<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX005133.4	1	GGCCAGGCTGGTTTTGAACTCCTCACCTCAAATGATCCACCTGCCTTGGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	54645	GGCCAGGCTGGTTTTGAACTCCTCACCTCAAATGATCCACCTGCCTTGGC	54694

BX005133.4	51	CTCCTAATATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTAAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	54695	CTCCTAATATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTAAAA	54744

BX005133.4	101	TTATAAAGATATTTTTCTATGTGACCATTTAGAAAATGAATAGTTTTAGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	54745	TTATAAAGATATTTTTCTATGTGACCATTTAGAAAATGAATAGTTTTAGC	54794

BX005133.4	151	TTCTATATTAATTAAGTCTGTGATCCTTATTGAGTTAATTTTTGAGTGTA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	54795	TTCTATATTAATTAAGTCTGTGATCCTTATTGAGTTAATTTTTGAGTGTA	54844

BX005133.4	201	GTATAAAGTGAGTGTTAATGATCATTCTTTTTCTATACAGATATATAGTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	54845	GTATAAAGTGAGTGTTAATGATCATTCTTTTTCTATACAGATATATAGTT	54894

BX005133.4	251	TTTAGTGTGATTTATTGAAAAGACATTATTTTCCCCCATTGATTTGCCTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	54895	TTTAGTGTGATTTATTGAAAAGACATTATTTTCCCCCATTGATTTGCCTT	54944

BX005133.4	301	AGCACCTTGTCAATATATGGGCTTACTATTCTTTTTCATTGATCTATGTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	54945	AGCACCTTGTCAATATATGGGCTTACTATTCTTTTTCATTGATCTATGTG	54994

BX005133.4	351	TTTATTTTTAACTAATACCATACCATACTGATTTCAGCAACTTTATAACG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	54995	TTTATTTTTAACTAATACCATACCATACTGATTTCAGCAACTTTATAACG	55044

BX005133.4	401	ATTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	55045	ATTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGT	55094

BX005133.4	451	GGCACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	55095	GGCACCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTC	55144

BX005133.4	501	TCCTGCCTCAGCCTCCTAAGTAGCTGGGACTATAGGCGCCCACCACCATG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	55145	TCCTGCCTCAGCCTCCTAAGTAGCTGGGACTATAGGCGCCCACCACCATG	55194

BX005133.4	551	CCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGGTA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	55195	CCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGGTA	55244

BX005133.4	601	GCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCGGCCTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	55245	GCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCGGCCTC	55294

BX005133.4	651	CCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCGTGCCCTTTATAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	55295	CCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCGTGCCCTTTATAA	55344

BX005133.4	701	CAATTCTTGAAGTCAGGTAGTTTAATGCCTCTAATCTTTTGATTTTCTAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	55345	CAATTCTTGAAGTCAGGTAGTTTAATGCCTCTAATCTTTTGATTTTCTAG	55394

BX005133.4	751	GCTTTGATTTTCCAAGTCTTCTGCATTTCCATATACACTTTAGAATTAGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	55395	GCTTTGATTTTCCAAGTCTTCTGCATTTCCATATACACTTTAGAATTAGC	55444

BX005133.4	801	TTGTTAATTCGTACTAAAAAGAAGCATGCTGGCATTTTTATTAGGATTGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	55445	TTGTTAATTCGTACTAAAAAGAAGCATGCTGGCATTTTTATTAGGATTGC	55494

BX005133.4	851	ATCAAATCTATAGATCATTTCTGAGAAAATAGAAGTCTTAATATTGAGTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	55495	ATCAAATCTATAGATCATTTCTGAGAAAATAGAAGTCTTAATATTGAGTC	55544

BX005133.4	901	ATTTAATTCATAAACACAACATAGCTTCCCATTTTTTAGGTCTTTAATTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	55545	ATTTAATTCATAAACACAACATAGCTTCCCATTTTTTAGGTCTTTAATTT	55594

BX005133.4	951	CTTTCAGTAACGTTACATGGCTTTCAGTGAGGCAGTCTTGTTCCTTTATT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	55595	CTTTCAGTAACGTTACATGGCTTTCAGTGAGGCAGTCTTGTTCCTTTATT	55644

BX005133.4	1001	AAATTTATTACTAATTATTCACATTTTAAGTTTTGAATACAAAAATTACA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	55645	AAATTTATTACTAATTATTCACATTTTAAGTTTTGAATACAAAAATTACA	55694

BX005133.4	1051	CTTCATGCTCCTTAAATTGTTTCAAATGTTGTAGAAATAACATTAAAATA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	55695	CTTCATGCTCCTTAAATTGTTTCAAATGTTGTAGAAATAACATTAAAATA	55744

