<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX004761.10	1	AAGCTTCTCAGTGCTGTTTCTGATGTTGAATATGGTCATGATTGTTAACG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	132852	AAGCTTCTCAGTGCTGTTTCTGATGTTGAATATGGTCATGATTGTTAACG	132901

BX004761.10	51	AGAGACACAACATATTTAGATGGAATAAACTCTTCATCTAAAGTCACGAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	132902	AGAGACACAACATATTTAGATGGAATAAACTCTTCATCTAAAGTCACGAC	132951

BX004761.10	101	TTAACACAATGGGGATTTTAGATTACTGTAGCCGTAACCCTTGAGTCTTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	132952	TTAACACAATGGGGATTTTAGATTACTGTAGCCGTAACCCTTGAGTCTTC	133001

BX004761.10	151	ATGTGTTTTCTCGTTATATAATATTGATTAATATCTGACTCTAGAAGGCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	133002	ATGTGTTTTCTCGTTATATAATATTGATTAATATCTGACTCTAGAAGGCA	133051

BX004761.10	201	CAGATTGTGTTTCATCCTATCTTTTCTTCATGAATACAGAGGTGATCTGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	133052	CAGATTGTGTTTCATCCTATCTTTTCTTCATGAATACAGAGGTGATCTGT	133101

BX004761.10	251	GTCAGTTGACAGGAATTAGCTTTTAGAAGATTTTCCACAGAATATCCACT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	133102	GTCAGTTGACAGGAATTAGCTTTTAGAAGATTTTCCACAGAATATCCACT	133151

BX004761.10	301	GGGCAGCTTTTGTAAAAATAAAAAAACGTGTGCAAAACACAAAATTAGTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	133152	GGGCAGCTTTTGTAAAAATAAAAAAACGTGTGCAAAACACAAAATTAGTT	133201

BX004761.10	351	ATAAATTCAATTACATCTTGAACTTTGTGGCCAAAATTTGTTATCAATCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	133202	ATAAATTCAATTACATCTTGAACTTTGTGGCCAAAATTTGTTATCAATCC	133251

BX004761.10	401	TGAGGCTACTTTCAAAACCAGAGATGTGGAGCGGCTGAAATATTACTCAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	133252	TGAGGCTACTTTCAAAACCAGAGATGTGGAGCGGCTGAAATATTACTCAT	133301

BX004761.10	451	CATTATCTGGGTTACTAATGTTTTCATCACCTCCTCCAGTGTTTTGAACT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	133302	CATTATCTGGGTTACTAATGTTTTCATCACCTCCTCCAGTGTTTTGAACT	133351

BX004761.10	501	CTGGAATAGTTCCCAGGTACATAAGCTGAACTCAGAATCCTCTGATTTCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	133352	CTGGAATAGTTCCCAGGTACATAAGCTGAACTCAGAATCCTCTGATTTCA	133401

BX004761.10	551	TTACTGTCCACACAGAGCCTTTATGTTGGATGCATTTTTAGATGCAAGTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	133402	TTACTGTCCACACAGAGCCTTTATGTTGGATGCATTTTTAGATGCAAGTT	133451

BX004761.10	601	ATTGAAGGACCAACAGACTATTTTAACAAAATTTATTAGCACAATCGAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	133452	ATTGAAGGACCAACAGACTATTTTAACAAAATTTATTAGCACAATCGAAA	133501

BX004761.10	651	CACTTTTGCACAAGAACAAATCTTTTATGTGAAATAATGCACTTAAACTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	133502	CACTTTTGCACAAGAACAAATCTTTTATGTGAAATAATGCACTTAAACTT	133551

BX004761.10	701	AGATTTAAACATCAAGTTTCATCAGATTTGCTCGTGAATTTTAACTACAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	133552	AGATTTAAACATCAAGTTTCATCAGATTTGCTCGTGAATTTTAACTACAC	133601

BX004761.10	751	GATGCAGTAGTTTTAACTGATTTGTTCAAAGACACACGCTGAACTTTAAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	133602	GATGCAGTAGTTTTAACTGATTTGTTCAAAGACACACGCTGAACTTTAAC	133651

BX004761.10	801	ATGTCTCCCCAAGCTGTAATCCTTGCTACGCCTCTGCATCTGTAAAAATG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	133652	ATGTCTCCCCAAGCTGTAATCCTTGCTACGCCTCTGCATCTGTAAAAATG	133701

BX004761.10	851	TTTATAATGCACTAAGAAATGGACATGTGCAAGTAGCTTGGAAGTATTTA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	133702	TTTATAATGCACTAAGAAATGGACATGTGCAAGTAGCTTGGAAGTATTTA	133751

BX004761.10	901	TTATTAGCACAAATAAATAATTCACAGATTGCTCAAATCTAAGGCCAAAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	133752	TTATTAGCACAAATAAATAATTCACAGATTGCTCAAATCTAAGGCCAAAT	133801

BX004761.10	951	ATAACCAGCTGGCTTATTAGACACAGGTTGTTTATAAATTTTTCTTCTGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	133802	ATAACCAGCTGGCTTATTAGACACAGGTTGTTTATAAATTTTTCTTCTGA	133851

BX004761.10	1001	GGGTACTTTTGACCTTATGGACTTTTAGGAAAAGAACCTCCATTACAACA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	133852	GGGTACTTTTGACCTTATGGACTTTTAGGAAAAGAACCTCCATTACAACA	133901

BX004761.10	1051	AACCCTTTACATTCTCACTAGGATTAATTTATCCACAAACAACGGCCAGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	133902	AACCCTTTACATTCTCACTAGGATTAATTTATCCACAAACAACGGCCAGC	133951

