<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL683871.15	1	GAATTCCAAGGGAAGCTGAATGTCTATCTTTTTGATACGTGGACACTGTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	67862	GAATTCCAAGGGAAGCTGAATGTCTATCTTTTTGATACGTGGACACTGTC	67911

AL683871.15	51	ATCCTGCAAACAAAACCGTAGACGTCTTTGGGGGGGTCGTGAACTTGGCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	67912	ATCCTGCAAACAAAACCGTAGACGTCTTTGGGGGGGTCGTGAACTTGGCA	67961

AL683871.15	101	GTGAAGTTCGAAGGTCTCCAGTGCTTCTCACATCCGAAGTCAGAGCCCAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	67962	GTGAAGTTCGAAGGTCTCCAGTGCTTCTCACATCCGAAGTCAGAGCCCAC	68011

AL683871.15	151	ATTTCTCCGTCAGTTTGTAACCCTGGCAAAAGAAGGTCTTCGGCTTGCTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	68012	ATTTCTCCGTCAGTTTGTAACCCTGGCAAAAGAAGGTCTTCGGCTTGCTT	68061

AL683871.15	201	GTTTTCCTGAAAAACAGGAAGTTTTATTTTGCCAAGAATGAATGGAATGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	68062	GTTTTCCTGAAAAACAGGAAGTTTTATTTTGCCAAGAATGAATGGAATGG	68111

AL683871.15	251	GAAGCCAAAGCGTTTGATATGCACAAGGGAAAATGCAGGATTTTTTTGTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	68112	GAAGCCAAAGCGTTTGATATGCACAAGGGAAAATGCAGGATTTTTTTGTG	68161

AL683871.15	301	TGCAAAGTTTACGTGGGGCTACACACCCTATTTCCTCTTTCCTCACAATG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	68162	TGCAAAGTTTACGTGGGGCTACACACCCTATTTCCTCTTTCCTCACAATG	68211

AL683871.15	351	ATGCCACGAAATTGATTTTATTCCCTGCGGCTACTACATTTACCGTTCAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	68212	ATGCCACGAAATTGATTTTATTCCCTGCGGCTACTACATTTACCGTTCAA	68261

AL683871.15	401	GTGCTGAATTCCTCCCCTCCCCTGCCCTCCCCACTCCCCTCCCCTGACCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	68262	GTGCTGAATTCCTCCCCTCCCCTGCCCTCCCCACTCCCCTCCCCTGACCT	68311

AL683871.15	451	CCCCCCTCCCCTCCCCTGCCCTCCCCATCCCCTCCCCCTCCCCCTCTACT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	68312	CCCCCCTCCCCTCCCCTGCCCTCCCCATCCCCTCCCCCTCCCCCTCTACT	68361

AL683871.15	501	CCCCCTCCTCCCATCCCATCTCCTTTCCCCCTCCCCCATCCCATCCCTCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	68362	CCCCCTCCTCCCATCCCATCTCCTTTCCCCCTCCCCCATCCCATCCCTCC	68411

AL683871.15	551	CGTCCTCCCCTCCCCTCCCCTCTTCCCCTCCCCTCTCCTTCACCCCCTCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	68412	CGTCCTCCCCTCCCCTCCCCTCTTCCCCTCCCCTCTCCTTCACCCCCTCA	68461

AL683871.15	601	CATCCCCTCCCCTCCCCTCCTACCCTCCCCTCCTCCCCTCTCCTTCCCCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	68462	CATCCCCTCCCCTCCCCTCCTACCCTCCCCTCCTCCCCTCTCCTTCCCCT	68511

AL683871.15	651	TCCCCCCTCCCCTCCTCCCCTTCCCTCTGTTCCTCCCCTCCTCCCCTCCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	68512	TCCCCCCTCCCCTCCTCCCCTTCCCTCTGTTCCTCCCCTCCTCCCCTCCC	68561

AL683871.15	701	CTCCTCCCCTCCCCTCCTCCCCTCCCCTCTCCTTTCCCACTCCCCCCTCC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	68562	CTCCTCCCCTCCCCTCCTCCCCTCCCCTCTCCTTTCCCACTCCCCCCTCC	68611

AL683871.15	751	CATCCCCTCCTCCACTCCCCTCCTCCCCTACTCTCCTCCCCTCCTCCCGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	68612	CATCCCCTCCTCCACTCCCCTCCTCCCCTACTCTCCTCCCCTCCTCCCGT	68661

AL683871.15	801	CCCCTCCTCCCCTCCCCTCTTCTCTTCCCCTCCCCTCCCCTCCTCCCTCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	68662	CCCCTCCTCCCCTCCCCTCTTCTCTTCCCCTCCCCTCCCCTCCTCCCTCT	68711

AL683871.15	851	CCTCCCCTTTCCCCCTCCCCCTTCCCATCCCCTCCCATCCTCCCCTCCCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	68712	CCTCCCCTTTCCCCCTCCCCCTTCCCATCCCCTCCCATCCTCCCCTCCCT	68761

AL683871.15	901	CCCATCTTCCCCTCCCCTCCCCTCCTCTCTTCCCCTCCCCTCCCCTCCCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	68762	CCCATCTTCCCCTCCCCTCCCCTCCTCTCTTCCCCTCCCCTCCCCTCCCC	68811

