<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 5753 bps / non-identical: 450 bps

Full alignment

C  AC239872.3	35132	AGTTCTGGGAAACAGATGAATGGGGAGAAGTGAGGCACAGGGACGTCCTG	35083
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	71580	AGTTCTGGGAAACAGATGAATGGGGAGAAGTGAGGCACAGGGACGTCCTG	71629

C  AC239872.3	35082	CCTGAGTATGCGGCCCTGGCCTGTCCTCCTGTCTGTGGGTGACACTGGAC	35033
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	71630	CCTGAGTATGCGGCCCTGGCCTGTCCTCCTGTCTGTGGGTGACACTGGAC	71679

C  AC239872.3	35032	ACTGAGCCACACACGATCCGTGGGGACTGAAGGCTCGGCCCCCCGACCCG	34983
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	71680	ACTGAGCCACACACGATCCGTGGGGACTGAAGGCTCGGCCCCCCGACCCG	71729

C  AC239872.3	34982	CTCTGGTGGGTGGCAGTAGATCGGGACGCTTCTCACTCCAGGCTCTTTCC	34933
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	71730	CTCTGGTGGGTGGCAGTAGATCGGGACGCTTCTCACTCCAGGCTCTTTCC	71779

C  AC239872.3	34932	CGGTCCCTGGGGCTCTCAGAGGAGTAGCTGACTGTCTCTTTCTGCTGCTG	34883
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	71780	CGGTCCCTGGGGCTCTCAGAGGAGTAGCTGACTGTCTCTTTCTGCTGCTG	71829

C  AC239872.3	34882	CTGCTGCTGGCAGGTATGGGGGCACCTTCCAGAACGTGTCTGTGCAGCTG	34833
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	71830	CTGCTGCTGGCAGGTATGGGGGCACCTTCCAGAACGTGTCTGTGCAGCTG	71879

C  AC239872.3	34832	CCCATCACTCTCAACAAATTCTTCCAGCCGACAGAAATGGCTTCTCAGGA	34783
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	71880	CCCATCACTCTCAACAAATTCTTCCAGCCGACAGAAATGGCTTCTCAGGA	71929

C  AC239872.3	34782	TTTCTTTCAACGTTGGAAGCAGTTGAGCAAGTGAGAAACCTGTTTCCTGT	34733
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	71930	TTTCTTTCAACGTTGGAAGCAGTTGAGCAAGTGAGAAACCTGTTTCCTGT	71979

C  AC239872.3	34732	AGGGGTCAGGGGTGGGGACGGGGCTCATTTGAAAAGGTGGGTTTTGGTCT	34683
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	71980	AGGGGTCAGGGGTGGGGACGGGGCTCATTTGAAAAGGTGGGTTTTGGTCT	72029

C  AC239872.3	34682	CTGGCCTGGCTGAGAACACTCGCCTTTGCTGTTTCTCACAGTCCACAGCA	34633
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	72030	CTGGCCTGGCTGAGAACACTCGCCTTTGCTGTTTCTCACAGTCCACAGCA	72079

C  AC239872.3	34632	GGAAGTGCAGAACATCTTCAAAGCAAAGCACCCAATGGACACAGAAGTCA	34583
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	72080	GGAAGTGCAGAACATCTTCAAAGCAAAGCACCCAATGGACACAGAAGTCA	72129

C  AC239872.3	34582	CCAAAGCCAAGGTAACACGTCTGGAGGGATGGCCCCGGGGGACACGCAGC	34533
			||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
  AP006477.2	72130	CCAAAGCCAAGGTAACACGTCTGGAGGGACGGCCCCGGGGGACACGCAGC	72179

C  AC239872.3	34532	CCGTGACCCCGCGCCAGGGTCTGGAGGGACGGCCCCGGGGAACACGCAGC	34483
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	72180	CCGTGACCCCGCGCCAGGGTCTGGAGGGACGGCCCCGGGGAACACGCAGC	72229

C  AC239872.3	34482	CCATGACCCCGCGCCAGGGTCTGGAGGGACGGCCCCGGGGGACACGCAGC	34433
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	72230	CCATGACCCCGCGCCAGGGTCTGGAGGGACGGCCCCGGGGGACACGCAGC	72279

C  AC239872.3	34432	CCGCGACCCAGCGCCAGGGTCTGGAGGGGCGGCCCCGGGGGACACGCAGC	34383
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	72280	CCGCGACCCAGCGCCAGGGTCTGGAGGGGCGGCCCCGGGGGACACGCAGC	72329