BX004761.10	1101	AATTTATATTGTAATAAGCATTATTGGAGAATTCAGGTAATTTTCTGAAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	133952	AATTTATATTGTAATAAGCATTATTGGAGAATTCAGGTAATTTTCTGAAA	134001

BX004761.10	1151	CACCCTAAACATTTGCAGCGCAGCACTTCTCAAAATATGTTTTTGTATTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	134002	CACCCTAAACATTTGCAGCGCAGCACTTCTCAAAATATGTTTTTGTATTT	134051

BX004761.10	1201	ACCAGACTTCTGTGAACTGAAAACATATTTAGAAGAAAACGGCTCATTTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	134052	ACCAGACTTCTGTGAACTGAAAACATATTTAGAAGAAAACGGCTCATTTG	134101

BX004761.10	1251	TCTTGAGTTTCAGCTCAGTTGACAGAACTTTCCCTTTTTAGGCCAGAGCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	134102	TCTTGAGTTTCAGCTCAGTTGACAGAACTTTCCCTTTTTAGGCCAGAGCT	134151

BX004761.10	1301	GTGTTAATTGCATCTTGATGATGCTAGGCAGTGTAAACAACGTAGTCTCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	134152	GTGTTAATTGCATCTTGATGATGCTAGGCAGTGTAAACAACGTAGTCTCC	134201

BX004761.10	1351	TATAACATCCTTTCCTAGCAAATAAAGGATTCCAATTTTGTGCTGGGTCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	134202	TATAACATCCTTTCCTAGCAAATAAAGGATTCCAATTTTGTGCTGGGTCA	134251

BX004761.10	1401	GTTAAACAGAAGAAACTGCATTGGAACTGTGGAGAAAAAAATTGTCTTTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	134252	GTTAAACAGAAGAAACTGCATTGGAACTGTGGAGAAAAAAATTGTCTTTA	134301

BX004761.10	1451	TTGGTGAGTCCTGATAAGACAAGTGTAATCATTCAGTTTATACTGTATCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	134302	TTGGTGAGTCCTGATAAGACAAGTGTAATCATTCAGTTTATACTGTATCA	134351

BX004761.10	1501	GAGAACGTATGGTAGTATTAGAGTCTGATAGCATCTCAACCACTGTATAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	134352	GAGAACGTATGGTAGTATTAGAGTCTGATAGCATCTCAACCACTGTATAT	134401

BX004761.10	1551	GGCACTGTCACCGAAGGCAACGTCTTCTGAAAAGTAATTTTAAGAAAGTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	134402	GGCACTGTCACCGAAGGCAACGTCTTCTGAAAAGTAATTTTAAGAAAGTC	134451

BX004761.10	1601	CAGCTAGTGCTTTGTCATGTGAAGTCTTTGTAGCTGCATTAATGCTACAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	134452	CAGCTAGTGCTTTGTCATGTGAAGTCTTTGTAGCTGCATTAATGCTACAC	134501

BX004761.10	1651	AATAGCAGGGAAGTAAATGCAGCTCCTGCAAGTCACTAGAAATGCTACTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	134502	AATAGCAGGGAAGTAAATGCAGCTCCTGCAAGTCACTAGAAATGCTACTC	134551

BX004761.10	1701	TTTGCTGCCATTCTGAAAAAGATTCAGACACCCTAGATTGAATACACTAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	134552	TTTGCTGCCATTCTGAAAAAGATTCAGACACCCTAGATTGAATACACTAA	134601

BX004761.10	1751	AATGTATTTATTATTTTATCTTTTGTTCAAAACTTAGCCTTAAAAAAATC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	134602	AATGTATTTATTATTTTATCTTTTGTTCAAAACTTAGCCTTAAAAAAATC	134651

BX004761.10	1801	TATAAATGGCCTTCCAATTTGTAACATATACAGGCTCGTAGCCAGCCTGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	134652	TATAAATGGCCTTCCAATTTGTAACATATACAGGCTCGTAGCCAGCCTGG	134701

BX004761.10	1851	TGAAAGGGGTGGGGTTTTTTTTGGGCCTTTTTGCTGTTATTCTATTTATA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	134702	TGAAAGGGGTGGGGTTTTTTTTGGGCCTTTTTGCTGTTATTCTATTTATA	134751

BX004761.10	1901	TTTTCTATTTAATTATAAGGTTTAAATAGGTTGCGTTTTAGTGACATTTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	134752	TTTTCTATTTAATTATAAGGTTTAAATAGGTTGCGTTTTAGTGACATTTT	134801

BX004761.10	1951	AGGGACTATTTTTTGCTGGAGTACTTCTTGATGTACCAAAAATACTTCCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005427.19	134802	AGGGACTATTTTTTGCTGGAGTACTTCTTGATGTACCAAAAATACTTCCT	134851

Overview

Query
BX004761.10 - 132841 bps
Hit
BX005427.19 - 134851 bps
Total alignments
22
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100193320001200011328521348511
275.91803431180812150-12345651
376.94825605502155580-1675672971
479.12121355103830104184-1871990821
587.2269135118302118436-118653187851
693.1477102103826103927-134699348001
796.27159218605002851887-143381452021
898.041441534665746809143440435921
992.64181924454758150025-145591480881
1097.266617314665747387-148739494681
1198.041441535166051812149316494681
1277.6566254120688120941152870531331
1384.41163318125127125444-154163544891
1481.451092812700327283-155427557171
1580.7799257120651120907-155427556861
1691.791471956582766021-177005771991
1787.587162118301118462-179083792421
1897.765874095241038181988820741
1910065874095241038182309823951
2083.41891964233942534-187929881271
2182.91262968909789392-193070933791
2287.873125299903011411199991201211
Short-link