<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR753822.3	1	GGCCCTGCACAGGTGAGAACTGGGAGGGTTTTGTACCTGCCAGCACCTGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	49843	GGCCCTGCACAGGTGAGAACTGGGAGGGTTTTGTACCTGCCAGCACCTGT	49892

CR753822.3	51	TTTTCCTCCTATCTTTTTTTTCCCCTTGTCCCCCAGGGGTTTTGACTTGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	49893	TTTTCCTCCTATCTTTTTTTTCCCCTTGTCCCCCAGGGGTTTTGACTTGA	49942

CR753822.3	101	GCTTTGAGCACTGCCCCAGTTAACACTAGCTCACCTCTCATTGGTTCAGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	49943	GCTTTGAGCACTGCCCCAGTTAACACTAGCTCACCTCTCATTGGTTCAGG	49992

CR753822.3	151	AACTCAACCTCTGCTCCTTCCCCTTCCCCTTCCTTCTCCAGGACCGCGGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	49993	AACTCAACCTCTGCTCCTTCCCCTTCCCCTTCCTTCTCCAGGACCGCGGA	50042

CR753822.3	201	GTGTACCTGTCCCTCCTGGCCTCCCTCCGCACACGTGCCCAGTTGCCCGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	50043	GTGTACCTGTCCCTCCTGGCCTCCCTCCGCACACGTGCCCAGTTGCCCGT	50092

CR753822.3	251	GGTGGTGTTCACCTTCTCCCGGGGCCGCTGTGATGAGCAGGCCTCAGGCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	50093	GGTGGTGTTCACCTTCTCCCGGGGCCGCTGTGATGAGCAGGCCTCAGGCC	50142

CR753822.3	301	TCACCTCCCTTGACCTCACCACCAGTTCGGAGAAGAGCGAGATCCACCTC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	50143	TCACCTCCCTTGACCTCACCACCAGTTCGGAGAAGAGCGAGATCCACCTC	50192

CR753822.3	351	TTCCTGCAGCGCTGCCTTGCTCGCCTCCGTGGCTCTGACCGCCAGCTGCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	50193	TTCCTGCAGCGCTGCCTTGCTCGCCTCCGTGGCTCTGACCGCCAGCTGCC	50242

CR753822.3	401	CCAGGTGCGTCTGTGTGCGTCTGTGTGCGTGCATGCACACATTTGGCAGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	50243	CCAGGTGCGTCTGTGTGCGTCTGTGTGCGTGCATGCACACATTTGGCAGA	50292

CR753822.3	451	CTGGTGGGGATAGGGTGTTCCGAGACTCCATCCCTGACCATGGGCCTCCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	50293	CTGGTGGGGATAGGGTGTTCCGAGACTCCATCCCTGACCATGGGCCTCCT	50342

CR753822.3	501	CCCACCAAAGGTCCTGCACATGTCAGAGCTCCTGAATCGCGGCCTGGGTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	50343	CCCACCAAAGGTCCTGCACATGTCAGAGCTCCTGAATCGCGGCCTGGGTG	50392

CR753822.3	551	TGCACCATAGCGGCATCCTGCCCATCCTCAAGGAGATCGTGGAGATGCTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	50393	TGCACCATAGCGGCATCCTGCCCATCCTCAAGGAGATCGTGGAGATGCTC	50442

CR753822.3	601	TTCAGCCGTGGCCTGGTCAAGGTGCATGTGGTGGTGGAAAGGGACTCCTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	50443	TTCAGCCGTGGCCTGGTCAAGGTGCATGTGGTGGTGGAAAGGGACTCCTC	50492

CR753822.3	651	AGGGTGCTTGTTGCCCACTTAGGGGCTGCCCAGAGGGCAGAGGGGCAGAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	50493	AGGGTGCTTGTTGCCCACTTAGGGGCTGCCCAGAGGGCAGAGGGGCAGAG	50542

CR753822.3	701	GTTTAGGCAGGCCAGTGCTGTGGTTAAGAATCTGGGCTCTGGATTCAGAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	50543	GTTTAGGCAGGCCAGTGCTGTGGTTAAGAATCTGGGCTCTGGATTCAGAC	50592

CR753822.3	751	TACCTGGGTTTGAATCCCAGGTACACCATGTATTCACAGTATCATCCTGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	50593	TACCTGGGTTTGAATCCCAGGTACACCATGTATTCACAGTATCATCCTGG	50642

CR753822.3	801	ACCAATTATTTAACCTTCCTGAACTTTAGGTTTCCCATCTTAAAATGGGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	50643	ACCAATTATTTAACCTTCCTGAACTTTAGGTTTCCCATCTTAAAATGGGG	50692

CR753822.3	851	ATGCATAAGATATGAATACGTAGGTCTCAGAAAAGAAACCCAGGAAGCTA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	50693	ATGCATAAGATATGAATACGTAGGTCTCAGAAAAGAAACCCAGGAAGCTA	50742

