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Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
BX248088.18 1 CCAAAGCCCCTTCTCCCCAGAGCTGAACCCACACACGACAGAGAAGCAGG 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 18344 CCAAAGCCCCTTCTCCCCAGAGCTGAACCCACACACGACAGAGAAGCAGG 18393 BX248088.18 51 GTACAAAGGGCAGGAGAGGGAAGCGAGAGGCAGCAAGCCAGAGGCAGCGA 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 18394 GTACAAAGGGCAGGAGAGGGAAGCGAGAGGCAGCAAGCCAGAGGCAGCGA 18443 BX248088.18 101 CTAGGGGTAGCTGAAACCTCAGTCCAGGCACTGCCGCATGCCCCGCCCCT 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 18444 CTAGGGGTAGCTGAAACCTCAGTCCAGGCACTGCCGCATGCCCCGCCCCT 18493 BX248088.18 151 CCCGGCCAAGGACTATACCAGCCCAGAGAATTAGTCTTTTTCAGGACCCC 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 18494 CCCGGCCAAGGACTATACCAGCCCAGAGAATTAGTCTTTTTCAGGACCCC 18543 BX248088.18 201 TTTCACCCTGGTCCCTCGGGTAGCGCCTCCACTATCTCAGCCCTAAGGGA 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 18544 TTTCACCCTGGTCCCTCGGGTAGCGCCTCCACTATCTCAGCCCTAAGGGA 18593 BX248088.18 251 CCCCCGAAGGTAGCAGCTCCAATCCCAGTACAGGAAGGAAAAGGGGAAGT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 18594 CCCCCGAAGGTAGCAGCTCCAATCCCAGTACAGGAAGGAAAAGGGGAAGT 18643 BX248088.18 301 GGGATGATAGGGGGTTGGGGGCGGTAGACTCAGAGAGTCACGTGGCCCCA 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 18644 GGGATGATAGGGGGTTGGGGGCGGTAGACTCAGAGAGTCACGTGGCCCCA 18693 BX248088.18 351 GCCCCTCCCCCGACCGATCCCGAAAAACCAGCCCTGCCAGTCAACCTGCC 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 18694 GCCCCTCCCCCGACCGATCCCGAAAAACCAGCCCTGCCAGTCAACCTGCC 18743 BX248088.18 401 CTCACCTAGGATCTGGACCTAGGAGTTTAGGGCCTCGGGGCCCCAAATCC 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 18744 CTCACCTAGGATCTGGACCTAGGAGTTTAGGGCCTCGGGGCCCCAAATCC 18793 BX248088.18 451 AAATTCTGGCCCCTCCTGAGGCCCGAAATCCTGCTCCTGGCCACCACCAT 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 18794 AAATTCTGGCCCCTCCTGAGGCCCGAAATCCTGCTCCTGGCCACCACCAT 18843 BX248088.18 501 TAATCCCTAATGAAAACAGATGACCACTCTCTACCCACCCTAGGATCTTT 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 18844 TAATCCCTAATGAAAACAGATGACCACTCTCTACCCACCCTAGGATCTTT 18893 BX248088.18 551 CCTCCAGGTCCCAGAACCGTGGCTTCCCGGCCTCTACCCAGGACCGGGGC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 18894 CCTCCAGGTCCCAGAACCGTGGCTTCCCGGCCTCTACCCAGGACCGGGGC 18943 BX248088.18 601 GGGGCGGGGGGGCGGGGGGAAGGGGGAGAGAGGGAAGGAGGGGTCACGAA 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 18944 GGGGCGGGGGGGCGGGGGGAAGGGGGAGAGAGGGAAGGAGGGGTCACGAA 18993 BX248088.18 651 ATCTGAGGGTTCCCTCCCCAATCCCAGAGTCAGAGGAGCTGGTTACTGTG 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 18994 ATCTGAGGGTTCCCTCCCCAATCCCAGAGTCAGAGGAGCTGGTTACTGTG 19043 BX248088.18 701 GAAACAAACCCCTCCCCGCCAAACAAAAACAAGGAGGGAGACAGGGACCA 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 19044 GAAACAAACCCCTCCCCGCCAAACAAAAACAAGGAGGGAGACAGGGACCA 19093 BX248088.18 751 AGACACGACTGCTCAGAGAGGTAGGCACACTCAGGCAGGCAGAGGTGGAG 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 19094 AGACACGACTGCTCAGAGAGGTAGGCACACTCAGGCAGGCAGAGGTGGAG 19143 BX248088.18 801 GGCCAAAGACCCGCAGGGACAGGACAGCCAGCCAGAAGTTCCAGGCAGGA 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 19144 GGCCAAAGACCCGCAGGGACAGGACAGCCAGCCAGAAGTTCCAGGCAGGA 19193 BX248088.18 851 ACAGGGCAGGTTCCTGCGGGCAGGTCCTGAGTCACACTGACAGAGAACCA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 19194 ACAGGGCAGGTTCCTGCGGGCAGGTCCTGAGTCACACTGACAGAGAACCA 19243 BX248088.18 901 CGGAGACGCCAGGACTCCCCGCAGCAGAGAAACGGGCCGACACCCAGGGA 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 19244 CGGAGACGCCAGGACTCCCCGCAGCAGAGAAACGGGCCGACACCCAGGGA 19293 BX248088.18 951 GGCGCGAGAATAACTGAGGCAAGGAGGAGGAGATGTAGGGACCCAGAGAC 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 19294 GGCGCGAGAATAACTGAGGCAAGGAGGAGGAGATGTAGGGACCCAGAGAC 