C  AC239872.3	34382	CCGCGACCCAGCGCCAGGGTCTGGAGGGGCGGCCCTGGGGGACACGCTGC	34333
			|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
  AP006477.2	72330	CCACGACCCAGCGCCAGGGTCTGGAGGGGCGGCCCCGGGGGACACGCTGC	72379

C  AC239872.3	34332	CCGCGACCCCGCGCCAGGGTCCTCATTCTCCTGTTTCTTTGGACAGATCA	34283
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	72380	CCGCGACCCCGCGCCAGGGTCCTCATTCTCCTGTTTCTTTGGACAGATCA	72429

C  AC239872.3	34282	TTGGATTTGGTTCTGCACTTCTTGAAGAAGTTGATCCTAATCCTGCGAAT	34233
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	72430	TTGGATTTGGTTCTGCACTTCTTGAAGAAGTTGATCCTAATCCTGCGAAT	72479

C  AC239872.3	34232	TTCGTGGGAGCTGGAATCATCCACACGAAAACCACCCAGATTGGATGCCT	34183
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	72480	TTCGTGGGAGCTGGAATCATCCACACGAAAACCACCCAGATTGGATGCCT	72529

C  AC239872.3	34182	GCTGCGCTTGGAGCCGAACCTGCAAGCCCAGGTCAGGCCCTCAGGAAATG	34133
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	72530	GCTGCGCTTGGAGCCGAACCTGCAAGCCCAGGTCAGGCCCTCAGGAAATG	72579

C  AC239872.3	34132	GTGGAACACACTTGAGTTGCTTTTTATTCTGGCACAATGTACGTGGTGAG	34083
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	72580	GTGGAACACACTTGAGTTGCTTTTTATTCTGGCACAATGTACGTGGTGAG	72629

C  AC239872.3	34082	ATGCGTAGCTCTTTAGTGCAGTTCAGTCAGTTTTGACAGATGTTGTTTAA	34033
			||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	72630	ATGTGTAGCTCTTTAGTGCAGTTCAGTCAGTTTTGACAGATGTTGTTTAA	72679

C  AC239872.3	34032	CCACCACCCTGTCAATACATGGTTGCCTCCCAGCCTCCCCGCAGCTGGCC	33983
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	72680	CCACCACCCTGTCAATACATGGTTGCCTCCCAGCCTCCCCGCAGCTGGCC	72729

C  AC239872.3	33982	ACCGTGGAGCATCATCCCTAGTGCAGTTCAGTCAGTTGTGACAGATGTTG	33933
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	72730	ACCGTGGAGCATCATCCCTAGTGCAGTTCAGTCAGTTGTGACAGATGTTG	72779

C  AC239872.3	33932	TGTGCCTGTTTAACCACCACCCTGTCAATACATGGTTGCATCCCAGCCTC	33883
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	72780	TGTGCCTGTTTAACCACCACCCTGTCAATACATGGTTGCATCCCAGCCTC	72829

C  AC239872.3	33882	CCCACAGCTGGCCACCGTGGAGCATCGTCCCACCATGGAGCAGCCTGGCC	33833
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	72830	CCCACAGCTGGCCACCGTGGAGCATCGTCCCACCATGGAGCAGCCTGGCC	72879

C  AC239872.3	33832	CTGGGCGGTGGCTCTCCCAGCTGTTCCTCTCTGTCACCGCGTTGTTCCTT	33783
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	72880	CTGGGCGGTGGCTCTCCCAGCTGTTCCTCTCTGTCACCGCGTTGTTCCTT	72929

C  AC239872.3	33782	CTCACCACGTCCCGTTCTGGCGACGGACACCTGTCTCCGTTTCACTTGGG	33733
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	72930	CTCACCACGTCCCGTTCTGGCGACGGACACCTGTCTCCGTTTCACTTGGG	72979

C  AC239872.3	33732	TGGCACCCAGGAGTGCTGCTGTCGCCCAGGGCCTGTGTGTGGTTAGTGCT	33683
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	72980	TGGCACCCAGGAGTGCTGCTGTCGCCCAGGGCCTGTGTGTGGTTAGTGCT	73029

C  AC239872.3	33682	GCAAGAACATCCCACAGCTTCTCCAGGTGGCCGTGCCACTTTGCACTCCC	33633
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	73030	GCAAGAACATCCCACAGCTTCTCCAGGTGGCCGTGCCACTTTGCACTCCC	73079

