<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX248093.4	1	GGCCAACACAAAGAAACCCCGTTTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	73843	GGCCAACACAAAGAAACCCCGTTTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTG	73892

BX248093.4	51	GGCATGGTGGCGGGCATCCGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAAGCAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	73893	GGCATGGTGGCGGGCATCCGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAAGCAG	73942

BX248093.4	101	GAGAATCACTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	73943	GAGAATCACTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTG	73992

BX248093.4	151	CCATTGCATTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTAAAATTCATTCTCAAACAAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	73993	CCATTGCATTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTAAAATTCATTCTCAAACAAA	74042

BX248093.4	201	ACAAAAACAAAGCCAGCTAGATTGAAGCCAAATTACATACCAAAAACAGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	74043	ACAAAAACAAAGCCAGCTAGATTGAAGCCAAATTACATACCAAAAACAGT	74092

BX248093.4	251	TCTGAAAAGGTGCATATGATGAATTTTATCAAGAGATCAGAGGGTTCAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	74093	TCTGAAAAGGTGCATATGATGAATTTTATCAAGAGATCAGAGGGTTCAAA	74142

BX248093.4	301	GTGTTTGAAGACTTTGATTCTGATGGAATAATTTTTGGCTTGGAATAACT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	74143	GTGTTTGAAGACTTTGATTCTGATGGAATAATTTTTGGCTTGGAATAACT	74192

BX248093.4	351	GGTAATTTAATTATAAGGATATTAAAATCCCTAACTAAAGGCGTAGACAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	74193	GGTAATTTAATTATAAGGATATTAAAATCCCTAACTAAAGGCGTAGACAG	74242

BX248093.4	401	GATGGTTATAGAATAATAGTATACAAGTGGAAGGCAATCCATCAAAGTCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	74243	GATGGTTATAGAATAATAGTATACAAGTGGAAGGCAATCCATCAAAGTCT	74292

BX248093.4	451	CCTGACTACCCTGAAGTTGATAGGAAATTGACATGACTTGTCTCAAGGAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	74293	CCTGACTACCCTGAAGTTGATAGGAAATTGACATGACTTGTCTCAAGGAA	74342

BX248093.4	501	CAGAGTACATTGGGGGAACTTCTGAAAAGAAAGGAGTTTCTAACTTTGAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	74343	CAGAGTACATTGGGGGAACTTCTGAAAAGAAAGGAGTTTCTAACTTTGAA	74392

BX248093.4	551	GACATGTCATATGGGTTCAGCATTGCTTCCTAAACAGAAGAAGACTTTTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	74393	GACATGTCATATGGGTTCAGCATTGCTTCCTAAACAGAAGAAGACTTTTC	74442

BX248093.4	601	TTTCTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTGAGACAGATTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	74443	TTTCTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTGAGACAGATTC	74492

BX248093.4	651	CTACTCTGTCACCCACGCTGGAGTGAGTGGCGCGATCTGGGCTAACTGCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	74493	CTACTCTGTCACCCACGCTGGAGTGAGTGGCGCGATCTGGGCTAACTGCA	74542

BX248093.4	701	ACTTCTGACTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCTTGCCCCAGCCTCCTGAGTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	74543	ACTTCTGACTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCTTGCCCCAGCCTCCTGAGTA	74592

BX248093.4	751	TCTGGGATTACAGGCGTGTACCACCATGCCCTGCTAATTTTTTTGTACTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	74593	TCTGGGATTACAGGCGTGTACCACCATGCCCTGCTAATTTTTTTGTACTT	74642

BX248093.4	801	TTAGTAGAGATGGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	74643	TTAGTAGAGATGGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCT	74692

BX248093.4	851	GACCTCATGTGATCTGCCCACCTTGGCCCCCACAAAGTACTGGGATTACA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	74693	GACCTCATGTGATCTGCCCACCTTGGCCCCCACAAAGTACTGGGATTACA	74742

BX248093.4	901	GGCGTGAACCACCGCGCCCAGCCAACAGAGGAAGGATTTTCTAATTGTTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	74743	GGCGTGAACCACCGCGCCCAGCCAACAGAGGAAGGATTTTCTAATTGTTG	74792

BX248093.4	951	ACAGAATTTAGTGAAATCACCAGAGCCTGGAAAATAGGAAAATGAGTTCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	74793	ACAGAATTTAGTGAAATCACCAGAGCCTGGAAAATAGGAAAATGAGTTCA	74842

BX248093.4	1001	AAGGTCATTACCATCATTGAAGATAAGGAAAGACTAAGAAGATTCTCATC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	74843	AAGGTCATTACCATCATTGAAGATAAGGAAAGACTAAGAAGATTCTCATC	74892

BX248093.4	1051	ACAATGGAGTACTTCTTATTTCTTACAGAAAAAGATTCTTGGCATCAGCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	74893	ACAATGGAGTACTTCTTATTTCTTACAGAAAAAGATTCTTGGCATCAGCC	74942