CR753822.3	901	GCAAGCATTCGAAAAGTTATTAGTAATCAGAAATATACAAATTGAAGTAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	50743	GCAAGCATTCGAAAAGTTATTAGTAATCAGAAATATACAAATTGAAGTAC	50792

CR753822.3	951	TCACAAGATACGACTTTACAGCTATTAGACTGGTAAAATTTAGGAAACTA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	50793	TCACAAGATACGACTTTACAGCTATTAGACTGGTAAAATTTAGGAAACTA	50842

CR753822.3	1001	GTTCATGCCGAGTGTTGCCAGAGATATAGGAGGTTGTAGGGTTCTGGGAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	50843	GTTCATGCCGAGTGTTGCCAGAGATATAGGAGGTTGTAGGGTTCTGGGAA	50892

CR753822.3	1051	TCCTTTACGGGATGCCTAGCCAGTTTGGAATGCACGCTGGCACTATTTAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	50893	TCCTTTACGGGATGCCTAGCCAGTTTGGAATGCACGCTGGCACTATTTAG	50942

CR753822.3	1101	ACAAAATAACTATATTGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	50943	ACAAAATAACTATATTGGCCGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAG	50992

CR753822.3	1151	CACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCGAGACC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	50993	CACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCGAGACC	51042

CR753822.3	1201	ATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	51043	ATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTA	51092

CR753822.3	1251	GCTGGGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	51093	GCTGGGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAG	51142

CR753822.3	1301	GCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	51143	GCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGAT	51192

CR753822.3	1351	AGCACCGCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGGGAGACTCCATCTCAAAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	51193	AGCACCGCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGGGAGACTCCATCTCAAAA	51242

CR753822.3	1401	CAAAAACAAACAAAGAAACAAACAAAAACTATATCATACTCTGAGCTTAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	51243	CAAAAACAAACAAAGAAACAAACAAAAACTATATCATACTCTGAGCTTAT	51292

CR753822.3	1451	ATTTCATTCCTGGGTATATATCACAAAGAAATTCTCACCCTGGTCTGTGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	51293	ATTTCATTCCTGGGTATATATCACAAAGAAATTCTCACCCTGGTCTGTGA	51342

CR753822.3	1501	GAGAACATGTACACCCATCCTTTGTTTGTGGTGGCATGGTGTTGGTAGTA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	51343	GAGAACATGTACACCCATCCTTTGTTTGTGGTGGCATGGTGTTGGTAGTA	51392

CR753822.3	1551	CCAGGGTGCCCTTCACTGGGAGAGAGGGAAGGTTAGTGTGGGGGATGCAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	51393	CCAGGGTGCCCTTCACTGGGAGAGAGGGAAGGTTAGTGTGGGGGATGCAC	51442

CR753822.3	1601	CCATAGAGTGTTCTGCAGCAGTTGGAAGCAGTGGGTTAGATGTGGCCACA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	51443	CCATAGAGTGTTCTGCAGCAGTTGGAAGCAGTGGGTTAGATGTGGCCACA	51492

CR753822.3	1651	GGAACATGGACAGATGTTGAAACACTAGGTGGAGAAAAAGAAGCAAAAAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	51493	GGAACATGGACAGATGTTGAAACACTAGGTGGAGAAAAAGAAGCAAAAAA	51542

CR753822.3	1701	AAATCAGATATATAACCACTTTTTATATGAATTATAAACTACAAGCTCAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	51543	AAATCAGATATATAACCACTTTTTATATGAATTATAAACTACAAGCTCAC	51592

CR753822.3	1751	AAAAGAAGACATGTTCTATAAGATCATATTTATATAAAAAGATATTTGTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	51593	AAAAGAAGACATGTTCTATAAGATCATATTTATATAAAAAGATATTTGTT	51642

CR753822.3	1801	GGATACATTGGAATGATTGCAGTCAGGGATGGGAATGGGATATGAAGGTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	51643	GGATACATTGGAATGATTGCAGTCAGGGATGGGAATGGGATATGAAGGTA	51692

CR753822.3	1851	AAAGTTAAGAAATAGAAATAAGTAGCTACATAAGTAAAATGAGGAAAACA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	51693	AAAGTTAAGAAATAGAAATAAGTAGCTACATAAGTAAAATGAGGAAAACA	51742

CR753822.3	1901	ATAATACCTGCCCTATAGATTTGCCTGGAGAGTTCAGTGAGATCCCATAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	51743	ATAATACCTGCCCTATAGATTTGCCTGGAGAGTTCAGTGAGATCCCATAA	51792

CR753822.3	1951	GTAACAACTGGGATGGTGCCTTATGCCTACAAAGTAAGGTGGGCTTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005143.8	51793	GTAACAACTGGGATGGTGCCTTATGCCTACAAAGTAAGGTGGGCTTGGCC	51842

Overview

Query
CR753822.3 - 10388 bps
Hit
BX005143.8 - 51842 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link