C  AC239872.3	33632	GCCAGCTACGTACGAGACGCCAGGCGCTCCCATGCCAGCCCTCAGTTTTC	33583
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	73080	GCCAGCTACGTACGAGACGCCAGGCGCTCCCATGCCAGCCCTCAGTTTTC	73129

C  AC239872.3	33582	ATGCTGACAGTGTGTGTGGTGCTCAGGCCTCTGCCGAGTTGTGGGTGCCT	33533
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	73130	ATGCTGACAGTGTGTGTGGTGCTCAGGCCTCTGCCGAGTTGTGGGTGCCT	73179

C  AC239872.3	33532	CCAGAGAGTGGTCCCTGGGCATGGCCCACAGGGTTCTGCATGGCGGATCC	33483
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	73180	CCAGAGAGTGGTCCCTGGGCATGGCCCACAGGGTTCTGCATGGCGGATCC	73229

C  AC239872.3	33482	TGGACCCGAGGGCTGTGTGAGCCTCGGCGTGCCCGTTGACCTGCTGTGCT	33433
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	73230	TGGACCCGAGGGCTGTGTGAGCCTCGGCGTGCCCGTTGACCTGCTGTGCT	73279

C  AC239872.3	33432	CTCTGTTTCAGATGTACCGGCTCACGCTGCGCACAAGTAAGGAAGCCGTT	33383
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	73280	CTCTGTTTCAGATGTACCGGCTCACGCTGCGCACAAGTAAGGAAGCCGTT	73329

C  AC239872.3	33382	TCTCAGAGATTATGTGAATTGCTCTCAGCGCAGTTTTAGTCCTGAGGATG	33333
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	73330	TCTCAGAGATTATGTGAATTGCTCTCAGCGCAGTTTTAGTCCTGAGGATG	73379

C  AC239872.3	33332	GAAGACCAGGCTCGTGTGTCTTGTGTTGTCTTCGTCTGTGCCGTTTGTCT	33283
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	73380	GAAGACCAGGCTCGTGTGTCTTGTGTTGTCTTCGTCTGTGCCGTTTGTCT	73429

C  AC239872.3	33282	TCGTGGCTATCCTGCAGATGAGCACCGTGTCCAGTGCCACAGCACAAGGC	33233
			||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	73430	TCGTGGCCATCCTGCAGATGAGCACCGTGTCCAGTGCCACAGCACAAGGC	73479

C  AC239872.3	33232	GCCTCCCCGCCCCACCGCCCCACACCTCTCCCCTTTGGGCTGGACGGGAA	33183
			||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	73480	GCCTCCCCGCCCCGCCGCCCCACACCTCTCCCCTTTGGGCTGGACGGGAA	73529

C  AC239872.3	33182	CACACGTGTGTGGCTCAGGAGGAAAAGCTCAGCCTGGACTGTGGCAGCCA	33133
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	73530	CACACGTGTGTGGCTCAGGAGGAAAAGCTCAGCCTGGACTGTGGCAGCCA	73579

C  AC239872.3	33132	CGGCAGAAGGTGGATCTTGGGATCAATTTTTATAAAAATCGAGACAGTTC	33083
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	73580	CGGCAGAAGGTGGATCTTGGGATCAATTTTTATAAAAATCGAGACAGTTC	73629

C  AC239872.3	33082	TGTGGTTAAATCTACAAATTAAAGGGAAATTAGAAGTTGGCGTGAACGTG	33033
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	73630	TGTGGTTAAATCTACAAATTAAAGGGAAATTAGAAGTTGGCGTGAACGTG	73679

C  AC239872.3	33032	GCGTTTGTGGGAGTGTCACTGAGATGGCCCGTGCTGCCGCCCACCCCGCC	32983
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	73680	GCGTTTGTGGGAGTGTCACTGAGATGGCCCGTGCTGCCGCCCACCCCGCC	73729

C  AC239872.3	32982	TCGGAGCCTCTGGGAGCAGCAGTGCCACTGTGCATGGCGTGGGCTGAGCC	32933
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	73730	TCGGAGCCTCTGGGAGCAGCAGTGCCACTGTGCATGGCGTGGGCTGAGCC	73779

C  AC239872.3	32932	TTGGTGTGTGGCCGTCCTGGTGGCTGCACACCTGGCGTCGTCCTGGGCCC	32883
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	73780	TTGGTGTGTGGCCGTCCTGGTGGCTGCACACCTGGCGTCGTCCTGGGCCC	73829

