<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX119957.13	1	GGCCGCGCCAGCTTGGAGAGCCAGCCCCATCGGGGTTCCCCGCCGCCGGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	32552	GGCCGCGCCAGCTTGGAGAGCCAGCCCCATCGGGGTTCCCCGCCGCCGGA	32601

BX119957.13	51	AGCGGAAATAGCACCGGGCGCCGCCACAGTAGCTGTAACTGCCACCGCGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	32602	AGCGGAAATAGCACCGGGCGCCGCCACAGTAGCTGTAACTGCCACCGCGA	32651

BX119957.13	101	TGCCGAAGGCGCCCAAGCAGCAGCCGCCGGAGCCCGAGTGGATCGGGGAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	32652	TGCCGAAGGCGCCCAAGCAGCAGCCGCCGGAGCCCGAGTGGATCGGGGAC	32701

BX119957.13	151	GGAGAGAGCACGAGCCCATCAGGTGAGGCTGGTAGGCAAGGAAGAAACGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	32702	GGAGAGAGCACGAGCCCATCAGGTGAGGCTGGTAGGCAAGGAAGAAACGA	32751

BX119957.13	201	GCAGAGGGGGAAGAGAGAGGAGACTGCGCGTGTTTTAAGAGAGGGTCATG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	32752	GCAGAGGGGGAAGAGAGAGGAGACTGCGCGTGTTTTAAGAGAGGGTCATG	32801

BX119957.13	251	GGGCACGAGACTGACCGGGCCCGTGCGGGAGTTACTGCGCATGCGTGCCG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	32802	GGGCACGAGACTGACCGGGCCCGTGCGGGAGTTACTGCGCATGCGTGCCG	32851

BX119957.13	301	TGGGCCCGGGAGGAGTTTGCCGGGGAGGAGTGGGTTTGGAATCGGGGTTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	32852	TGGGCCCGGGAGGAGTTTGCCGGGGAGGAGTGGGTTTGGAATCGGGGTTA	32901

BX119957.13	351	AAGGAAAGAGATCCAGATGTCGCACGTGACCTAAGTGAGACTGGGCGAGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	32902	AAGGAAAGAGATCCAGATGTCGCACGTGACCTAAGTGAGACTGGGCGAGA	32951

BX119957.13	401	TAAAAGAAAGAGCATATGGCACCGAGGGAGAGATGGGGAGAAATGGGAAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	32952	TAAAAGAAAGAGCATATGGCACCGAGGGAGAGATGGGGAGAAATGGGAAA	33001

BX119957.13	451	ACCTTGCTTAAAAAATTTGGACATCCGCCCCACCATACACTGTATTCCAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	33002	ACCTTGCTTAAAAAATTTGGACATCCGCCCCACCATACACTGTATTCCAC	33051

BX119957.13	501	CAGGAATATATGAGCCCTGCCTCGACCTCCCCTTCCCCCTGCGCGCGCAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	33052	CAGGAATATATGAGCCCTGCCTCGACCTCCCCTTCCCCCTGCGCGCGCAT	33101

BX119957.13	551	ACACACACCTTGGGAGCCTGTGATCCCCCTTGTTTCTCAAGAGAGGGTGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	33102	ACACACACCTTGGGAGCCTGTGATCCCCCTTGTTTCTCAAGAGAGGGTGA	33151

BX119957.13	601	CTCCTTCATGGTTTCTTTCTTAAGACACCCCTCTCACTCAACTGGAGCAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	33152	CTCCTTCATGGTTTCTTTCTTAAGACACCCCTCTCACTCAACTGGAGCAA	33201

BX119957.13	651	GAGTGTAGATTTTTGATGTTGGAATGAGGGTTAAGGTTTACTTAAAAAGC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	33202	GAGTGTAGATTTTTGATGTTGGAATGAGGGTTAAGGTTTACTTAAAAAGC	33251

BX119957.13	701	AGCGAAAGTTTGTTAAGCGCTTGTTTTTAATTAAGCACTCTATATACTGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	33252	AGCGAAAGTTTGTTAAGCGCTTGTTTTTAATTAAGCACTCTATATACTGT	33301

BX119957.13	751	GCTTTGAGAGGGGAAGGAAAAAAACATGAAGATATCTTCCCAGGGTTGAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	33302	GCTTTGAGAGGGGAAGGAAAAAAACATGAAGATATCTTCCCAGGGTTGAA	33351

BX119957.13	801	GTCAGTTTTAAGGGGGACATAAATGGACACAACTAACCCCAGTAGGTACA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	33352	GTCAGTTTTAAGGGGGACATAAATGGACACAACTAACCCCAGTAGGTACA	33401

BX119957.13	851	CAGTAACTAATTTTAAAAGCACTTATTGGATGCCTACTGTATACCAGGTA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	33402	CAGTAACTAATTTTAAAAGCACTTATTGGATGCCTACTGTATACCAGGTA	33451

BX119957.13	901	CTGTGTGGAGGAAGTGGGAATGTAGAGATAAAAGATAAGACTTTCCCTCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	33452	CTGTGTGGAGGAAGTGGGAATGTAGAGATAAAAGATAAGACTTTCCCTCA	33501

