<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 5207 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  AL929225.6	151067	GAATTCTCATTAAAATCTGTCACCGTTTACTTGTTTCAAACCAGTTTGAG	151018
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	148290	GAATTCTCATTAAAATCTGTCACCGTTTACTTGTTTCAAACCAGTTTGAG	148339

C  AL929225.6	151017	TTTGTTTTATTGAAGACAAAAGAAGACATACCGGAGAATGGTGGAAACTG	150968
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	148340	TTTGTTTTATTGAAGACAAAAGAAGACATACCGGAGAATGGTGGAAACTG	148389

C  AL929225.6	150967	GTTACCATTGATTTTCATAGTATTTGTTCCTACTAAGGAAGTTAGGGCTA	150918
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	148390	GTTACCATTGATTTTCATAGTATTTGTTCCTACTAAGGAAGTTAGGGCTA	148439

C  AL929225.6	150917	CATGGTGGCTTAGTGGCAAGCACTGTCACCTCACAGTTGGCCTTTCTTTG	150868
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	148440	CATGGTGGCTTAGTGGCAAGCACTGTCACCTCACAGTTGGCCTTTCTTTG	148489

C  AL929225.6	150867	TGGAGTTATATATTCTCCCCGTATTCCCGTGGGTTTCCTCCGGGTGCTCC	150818
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	148490	TGGAGTTATATATTCTCCCCGTATTCCCGTGGGTTTCCTCCGGGTGCTCC	148539

C  AL929225.6	150817	GGTTTTCCCCCACAGTCCAAAAACATGGTACAAGTAAATTGAATAAACTA	150768
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	148540	GGTTTTCCCCCACAGTCCAAAAACATGGTACAAGTAAATTGAATAAACTA	148589

C  AL929225.6	150767	AATTGGCCGTAGTGTATATGTGTGAATGATTGTGTATGGATGTTTCACAT	150718
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	148590	AATTGGCCGTAGTGTATATGTGTGAATGATTGTGTATGGATGTTTCACAT	148639

C  AL929225.6	150717	TACTGGGTTGCAGCTGAAAGAAAAACATGTGCTGATTAAGTTGGCGGTTC	150668
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	148640	TACTGGGTTGCAGCTGAAAGAAAAACATGTGCTGATTAAGTTGGCGGTTC	148689

C  AL929225.6	150667	ATTCTGCTATGGCAACCCCTGATAAATAAAGGGACTAAGCCAAAAAGAAA	150618
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	148690	ATTCTGCTATGGCAACCCCTGATAAATAAAGGGACTAAGCCAAAAAGAAA	148739

C  AL929225.6	150617	AGGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAAT	150568
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	148740	AGGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAAT	148789

C  AL929225.6	150567	GAATGAATGAAGTCAGTGGTTACCAGTTTCCATCATTCTTCGGTATGTCT	150518
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	148790	GAATGAATGAAGTCAGTGGTTACCAGTTTCCATCATTCTTCGGTATGTCT	148839

C  AL929225.6	150517	TCTTTTATTCCTTTTATGTTCTTTTAACTGAACAAAACAACTTGGACTAG	150468
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	148840	TCTTTTATTCCTTTTATGTTCTTTTAACTGAACAAAACAACTTGGACTAG	148889

C  AL929225.6	150467	TTTGCAACAAGTCAAGGGTGAATTATTAATTAAACTGATAAAATACAAAA	150418
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	148890	TTTGCAACAAGTCAAGGGTGAATTATTAATTAAACTGATAAAATACAAAA	148939

C  AL929225.6	150417	AAGTGCTTTCTGGATGTTTTCTTTTCAGTAGTTCTACTAGTCTGAAACAC	150368
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	148940	AAGTGCTTTCTGGATGTTTTCTTTTCAGTAGTTCTACTAGTCTGAAACAC	148989

C  AL929225.6	150367	ATTTTAAACTGCACACAAATTTTTAAAACTGACAAATGTCTTGCCTCAAA	150318
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	148990	ATTTTAAACTGCACACAAATTTTTAAAACTGACAAATGTCTTGCCTCAAA	149039