C  AC239872.3	32882	TTGGGAGGAGCACAGCTGACCCTGGTTTTGCTGCAGTCCCAGCTGGACTG	32833
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	73830	TTGGGAGGAGCACAGCTGACCCTGGTTTTGCTGCAGTCCCAGCTGGACTG	73879

C  AC239872.3	32832	TTTTCCCAGGCAGGATTTTAATCTAGAATTTAGAAACATTTGTATTTGTA	32783
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	73880	TTTTCCCAGGCAGGATTTTAATCTAGAATTTAGAAACATTTGTATTTGTA	73929

C  AC239872.3	32782	ATGACTTCTGGCAAAAGCACGTGTCCTGGCCGGATGTAACTGTTCTCCTT	32733
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	73930	ATGACTTCTGGCAAAAGCACGTGTCCTGGCCGGATGTAACTGTTCTCCTT	73979

C  AC239872.3	32732	TCCCAGCTCCTGTTTGTGAAGGGCGTCTGTTATGCTCCTGCAGTCGCCGA	32683
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	73980	TCCCAGCTCCTGTTTGTGAAGGGCGTCTGTTATGCTCCTGCAGTCGCCGA	74029

C  AC239872.3	32682	GGCCTTGGATGTGCAGCCAGGGGAGGAGCGTCCTGCCGGCCCCGCAGGGC	32633
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	74030	GGCCTTGGATGTGCAGCCAGGGGAGGAGCGTCCTGCCGGCCCCGCAGGGC	74079

C  AC239872.3	32632	CCCCAGGACTCCAGGGTAAAGTGTGGGCCGGTGGCGCAAGACTCAGAGGT	32583
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	74080	CCCCAGGACTCCAGGGTAAAGTGTGGGCCGGTGGCGCAAGACTCAGAGGT	74129

C  AC239872.3	32582	GTGCTCGTCTCTTTCCTGTCAGAGTGGGCGTCCCCAGGCCACGGTGCAGG	32533
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	74130	GTGCTCGTCTCTTTCCTGTCAGAGTGGGCGTCCCCAGGCCACGGTGCAGG	74179

C  AC239872.3	32532	CCTGAGTCCTTCCACCGGCCCCGTCCAGTCGTCCCTGGAGGGGCTGTGGA	32483
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	74180	CCTGAGTCCTTCCACCGGCCCCGTCCAGTCGTCCCTGGAGGGGCTGTGGA	74229

C  AC239872.3	32482	GGAAGGACGCCTCTGTGTGGTCAGGAAGTGAAGGGGCCATTGGCCGCATG	32433
			||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	74230	GGAGGGACGCCTCTGTGTGGTCAGGAAGTGAAGGGGCCATTGGCCGCATG	74279

C  AC239872.3	32432	CCATGTGCCACCTGCGGCTTGTGTCTCACCTGTCATCTGGACTCAGCACC	32383
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	74280	CCATGTGCCACCTGCGGCTTGTGTCTCACCTGTCATCTGGACTCAGCACC	74329

C  AC239872.3	32382	CAGGCTGCACGTCTGACACCTGAGAGGCGAGAGAGTGGGGCCGGCCTAGG	32333
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	74330	CAGGCTGCACGTCTGACACCTGAGAGGCGAGAGAGTGGGGCCGGCCTAGG	74379

C  AC239872.3	32332	AGCCAAGGCTGGGGCCTTGCGCTCTGTCCCCAGGATGGTGGCCTTGTTTG	32283
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	74380	AGCCAAGGCTGGGGCCTTGCGCTCTGTCCCCAGGATGGTGGCCTTGTTTG	74429

C  AC239872.3	32282	TCCTAAACACACCCAGCACAGGTTCTGGCTTCCTGACATGCTGTGGAGGC	32233
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	74430	TCCTAAACACACCCAGCACAGGTTCTGGCTTCCTGACATGCTGTGGAGGC	74479

C  AC239872.3	32232	AGGGAGGGTGGGTGGCCACATGTGCTTGAGGGTTTTCACCCTGGCCCTCA	32183
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	74480	AGGGAGGGTGGGTGGCCACATGTGCTTGAGGGTTTTCACCCTGGCCCTCA	74529

C  AC239872.3	32182	GTTGCCTGCTGTGCGGGTCCCTGGGGCAGCTGCAGGGGCTCACGGACCCA	32133
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
  AP006477.2	74530	GTTGCCTGCTGTGCGGGTCCCTGGGGCAGCTGCAGGGGCTCATGGACCCA	74579

