<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX470206.6	1	GGGGACTATAACCAGGCATTCCAAGCATGATGACTGGACATTAAAAATGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	46455	GGGGACTATAACCAGGCATTCCAAGCATGATGACTGGACATTAAAAATGG	46504

BX470206.6	51	CAGATCAGTGAAATAAGGAAGGGCTTGTTGGTGAGACATCCAGGCTCCCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	46505	CAGATCAGTGAAATAAGGAAGGGCTTGTTGGTGAGACATCCAGGCTCCCC	46554

BX470206.6	101	GGCTGGCAGCAGAGATCACTTCAGTTCAGCTTGGAGACGTCCAGCACCAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	46555	GGCTGGCAGCAGAGATCACTTCAGTTCAGCTTGGAGACGTCCAGCACCAG	46604

BX470206.6	151	TGAGACCTAGAATGGTGCATGGCAAATGCCCATGTCCTCCTAGGGCCTCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	46605	TGAGACCTAGAATGGTGCATGGCAAATGCCCATGTCCTCCTAGGGCCTCA	46654

BX470206.6	201	GTTTCATGGGGATTCAAGGGAACACCCTGGACTCCATCGTCCAGCTTAGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	46655	GTTTCATGGGGATTCAAGGGAACACCCTGGACTCCATCGTCCAGCTTAGC	46704

BX470206.6	251	TCACAGGGATGCCGATGACCTCCTGGATTTTGGTACATGTTTCTGTGGTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	46705	TCACAGGGATGCCGATGACCTCCTGGATTTTGGTACATGTTTCTGTGGTT	46754

BX470206.6	301	GCAGGATTCTCTTGTTACCTAGAAAGCCACCTCCTCTACTGTCACTGAAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	46755	GCAGGATTCTCTTGTTACCTAGAAAGCCACCTCCTCTACTGTCACTGAAA	46804

BX470206.6	351	CACCTCTAGGGTATATACTAAACATTGGAATATTTTGAAACTGTATAAAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	46805	CACCTCTAGGGTATATACTAAACATTGGAATATTTTGAAACTGTATAAAT	46854

BX470206.6	401	TAAAAGATAATAGGTGGGTGCGATGGCTTACACCTGTAATCTCAGCACTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	46855	TAAAAGATAATAGGTGGGTGCGATGGCTTACACCTGTAATCTCAGCACTT	46904

BX470206.6	451	TGCGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGATTTTGAGACCAGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	46905	TGCGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGATTTTGAGACCAGC	46954

BX470206.6	501	CTGACCAACATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	46955	CTGACCAACATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTG	47004

BX470206.6	551	GGCATGGCGGCACATTCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	47005	GGCATGGCGGCACATTCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG	47054

BX470206.6	601	GAGAATTGCTTGAACCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTAAGCCGAGATTATGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	47055	GAGAATTGCTTGAACCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTAAGCCGAGATTATGC	47104

BX470206.6	651	CATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCGTCTCAAAAAAAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	47105	CATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCGTCTCAAAAAAAA	47154

BX470206.6	701	ATTTTTTTTTAAATAAATATAATAAACAGTTGCCAAAGAATAAAACTATT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	47155	ATTTTTTTTTAAATAAATATAATAAACAGTTGCCAAAGAATAAAACTATT	47204

BX470206.6	751	GATACAATCCTCACCACTTTAAGGCTTAAGGTTTTCTTTTCCATCACTGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	47205	GATACAATCCTCACCACTTTAAGGCTTAAGGTTTTCTTTTCCATCACTGA	47254

BX470206.6	801	GTCTCTCCCTTTCCTCTCATTCTTCCACTTACAAATCTCCAAAACAATTC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	47255	GTCTCTCCCTTTCCTCTCATTCTTCCACTTACAAATCTCCAAAACAATTC	47304

BX470206.6	851	TCACGCACTGTGACTTTGCTCCCTTCAGCTGATTTATCAGTTCATCCTGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	47305	TCACGCACTGTGACTTTGCTCCCTTCAGCTGATTTATCAGTTCATCCTGA	47354

BX470206.6	901	TAGCCTGATAGGTGACAAGCAGAGGTGAGGACTTCAAAGTTCACACCAAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	47355	TAGCCTGATAGGTGACAAGCAGAGGTGAGGACTTCAAAGTTCACACCAAG	47404

BX470206.6	951	TAGATCTAGTTCACTGTGGCCCTCCTTGACAGGAGGTTTGTGAAGCTGGC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	47405	TAGATCTAGTTCACTGTGGCCCTCCTTGACAGGAGGTTTGTGAAGCTGGC	47454