C  AL929225.6	150317	GGTTTAGTTCATTCATAAATTAAATTTTCTGTAAATCTAATCTAGCCTCT	150268
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	149040	GGTTTAGTTCATTCATAAATTAAATTTTCTGTAAATCTAATCTAGCCTCT	149089

C  AL929225.6	150267	AGACTCTAGACCATCCAAGATGTAGATGACTTTTTCAAAACAATAAAATA	150218
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	149090	AGACTCTAGACCATCCAAGATGTAGATGACTTTTTCAAAACAATAAAATA	149139

C  AL929225.6	150217	AAATAAAAATGTATAGTGCTCAGCATATATAAGTACTCCCTTTACACATA	150168
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	149140	AAATAAAAATGTATAGTGCTCAGCATATATAAGTACTCCCTTTACACATA	149189

C  AL929225.6	150167	TACAATAATATACAATGTTATATTTGGCATTTACATTAGATTAGTGAGTA	150118
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	149190	TACAATAATATACAATGTTATATTTGGCATTTACATTAGATTAGTGAGTA	149239

C  AL929225.6	150117	CTGAAACCAAATTTGAAGCTTATCTTACAAAATAACTTACGATTAAGGGT	150068
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	149240	CTGAAACCAAATTTGAAGCTTATCTTACAAAATAACTTACGATTAAGGGT	149289

C  AL929225.6	150067	CCAAAAACTAGTACACCCAAATATGTATATATGTTATAAAAAAATATTAA	150018
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	149290	CCAAAAACTAGTACACCCAAATATGTATATATGTTATAAAAAAATATTAA	149339

C  AL929225.6	150017	ATACAAATTTAAAAAAGAGGACAAATCAAGAGAAGCAGAAAAATTTAAAA	149968
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	149340	ATACAAATTTAAAAAAGAGGACAAATCAAGAGAAGCAGAAAAATTTAAAA	149389

C  AL929225.6	149967	TTGAGTTGAAATTTTGTAGGTTGTATTTTATTTTTGCAATATTTAGCTTG	149918
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	149390	TTGAGTTGAAATTTTGTAGGTTGTATTTTATTTTTGCAATATTTAGCTTG	149439

C  AL929225.6	149917	AATTTAATTGTATTATCTTTTGACTTCTAAATATGTTTGGTGACTAAACG	149868
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	149440	AATTTAATTGTATTATCTTTTGACTTCTAAATATGTTTGGTGACTAAACG	149489

C  AL929225.6	149867	ATAATTTTAATAAATATATCTGTTTGATAAATGTGTTTTGTTTAAATGCA	149818
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	149490	ATAATTTTAATAAATATATCTGTTTGATAAATGTGTTTTGTTTAAATGCA	149539

C  AL929225.6	149817	CCAAAATACACTACCTATATTCACTGAGTAATGGATACAAATATTCATTT	149768
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	149540	CCAAAATACACTACCTATATTCACTGAGTAATGGATACAAATATTCATTT	149589

C  AL929225.6	149767	TCAAAATGGGGTGTACTTATATATGCTGAGCACTGTATCTGAAGCCATTA	149718
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	149590	TCAAAATGGGGTGTACTTATATATGCTGAGCACTGTATCTGAAGCCATTA	149639

C  AL929225.6	149717	TACTTGGGTCATAAATTGCAAGAAAATGGCTGCTTATTCTTTGAAAGTCC	149668
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	149640	TACTTGGGTCATAAATTGCAAGAAAATGGCTGCTTATTCTTTGAAAGTCC	149689

C  AL929225.6	149667	AAAATATATGAAGAATGTTACTTTGAGGATATGTTTTGCTTCATAAAACC	149618
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	149690	AAAATATATGAAGAATGTTACTTTGAGGATATGTTTTGCTTCATAAAACC	149739

C  AL929225.6	149617	TCAATGTGTCCCCAGAATCCATGGGTACTTAGTTTACTCTTATATTTCAC	149568
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	149740	TCAATGTGTCCCCAGAATCCATGGGTACTTAGTTTACTCTTATATTTCAC	149789

C  AL929225.6	149567	CACTGCTATTTAACAAATCTGAAACAAAAATAATTGCCTTGTCAAGTCAA	149518
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	149790	CACTGCTATTTAACAAATCTGAAACAAAAATAATTGCCTTGTCAAGTCAA	149839