C  AC239872.3	32132	TCAGGGTCTCCACAGCTCCCCTGCAGTGTGTGCACCCCACAATGTCTGCG	32083
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	74580	TCAGGGTCTCCACAGCTCCCCTGCAGTGTGTGCACCCCACAATGTCTGCG	74629

C  AC239872.3	32082	GCTCTTCTTCCGGCGTGTCGGGCTTTGATCACAGCATAGCCACGTCAGTG	32033
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	74630	GCTCTTCTTCCGGCGTGTCGGGCTTTGATCACAGCATAGCCACGTCAGTG	74679

C  AC239872.3	32032	GCGTGCGCCTCTCGCACAGGCCATTCTGGGTCTGGTGGTGCCAGGTGCCG	31983
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	74680	GCGTGCGCCTCTCGCACAGGCCATTCTGGGTCTGGTGGTGCCAGGTGCCG	74729

C  AC239872.3	31982	TGACACGCCGTGCTGGGCTTGTGCTGCAGCTGGGTGGTGTGGCCCTCATT	31933
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	74730	TGACACGCCGTGCTGGGCTTGTGCTGCAGCTGGGTGGTGTGGCCCTCATT	74779

C  AC239872.3	31932	CTCATGTTCCAGCTGCTGGGCAGTGCTCTGCCTGTGTGCTGCGCCTGCAG	31883
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	74780	CTCATGTTCCAGCTGCTGGGCAGTGCTCTGCCTGTGTGCTGCGCCTGCAG	74829

C  AC239872.3	31882	GCTGCGTGTGCTGCCGTGGATCTCCTGCATCCCTTGACCCCTCCCGCCAT	31833
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	74830	GCTGCGTGTGCTGCCGTGGATCTCCTGCATCCCTTGACCCCTCCCGCCAT	74879

C  AC239872.3	31832	CAGAGGAAAGGCTGCTCCCCGAGGCACCGCTTCCCTGTGCGGCGCTGCAG	31783
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	74880	CAGAGGAAAGGCTGCTCCCCGAGGCACCGCTTCCCTGTGCGGCGCTGCAG	74929

C  AC239872.3	31782	AGGGGCCCTCAGTGTGGCACTCCTCGTCAAAGAAAAATAAAGGCTAGAAC	31733
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	74930	AGGGGCCCTCAGTGTGGCACTCCTCGTCAAAGAAAAATAAAGGCTAGAAC	74979

C  AC239872.3	31732	TGCACCCCGGATCACGCGCTTTCTTTGGGGGGAAAGCATCCCATGTAACC	31683
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	74980	TGCACCCCGGATCACGCGCTTTCTTTGGGGGGAAAGCATCCCATGTAACC	75029

C  AC239872.3	31682	CTCATAGCTCCCCGGGGGTCGCGTGAGGCACAGACCCCAAGGTCCCCGAC	31633
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	75030	CTCATAGCTCCCCGGGGGTCGCGTGAGGCACAGACCCCAAGGTCCCCGAC	75079

C  AC239872.3	31632	CTGTCCTTCAGCAGTGGGCTCACGGGCAGCGGGCATCAGAAAGTGACCTG	31583
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	75080	CTGTCCTTCAGCAGTGGGCTCACGGGCAGCGGGCATCAGAAAGTGACCTG	75129

C  AC239872.3	31582	CCCTTTGCTCCGCCGGTTTGATTCTGGGTGTGTGGTGGAGCTTTTTGGGA	31533
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	75130	CCCTTTGCTCCGCCGGTTTGATTCTGGGTGTGTGGTGGAGCTTTTTGGGA	75179

C  AC239872.3	31532	CTCAGGTCATGCGGGAACCCCTCCAGCGTGGCCGCAGGGCTCCCCACTGT	31483
			||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	75180	CTCAGGTCATGCGGGAACCCCTCCAGCCTGGCCGCAGGGCTCCCCACTGT	75229

C  AC239872.3	31482	ACAGTGTGTTGAGGTGCAGCCCAGGGCTCCTTCCTGGGGAACGGGAGGCC	31433
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	75230	ACAGTGTGTTGAGGTGCAGCCCAGGGCTCCTTCCTGGGGAACGGGAGGCC	75279

C  AC239872.3	31432	CCGTGGGGATCCTCCAGTTGATCCTACCACAGATGGTGCAGAAGGGGCTC	31383
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	75280	CCGTGGGGATCCTCCAGTTGATCCTACCACAGATGGTGCAGAAGGGGCTC	75329

