<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX470194.8	1	CTCATTTCTTTTTCACCTTCCTTCTGCCGTCACAATCGCCTTCAGTGATG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	85598	CTCATTTCTTTTTCACCTTCCTTCTGCCGTCACAATCGCCTTCAGTGATG	85647

BX470194.8	51	TCGAAGCTCACGGCATAGAAATGGGTTATAAATGGAGGCAACCCATTGGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	85648	TCGAAGCTCACGGCATAGAAATGGGTTATAAATGGAGGCAACCCATTGGG	85697

BX470194.8	101	TTACGTCTTTACTCTCTATATGTGCAGAAATAGGACAGAAAAAGGTGCGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	85698	TTACGTCTTTACTCTCTATATGTGCAGAAATAGGACAGAAAAAGGTGCGG	85747

BX470194.8	151	AGGCAGAAGTAAGTCTATGTTGCTTGAGAATTAGGTTTGAGCACTACCAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	85748	AGGCAGAAGTAAGTCTATGTTGCTTGAGAATTAGGTTTGAGCACTACCAG	85797

BX470194.8	201	AGCAAAAAGTCACCGTTTGGAGGTGCCGGGGATCGAACCCGGGACCTCAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	85798	AGCAAAAAGTCACCGTTTGGAGGTGCCGGGGATCGAACCCGGGACCTCAT	85847

BX470194.8	251	ACATGCAAAGCATGCGCTCTACCACTGAGCTACACCCCCTTCCTGAAAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	85848	ACATGCAAAGCATGCGCTCTACCACTGAGCTACACCCCCTTCCTGAAAAA	85897

BX470194.8	301	AATCCTTCTTGTAATAATTTCCAGGAGGTAACTTTCTTTTTCTGAGTATT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	85898	AATCCTTCTTGTAATAATTTCCAGGAGGTAACTTTCTTTTTCTGAGTATT	85947

BX470194.8	351	GTGGAGCGTCTGCAGCTGCTGTGAGTAGAAGATACTAGGTACTAACGGGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	85948	GTGGAGCGTCTGCAGCTGCTGTGAGTAGAAGATACTAGGTACTAACGGGG	85997

BX470194.8	401	GATACAAATTATTTAGAATACAGTATACGACTTGAAATGGAAGGCGCCTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	85998	GATACAAATTATTTAGAATACAGTATACGACTTGAAATGGAAGGCGCCTG	86047

BX470194.8	451	TAATCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAGCCAGGAGAATCCTTGAACCCGGGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	86048	TAATCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAGCCAGGAGAATCCTTGAACCCGGGA	86097

BX470194.8	501	GGCGGAGATTGCACTGAGCCGACATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	86098	GGCGGAGATTGCACTGAGCCGACATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGC	86147

BX470194.8	551	ATCGGAGCGAAACTCAATCTCAAAAAAAAAAAAATCACTTCCTAGGTTTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	86148	ATCGGAGCGAAACTCAATCTCAAAAAAAAAAAAATCACTTCCTAGGTTTC	86197

BX470194.8	601	AGACTGTAAATAATTTATTTAATGTCAGCGCTTCATGGAAGACTTCACTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	86198	AGACTGTAAATAATTTATTTAATGTCAGCGCTTCATGGAAGACTTCACTG	86247

BX470194.8	651	GAATATGCAACCAAAGCAGAGAGTGATGCATATATATATATATATGCGTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	86248	GAATATGCAACCAAAGCAGAGAGTGATGCATATATATATATATATGCGTG	86297

BX470194.8	701	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTACCTTTATCGGATTTTCAAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	86298	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTACCTTTATCGGATTTTCAAC	86347

BX470194.8	751	AGCAAAAAATTGGAGTTCTATACACCTTTCTGGGATTGGCATGCAAGTGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	86348	AGCAAAAAATTGGAGTTCTATACACCTTTCTGGGATTGGCATGCAAGTGT	86397

BX470194.8	801	TGTATAAGGGTTGTATCAGCCGAGCGCTGTGTCTTACGCCTGTAATCCCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	86398	TGTATAAGGGTTGTATCAGCCGAGCGCTGTGTCTTACGCCTGTAATCCCA	86447

BX470194.8	851	GCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCCGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	86448	GCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCCGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAG	86497

BX470194.8	901	ACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	86498	ACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAT	86547

BX470194.8	951	TAGCCAGGCGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	86548	TAGCCAGGCGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTG	86597

BX470194.8	1001	AGGCAGGAGAATCGCTTGAACTCAGGAGGCGGAGGTTGCGGTGAGCCGAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	86598	AGGCAGGAGAATCGCTTGAACTCAGGAGGCGGAGGTTGCGGTGAGCCGAG	86647

BX470194.8	1051	TTCGCTCCATTGCACTCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCGTCAAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	86648	TTCGCTCCATTGCACTCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCGTCAAAA	86697