C  AL929225.6	149517	TCTTTTTTTAAATATACTTTTGTTTTTAAACAACAAATGTTATTTTTTCC	149468
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	149840	TCTTTTTTTAAATATACTTTTGTTTTTAAACAACAAATGTTATTTTTTCC	149889

C  AL929225.6	149467	ATTGAATGCAAGTATGTGGAGGAAAGTTATGTTTGAAGGCTATTTTCCAC	149418
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	149890	ATTGAATGCAAGTATGTGGAGGAAAGTTATGTTTGAAGGCTATTTTCCAC	149939

C  AL929225.6	149417	ACTTATGATTGCTTATAAAAGTATGAAAATGTATTGGGAATTTGAAGTCA	149368
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	149940	ACTTATGATTGCTTATAAAAGTATGAAAATGTATTGGGAATTTGAAGTCA	149989

C  AL929225.6	149367	CAAAAATAGTGAAAAATGTAATCCGCCACAAAGTAGCCATTGTCTTTCAT	149318
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	149990	CAAAAATAGTGAAAAATGTAATCCGCCACAAAGTAGCCATTGTCTTTCAT	150039

C  AL929225.6	149317	GTTATACTCACAGAAATCTGCTTTGATATTCTACTGAAGAAAAAAATCAC	149268
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	150040	GTTATACTCACAGAAATCTGCTTTGATATTCTACTGAAGAAAAAAATCAC	150089

C  AL929225.6	149267	TTGGATCAATCTATCCTTACAACCATCTCATGTTTGTTGTCTTTTCCTTG	149218
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	150090	TTGGATCAATCTATCCTTACAACCATCTCATGTTTGTTGTCTTTTCCTTG	150139

C  AL929225.6	149217	TTTTAGACATCACTGAAGCATGGGGCTGGACTAAACTGATGCTGTCTGTG	149168
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	150140	TTTTAGACATCACTGAAGCATGGGGCTGGACTAAACTGATGCTGTCTGTG	150189

C  AL929225.6	149167	CTCCAGCATCTCCATGAGAGCCTCCTCCTCTGAACCAGAGAACAAGGACT	149118
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	150190	CTCCAGCATCTCCATGAGAGCCTCCTCCTCTGAACCAGAGAACAAGGACT	150239

C  AL929225.6	149117	GAATGTCAAACCATGTGTTAATAGCAAACGAGGGACACCCTGAAGGCTGA	149068
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	150240	GAATGTCAAACCATGTGTTAATAGCAAACGAGGGACACCCTGAAGGCTGA	150289

C  AL929225.6	149067	ATCCCCACTCAAAATAAACGTTTTGCCTGCTCCTCTAGATATTATATTTC	149018
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	150290	ATCCCCACTCAAAATAAACGTTTTGCCTGCTCCTCTAGATATTATATTTC	150339

C  AL929225.6	149017	ACACCGTTTCACCATAGTCTCACCAGACAACGCAACTGTATTAGCGCCGT	148968
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	150340	ACACCGTTTCACCATAGTCTCACCAGACAACGCAACTGTATTAGCGCCGT	150389

C  AL929225.6	148967	CCTAGTGGTCTTATTCCTGTTATACACCTGTAGCATTGATGAGTAACACA	148918
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	150390	CCTAGTGGTCTTATTCCTGTTATACACCTGTAGCATTGATGAGTAACACA	150439

C  AL929225.6	148917	CGTGACAATTGTAGCAGCTCCATTGTGTAATTTGTTTTATTTTGGGTTGC	148868
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	150440	CGTGACAATTGTAGCAGCTCCATTGTGTAATTTGTTTTATTTTGGGTTGC	150489

C  AL929225.6	148867	AAAAACGACCAGCAAATCCGAGCTGAGTCCTGCTAATTGTGCTGTAGTGT	148818
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	150490	AAAAACGACCAGCAAATCCGAGCTGAGTCCTGCTAATTGTGCTGTAGTGT	150539

C  AL929225.6	148817	ATGGCCGGGGTTTGCAAACAGTATATCGTGTAAATCCAATGACTTCTCTG	148768
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	150540	ATGGCCGGGGTTTGCAAACAGTATATCGTGTAAATCCAATGACTTCTCTG	150589