C  AC239872.3	31382	TCGGGCAGATGGGGGTGGCCCCCGGAGGACGGTGGGCTTCGCCAGAGACG	31333
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	75330	TCGGGCAGATGGGGGTGGCCCCCGGAGGACGGTGGGCTTCGCCAGAGACG	75379

C  AC239872.3	31332	GAACAGTCCTAATGGAGGGAGGGCAGGGGCCCAAAGCCAGAGGCAGCTTC	31283
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	75380	GAACAGTCCTAATGGAGGGAGGGCAGGGGCCCAAAGCCAGAGGCAGCTTC	75429

C  AC239872.3	31282	TCTTACCAGCCCAGACCCTGCTGGGGGCAGCCCTGCCCAACTGCAGATCC	31233
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	75430	TCTTACCAGCCCAGACCCTGCTGGGGGCAGCCCTGCCCAACTGCAGATCC	75479

C  AC239872.3	31232	CAGGGGCCCACAGGGTGCAGATGTGGGTCGGGTGCCTACTAAGGGACTGG	31183
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	75480	CAGGGGCCCACAGGGTGCAGATGTGGGTCGGGTGCCTACTAAGGGACTGG	75529

C  AC239872.3	31182	GGAGAGGCAAAAGCAGTGCTCAGGGACCAGCCTCTGTGCCTTGACAAGAA	31133
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	75530	GGAGAGGCAAAAGCAGTGCTCAGGGACCAGCCTCTGTGCCTTGACAAGAA	75579

C  AC239872.3	31132	CCGGTTTATTTGGAGTCTCTGACCGGGTGACGCCCTCTCCCAAGGACAGG	31083
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	75580	CCGGTTTATTTGGAGTCTCTGACCGGGTGACGCCCTCTCCCAAGGACAGG	75629

C  AC239872.3	31082	CTGCTGGGGATGGGTGTGGTGCTGGTGGGGGCCTTCTGCCTGGCTGGGAG	31033
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	75630	CTGCTGGGGATGGGTGTGGTGCTGGTGGGGGCCTTCTGCCTGGCTGGGAG	75679

C  AC239872.3	31032	CGGGGGCGGCTGCCCTGCCCTCGCTGCCACCCTCTGCCCTCCCTGACTCT	30983
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	75680	CGGGGGCGGCTGCCCTGCCCTCGCTGCCACCCTCTGCCCTCCCTGACTCT	75729

C  AC239872.3	30982	GGGGATCTCCTCTTCTCTGTGCTGGTGGCTGCCTGGGCCTCTTGCCCCCA	30933
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	75730	GGGGATCTCCTCTTCTCTGTGCTGGTGGCTGCCTGGGCCTCTTGCCCCCA	75779

C  AC239872.3	30932	TCTCGGCACAGGTTTCCGTGCCCTCCTCGCCCCTGATGGGTCTGGTCGAG	30883
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	75780	TCTCGGCACAGGTTTCCGTGCCCTCCTCGCCCCTGATGGGTCTGGTCGAG	75829

C  AC239872.3	30882	CGCCTGCTCTGTGGCTTCATCTGCAGGGTTCTGGGCCCAGCAGGGCTGGG	30833
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	75830	CGCCTGCTCTGTGGCTTCATCTGCAGGGTTCTGGGCCCAGCAGGGCTGGG	75879

C  AC239872.3	30832	GCCAAGTTCAGGGGCTGGGAGGTGTTGGACAGTGGGCAGGGGTGGTCGGG	30783
			|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
  AP006477.2	75880	GCCAAGTTCAGGGGCTGGGAGGTGTTGGACGGTGGGCAGGGGTGGTCGGG	75929

C  AC239872.3	30782	AGTGCCCTGTGTGCCTGGGAGGTCCGTGACCACTGTCCGCCTCAGTCCCT	30733
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	75930	AGTGCCCTGTGTGCCTGGGAGGTCCGTGACCACTGTCCGCCTCAGTCCCT	75979

C  AC239872.3	30732	CTCTGCTGGCTCAGGGTCTGCAGGAGTGTGGTAGTCTGAGCCCCTGCTTG	30683
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	75980	CTCTGCTGGCTCAGGGTCTGCAGGAGTGTGGTAGTCTGAGCCCCTGCTTG	76029

C  AC239872.3	30682	GCAGCCCCTCTCCAACCGGTGCCCCAGGGAGCCACGGCCCAGGGCACTTG	30633
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	76030	GCAGCCCCTCTCCAACCGGTGCCCCAGGGAGCCACGGCCCAGGGCACTTG	76079