19343 BX248088.18 1001 AAGAGAAAAGTGGAGACTTCAGAAATACATACGCCCCCTACCTCCCACCA 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 19344 AAGAGAAAAGTGGAGACTTCAGAAATACATACGCCCCCTACCTCCCACCA 19393 BX248088.18 1051 CCCGCGTCTCACCTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTGCCCCCCGC 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 19394 CCCGCGTCTCACCTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTGCCCCCCGC 19443 BX248088.18 1101 CCACGACCAGGCCACCTGGGCCCCCACCCTCTTCGGGGTCCCGGCTTCGG 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 19444 CCACGACCAGGCCACCTGGGCCCCCACCCTCTTCGGGGTCCCGGCTTCGG 19493 BX248088.18 1151 AAGCTGCTCAGTACGACTCCCCCGGGGGGGCTCGTGTCCAAAAGCAGCCG 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 19494 AAGCTGCTCAGTACGACTCCCCCGGGGGGGCTCGTGTCCAAAAGCAGCCG 19543 BX248088.18 1201 CAGGGGCCGCGGGAGCATGGCCGAGTGAAGGAATCAGCGGGGTCGGGCCA 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 19544 CAGGGGCCGCGGGAGCATGGCCGAGTGAAGGAATCAGCGGGGTCGGGCCA 19593 BX248088.18 1251 TGGGGGCGCCTGGGGAGAGACGGGGTGGGGTGGGGGTGGAGAGTCAGGCA 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 19594 TGGGGGCGCCTGGGGAGAGACGGGGTGGGGTGGGGGTGGAGAGTCAGGCA 19643 BX248088.18 1301 GGCGCGGGGGAACCGGGCAGGGAAGGGACGTGGGTGGGTGTCAAGAAGAC 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 19644 GGCGCGGGGGAACCGGGCAGGGAAGGGACGTGGGTGGGTGTCAAGAAGAC 19693 BX248088.18 1351 CGGAAGGGAGTTCTGCAGGAAGGTTGGGGGAGGGGGCAACAGAAGGGTGG 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 19694 CGGAAGGGAGTTCTGCAGGAAGGTTGGGGGAGGGGGCAACAGAAGGGTGG 19743 BX248088.18 1401 AATAGGGGGGCCCTTGGTGCTGTTGGGGAAGGAGGAGGTCACGAGTACGG 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 19744 AATAGGGGGGCCCTTGGTGCTGTTGGGGAAGGAGGAGGTCACGAGTACGG 19793 BX248088.18 1451 GGACGCGCAGGGTGCTCAGGCTCTGACCTGCTCGGGAGGGGTGGGGGCAG 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 19794 GGACGCGCAGGGTGCTCAGGCTCTGACCTGCTCGGGAGGGGTGGGGGCAG 19843 BX248088.18 1501 CGTGGGTCCTGAGCCGCTGTTGCCGTCGGTCTCCGGCCCCGGACCGAGTC 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 19844 CGTGGGTCCTGAGCCGCTGTTGCCGTCGGTCTCCGGCCCCGGACCGAGTC 19893 BX248088.18 1551 CCCTCCCCGGCTTTTCCGTACCCCCTTGAACCCCCCCGCCGGGCTCCTGG 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 19894 CCCTCCCCGGCTTTTCCGTACCCCCTTGAACCCCCCCGCCGGGCTCCTGG 19943 BX248088.18 1601 GCCCTCCCGCCCTTTCCGCTCCCCCCCGCGTCCGCCCGCTCCGAGAGCAG 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 19944 GCCCTCCCGCCCTTTCCGCTCCCCCCCGCGTCCGCCCGCTCCGAGAGCAG 19993 BX248088.18 1651 GAGCCAAAAGGGGAAGGAAGTGAGGACAGGAGCCAGGGCCGCGGACTAGG 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 19994 GAGCCAAAAGGGGAAGGAAGTGAGGACAGGAGCCAGGGCCGCGGACTAGG 20043 BX248088.18 1701 GGAGCGCTGGACGCTCAGGGACCAGGACCCAGGCGCCCGAGTCCCCAGCT 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 20044 GGAGCGCTGGACGCTCAGGGACCAGGACCCAGGCGCCCGAGTCCCCAGCT 20093 BX248088.18 1751 CCACTGTCCTCCGCCTCTACACTCGGGGATTCTGGAGACCACGTCGACCC 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 20094 CCACTGTCCTCCGCCTCTACACTCGGGGATTCTGGAGACCACGTCGACCC 20143 BX248088.18 1801 GCAATGAACTGGAATAAAGATTCCAGTCTCCAGCCCCTGGGGGAAGGCAG 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 20144 GCAATGAACTGGAATAAAGATTCCAGTCTCCAGCCCCTGGGGGAAGGCAG 20193 BX248088.18 1851 GAGCAGAATTTGACATTCCCTTCCCCAACAATAACACGGCTAAAACTCCC 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 20194 GAGCAGAATTTGACATTCCCTTCCCCAACAATAACACGGCTAAAACTCCC 20243 BX248088.18 1901 GCGGGAAGCGTTTCAGGCGGAGAGAGAGCCGGTTACTCCATCCCCACGGG 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 20244 GCGGGAAGCGTTTCAGGCGGAGAGAGAGCCGGTTACTCCATCCCCACGGG 20293 BX248088.18 1951 ATTACCCTCCCTACCACAACCCACGAATGTAGCTGACCGAAATCCCGGCC 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BX000343.5 20294 ATTACCCTCCCTACCACAACCCACGAATGTAGCTGACCGAAATCCCGGCC 20343