C  AL929225.6	148767	CGTCTTCTCAGCAATCCGAGCTTTGTAGTCTAAAAGTGGATATATGAATA	148718
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	150590	CGTCTTCTCAGCAATCCGAGCTTTGTAGTCTAAAAGTGGATATATGAATA	150639

C  AL929225.6	148717	GATGTAAAGTGTGATATTATTCCACCATAAACACTGGCATTAATGTATTA	148668
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	150640	GATGTAAAGTGTGATATTATTCCACCATAAACACTGGCATTAATGTATTA	150689

C  AL929225.6	148667	TTAGTCAACGGTGGTTAGAAGTTATAGCAGAGGGGGTGGGGGTGGGCCGT	148618
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	150690	TTAGTCAACGGTGGTTAGAAGTTATAGCAGAGGGGGTGGGGGTGGGCCGT	150739

C  AL929225.6	148617	TAACAGAATAAAGTGTACTTCTAATGTAATTTATTGTGTAAAAGTTTAAA	148568
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	150740	TAACAGAATAAAGTGTACTTCTAATGTAATTTATTGTGTAAAAGTTTAAA	150789

C  AL929225.6	148567	AAAGGAATTAAAGGTGCACAAGTCGGTTGTGTTCAATAGCATAGTGCTTT	148518
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	150790	AAAGGAATTAAAGGTGCACAAGTCGGTTGTGTTCAATAGCATAGTGCTTT	150839

C  AL929225.6	148517	TAACTCTTCATAGACTTCTGTATTGTTTTGTCGAAATGACATCATTGCAC	148468
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	150840	TAACTCTTCATAGACTTCTGTATTGTTTTGTCGAAATGACATCATTGCAC	150889

C  AL929225.6	148467	ACAGCTCTATGCAGAACCATACACGGCAACACAAATCAAGGTAATTCAGC	148418
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	150890	ACAGCTCTATGCAGAACCATACACGGCAACACAAATCAAGGTAATTCAGC	150939

C  AL929225.6	148417	ATTTGGTGACAAGAGAAGGAGTTGTACTTGCTGAGTATGTTGCCTATAAA	148368
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	150940	ATTTGGTGACAAGAGAAGGAGTTGTACTTGCTGAGTATGTTGCCTATAAA	150989

C  AL929225.6	148367	TACTCTGTTTACCATCTTGTACACTCAGGGTAAAAGTGAGCTTTGCATGT	148318
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	150990	TACTCTGTTTACCATCTTGTACACTCAGGGTAAAAGTGAGCTTTGCATGT	151039

C  AL929225.6	148317	GAGCTCATTTGTGATGTTTGGTCATGTATGATGCTGTTGTGCACTGGACT	148268
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	151040	GAGCTCATTTGTGATGTTTGGTCATGTATGATGCTGTTGTGCACTGGACT	151089

C  AL929225.6	148267	GCTTCAGGACCAATAAGAAACAGATTTATTGAAGGATGTAAGTTTGTATC	148218
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	151090	GCTTCAGGACCAATAAGAAACAGATTTATTGAAGGATGTAAGTTTGTATC	151139

C  AL929225.6	148217	TGTCTTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTAT	148168
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	151140	TGTCTTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTAT	151189

C  AL929225.6	148167	CTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCT	148118
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	151190	CTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCT	151239

C  AL929225.6	148117	ATCTATATTTCTGTCTATCTATATTTCTGTCTATCTATATTTCTGTCTAT	148068
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	151240	ATCTATATTTCTGTCTATCTATATTTCTGTCTATCTATATTTCTGTCTAT	151289

C  AL929225.6	148067	TTAGAAACGTGGGAAGTTGATTACATTTTTGATTTTACAGGAAGTGATGG	148018
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	151290	TTAGAAACGTGGGAAGTTGATTACATTTTTGATTTTACAGGAAGTGATGG	151339

C  AL929225.6	148017	GAAATTCAGCACTTCAAAATGACATTTGAGAAAAGGTGCATGAATCAGCT	147968
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	151340	GAAATTCAGCACTTCAAAATGACATTTGAGAAAAGGTGCATGAATCAGCT	151389