BX119957.13	951	AGGGACAACCCAGTATGGTGAAGGGTCAGAGCATTAACCAGACAGACAGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	33502	AGGGACAACCCAGTATGGTGAAGGGTCAGAGCATTAACCAGACAGACAGT	33551

BX119957.13	1001	GGTTGTCAGAGTATGATGAAGGTGCTTAAGAATGTTATGGGACTGTAGAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	33552	GGTTGTCAGAGTATGATGAAGGTGCTTAAGAATGTTATGGGACTGTAGAA	33601

BX119957.13	1051	GAGAGGAGGAGCATCTACTCAGACAGGTAAGGGAGTGTCAGCAAAGCCTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	33602	GAGAGGAGGAGCATCTACTCAGACAGGTAAGGGAGTGTCAGCAAAGCCTC	33651

BX119957.13	1101	CCAAGAATATGTAATAGCTGAGTATTTTTTTTTGAGGCACATTGTAGCTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	33652	CCAAGAATATGTAATAGCTGAGTATTTTTTTTTGAGGCACATTGTAGCTC	33701

BX119957.13	1151	CATCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGAACATGGCTCACTGCAGCCTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	33702	CATCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGAACATGGCTCACTGCAGCCTC	33751

BX119957.13	1201	CACCTCCTGGGTTTAAAGGATCTTCCTGCCTCAGTCTCCCAAGTAGTTGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	33752	CACCTCCTGGGTTTAAAGGATCTTCCTGCCTCAGTCTCCCAAGTAGTTGA	33801

BX119957.13	1251	GACTACTGGCATGCACCACCACACCTTATTTTTAAAATTTTTTGTAGACA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	33802	GACTACTGGCATGCACCACCACACCTTATTTTTAAAATTTTTTGTAGACA	33851

BX119957.13	1301	CAAGATCTGGCTATGTTGCCTAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	33852	CAAGATCTGGCTATGTTGCCTAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGT	33901

BX119957.13	1351	AATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	33902	AATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCA	33951

BX119957.13	1401	CTACATCTGCTCCCCAGAGTTTATTCTTGAAAGATCATCGTGAATTAGCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	33952	CTACATCTGCTCCCCAGAGTTTATTCTTGAAAGATCATCGTGAATTAGCA	34001

BX119957.13	1451	AGGGGAAGCGCATTCCAAGCCAAGGAAGTTTGTGGAAGGTAGAGATGTAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	34002	AGGGGAAGCGCATTCCAAGCCAAGGAAGTTTGTGGAAGGTAGAGATGTAG	34051

BX119957.13	1501	GCAAGCCTGACTGGTCCCACTAGAGCCTGGTGACTAGTGTGATGAAGTCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	34052	GCAAGCCTGACTGGTCCCACTAGAGCCTGGTGACTAGTGTGATGAAGTCA	34101

BX119957.13	1551	GAAAGATGCTCAGGAGACAGATAATGAAAGGCTTTAGATGCCATTCCGAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	34102	GAAAGATGCTCAGGAGACAGATAATGAAAGGCTTTAGATGCCATTCCGAG	34151

BX119957.13	1601	GAGTTTAATCCTAAAGACATTAAGAAGGAAGGCCCATTGAAGTGCATAAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	34152	GAGTTTAATCCTAAAGACATTAAGAAGGAAGGCCCATTGAAGTGCATAAG	34201

BX119957.13	1651	GAATGATTATGAACAGTTCACCTGTAGCACTGAGCAATGGAGAATGAATG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	34202	GAATGATTATGAACAGTTCACCTGTAGCACTGAGCAATGGAGAATGAATG	34251

BX119957.13	1701	GCCTTGAACTGGTCAAGATGGAGGTGGGGAGACCATTTAGGGGGCTCTGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	34252	GCCTTGAACTGGTCAAGATGGAGGTGGGGAGACCATTTAGGGGGCTCTGG	34301

BX119957.13	1751	CCATGATCTAGGTGAGAAGTGGTAAGGGGATAAGCCAAGGCCTGAAGAAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	34302	CCATGATCTAGGTGAGAAGTGGTAAGGGGATAAGCCAAGGCCTGAAGAAT	34351

BX119957.13	1801	AAAGAGTTACTAAGGAGGCGGCATTGATCGGAACTGAGAACTGATTAAAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	34352	AAAGAGTTACTAAGGAGGCGGCATTGATCGGAACTGAGAACTGATTAAAT	34401

BX119957.13	1851	GAAGGGAGAAGTAAGGTTGACACTTAAGTAACCCAGTGACTAGTAGACTA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	34402	GAAGGGAGAAGTAAGGTTGACACTTAAGTAACCCAGTGACTAGTAGACTA	34451

BX119957.13	1901	TTAACTGAAAGCAGTAATGGACAGGAGAGTAAGAAGTGGAAAGAGATAAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	34452	TTAACTGAAAGCAGTAATGGACAGGAGAGTAAGAAGTGGAAAGAGATAAG	34501

BX119957.13	1951	GTGAACTTCTGAATGCTGAGTTAGGCGTTTCTGAGGATTTCTAAAAGGAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248518.5	34502	GTGAACTTCTGAATGCTGAGTTAGGCGTTTCTGAGGATTTCTAAAAGGAA	34551

Overview

Query
BX119957.13 - 112118 bps
Hit
BX248518.5 - 34551 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link