<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1997 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX548031.8	71802	GAATTCACCCCAAACAACTCCCCATCATTCTGCCTCTATTTTCAGATGGG	71851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	1	GAATTCACCCCAAACAACTCCCCATCATTCTGCCTCTATTTTCAGATGGG	50

BX548031.8	71852	ATGGTGGGCCATGTTTCTATGGGAAATTTCCCCAGCCAAATCACCTTGCA	71901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	51	ATGGTGGGCCATGTTTCTATGGGAAATTTCCCCAGCCAAATCACCTTGCA	100

BX548031.8	71902	TCCCAAGACAGGTTACTCACTAAAGCTAAGCAGTGCTAAGCCTGGTCAGT	71951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	101	TCCCAAGACAGGTTACTCACTAAAGCTAAGCAGTGCTAAGCCTGGTCAGT	150

BX548031.8	71952	ACCTGGATGTGAGACCACAAGAGAAAACTAGGTTGCTGTTGGAAGTGGTG	72001
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	151	ACCTGGATGTGAGACCACAAGAGAAAACTAGGTTGCTGTTGGAAGTGGTG	200

BX548031.8	72002	TTAGTGTGACCAGCAGGGGGTCGCTTAACCTGCAGTCTGTGTGAGTCCTA	72051
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	201	TTAGTGTGACCAGCAGGGGGTCGCTTAACCTGCAGTCTGTGTGAGTCCTA	250

BX548031.8	72052	ATGCCCCAGTATAGTGAAGGGGACACTATATTGTCAGTGAGTGCTGTCTT	72101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	251	ATGCCCCAGTATAGTGAAGGGGACACTATATTGTCAGTGAGTGCTGTCTT	300

BX548031.8	72102	TTAGATAAGATGCTAAACTGAGGTCCTGACTGTCTGTGGTCATTAAAAAT	72151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	301	TTAGATAAGATGCTAAACTGAGGTCCTGACTGTCTGTGGTCATTAAAAAT	350

BX548031.8	72152	CCCATGGCACTTGTAGTAAAGAGTAGTGGTGTAGCCTCTGTGTCCTGGCC	72201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	351	CCCATGGCACTTGTAGTAAAGAGTAGTGGTGTAGCCTCTGTGTCCTGGCC	400

BX548031.8	72202	AAATTCTCGCTGTCTCTAGGCCAAATCCGATCATGGCCTCCTAATCATTC	72251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	401	AAATTCTCGCTGTCTCTAGGCCAAATCCGATCATGGCCTCCTAATCATTC	450

BX548031.8	72252	CCATACACCGAATTGGCTGTATCACTGTTTCTTCGCTCCATCAATAGCTG	72301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	451	CCATACACCGAATTGGCTGTATCACTGTTTCTTCGCTCCATCAATAGCTG	500

BX548031.8	72302	GTGTGTTGTGAGCACATTGTGATGCTGCTGATGATGTGATGTGGTTGTCC	72351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	501	GTGTGTTGTGAGCACATTGTGATGCTGCTGATGATGTGATGTGGTTGTCC	550

BX548031.8	72352	TGTAACTGTCTTCGCATAATCCAAGTGGATGCAGCACTCTACACTATGCA	72401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	551	TGTAACTGTCTTCGCATAATCCAAGTGGATGCAGCACTCTACACTATGCA	600

BX548031.8	72402	AATAAACATTACATTGCAACTATTAACAAATAAATAAATACAATTCTTTC	72451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	601	AATAAACATTACATTGCAACTATTAACAAATAAATAAATACAATTCTTTC	650

BX548031.8	72452	ACCACCATGCTTTTTGGTCATTCATCATTGTGTAAGATTACCAGTGTTTG	72501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	651	ACCACCATGCTTTTTGGTCATTCATCATTGTGTAAGATTACCAGTGTTTG	700

