<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX465856.15	1	ACTTTCAAGAGGCTCATTCATTCATGTTATACCTTTAAGGATCTATTATA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	152825	ACTTTCAAGAGGCTCATTCATTCATGTTATACCTTTAAGGATCTATTATA	152874

BX465856.15	51	GACCATTTCAATGTGGTCATGTCATTGACCCATGAACATTCCCTGCTTAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	152875	GACCATTTCAATGTGGTCATGTCATTGACCCATGAACATTCCCTGCTTAT	152924

BX465856.15	101	TATCAAACTATTTCATAGCTGTAATAAGAGGCAATTTAATCATAACTACA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	152925	TATCAAACTATTTCATAGCTGTAATAAGAGGCAATTTAATCATAACTACA	152974

BX465856.15	151	TGTTAAAACAACTATAATAACATTATTTATTAACATATGGCTCTTTTTGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	152975	TGTTAAAACAACTATAATAACATTATTTATTAACATATGGCTCTTTTTGG	153024

BX465856.15	201	TTTCATGGAAGCTAAAGAAATTAAATGTGTAAAACCAGAAATGCATTGAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	153025	TTTCATGGAAGCTAAAGAAATTAAATGTGTAAAACCAGAAATGCATTGAG	153074

BX465856.15	251	ACCATTGTTTTTGTTTACATCCCTCAAAATGATCTATACTTTTGTTTGTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	153075	ACCATTGTTTTTGTTTACATCCCTCAAAATGATCTATACTTTTGTTTGTG	153124

BX465856.15	301	TAAAGGTTTTGTAAATTCATTCATTCATTCATTTATTCATTTTCCTTTGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	153125	TAAAGGTTTTGTAAATTCATTCATTCATTCATTTATTCATTTTCCTTTGG	153174

BX465856.15	351	TTTAATCCCTTATTTATCAGCAGTTGCTCCAGTGGAATTATAGCCGTATA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	153175	TTTAATCCCTTATTTATCAGCAGTTGCTCCAGTGGAATTATAGCCGTATA	153224

BX465856.15	401	TATGGCTATTACACAACCATAATACACTGTGATATAGCCTGGTTTGTTAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	153225	TATGGCTATTACACAACCATAATACACTGTGATATAGCCTGGTTTGTTAG	153274

BX465856.15	451	CTTGTTGGGTCATTTTGCTTCCTCTTTACAATCTATTCGCTCCGGAGTTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	153275	CTTGTTGGGTCATTTTGCTTCCTCTTTACAATCTATTCGCTCCGGAGTTT	153324

BX465856.15	501	GTTTCAATCAAGCCAAATCAAGACTAATTGATTTGATGTAGGTCCGAGCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	153325	GTTTCAATCAAGCCAAATCAAGACTAATTGATTTGATGTAGGTCCGAGCT	153374

BX465856.15	551	CGATTGCGGCATTCACATATGCCGAATGAACCAGGCTAACTGGGCAAATG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	153375	CGATTGCGGCATTCACATATGCCGAATGAACCAGGCTAACTGGGCAAATG	153424

BX465856.15	601	AGACTTCTAGGTGTGAAAGCATACCAAGACTGTATTTGCATGCAATTGAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	153425	AGACTTCTAGGTGTGAAAGCATACCAAGACTGTATTTGCATGCAATTGAG	153474

BX465856.15	651	AACAGTGGCAGCTAAATGAAACTTTAGTGACAAGGCAGCACCACCAGATT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	153475	AACAGTGGCAGCTAAATGAAACTTTAGTGACAAGGCAGCACCACCAGATT	153524

BX465856.15	701	CCGCCAGTATTCATCCTGTCTACTGTTCTGTATGTCTCACACACTGGCCC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	153525	CCGCCAGTATTCATCCTGTCTACTGTTCTGTATGTCTCACACACTGGCCC	153574

BX465856.15	751	CGGGCCATCGGGCAGTCCTTATTGTTGAGCCTTAGTGGTATGTCTTTGGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	153575	CGGGCCATCGGGCAGTCCTTATTGTTGAGCCTTAGTGGTATGTCTTTGGA	153624

BX465856.15	801	ATGTTTGGGAAATCTGAGCACCCAAAGGAAACTCACAGAAACACGAGGAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	153625	ATGTTTGGGAAATCTGAGCACCCAAAGGAAACTCACAGAAACACGAGGAG	153674

BX465856.15	851	AACATGCAAACTCCACACAGCAATGCCAACGACTTACTTGCTGTGAGATA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	153675	AACATGCAAACTCCACACAGCAATGCCAACGACTTACTTGCTGTGAGATA	153724

BX465856.15	901	ACAGTGCTTACCACTGAGTCACTGTGGCACTGTGCTACCCCAGTTATTAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	153725	ACAGTGCTTACCACTGAGTCACTGTGGCACTGTGCTACCCCAGTTATTAC	153774

BX465856.15	951	CATATATATCGATATATATGTATAATATATATATATATATATATCTATAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	153775	CATATATATCGATATATATGTATAATATATATATATATATATATCTATAT	153824

BX465856.15	1001	ATTAATTATAATAATTCCTTTTATATCGTGCTTTTCTGGCCACTCAAAGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	153825	ATTAATTATAATAATTCCTTTTATATCGTGCTTTTCTGGCCACTCAAAGT	153874

BX465856.15	1051	GTTCTACACATTGTGGGGAATCTCCTCATCCACCACCAGTGTGCAGAACC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	153875	GTTCTACACATTGTGGGGAATCTCCTCATCCACCACCAGTGTGCAGAACC	153924

