<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL929560.14	1	ACTGACGTAGCTCTCCCCCTCTGGTTCAATGCTGGTGAAAGCAAACTGAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	164248	ACTGACGTAGCTCTCCCCCTCTGGTTCAATGCTGGTGAAAGCAAACTGAC	164297

AL929560.14	51	GCATGCGCGCGGAATACCATTCTCGCGTGCCTCACGCACTCCTGTGTGAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	164298	GCATGCGCGCGGAATACCATTCTCGCGTGCCTCACGCACTCCTGTGTGAA	164347

AL929560.14	101	TCCCGGTTGGTTGTTTGCATGCACGCCGACATAATAGGCACCGCTCATGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	164348	TCCCGGTTGGTTGTTTGCATGCACGCCGACATAATAGGCACCGCTCATGC	164397

AL929560.14	151	GCCGTGAAACCGGAGTAACAGCCTTTTGTGTAGAAGTGTCGGCACGCAGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	164398	GCCGTGAAACCGGAGTAACAGCCTTTTGTGTAGAAGTGTCGGCACGCAGC	164447

AL929560.14	201	GAGTTTTGAAAGTCGGTTAAAGTTTATATAATATGATAATGATGATGATG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	164448	GAGTTTTGAAAGTCGGTTAAAGTTTATATAATATGATAATGATGATGATG	164497

AL929560.14	251	ATGATGATGATGTTACTTTCACTAAGCATGCCTTTAAAGCAGAAAGGAGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	164498	ATGATGATGATGTTACTTTCACTAAGCATGCCTTTAAAGCAGAAAGGAGG	164547

AL929560.14	301	GATAATGAGTCAGGGAGGTAAGACTTCATAACATGATTTATCAGCCATGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	164548	GATAATGAGTCAGGGAGGTAAGACTTCATAACATGATTTATCAGCCATGA	164597

AL929560.14	351	TCTGGTCTAAGACCACAGATAATTCTATAATACATTTTTTGTATTCTTTA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	164598	TCTGGTCTAAGACCACAGATAATTCTATAATACATTTTTTGTATTCTTTA	164647

AL929560.14	401	GAATTGTCATAATTAATTTTCATGCAAAAGGTTTCTTAAGTGATCTTGGC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	164648	GAATTGTCATAATTAATTTTCATGCAAAAGGTTTCTTAAGTGATCTTGGC	164697

AL929560.14	451	ATATCACTCCAGTTGTTGTTTTCCAGTAATATTTAGGACTGATTTCTGTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	164698	ATATCACTCCAGTTGTTGTTTTCCAGTAATATTTAGGACTGATTTCTGTT	164747

AL929560.14	501	ATTTATTCAGAATATTAATTGTATATTAATATTATTTGTATTTATTTAGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	164748	ATTTATTCAGAATATTAATTGTATATTAATATTATTTGTATTTATTTAGA	164797

AL929560.14	551	ATAAATATAAATAAATTGTTATATTTATTGAATAACAAATCTAACAATTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	164798	ATAAATATAAATAAATTGTTATATTTATTGAATAACAAATCTAACAATTC	164847

AL929560.14	601	AAGAGAGGTGGGGGTGTATAGGGTGGTTCGCCCAGGGTGTCATTTAAACT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	164848	AAGAGAGGTGGGGGTGTATAGGGTGGTTCGCCCAGGGTGTCATTTAAACT	164897

AL929560.14	651	AGAACCACCACTACCCTCCCCGATCGTCCTTGACAGCACGCACACACCTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	164898	AGAACCACCACTACCCTCCCCGATCGTCCTTGACAGCACGCACACACCTT	164947

AL929560.14	701	CAATAGACAGCAATGGCAATTTAATATTTACCTTAAGCTACAGTATATCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	164948	CAATAGACAGCAATGGCAATTTAATATTTACCTTAAGCTACAGTATATCA	164997

AL929560.14	751	ATAGAAGAAGCTGCATTAATAAAATGGTTCAAAAAGCAATATGGATAAAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	164998	ATAGAAGAAGCTGCATTAATAAAATGGTTCAAAAAGCAATATGGATAAAT	165047

AL929560.14	801	AATATTATTAGGTATAGTGAGTGTGTATAGTAATGCCTTTTGTTCAGTTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	165048	AATATTATTAGGTATAGTGAGTGTGTATAGTAATGCCTTTTGTTCAGTTT	165097

AL929560.14	851	GTTCATTTGTTTGGGTAATTAATAAACTCATTATTCTTTCATTCATTTTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	165098	GTTCATTTGTTTGGGTAATTAATAAACTCATTATTCTTTCATTCATTTTC	165147

AL929560.14	901	TTTTCGGCTTAGTCCCTTTATTAATCCAGGGTCACCACAGCAGAATGAAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	165148	TTTTCGGCTTAGTCCCTTTATTAATCCAGGGTCACCACAGCAGAATGAAC	165197

AL929560.14	951	CGCCAACTTATCCAGCACATTTTTACACAGCGGATGCCCTTCCAGCTGCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	165198	CGCCAACTTATCCAGCACATTTTTACACAGCGGATGCCCTTCCAGCTGCA	165247

AL929560.14	1001	ACCCATCACTGGGAATAATAAACTCATTAATCTTCATTAATTTTAGACAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	165248	ACCCATCACTGGGAATAATAAACTCATTAATCTTCATTAATTTTAGACAT	165297

AL929560.14	1051	GGCATATCTCGTATGATGTACAATAAAGGCACGTAAAAAAAGAAGTTATT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	165298	GGCATATCTCGTATGATGTACAATAAAGGCACGTAAAAAAAGAAGTTATT	165347