C  AC239872.3	30632	GGGGCCAGGCCTGGTGACCAGGAAAGCAGCTGCTGGCACAAGCGGGAAGG	30583
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	76080	GGGGCCAGGCCTGGTGACCAGGAAAGCAGCTGCTGGCACAAGCGGGAAGG	76129

C  AC239872.3	30582	GGGCTGGTGGGTGTTTTCCTGTCTGTCATCTGCAGTCCTTCAGCCCCAGG	30533
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	76130	GGGCTGGTGGGTGTTTTCCTGTCTGTCATCTGCAGTCCTTCAGCCCCAGG	76179

C  AC239872.3	30532	AGAGCAGGCAGCGACCCTGCTAGTCTCCACAGGCCACAGAGCTGCACACG	30483
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	76180	AGAGCAGGCAGCGACCCTGCTAGTCTCCACAGGCCACAGAGCTGCACACG	76229

C  AC239872.3	30482	CAGTGGCTGAACACCTGCAGGGTGAGTACGAGCCGCCGGCCAGGCGTGCT	30433
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	76230	CAGTGGCTGAACACCTGCAGGGTGAGTACGAGCCGCCGGCCAGGCGTGCT	76279

C  AC239872.3	30432	GGGATCGGGGCAGGGCAGCTCCAGCTGCTGCTCATAGGAGTGGAGGGGGC	30383
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	76280	GGGATCGGGGCAGGGCAGCTCCAGCTGCTGCTCATAGGAGTGGAGGGGGC	76329

C  AC239872.3	30382	GGCAGCAGCTGCAGCGGGCATCCACCTGCTGGGTGATGATGTTGAAGCTG	30333
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	76330	GGCAGCAGCTGCAGCGGGCATCCACCTGCTGGGTGATGATGTTGAAGCTG	76379

C  AC239872.3	30332	CCGAGAAGTCAAGACAGAGCAGGGTCATGACTGCTGCAGGGGCATAAGGC	30283
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	76380	CCGAGAAGTCAAGACAGAGCAGGGTCATGACTGCTGCAGGGGCATAAGGC	76429

C  AC239872.3	30282	CCCTCCCTCCCCAGGGCAGCTGCTCCGCAGAGGCCTGGACCTCCCCGCTG	30233
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	76430	CCCTCCCTCCCCAGGGCAGCTGCTCCGCAGAGGCCTGGACCTCCCCGCTG	76479

C  AC239872.3	30232	AGCTCCCGGCTCACAGGGGCCAGGGCGGTGTTGGGCAGATGGAGCGCAGA	30183
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	76480	AGCTCCCGGCTCACAGGGGCCAGGGCGGTGTTGGGCAGATGGAGCGCAGA	76529

C  AC239872.3	30182	GTGGCTCACCTGATGGGGCAGCAGGCGCCTGGGTGGGGTGCCCGAACCTC	30133
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	76530	GTGGCTCACCTGATGGGGCAGCAGGCGCCTGGGTGGGGTGCCCGAACCTC	76579

C  AC239872.3	30132	TCTGGGGTGGGGTTGTGAGCACCTTGGTGGACGTGGGGCAGGCCTCCCAC	30083
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	76580	TCTGGGGTGGGGTTGTGAGCACCTTGGTGGACGTGGGGCAGGCCTCCCAC	76629

C  AC239872.3	30082	CTGTGGACTCACCTGGCAGCGGAAATGCAGGCGCCCTCACAGCGGGTTAC	30033
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	76630	CTGTGGACTCACCTGGCAGCGGAAATGCAGGCGCCCTCACAGCGGGTTAC	76679

C  AC239872.3	30032	CGTCACGTTCGCCATGCACCCCTTGAACGTGATCTCCTCCTGCTGCTCCC	29983
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	76680	CGTCACGTTCGCCATGCACCCCTTGAACGTGATCTCCTCCTGCTGCTCCC	76729

C  AC239872.3	29982	GCACACTGCAGACCCCTGGTAGCCGAGTGGACGGTCAGCAGCGCCCAGGG	29933
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	76730	GCACACTGCAGACCCCTGGTAGCCGAGTGGACGGTCAGCAGCGCCCAGGG	76779

C  AC239872.3	29932	TGGGCATGGAGCGAGGAGGGAGGGAAACCCTGGCTAGAGACCGGGGTCCC	29883
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	76780	TGGGCATGGAGCGAGGAGGGAGGGAAACCCTGGCTAGAGACCGGGGTCCC	76829