AL683871.15	951	CACTTCTCACTCTCCTCCCCCCTCCCATCCCCTCCCCTCCTCTTCTCTTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	68812	CACTTCTCACTCTCCTCCCCCCTCCCATCCCCTCCCCTCCTCTTCTCTTC	68861

AL683871.15	1001	TCTTCTTTTCTCTTCTTTTCTTTTTTTTCTTCTTCTTTTTTTTTTTTCTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	68862	TCTTCTTTTCTCTTCTTTTCTTTTTTTTCTTCTTCTTTTTTTTTTTTCTA	68911

AL683871.15	1051	ATGGTCTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	68912	ATGGTCTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCT	68961

AL683871.15	1101	CACTGCAGCCTCCACCTCTCTGGCTCAAGAGATCCTTCCACCTCATCCTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	68962	CACTGCAGCCTCCACCTCTCTGGCTCAAGAGATCCTTCCACCTCATCCTT	69011

AL683871.15	1151	CTGATTCTGTTACTTATTTTTATTTTTTTAATTAATTAATTAATCTTTTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	69012	CTGATTCTGTTACTTATTTTTATTTTTTTAATTAATTAATTAATCTTTTT	69061

AL683871.15	1201	TTTGAGATGGAGTCTGGCTCTGTTGCCCAGTCTGGAGTGCAGTGGCGCTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	69062	TTTGAGATGGAGTCTGGCTCTGTTGCCCAGTCTGGAGTGCAGTGGCGCTA	69111

AL683871.15	1251	CCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	69112	CCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCC	69161

AL683871.15	1301	TCAGCCTCCCGGGTAACTGGGACTACAGGCACCCGTCACCACACCCGACT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	69162	TCAGCCTCCCGGGTAACTGGGACTACAGGCACCCGTCACCACACCCGACT	69211

AL683871.15	1351	AATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTCACCGTGTTAGCCAGGATG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	69212	AATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTCACCGTGTTAGCCAGGATG	69261

AL683871.15	1401	ATCTCGGTCTCCTGACCTCATGATCTGCCCTCCTCAGCCTCCCAAAATGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	69262	ATCTCGGTCTCCTGACCTCATGATCTGCCCTCCTCAGCCTCCCAAAATGC	69311

AL683871.15	1451	TGGTATGACAGGCATGAGCCACCGCGCCCAGCCTAATTAATTTTTTACAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	69312	TGGTATGACAGGCATGAGCCACCGCGCCCAGCCTAATTAATTTTTTACAT	69361

AL683871.15	1501	TTTACTTTAACTTCTGAGATACATGTGCTAATTAATTAATTTTTTAAATT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	69362	TTTACTTTAACTTCTGAGATACATGTGCTAATTAATTAATTTTTTAAATT	69411

AL683871.15	1551	TTACTTTAAAAAAGTCATACTTTACTTAAGTAAAAGTAAGTAAATGTGTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	69412	TTACTTTAAAAAAGTCATACTTTACTTAAGTAAAAGTAAGTAAATGTGTG	69461

AL683871.15	1601	TTAACTAAACACATTCTGGGGTACATGTGCACAAAGCGCAGGTTAGTTAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	69462	TTAACTAAACACATTCTGGGGTACATGTGCACAAAGCGCAGGTTAGTTAC	69511

AL683871.15	1651	ATATGTATACATGTGCCATGGTGGTTTGCTGCTCCTATCAACCCATTATC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	69512	ATATGTATACATGTGCCATGGTGGTTTGCTGCTCCTATCAACCCATTATC	69561

AL683871.15	1701	TAAGTTTTAAGCCCCACATGCACTAGGTATTTGTCCTAATGCTCTCCATC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	69562	TAAGTTTTAAGCCCCACATGCACTAGGTATTTGTCCTAATGCTCTCCATC	69611

AL683871.15	1751	CTCTTGCCTTCTATCCCCCCACAGGCCCTGGTGTGTGATGTTCCCCTCCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	69612	CTCTTGCCTTCTATCCCCCCACAGGCCCTGGTGTGTGATGTTCCCCTCCC	69661

AL683871.15	1801	TGTGTCCATGTGTTCTCACTGTTCAACTCCCACTTACGAGTGAGAACATG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	69662	TGTGTCCATGTGTTCTCACTGTTCAACTCCCACTTACGAGTGAGAACATG	69711

AL683871.15	1851	CAGTGTTTGGTTTTCTGAGGATGCGGAAAAATAGGAAAGCTTTTACTCTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	69712	CAGTGTTTGGTTTTCTGAGGATGCGGAAAAATAGGAAAGCTTTTACTCTC	69761

AL683871.15	1901	GATGGTGGGAGGTGAATAAGTTCAACCATTGTGGAAGGCAGTGTGATGAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	69762	GATGGTGGGAGGTGAATAAGTTCAACCATTGTGGAAGGCAGTGTGATGAT	69811

AL683871.15	1951	TCCTTGAGGATCTAGAACAAGAAGTAACATTGGACCCAGCCATCCCATTA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX004827.19	69812	TCCTTGAGGATCTAGAACAAGAAGTAACATTGGACCCAGCCATCCCATTA	69861

Overview

Query
AL683871.15 - 175765 bps
Hit
BX004827.19 - 69861 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link