BX548031.8	72502	ATTTACAACATTTTACAGTTGGCTTTAAGTCTAAATATGGCTGCAACAGT	72551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	701	ATTTACAACATTTTACAGTTGGCTTTAAGTCTAAATATGGCTGCAACAGT	750

BX548031.8	72552	GTAAACAATGTTTATTTTCTTGCACAGACAGATTGTTTTGCTCTATAATA	72601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	751	GTAAACAATGTTTATTTTCTTGCACAGACAGATTGTTTTGCTCTATAATA	800

BX548031.8	72602	GGTCAGTGTTTGTTAGGTGTCGTGGGTGTTGTTATTAATATTATTTGTTT	72651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	801	GGTCAGTGTTTGTTAGGTGTCGTGGGTGTTGTTATTAATATTATTTGTTT	850

BX548031.8	72652	TTGGACTCTCAAAGTGCCGTTAGCCATTCCCTTGAATTTTATCAATCACT	72701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	851	TTGGACTCTCAAAGTGCCGTTAGCCATTCCCTTGAATTTTATCAATCACT	900

BX548031.8	72702	ATAGACCACAGTTTCAGCAAAAAATCTTGGCCTGACCATGAGTACATTTA	72751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	901	ATAGACCACAGTTTCAGCAAAAAATCTTGGCCTGACCATGAGTACATTTA	950

BX548031.8	72752	CAGCAGATAATCATATTTGTGTGAATCTCCTTTTTTTAAGGCTGGTATGT	72801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	951	CAGCAGATAATCATATTTGTGTGAATCTCCTTTTTTTAAGGCTGGTATGT	1000

BX548031.8	72802	ATACCGATTTTCATATTGTTCTTCAAAATATGAACTGTTTTTGTTGTGTT	72851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	1001	ATACCGATTTTCATATTGTTCTTCAAAATATGAACTGTTTTTGTTGTGTT	1050

BX548031.8	72852	TCTTACTTATCCCTTTCAGTCTCTCTTTCACACAAACACACACACATTTT	72901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	1051	TCTTACTTATCCCTTTCAGTCTCTCTTTCACACAAACACACACACATTTT	1100

BX548031.8	72902	TCCTAGGAGACAAAGTTATGAAAGGGAAGGTGACATATTTAACCCTCCTG	72951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	1101	TCCTAGGAGACAAAGTTATGAAAGGGAAGGTGACATATTTAACCCTCCTG	1150

BX548031.8	72952	GAGTTTATTTTTTTCTTTCTTGGTAACATCTTGTGCTTTTACCCAAGTGT	73001
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	1151	GAGTTTATTTTTTTCTTTCTTGGTAACATCTTGTGCTTTTACCCAAGTGT	1200

BX548031.8	73002	GAAATGTGCAATTTTTGACATGCTTTCTATCGAGCTGCTAAAGCACTCTC	73051
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	1201	GAAATGTGCAATTTTTGACATGCTTTCTATCGAGCTGCTAAAGCACTCTC	1250

BX548031.8	73052	AAAGAGGAAGACAGCTTCTATTTCTGTCATTAAATGTGGTCATATTTTTT	73101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	1251	AAAGAGGAAGACAGCTTCTATTTCTGTCATTAAATGTGGTCATATTTTTT	1300

BX548031.8	73102	AAAGTTTATTTTAAATTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTAT	73151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	1301	AAAGTTTATTTTAAATTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTAT	1350

BX548031.8	73152	TATTATTATTATCATTAATATTGTTTGAATTTGTATTTTGTTTAAAAGTG	73201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	1351	TATTATTATTATCATTAATATTGTTTGAATTTGTATTTTGTTTAAAAGTG	1400

BX548031.8	73202	ATTTTTTATTTCTCTCTGAACCACCCAAGAATGAGCATTTTTTTTGCTGT	73251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	1401	ATTTTTTATTTCTCTCTGAACCACCCAAGAATGAGCATTTTTTTTGCTGT	1450