AL929560.14	1101	TATACAGTATATGAAAAGTGTTTTTAAACTAAACATAGATTTTTATTTGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	165348	TATACAGTATATGAAAAGTGTTTTTAAACTAAACATAGATTTTTATTTGG	165397

AL929560.14	1151	TTTGCACATGTACTTGCTGAATTATTTCAAAGAATGAATTGCAATATTTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	165398	TTTGCACATGTACTTGCTGAATTATTTCAAAGAATGAATTGCAATATTTC	165447

AL929560.14	1201	AAGTAGAATTAATTAAATGAATAAAAACTACATTATTTCATTTACCAGAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	165448	AAGTAGAATTAATTAAATGAATAAAAACTACATTATTTCATTTACCAGAA	165497

AL929560.14	1251	ACAAAAATATAACATTACACTGAATTCATTATTTTTTTTGTGTGCCACCC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	165498	ACAAAAATATAACATTACACTGAATTCATTATTTTTTTTGTGTGCCACCC	165547

AL929560.14	1301	CAAGATTTGGTGCGGCCTCTTCTGGCCACCCCTAAGAAAATTTTCTGGGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	165548	CAAGATTTGGTGCGGCCTCTTCTGGCCACCCCTAAGAAAATTTTCTGGGG	165597

AL929560.14	1351	GCGCCACTGCAGTCAGAACATGAACATTACTGAGCATGTCTGGGGTAAGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	165598	GCGCCACTGCAGTCAGAACATGAACATTACTGAGCATGTCTGGGGTAAGA	165647

AL929560.14	1401	TGAAGGAGGAGGCACTGAGGATGAATCCAAAGAATCTTGATGAACTCTGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	165648	TGAAGGAGGAGGCACTGAGGATGAATCCAAAGAATCTTGATGAACTCTGG	165697

AL929560.14	1451	GAGTCCTGCAAGAACGCTTTCTTTGCCATTCCAGATGACTTGAGTTATTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	165698	GAGTCCTGCAAGAACGCTTTCTTTGCCATTCCAGATGACTTGAGTTATTT	165747

AL929560.14	1501	GAGTTACTGCAGAGATGTTTGGATGCAGTCCTCCAAGCTCATGGGAGTCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	165748	GAGTTACTGCAGAGATGTTTGGATGCAGTCCTCCAAGCTCATGGGAGTCA	165797

AL929560.14	1551	TACACAATATTAATTCTTTTTCCACTGCACCATGACTTTATATTCTATAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	165798	TACACAATATTAATTCTTTTTCCACTGCACCATGACTTTATATTCTATAC	165847

AL929560.14	1601	TGTTCATTATTTCTGTTAAGTGACAAGACTTTTGTCTAAGCAAAGTCAGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	165848	TGTTCATTATTTCTGTTAAGTGACAAGACTTTTGTCTAAGCAAAGTCAGA	165897

AL929560.14	1651	CCTTATTGTCCTAATTAAACAATTAAAAATTAAGGCTTGATCATATTTTA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	165898	CCTTATTGTCCTAATTAAACAATTAAAAATTAAGGCTTGATCATATTTTA	165947

AL929560.14	1701	TGTTGTTAAAATAAGCGTAATCTAGAGGCCTTTTCCTTTCATATAATTCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	165948	TGTTGTTAAAATAAGCGTAATCTAGAGGCCTTTTCCTTTCATATAATTCA	165997

AL929560.14	1751	CTTCTGATACCAAATGATAAACTAGAAGTCAAGTTATTATTAGTTGTTCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	165998	CTTCTGATACCAAATGATAAACTAGAAGTCAAGTTATTATTAGTTGTTCC	166047

AL929560.14	1801	TAAAACTTGGATAGGCGACAAGACTTTTGTTAGGTAGTGTATTAAAAATC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	166048	TAAAACTTGGATAGGCGACAAGACTTTTGTTAGGTAGTGTATTAAAAATC	166097

AL929560.14	1851	TAAATCAAAATGGAGCAAAGTGGACAAAATGCATAATGAAAGGTATTGAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	166098	TAAATCAAAATGGAGCAAAGTGGACAAAATGCATAATGAAAGGTATTGAA	166147

AL929560.14	1901	AAATAGAAAGTGTACCATTTACTCAACCTGAAGTGGTTTTTCTGTTGAAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	166148	AAATAGAAAGTGTACCATTTACTCAACCTGAAGTGGTTTTTCTGTTGAAC	166197

AL929560.14	1951	ACATAAGAAGTTATTTTGAAGAATGTTAGAAACTGCTAACCACTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005435.16	166198	ACATAAGAAGTTATTTTGAAGAATGTTAGAAACTGCTAACCACTGAATTC	166247

Overview

Query
AL929560.14 - 103820 bps
Hit
BX005435.16 - 166247 bps
Total alignments
28
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100193420001200011642481662471
297.6541857256372647-124644247281
397.6541857255472638124644247281
498.6336734647646548124652247241
598.6336734647646548-124657247291
682.2618047313691841-128515289651
783.33481074360543711132187322941
895.28401257254172665134957350831
994.61391287253972666-134959350881
1010037694648046548-135047351151
1198.8539877254372629150092501781
1298.8640887254272629-150093501801
1398.5536694648046548169674697421
1492.4738937255172643-169676697681
1584.17711607348373642-181456816131
1693.8136977254972645-181733818291
1783.57681436406564207187243873821
1891.2820229815421839188455887521
1997.12511042494025043196673967761
2093.86521142557825691196673967861
2110048925721057301196685967761
2210038793718737265-196697967751
2388.751913282523725564-11205171208451
2483.13124333252352556711519981523231
2581.3779202556095581011536741538771
2690.2389134959809611311651271652591
2789.92871302379923928-11651341652621
2892.19951295567455802-11651351652621
Short-link