BX470206.6	1001	AGGGCTTCCGTCCAGGCTGTGCACTGTCTGGGAATCCTCATTTGCAATGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	47455	AGGGCTTCCGTCCAGGCTGTGCACTGTCTGGGAATCCTCATTTGCAATGT	47504

BX470206.6	1051	CTGGAGATCTTCATTTTTCTTACTGCTAACAATCATCTTGTTATGTTTGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	47505	CTGGAGATCTTCATTTTTCTTACTGCTAACAATCATCTTGTTATGTTTGC	47554

BX470206.6	1101	ACTTCTTTGCATCTCACCCCTTTTGAATTCTGTCCTTCCATGAAAATTTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	47555	ACTTCTTTGCATCTCACCCCTTTTGAATTCTGTCCTTCCATGAAAATTTA	47604

BX470206.6	1151	TTGTCCTTTTTGATCCATCTGTATTCACAGACTTTCATTTGCTTTCTTTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	47605	TTGTCCTTTTTGATCCATCTGTATTCACAGACTTTCATTTGCTTTCTTTT	47654

BX470206.6	1201	TCTCTCTAACCCGTAAGACTGATAAAAATTGTCCTAAAGGTTCTTTCTTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	47655	TCTCTCTAACCCGTAAGACTGATAAAAATTGTCCTAAAGGTTCTTTCTTT	47704

BX470206.6	1251	CTGCTTTGTGTGTCAGGGCTCCTCTGCCTTTGGTGAGAGCAAAGAGAGTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	47705	CTGCTTTGTGTGTCAGGGCTCCTCTGCCTTTGGTGAGAGCAAAGAGAGTT	47754

BX470206.6	1301	TTATCTTTACCGGAAGAAAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAAAAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	47755	TTATCTTTACCGGAAGAAAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAAAAT	47804

BX470206.6	1351	CTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCCCGATCTCAGCTCACTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	47805	CTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCCCGATCTCAGCTCACTG	47854

BX470206.6	1401	CAACCTCCACCTCCCTGGTTTGAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTCCCGAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	47855	CAACCTCCACCTCCCTGGTTTGAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTCCCGAG	47904

BX470206.6	1451	TAGCTGGGACTACAGGTGTGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTTGTAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	47905	TAGCTGGGACTACAGGTGTGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTTGTAT	47954

BX470206.6	1501	TTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGACTGCTCTGGAACTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	47955	TTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGACTGCTCTGGAACTC	48004

BX470206.6	1551	CTGACCTCAGGCAATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAATGCTGTGATTAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	48005	CTGACCTCAGGCAATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAATGCTGTGATTAC	48054

BX470206.6	1601	AGGTGTGAGCCACAGTGCCCAGCCCTGGAAGAAAACTAATTGCTGGGTGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	48055	AGGTGTGAGCCACAGTGCCCAGCCCTGGAAGAAAACTAATTGCTGGGTGA	48104

BX470206.6	1651	AATATATTTTCTACCAAATTCCCCTTACGAGACCTAGAAAGCCTAATGAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	48105	AATATATTTTCTACCAAATTCCCCTTACGAGACCTAGAAAGCCTAATGAA	48154

BX470206.6	1701	CATAGCTACTTACATGTCCTAAGCTGTTATTTTAAGGCCAAAATTAAAAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	48155	CATAGCTACTTACATGTCCTAAGCTGTTATTTTAAGGCCAAAATTAAAAC	48204

BX470206.6	1751	ATTAAGGGCACATATAAGGTTGGCCATTACTAACCTGAAAAAAAAGATAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	48205	ATTAAGGGCACATATAAGGTTGGCCATTACTAACCTGAAAAAAAAGATAA	48254

BX470206.6	1801	ATAAATTTCCATGATTAGGTCTTTTCAACACTGCATGGTCCCAAACAATA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	48255	ATAAATTTCCATGATTAGGTCTTTTCAACACTGCATGGTCCCAAACAATA	48304

BX470206.6	1851	CTGTTTTACAATTAGAGTTTTTGTTGTTGTTGCTGTTTTTAAATAAAAAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	48305	CTGTTTTACAATTAGAGTTTTTGTTGTTGTTGCTGTTTTTAAATAAAAAC	48354

BX470206.6	1901	AAAGGAAGTTTGGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	48355	AAAGGAAGTTTGGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGG	48404

BX470206.6	1951	AGGCCAAGGCGGGCAGATCACGAGGTCAGGAATTTGAGACCAGCCTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088580.11	48405	AGGCCAAGGCGGGCAGATCACGAGGTCAGGAATTTGAGACCAGCCTGGCC	48454

Overview

Query
BX470206.6 - 58846 bps
Hit
BX088580.11 - 48454 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link