<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL845307.30	221773	CCTGAGAGCAGTCGTGGAAAGTGAGTGAAATCCTGTAATGCAATATTCAG	221822
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	1	CCTGAGAGCAGTCGTGGAAAGTGAGTGAAATCCTGTAATGCAATATTCAG	50

AL845307.30	221823	CTTGTTGACCTTTTATTATAGACCATAAAGATGATGAGGCGAATCAACAT	221872
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	51	CTTGTTGACCTTTTATTATAGACCATAAAGATGATGAGGCGAATCAACAT	100

AL845307.30	221873	TTGCTCTCAGGGCTTCATGTAACTATTATTCATCTGCTGTTTCATCAACA	221922
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	101	TTGCTCTCAGGGCTTCATGTAACTATTATTCATCTGCTGTTTCATCAACA	150

AL845307.30	221923	GGCTGTTAAAACGACACTTAAGCGTGTCTATCATCTCAAAGCTTTTGAAT	221972
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	151	GGCTGTTAAAACGACACTTAAGCGTGTCTATCATCTCAAAGCTTTTGAAT	200

AL845307.30	221973	CACACCTGCACTTATAATCCCTCGGGCACAGATTTTAAGGTGAGAATAAT	222022
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	201	CACACCTGCACTTATAATCCCTCGGGCACAGATTTTAAGGTGAGAATAAT	250

AL845307.30	222023	TCATTCAATATCAGCTGCTTTTTGATGTTGACAATTCAGCTTCAATTAAG	222072
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	251	TCATTCAATATCAGCTGCTTTTTGATGTTGACAATTCAGCTTCAATTAAG	300

AL845307.30	222073	ATGCTTTATGATCTGTGATGAGTGAAATTATGCAGGTGCATGGTTCACTC	222122
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	301	ATGCTTTATGATCTGTGATGAGTGAAATTATGCAGGTGCATGGTTCACTC	350

AL845307.30	222123	AGAAGACCATGCTTTGTTATTTTTGAAATAATAATACATGCAGTGGCCAG	222172
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	351	AGAAGACCATGCTTTGTTATTTTTGAAATAATAATACATGCAGTGGCCAG	400

AL845307.30	222173	CATAAACAAATCTCTTACAAATCTCTTTTAGACAAATACTTTACACAATA	222222
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	401	CATAAACAAATCTCTTACAAATCTCTTTTAGACAAATACTTTACACAATA	450

AL845307.30	222223	AGATAATTGTGTACAGTGTATACAATACATTACCTTGGTCAATACCAAAG	222272
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	451	AGATAATTGTGTACAGTGTATACAATACATTACCTTGGTCAATACCAAAG	500

AL845307.30	222273	CCCAAATTGGAACTGATATACAAAATAACTTAAGTGTGTATGTTTCCATG	222322
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	501	CCCAAATTGGAACTGATATACAAAATAACTTAAGTGTGTATGTTTCCATG	550

AL845307.30	222323	AATAAACTGTGAAAACTGCTGGGATTCACATAGTTCCTACATGTTGTCCC	222372
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	551	AATAAACTGTGAAAACTGCTGGGATTCACATAGTTCCTACATGTTGTCCC	600

AL845307.30	222373	AACACAAATCAATTAAGTTAACTTAAAAATGTTTAAAAACTTGGTCCCAC	222422
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	601	AACACAAATCAATTAAGTTAACTTAAAAATGTTTAAAAACTTGGTCCCAC	650

AL845307.30	222423	TTTATATTAAGTGTCCTTAACTACTATGTAATTACATCAAAAAAAAAAAA	222472
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	651	TTTATATTAAGTGTCCTTAACTACTATGTAATTACATCAAAAAAAAAAAA	700

AL845307.30	222473	TACAATGTACTTACTGTGTTCATAAAGTATTTAAGAACACTAGTGGTGCA	222522
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	701	TACAATGTACTTACTGTGTTCATAAAGTATTTAAGAACACTAGTGGTGCA	750

AL845307.30	222523	CTTGAGTTGGGATAGGGGTTGGCTTAGGGACAGGTTTGGTGGTGTTGGGT	222572
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	751	CTTGAGTTGGGATAGGGGTTGGCTTAGGGACAGGTTTGGTGGTGTTGGGT	800

AL845307.30	222573	AGGTTTATGGGTGGGTTAAGGTGTAGGGAATGTCTGCAGTGTATTTACAT	222622
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	801	AGGTTTATGGGTGGGTTAAGGTGTAGGGAATGTCTGCAGTGTATTTACAT	850

AL845307.30	222623	ATGTAATTACAGAAGTTAATTACAGATGTAATTACATACAGGTATTTAAT	222672
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	851	ATGTAATTACAGAAGTTAATTACAGATGTAATTACATACAGGTATTTAAT	900

AL845307.30	222673	CAAGCATAAGTACACAATAAATACATGTATTTACACAATAAGTACATTGT	222722
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	901	CAAGCATAAGTACACAATAAATACATGTATTTACACAATAAGTACATTGT	950

AL845307.30	222723	AACAAACTATTAATTCCTGTGTAAGTACATATTAGTTAAGGGCACTTAAT	222772
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	951	AACAAACTATTAATTCCTGTGTAAGTACATATTAGTTAAGGGCACTTAAT	1000

AL845307.30	222773	ATAAAGTGGGACCAAAAACTTAAGTGGATTGAACATAAAACAATTAAGTT	222822
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	1001	ATAAAGTGGGACCAAAAACTTAAGTGGATTGAACATAAAACAATTAAGTT	1050

AL845307.30	222823	GTATCTTCAAAAACTTAAAAATGTGGTTTCCGCTTATTTTAAATAAGTCA	222872
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	1051	GTATCTTCAAAAACTTAAAAATGTGGTTTCCGCTTATTTTAAATAAGTCA	1100