BX005133.4	1101	AGAATTTCCTCTTTAATAGTGATTCCTAGAGGTTATCACTATTTTAATTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	55745	AGAATTTCCTCTTTAATAGTGATTCCTAGAGGTTATCACTATTTTAATTT	55794

BX005133.4	1151	TGATATATATATAGACAAAATTGCATATATTATTTCTTTTTTCCTTTTAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	55795	TGATATATATATAGACAAAATTGCATATATTATTTCTTTTTTCCTTTTAT	55844

BX005133.4	1201	TATGTGGTTGGATCTCAAGTGCAGAAGGTTGAGTTCATTACATTTATCAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	55845	TATGTGGTTGGATCTCAAGTGCAGAAGGTTGAGTTCATTACATTTATCAG	55894

BX005133.4	1251	TTCATGGCACCCTGTCCTCATTAATATGTGCACGATCTCTCTCATCTTAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	55895	TTCATGGCACCCTGTCCTCATTAATATGTGCACGATCTCTCTCATCTTAC	55944

BX005133.4	1301	TTTATTTAAAACATTTCTTTCCTGTCTGTTTCTACTACCATTCCCCCTAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	55945	TTTATTTAAAACATTTCTTTCCTGTCTGTTTCTACTACCATTCCCCCTAA	55994

BX005133.4	1351	GGAAAACAATTATTATAAGTTTCATGTGTAACATTTTATGGGCTCTTAAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	55995	GGAAAACAATTATTATAAGTTTCATGTGTAACATTTTATGGGCTCTTAAT	56044

BX005133.4	1401	TTCTATTAGTATTGTTGTTTTAGGATATTTTATTCTATAAAATAGTATTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	56045	TTCTATTAGTATTGTTGTTTTAGGATATTTTATTCTATAAAATAGTATTA	56094

BX005133.4	1451	CATTATAATCTTATTCAGTTTCTTACTTTTTTTCACTCAGCACACTACTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	56095	CATTATAATCTTATTCAGTTTCTTACTTTTTTTCACTCAGCACACTACTT	56144

BX005133.4	1501	TTAAGAGCTATCACGTTACAATGTCTACATCTAGCCCACTTTTTCTAAAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	56145	TTAAGAGCTATCACGTTACAATGTCTACATCTAGCCCACTTTTTCTAAAA	56194

BX005133.4	1551	ACTGCATTTTTTTGATGTTGTACATCCTCAACCTTCGCAAATCTGCTCTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	56195	ACTGCATTTTTTTGATGTTGTACATCCTCAACCTTCGCAAATCTGCTCTC	56244

BX005133.4	1601	CCGTTGATGGACATCTGGGTTGCTTCTAATTCCCCATTACCATAAATTAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	56245	CCGTTGATGGACATCTGGGTTGCTTCTAATTCCCCATTACCATAAATTAT	56294

BX005133.4	1651	GCCAAACAACTGTTGTTATGGACCTGTGTAAGGATTTATTTGGGATATAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	56295	GCCAAACAACTGTTGTTATGGACCTGTGTAAGGATTTATTTGGGATATAT	56344

BX005133.4	1701	ACCTGGAAGCAAAATTGCTCAGGTCCAATATATGAGAGACTTAATTTGAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	56345	ACCTGGAAGCAAAATTGCTCAGGTCCAATATATGAGAGACTTAATTTGAA	56394

BX005133.4	1751	TTTTTATACCCAGAATGTGCTCCAGAATGCTTCCATGAGGCTACACTCCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	56395	TTTTTATACCCAGAATGTGCTCCAGAATGCTTCCATGAGGCTACACTCCT	56444

BX005133.4	1801	ACCAGCGGGGCAGACGTGTTCCTGTCATTTCCTCACCTGTCCCAATTCTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	56445	ACCAGCGGGGCAGACGTGTTCCTGTCATTTCCTCACCTGTCCCAATTCTT	56494

BX005133.4	1851	GGCACTACCCTGCTTTCTAATACTTACTACTCAAATAGAATACAATGTTA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	56495	GGCACTACCCTGCTTTCTAATACTTACTACTCAAATAGAATACAATGTTA	56544

BX005133.4	1901	CCTCACTTTTAAACTTTGGAGAAATTTTAAACCTGTAAAAAATTTGTAAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	56545	CCTCACTTTTAAACTTTGGAGAAATTTTAAACCTGTAAAAAATTTGTAAA	56594

BX005133.4	1951	AACAATACAGAGGCTTCTCTTTTTATCCCTCACCTTGTTTCCCTAATGTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005432.7	56595	AACAATACAGAGGCTTCTCTTTTTATCCCTCACCTTGTTTCCCTAATGTT	56644

Overview

Query
BX005133.4 - 96209 bps
Hit
BX005432.7 - 56644 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link