BX548031.8	73252	CAATATCTTGGCAAGTCATGATAAAACGAACAACGCCCTGTTTAAACCTG	73301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	1451	CAATATCTTGGCAAGTCATGATAAAACGAACAACGCCCTGTTTAAACCTG	1500

BX548031.8	73302	ATATTAAGATTCACACCAACATGCAGGTGTAAACCGGTTTGAGCTTGTTC	73351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	1501	ATATTAAGATTCACACCAACATGCAGGTGTAAACCGGTTTGAGCTTGTTC	1550

BX548031.8	73352	AATTTTTGAGCATTTCAAGATGTAGTGTAAATGCTCTTAAAGTTCCAAAA	73401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	1551	AATTTTTGAGCATTTCAAGATGTAGTGTAAATGCTCTTAAAGTTCCAAAA	1600

BX548031.8	73402	AGCCACCTGCTTTATTGGTAAAATCCTGAACATTATGTGGCCTGTTGTTG	73451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	1601	AGCCACCTGCTTTATTGGTAAAATCCTGAACATTATGTGGCCTGTTGTTG	1650

BX548031.8	73452	AAATGCTTTAGCACTTTAACATTGGTATCTGAAATAATGGCTACATGAGT	73501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	1651	AAATGCTTTAGCACTTTAACATTGGTATCTGAAATAATGGCTACATGAGT	1700

BX548031.8	73502	ATAACAGTATATCAAATTGATTCAAACACACACAAGGGGTGGGAAGTATG	73551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	1701	ATAACAGTATATCAAATTGATTCAAACACACACAAGGGGTGGGAAGTATG	1750

BX548031.8	73552	ACCAATTTATAAGCAATTTGATTTCATGGTAACAATATATATATGTTACA	73601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	1751	ACCAATTTATAAGCAATTTGATTTCATGGTAACAATATATATATGTTACA	1800

BX548031.8	73602	ATATAGTTATGTAAATAGATATTACAAAAAAATCTTTTAAAATTATAAAT	73651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	1801	ATATAGTTATGTAAATAGATATTACAAAAAAATCTTTTAAAATTATAAAT	1850

BX548031.8	73652	AATTAAATAAATAAACTGAAATACTTCTGAAATGAAAAAGACTTTTCTGC	73701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	1851	AATTAAATAAATAAACTGAAATACTTCTGAAATGAAAAAGACTTTTCTGC	1900

BX548031.8	73702	TTTTTCTTTTTATTTTGACCATGATAAATATAGTAGGTTGCATAATACTG	73751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	1901	TTTTTCTTTTTATTTTGACCATGATAAATATAGTAGGTTGCATAATACTG	1950

BX548031.8	73752	TATTTTTTAAACAATATATATATATTTTTAAATGTTTTTTTTTTTTT	73798
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX323847.8	1951	TATTTTTTAAACAATATATATATATTTTTAAATGTTTTTTTTTTTTT	1997

Overview

Query
BX548031.8 - 73801 bps
Hit
BX323847.8 - 154483 bps
Total alignments
24
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1997 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001919199771802737981119971
290.11301936822568417120870210611
381.51112573574736003135159354121
410041433610436146135524355661
586.84581146231862431-138199383121
695.5644906496065049147344474331
797.5436822405024131-147355474351
810035722405124122147357474281
910038786497265049-147358474351
1090.232463696823068598151620519771
1181.771333271922419550-151622519501
1298.3630616498065040-162043621031
1398.5330682428524352-165953660201
1484.931272375377854014167213674511
1586.25821576630566461191561917201
1694.7431386832768364191564916011
1787.791272186837968596191602918221
1883.8425655036724221195165957151
1996.4342844068940772-199520996031
2093.145854069140775-11065631066491
2198.7235786496965046-11163621164391
221003572240512412211163621164331
2395.563891649756506511163621164511
2410035722405124122-11163641164351
Short-link