BX465856.15	1101	CACCTGCAGCCATGATGAACAAAGGCCAGTGGGAAAATTTGGGTGGTCAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	153925	CACCTGCAGCCATGATGAACAAAGGCCAGTGGGAAAATTTGGGTGGTCAG	153974

BX465856.15	1151	TAGATGTGAGTTTCGGTGATGTAATAAAAAAGTTATTACTATTGGCATTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	153975	TAGATGTGAGTTTCGGTGATGTAATAAAAAAGTTATTACTATTGGCATTA	154024

BX465856.15	1201	GTGAGAAACTGTAAGTAAATGCTTATATCTTCTATTGCTATGAAGTGGTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	154025	GTGAGAAACTGTAAGTAAATGCTTATATCTTCTATTGCTATGAAGTGGTG	154074

BX465856.15	1251	TTGCTACCAGGGTGGCGGGGTTAAACCCCTACTCTTTTTCGAAGGACATC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	154075	TTGCTACCAGGGTGGCGGGGTTAAACCCCTACTCTTTTTCGAAGGACATC	154124

BX465856.15	1301	CAGGAATTTTTAACAACCACAGAGAGTCAGGTCATCGGGTTAAGGTCTCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	154125	CAGGAATTTTTAACAACCACAGAGAGTCAGGTCATCGGGTTAAGGTCTCA	154174

BX465856.15	1351	ACTGAAAGACATCTCTCACTGCGCAGTATAAAATCCCCCATCAACATACT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	154175	ACTGAAAGACATCTCTCACTGCGCAGTATAAAATCCCCCATCAACATACT	154224

BX465856.15	1401	GGGGCATTAGGACCCACATAGACCACAGGTTGAGTGCCCCCTGCTGACCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	154225	GGGGCATTAGGACCCACATAGACCACAGGTTGAGTGCCCCCTGCTGACCT	154274

BX465856.15	1451	CACTAACATCACTTCCGGCAGCAACCTAGCTTTGCCATGTGGTCTCCCAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	154275	CACTAACATCACTTCCGGCAGCAACCTAGCTTTGCCATGTGGTCTCCCAT	154324

BX465856.15	1501	CCAGGTACTAACCGGGCACAACCCTGGTTAGCTTCAGAGGGCAACCATGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	154325	CCAGGTACTAACCGGGCACAACCCTGGTTAGCTTCAGAGGGCAACCATGT	154374

BX465856.15	1551	GAGAGTTGCAGAGAGCTAACTGATGGCACATATTTTGTTTGTAAAGCGCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	154375	GAGAGTTGCAGAGAGCTAACTGATGGCACATATTTTGTTTGTAAAGCGCC	154424

BX465856.15	1601	TTTATGAAATGTGCTATTATTATAATATTACTGTAAGTACTGCACAGATA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	154425	TTTATGAAATGTGCTATTATTATAATATTACTGTAAGTACTGCACAGATA	154474

BX465856.15	1651	TTTATAATTACTTTTTCATTTGATTTAAATCTTCAATACCTGACTGGGCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	154475	TTTATAATTACTTTTTCATTTGATTTAAATCTTCAATACCTGACTGGGCA	154524

BX465856.15	1701	TCGCATTTCTGTACAAACATTACGCATTAATTACAGATGTTTTATTTAGC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	154525	TCGCATTTCTGTACAAACATTACGCATTAATTACAGATGTTTTATTTAGC	154574

BX465856.15	1751	ATATAAGATATAAGATCTGCAAATCAGATTTCAACCAGACCATGAATTGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	154575	ATATAAGATATAAGATCTGCAAATCAGATTTCAACCAGACCATGAATTGT	154624

BX465856.15	1801	AATTCAGCAGCTGCTTTTTCTGACGAATGTGAGATGATGACAAGATCATC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	154625	AATTCAGCAGCTGCTTTTTCTGACGAATGTGAGATGATGACAAGATCATC	154674

BX465856.15	1851	TCATTTATGGGAGACTGCAAAGAAAGACAAGTCAGTAGTCTTTAATAAAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	154675	TCATTTATGGGAGACTGCAAAGAAAGACAAGTCAGTAGTCTTTAATAAAT	154724

BX465856.15	1901	AAGCCATCATTCTATTTTTGAGGTTTTACTTGATTTGTTGCTCCCCTGAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	154725	AAGCCATCATTCTATTTTTGAGGTTTTACTTGATTTGTTGCTCCCCTGAC	154774

BX465856.15	1951	GGGCCTTACATGACCAAGTGTGCTGATTCTGTTCGCACCTCATTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323864.8	154775	GGGCCTTACATGACCAAGTGTGCTGATTCTGTTCGCACCTCATTGAATTC	154824

Overview

Query
BX465856.15 - 157035 bps
Hit
BX323864.8 - 154824 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100196220001200011528251548241
281.65172512119908120419-110903114251
379.871104419597996419-110993114591
484.33212495119923120417-116042165451
585.97189395103590103984116050164411
680.921194309599096419-116129165841
795.12901236727567397149322494441
895.19132186111950112135149322495081
998.976997150465150561151338514341
1099.1180112111890112001-151847519581
1110081109150487150595151851519591
1284.93111223132839133061-162830630481
1384.94207393125815126207173679740701
1487.478127126217126343181266813921
1588.7489143267752691711055051056461
1687.781252259205992283-11110101112301
1781.0798254104035104288-11169061171481
1888.5277122124669124790-11169131170341
1986.86130231117571198711170341172691
2083.43901817612876308-11514011515811
2195.288310634853590-11539611540661
Short-link