGCCTT	145737
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	1401	TATTGTTCTGGATTAGAAAGAGAGTGTGTCATGCTCATCACTGATGCCTT	1450

BX510936.5	145738	GATTTATTTAAAAAGCTCTCAGTGCATTAGTCAAGCTTATTATTTGTAGT	145787
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	1451	GATTTATTTAAAAAGCTCTCAGTGCATTAGTCAAGCTTATTATTTGTAGT	1500

BX510936.5	145788	GGGCAGAAATACCATCATTTGGCTGTTGTCTTGAGTAGCGGTGGATTTCT	145837
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	1501	GGGCAGAAATACCATCATTTGGCTGTTGTCTTGAGTAGCGGTGGATTTCT	1550

BX510936.5	145838	CTGCCCTTGAACTCACAGGTGCAGCCGACCTAAATCCACTGCAGTCATGG	145887
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	1551	CTGCCCTTGAACTCACAGGTGCAGCCGACCTAAATCCACTGCAGTCATGG	1600

BX510936.5	145888	CAATCAGTGTGAGTCTTGTTATTTTCAATTTTTGCTGTGCATAAGGATAA	145937
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	1601	CAATCAGTGTGAGTCTTGTTATTTTCAATTTTTGCTGTGCATAAGGATAA	1650

BX510936.5	145938	AAAGGACAGCTGTTGAGACTATTTTTGGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGT	145987
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	1651	AAAGGACAGCTGTTGAGACTATTTTTGGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGT	1700

BX510936.5	145988	TATCATTGGAAATTAATTATTGACTTTTCCTGTGGTTTGATTCTTTTGTG	146037
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	1701	TATCATTGGAAATTAATTATTGACTTTTCCTGTGGTTTGATTCTTTTGTG	1750

BX510936.5	146038	AATACACTTAACTCAACTTTGAGTGATACAGCCTTTCAGATTCTGAGTCA	146087
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	1751	AATACACTTAACTCAACTTTGAGTGATACAGCCTTTCAGATTCTGAGTCA	1800

BX510936.5	146088	GAGGACCACAGAGAACTCTAAAAGGGTGCTGGAAGGTCCATAGAACTATT	146137
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	1801	GAGGACCACAGAGAACTCTAAAAGGGTGCTGGAAGGTCCATAGAACTATT	1850

BX510936.5	146138	ACTGATAAAGGAAATTACGTCTTTAATATTTTAGTATCATTTATGATTAT	146187
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	1851	ACTGATAAAGGAAATTACGTCTTTAATATTTTAGTATCATTTATGATTAT	1900

BX510936.5	146188	ACTATGAACATTGATATTAAATACTTAAAAAGCAGGTAATGTTTTGAAAA	146237
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	1901	ACTATGAACATTGATATTAAATACTTAAAAAGCAGGTAATGTTTTGAAAA	1950

BX510936.5	146238	AAAAAAAATAATAATAGTACATATTTTGTTAAATGTACGAACATTTTCTT	146287
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX324225.7	1951	AAAAAAAATAATAATAGTACATATTTTGTTAAATGTACGAACATTTTCTT	2000

Overview

Query
BX510936.5 - 146287 bps
Hit
BX324225.7 - 207125 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100189720001442881462871120001
283.011062488474284989-1865089081
378.12102534104100104633-116363169061
487.781091839852298704129093292721
584.691212399852298760142021422551
690.82151215111666111880-146765469821
791.671111534669346845146774469291
883.751523198235682674-190887912061
982.051353149860598918190895912061
1091.82124172111527111698-197221973911
1179.1511134511152711187111082571086061
1283.19297669487184938611102281109171
1385.72112204165291673211254821256841
14902373584670247059-11537201540791
1589.7222333711152611186211537301540791
1691.221041482886329010-11537931539401
1785.32182371466904706011588441592111
1881.97131347111526111872-11588461592001
1987.12218446454744591911595731600221
2091140197460534624911600171602161
2191.75249338111526111863-11661201664581
Short-link