C  AL929225.6	147967	GCTTTGAAGTTGCCGAATACTGACATAACAATAAAGTATGTATCACACTA	147918
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	151390	GCTTTGAAGTTGCCGAATACTGACATAACAATAAAGTATGTATCACACTA	151439

C  AL929225.6	147917	TGAGATATCTTTATTCACAATACATATAGCTTTAGTGTATTTACTTATTG	147868
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	151440	TGAGATATCTTTATTCACAATACATATAGCTTTAGTGTATTTACTTATTG	151489

C  AL929225.6	147867	ACCTTAATTTTCACATATGTGCAGCCTTTGGAACCTTATTGGCTCGAATA	147818
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	151490	ACCTTAATTTTCACATATGTGCAGCCTTTGGAACCTTATTGGCTCGAATA	151539

C  AL929225.6	147817	TTGGCTAAAAGTTGAAGATTTTTAGCTGTATGCTAACAGCTCACTATGCT	147768
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	151540	TTGGCTAAAAGTTGAAGATTTTTAGCTGTATGCTAACAGCTCACTATGCT	151589

C  AL929225.6	147767	ACTTTTATATAGTCATAAACACATTTGTTTGCTGAGCAAGTAGCTTGACT	147718
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	151590	ACTTTTATATAGTCATAAACACATTTGTTTGCTGAGCAAGTAGCTTGACT	151639

C  AL929225.6	147717	GTACACTTATTTAGTTTGTTATTGCTGGTAATTTTCCCTAAAGGTGAATA	147668
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	151640	GTACACTTATTTAGTTTGTTATTGCTGGTAATTTTCCCTAAAGGTGAATA	151689

C  AL929225.6	147667	AATTGGAAGTCCTAAAACAATCAGCGAAAAGAGCTTGCTTCCGCGTTGCT	147618
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	151690	AATTGGAAGTCCTAAAACAATCAGCGAAAAGAGCTTGCTTCCGCGTTGCT	151739

C  AL929225.6	147617	AAAAAAGGTGAATAGAAGTTGGAAAAATCGGTAACACTTTACAATAACAG	147568
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	151740	AAAAAAGGTGAATAGAAGTTGGAAAAATCGGTAACACTTTACAATAACAG	151789

C  AL929225.6	147567	TACTTAAATAATGATGTGTTCATTTGTAAACTAATTTTTACTTTATTTCA	147518
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	151790	TACTTAAATAATGATGTGTTCATTTGTAAACTAATTTTTACTTTATTTCA	151839

C  AL929225.6	147517	TCATTTGTTCATATTTTAATTATGAACAAATGATGAGTTAATGCATGCGC	147468
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	151840	TCATTTGTTCATATTTTAATTATGAACAAATGATGAGTTAATGCATGCGC	151889

C  AL929225.6	147467	TAATCATGAACTGACTTACAACATAAGTCACATGTATGAATAACAGCTAC	147418
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	151890	TAATCATGAACTGACTTACAACATAAGTCACATGTATGAATAACAGCTAC	151939

C  AL929225.6	147417	CTCAATTACTTGTTAGTACATGATTGTTTGTTAATTAATGTATTAATTAC	147368
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	151940	CTCAATTACTTGTTAGTACATGATTGTTTGTTAATTAATGTATTAATTAC	151989

C  AL929225.6	147367	CACATTAGTTTATGCTTACTTTAACCATCATGAACTCATATGTTAATATA	147318
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	151990	CACATTAGTTTATGCTTACTTTAACCATCATGAACTCATATGTTAATATA	152039

C  AL929225.6	147317	TTATGTCATGACTTTACTTGGAGGGGCACATCACCATTTTAAACTACTCA	147268
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	152040	TTATGTCATGACTTTACTTGGAGGGGCACATCACCATTTTAAACTACTCA	152089

C  AL929225.6	147267	TGCACTTATGCATGTCCAACTAATGCATTTACACTGAATGAAAATAGAAA	147218
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	152090	TGCACTTATGCATGTCCAACTAATGCATTTACACTGAATGAAAATAGAAA	152139

C  AL929225.6	147217	AGTGTTCTGTCAACATCAACACGAACAGTTTTAGGACAGGAGTTCATGAG	147168
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	152140	AGTGTTCTGTCAACATCAACACGAACAGTTTTAGGACAGGAGTTCATGAG	152189