BX470194.8	1101	AATAAATAAATAAACAAAATAAGGGTTCTATTAGGCAAAACTGAAAGAAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	86698	AATAAATAAATAAACAAAATAAGGGTTCTATTAGGCAAAACTGAAAGAAA	86747

BX470194.8	1151	GAAAGAAAAAAAAAAAACCCTGCCGAAACCCGGGATCGAACCAGGGACCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	86748	GAAAGAAAAAAAAAAAACCCTGCCGAAACCCGGGATCGAACCAGGGACCT	86797

BX470194.8	1201	TTAGATCTTCAGTCTAACGCTCTCCCAACTGAGCTATTTCGGCTTCCCGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	86798	TTAGATCTTCAGTCTAACGCTCTCCCAACTGAGCTATTTCGGCTTCCCGA	86847

BX470194.8	1251	ATTTGTTTTAGGTGTTTCTTCAAAATATAAAAACTCATTTGTAGGGTCAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	86848	ATTTGTTTTAGGTGTTTCTTCAAAATATAAAAACTCATTTGTAGGGTCAG	86897

BX470194.8	1301	TATATCTTCCAATTCTGTTGTCTTCAATATCACCTGTCATTCACTCACCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	86898	TATATCTTCCAATTCTGTTGTCTTCAATATCACCTGTCATTCACTCACCC	86947

BX470194.8	1351	CTTCACCCCCAAAATATAGATTCTTCCCCAATTTATGTCTGAAAACAGGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	86948	CTTCACCCCCAAAATATAGATTCTTCCCCAATTTATGTCTGAAAACAGGA	86997

BX470194.8	1401	CCCAATTTTAAGGACAATGAATGGGTTAGCAAAAGCCAGGGAAAGAAAAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	86998	CCCAATTTTAAGGACAATGAATGGGTTAGCAAAAGCCAGGGAAAGAAAAG	87047

BX470194.8	1451	GCAAAAATGAAGAATAGAGCAAAGTAAGAACATGCTCCCCTACATGCTCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	87048	GCAAAAATGAAGAATAGAGCAAAGTAAGAACATGCTCCCCTACATGCTCA	87097

BX470194.8	1501	CTGCTCAGAATACCAAGGGAATTCAAAAGAAAATTTTCTAGGCTTTTCCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	87098	CTGCTCAGAATACCAAGGGAATTCAAAAGAAAATTTTCTAGGCTTTTCCT	87147

BX470194.8	1551	TTTCTCTGGGCTCTTGTTTTTCTGTCTTGCTCTTCAACGATATGGCAAAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	87148	TTTCTCTGGGCTCTTGTTTTTCTGTCTTGCTCTTCAACGATATGGCAAAA	87197

BX470194.8	1601	AGGAACAGAGGATTATTGGGCACGTTAATGTGGTGGCAGGTTTATAGCTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	87198	AGGAACAGAGGATTATTGGGCACGTTAATGTGGTGGCAGGTTTATAGCTT	87247

BX470194.8	1651	CTGACTAAGGAAATCCTGAGCGAGAAAATTCATTTTCGCTATTCCCTTCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	87248	CTGACTAAGGAAATCCTGAGCGAGAAAATTCATTTTCGCTATTCCCTTCC	87297

BX470194.8	1701	TTTCACTCGTCTTGTGCTGACACATCCACCTTGGGTGGTACAGAGACCCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	87298	TTTCACTCGTCTTGTGCTGACACATCCACCTTGGGTGGTACAGAGACCCA	87347

BX470194.8	1751	GGGAGTGGAAATGGAAAGTATAATATGTTTATTTTAGTGTGACCACGCAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	87348	GGGAGTGGAAATGGAAAGTATAATATGTTTATTTTAGTGTGACCACGCAA	87397

BX470194.8	1801	GGCATGTTTTTAAAAGGAGAAAAGTACAGAGTGGCGAGAATTGTGAAAAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	87398	GGCATGTTTTTAAAAGGAGAAAAGTACAGAGTGGCGAGAATTGTGAAAAA	87447

BX470194.8	1851	CAGATGAACATGTATGCTTTTGAACTCTGTGCAAGGCAAGGACACACTAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	87448	CAGATGAACATGTATGCTTTTGAACTCTGTGCAAGGCAAGGACACACTAC	87497

BX470194.8	1901	CACTGAGCCACACCTCTCTCGCTACAGAAACATCGTGAAGATCTTTTTTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	87498	CACTGAGCCACACCTCTCTCGCTACAGAAACATCGTGAAGATCTTTTTTG	87547

BX470194.8	1951	ACGCATTAGTCATATTTCTGAGAGGTCTTCAAAAATATGGTAAGTTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX088523.6	87548	ACGCATTAGTCATATTTCTGAGAGGTCTTCAAAAATATGGTAAGTTGGCC	87597

Overview

Query
BX470194.8 - 43833 bps
Hit
BX088523.6 - 87597 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link