BX248093.4	1101	TCTTGAAGGCCTCCTTCATATCTTTATTTCTAAGGCTGTAGATGAGGGAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	74943	TCTTGAAGGCCTCCTTCATATCTTTATTTCTAAGGCTGTAGATGAGGGAG	74992

BX248093.4	1151	TTCAACATGGATGTGATGATTCCATAGAAGAGGGAAACCATCTTTCCCCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	74993	TTCAACATGGATGTGATGATTCCATAGAAGAGGGAAACCATCTTTCCCCA	75042

BX248093.4	1201	GTCCTTAGAGGTGGATGAAGGTGGTTGAAGATACATATAAATGGCTGTTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	75043	GTCCTTAGAGGTGGATGAAGGTGGTTGAAGATACATATAAATGGCTGTTC	75092

BX248093.4	1251	CATAAAAGAGGGACACCACAATCATGTGGGACCCACATGTCCCAAATGCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	75093	CATAAAAGAGGGACACCACAATCATGTGGGACCCACATGTCCCAAATGCT	75142

BX248093.4	1301	TTTTGCCGTCCTTCTGCTGACCTGATTTTTAATACTGCTTGAGCTATGAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	75143	TTTTGCCGTCCTTCTGCTGACCTGATTTTTAATACTGCTTGAGCTATGAA	75192

BX248093.4	1351	GCCATAGGAGATGAGGATCAATGTCACTGGAATTAGAAGAATTAGTACAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	75193	GCCATAGGAGATGAGGATCAATGTCACTGGAATTAGAAGAATTAGTACAC	75242

BX248093.4	1401	TAAAGAAGAAGAGCTCAGCCTCAATAGGCTTTGTGTCAGCACATGACAAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	75243	TAAAGAAGAAGAGCTCAGCCTCAATAGGCTTTGTGTCAGCACATGACAAC	75292

BX248093.4	1451	TTGAGAAGTGCAGGCACCTCACAGAAAAAGTGGTCCACTTCCTGGTGACC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	75293	TTGAGAAGTGCAGGCACCTCACAGAAAAAGTGGTCCACTTCCTGGTGACC	75342

BX248093.4	1501	ACAGCGTGGCATGTTAAGAGTCAAGGAAGACTGCAGCACTGAGTTGCCGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	75343	ACAGCGTGGCATGTTAAGAGTCAAGGAAGACTGCAGCACTGAGTTGCCGA	75392

BX248093.4	1551	AACCAATGAGCCATGAGAAGGCTGCCATCCTTAGGCAGAACCAATAATTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	75393	AACCAATGAGCCATGAGAAGGCTGCCATCCTTAGGCAGAACCAATAATTC	75442

BX248093.4	1601	ATGATGACTACATAGTGGAGGGGTCTGCAAACAGCCACATATCTGTCAAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	75443	ATGATGACTACATAGTGGAGGGGTCTGCAAACAGCCACATATCTGTCAAA	75492

BX248093.4	1651	GGACATAACAGCCAGAAGGAGACACTCTGTAGCACCTAGGGCCAGGAAGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	75493	GGACATAACAGCCAGAAGGAGACACTCTGTAGCACCTAGGGCCAGGAAGA	75542

BX248093.4	1701	TGATGAGGTGGGCCACACAGCCAGCATAGCTGATGGTCTTTTTGTTGCAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	75543	TGATGAGGTGGGCCACACAGCCAGCATAGCTGATGGTCTTTTTGTTGCAA	75592

BX248093.4	1751	CCAATATTTACCAACATATGAGGGACTGTAGTTGTGGTATAGCAGAGATC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	75593	CCAATATTTACCAACATATGAGGGACTGTAGTTGTGGTATAGCAGAGATC	75642

BX248093.4	1801	TAAGATGGAGAGATTAGTGAGAAAGAAATACATGGGAGTATGAAGTTTGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	75643	TAAGATGGAGAGATTAGTGAGAAAGAAATACATGGGAGTATGAAGTTTGG	75692

BX248093.4	1851	GATCCAGAATGCACACCATCATGATGGACACATTGCCAAATATGGTGATT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	75693	GATCCAGAATGCACACCATCATGATGGACACATTGCCAAATATGGTGATT	75742

BX248093.4	1901	GTGTATGATATTAACAGGACCACAAAAAGGGGCATTTGTAGCCAAGCCCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	75743	GTGTATGATATTAACAGGACCACAAAAAGGGGCATTTGTAGCCAAGCCCT	75792

BX248093.4	1951	ATCTGAGAAGCCAAGTAGTATAAACTCTTTTGGGGAGCTCTCATTTTCCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX248413.5	75793	ATCTGAGAAGCCAAGTAGTATAAACTCTTTTGGGGAGCTCTCATTTTCCC	75842

Overview

Query
BX248093.4 - 111633 bps
Hit
BX248413.5 - 75842 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link