C  AL929225.6	147167	TAGTTAAGGAGGATTTAATGATGTGTGCTCCTCCAAGTAAAGTGACGAAA	147118
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	152190	TAGTTAAGGAGGATTTAATGATGTGTGCTCCTCCAAGTAAAGTGACGAAA	152239

C  AL929225.6	147117	TAATTATACATCAACAGCTCATGAGTTCATGTTGGTTACATTTAGCTTAA	147068
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	152240	TAATTATACATCAACAGCTCATGAGTTCATGTTGGTTACATTTAGCTTAA	152289

C  AL929225.6	147067	ACGCAAATGTTAATTAAACTAATTAACAACATGTACTAACAAGTAATTAT	147018
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	152290	ACGCAAATGTTAATTAAACTAATTAACAACATGTACTAACAAGTAATTAT	152339

C  AL929225.6	147017	GGCACTAATGTGACTCATGTTGTAGTTAAAGTTAGTTTATGATTAGCGTG	146968
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	152340	GGCACTAATGTGACTCATGTTGTAGTTAAAGTTAGTTTATGATTAGCGTG	152389

C  AL929225.6	146967	CGCCTTAACTCTTCATTAATTCACAATAAAATAATGTTTCATTATTCATG	146918
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	152390	CGCCTTAACTCTTCATTAATTCACAATAAAATAATGTTTCATTATTCATG	152439

C  AL929225.6	146917	TACTGTTAAAGTGTTACCCAAAAGTCCATTAAAACATTCATGAAACACGT	146868
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	152440	TACTGTTAAAGTGTTACCCAAAAGTCCATTAAAACATTCATGAAACACGT	152489

C  AL929225.6	146867	TTACTTCTAGCAGGATATGCTAACACAATTGAGAGCATAATGAGGGGGAT	146818
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	152490	TTACTTCTAGCAGGATATGCTAACACAATTGAGAGCATAATGAGGGGGAT	152539

C  AL929225.6	146817	AAAACAGCATCATATAGCCTCAACAAGTTTAAACCAAGCATATAGGGAAC	146768
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	152540	AAAACAGCATCATATAGCCTCAACAAGTTTAAACCAAGCATATAGGGAAC	152589

C  AL929225.6	146767	AAAGGTGGATAAGTTACTTTGAATTTCAGAAACTGTTGATCTGATGGGAT	146718
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	152590	AAAGGTGGATAAGTTACTTTGAATTTCAGAAACTGTTGATCTGATGGGAT	152639

C  AL929225.6	146717	TTTAATCTCAACCATATCTAGTCTTTAGAGCATGGTAGAATAATATTAGA	146668
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	152640	TTTAATCTCAACCATATCTAGTCTTTAGAGCATGGTAGAATAATATTAGA	152689

C  AL929225.6	146667	GAAAAAATTGCATGCTGGTTTGAGCTAAAAGAGAGACTACAGAAACTCTT	146618
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	152690	GAAAAAATTGCATGCTGGTTTGAGCTAAAAGAGAGACTACAGAAACTCTT	152739

C  AL929225.6	146617	TTAAATGTAAACGCACCAACATATACACAGAAAACAAAATCTATGATTGT	146568
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	152740	TTAAATGTAAACGCACCAACATATACACAGAAAACAAAATCTATGATTGT	152789

C  AL929225.6	146567	ACAAAAATGTGCCTGGTCTGGTGATGAGTCTCAATTTCTGCTGCTACATT	146518
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	152790	ACAAAAATGTGCCTGGTCTGGTGATGAGTCTCAATTTCTGCTGCTACATT	152839

C  AL929225.6	146517	TAATGGTATGGCCTAAAATTGAGCTAAAACAACATGAAAGCATGGTTTCA	146468
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	152840	TAATGGTATGGCCTAAAATTGAGCTAAAACAACATGAAAGCATGGTTTCA	152889

C  AL929225.6	146467	AAGTGCCTTGAATTAACTACAGTCTGTTACTGGTGGTGTGGAATATTTTC	146418
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	152890	AAGTGCCTTGAATTAACTACAGTCTGTTACTGGTGGTGTGGAATATTTTC	152939