AL845307.30	222873	TTTGAACAAGCAGCAAAAGTCATTTTTGAGTGTTTGTTAGGAAAAACATG	222922
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	1101	TTTGAACAAGCAGCAAAAGTCATTTTTGAGTGTTTGTTAGGAAAAACATG	1150

AL845307.30	222923	AAATATTATTTTAATAAAGAGGAAAAATCAAGAAAACCTTAAATAATATT	222972
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	1151	AAATATTATTTTAATAAAGAGGAAAAATCAAGAAAACCTTAAATAATATT	1200

AL845307.30	222973	AAGTTTTGTTGATATTTTGTTGTATTTTTTTTTGTGCAATATCTCATTTA	223022
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	1201	AAGTTTTGTTGATATTTTGTTGTATTTTTTTTTGTGCAATATCTCATTTA	1250

AL845307.30	223023	TATTTAATTATATTATGGTATTATTCCTAAAGATGTTTTGGAACCACACT	223072
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	1251	TATTTAATTATATTATGGTATTATTCCTAAAGATGTTTTGGAACCACACT	1300

AL845307.30	223073	CTCTTTTTGAATGAATTAAATACAGTTTTGTTTAAATACACACACCGGCC	223122
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	1301	CTCTTTTTGAATGAATTAAATACAGTTTTGTTTAAATACACACACCGGCC	1350

AL845307.30	223123	ACTTTAGGTACACCAGTCCAACTGCTTGTTGGCGCAAATTTCTAATTAGC	223172
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	1351	ACTTTAGGTACACCAGTCCAACTGCTTGTTGGCGCAAATTTCTAATTAGC	1400

AL845307.30	223173	TAATTACATGGCAGCAACTCAGCGCATTTAGGCGTGTAGACATGGTCAAG	223222
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	1401	TAATTACATGGCAGCAACTCAGCGCATTTAGGCGTGTAGACATGGTCAAG	1450

AL845307.30	223223	ATGATCTGCTGCAGTTCAAACAGAGCATCAGAATGGGAAAGAAAGGTGAT	223272
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	1451	ATGATCTGCTGCAGTTCAAACAGAGCATCAGAATGGGAAAGAAAGGTGAT	1500

AL845307.30	223273	TTAAGTGACTTTGAACATGGCATGGTTGTTGATACCAGACGGGCTGGTAT	223322
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	1501	TTAAGTGACTTTGAACATGGCATGGTTGTTGATACCAGACGGGCTGGTAT	1550

AL845307.30	223323	TTCAGAAACTGCTGATCTACTGGGATTTTCACTCACAACCATCTCTAGGG	223372
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	1551	TTCAGAAACTGCTGATCTACTGGGATTTTCACTCACAACCATCTCTAGGG	1600

AL845307.30	223373	TTTACAGAGAATGATCAGAAAAAGAAAATCTCCAGTCAGTGGCCGTTCTG	223422
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	1601	TTTACAGAGAATGATCAGAAAAAGAAAATCTCCAGTCAGTGGCCGTTCTG	1650

AL845307.30	223423	TGAGCGCAAATGCCTTGTTGATGTCAGAGGAGAACGGCCAGACTGGTTCC	223472
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	1651	TGAGCGCAAATGCCTTGTTGATGTCAGAGGAGAACGGCCAGACTGGTTCC	1700

AL845307.30	223473	AGCTGATAGAAAGGCAACAGTAACTCAAATAACCACTCGATACAACCGAG	223522
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	1701	AGCTGATAGAAAGGCAACAGTAACTCAAATAACCACTCGATACAACCGAG	1750

AL845307.30	223523	GGATGCAGAAGAGCATATCTGAACACACAACATGTTCAATCTTGAGGCAG	223572
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	1751	GGATGCAGAAGAGCATATCTGAACACACAACATGTTCAATCTTGAGGCAG	1800

AL845307.30	223573	ATAAGCTACAGCAGCAGAAGACCACACCTGGTGCCACTTCTGTCAGCTAA	223622
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	1801	ATAAGCTACAGCAGCAGAAGACCACACCTGGTGCCACTTCTGTCAGCTAA	1850

AL845307.30	223623	GAACAGGAAACTGAGGCTACAATTCGCACAGGCTCACCAGAATTGTACAA	223672
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	1851	GAACAGGAAACTGAGGCTACAATTCGCACAGGCTCACCAGAATTGTACAA	1900

AL845307.30	223673	TAGAAAATTGGAAAAACGTTGCCTGGTCTGATGAGTCTCGATTTCTGCTG	223722
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	1901	TAGAAAATTGGAAAAACGTTGCCTGGTCTGATGAGTCTCGATTTCTGCTG	1950

AL845307.30	223723	CGACATTCGGATGGTAGGGTCAGAATTTGGTGTCAATAACATGAAAGCTT	223772
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX005063.7	1951	CGACATTCGGATGGTAGGGTCAGAATTTGGTGTCAATAACATGAAAGCTT	2000

Overview

Query
AL845307.30 - 223772 bps
Hit
BX005063.7 - 24458 bps
Total alignments
16
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100193720002217732237721120001
281.28228605146361146965-1183824571
389.891241781577191578961404042171
493.0491115157531157645-1409542091
579.54792211770311772511457547891
689.94111178138871139048-1800281801
7100325888946890031826983261
896.674360187313187372-110473105321
91004561187312187372-110533105931
1087.29551179590296018-110661107781
111004561187312187372-110776108361
1285.671763231604416366114740150671
1387.21983293200632334114740150671
1483.2120270199768200037-114784150511
1598.5932718894289012-119134192041
1698.5932718894389013119134192041
Short-link