C  AL929225.6	146417	TTGGCTCACTGTACTAAACTATTTGAGATGTAAGAGCTGGGGCCTGTACC	146368
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	152940	TTGGCTCACTGTACTAAACTATTTGAGATGTAAGAGCTGGGGCCTGTACC	152989

C  AL929225.6	146367	ATCAAGCTGGATAGCCAGTTAAGTTTCAGTTTAGTTTGCAGCGATCTTGG	146318
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	152990	ATCAAGCTGGATAGCCAGTTAAGTTTCAGTTTAGTTTGCAGCGATCTTGG	153039

C  AL929225.6	146317	GTGTAGGTATCATGAAAGCAGCGTGTCTTTAATCAGTTTTTTGTTGCCAT	146268
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	153040	GTGTAGGTATCATGAAAGCAGCGTGTCTTTAATCAGTTTTTTGTTGCCAT	153089

C  AL929225.6	146267	GGTGTTATGGAGCAGCTGAGCCGCCTGCATGGTACCTAAAACCCAGAACA	146218
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	153090	GGTGTTATGGAGCAGCTGAGCCGCCTGCATGGTACCTAAAACCCAGAACA	153139

C  AL929225.6	146217	AAACAGAAACTAAACTGACTAGCCAGCTTATCTAGCTTCATGATACAGCC	146168
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	153140	AAACAGAAACTAAACTGACTAGCCAGCTTATCTAGCTTCATGATACAGCC	153189

C  AL929225.6	146167	CTCTGATCTGATTTAGAGGACAATACTTTTGAAAATAAAGTTCTTTATTG	146118
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	153190	CTCTGATCTGATTTAGAGGACAATACTTTTGAAAATAAAGTTCTTTATTG	153239

C  AL929225.6	146117	TTATCGATGGTTCCGTGAGGAATATTTACCACTTGTACATCAAATTTTTA	146068
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	153240	TTATCGATGGTTCCGTGAGGAATATTTACCACTTGTACATCAAATTTTTA	153289

C  AL929225.6	146067	AAAAAATGTGACCCATAAGGGCATATAAGAAAAAATGTCTGTGTTCGAAA	146018
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	153290	AAAAAATGTGACCCATAAGGGCATATAAGAAAAAATGTCTGTGTTCGAAA	153339

C  AL929225.6	146017	ACCAACATTTGGTTGGTCACAATTCACGGTATTAACAAAGCATTAAGTAA	145968
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	153340	ACCAACATTTGGTTGGTCACAATTCACGGTATTAACAAAGCATTAAGTAA	153389

C  AL929225.6	145967	CACCACTAGCTTAACAAACTACTAAAATTATCTGTTATAAGGTGGAGGTT	145918
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	153390	CACCACTAGCTTAACAAACTACTAAAATTATCTGTTATAAGGTGGAGGTT	153439

C  AL929225.6	145917	GGGTTTGGGAAGGATTTCCCTGCTGAAAAATCCAGCTTAAACCAGCCTAG	145868
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX248581.17	153440	GGGTTTGGGAAGGATTTCCCTGCTGAAAAATCCAGCTTAAACCAGCCTAG	153489

C  AL929225.6	145867	GCTGGTT	145861
			|||||||
  BX248581.17	153490	GCTGGTT	153496

Overview

Query
AL929225.6 - 151067 bps
Hit
BX248581.17 - 202872 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 5207 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
110050095207145861151067-11482901534961
282.682124471299231303691652370011
384.852254584648446941-1657070311
482.921803881159941163811659870011
587.3920733332005323371732576651
683.4418932894949952761732576681
778.311955274648347009112826133921
882.33191430129923130352-112888133511
982.36177404129985130388-121022214461
1085.242104234651846940121041214671
1180.331643603877739136156323566781
1284.271933293200932337-156324566601
1385.131533154663146945156744570661
1481.433607497717377921-191796925761
1599.71477404953895996145533-11534792028721
1680.96158402115994116395-11686301690231
1783.81301562121017121578-11711711717321
1883.81300562127281127842-11774351779961
1981.15196431111177111607-11819581823551
2081.8158394129990130383-11826181830181
2182.84192398116658117055-11874051878351
Short-link