C  AC239872.3	29882	CACCTGTCTCTGGACTCTCCTGCCCAAGGTGTGGTCTCCCCTTGTGGAGC	29833
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	76830	CACCTGTCTCTGGACTCTCCTGCCCAAGGTGTGGTCTCCCCTTGTGGAGC	76879

C  AC239872.3	29832	CCCACAGAGCTCAGACCTCAGCCATACACAAAGGCAAAGGCCAGCCGCAT	29783
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	76880	CCCACAGAGCTCAGACCTCAGCCATACACAAAGGCAAAGGCCAGCCGCAT	76929

C  AC239872.3	29782	CCTAGTTTGTTTTTTCCCCTCAAAGTCGCTCTGCTGGAGTCCATAAGGTA	29733
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	76930	CCTAGTTTGTTTTTTCCCCTCAAAGTCGCTCTGCTGGAGTCCATAAGGTA	76979

C  AC239872.3	29732	GAGAATTTTCTCAGCGGACTCAGCAGATACTGAGCCCTGGGCCTGTGTGA	29683
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	76980	GAGAATTTTCTCAGCGGACTCAGCAGATACTGAGCCCTGGGCCTGTGTGA	77029

C  AC239872.3	29682	GCCACCCTTGGGCCCCAGCTTCCCTGATGACCAACCCCAGGCCTCAACAC	29633
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	77030	GCCACCCTTGGGCCCCAGCTTCCCTGATGACCAACCCCAGGCCTCAACAC	77079

C  AC239872.3	29632	TGACCTGTGGGCATGGGCCTCTCTGGTTGGCCAGACCCAGGACCTGCAGG	29583
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	77080	TGACCTGTGGGCATGGGCCTCTCTGGTTGGCCAGACCCAGGACCTGCAGG	77129

C  AC239872.3	29582	GGGGCCGAGGACACCGTGCCAGTGACCCCAGAGCGGGACATATGGTGTTG	29533
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	77130	GGGGCCGAGGACACCGTGCCAGTGACCCCAGAGCGGGACATATGGTGTTG	77179

C  AC239872.3	29532	CAGGAGCTCCGTGTGCCCCAGCTGGGGAGGAGGGAAGTGGAGCAGGCCCC	29483
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	77180	CAGGAGCTCCGTGTGCCCCAGCTGGGGAGGAGGGAAGTGGAGCAGGCCCC	77229

C  AC239872.3	29482	GTGGTCTGGGCTCCTGGAAGGGGCGGGGTGGGGGCCCGCGGGGAAGGCCC	29433
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	77230	GTGGTCTGGGCTCCTGGAAGGGGCGGGGTGGGGGCCCGCGGGGAAGGCCC	77279

C  AC239872.3	29432	AGAGACAGCCAGCCTCAGCGAGAGGCCTGGGTACGTGGCAGGCAGCACAG	29383
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	77280	AGAGACAGCCAGCCTCAGCGAGAGGCCTGGGTACGTGGCAGGCAGCACAG	77329

C  AC239872.3	29382	AGC	29380
			|||
  AP006477.2	77330	AGC	77332

Compact alignment

skip 550 bps 100% identity alignment

C  AC239872.3	34582	CCAAAGCCAAGGTAACACGTCTGGAGGGATGGCCCCGGGGGACACGCAGC	34533
			||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
  AP006477.2	72130	CCAAAGCCAAGGTAACACGTCTGGAGGGACGGCCCCGGGGGACACGCAGC	72179

skip 150 bps 100% identity alignment

C  AC239872.3	34382	CCGCGACCCAGCGCCAGGGTCTGGAGGGGCGGCCCTGGGGGACACGCTGC	34333
			|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
  AP006477.2	72330	CCACGACCCAGCGCCAGGGTCTGGAGGGGCGGCCCCGGGGGACACGCTGC	72379

skip 250 bps 100% identity alignment

C  AC239872.3	34082	ATGCGTAGCTCTTTAGTGCAGTTCAGTCAGTTTTGACAGATGTTGTTTAA	34033
			||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	72630	ATGTGTAGCTCTTTAGTGCAGTTCAGTCAGTTTTGACAGATGTTGTTTAA	72679

skip 750 bps 100% identity alignment

C  AC239872.3	33282	TCGTGGCTATCCTGCAGATGAGCACCGTGTCCAGTGCCACAGCACAAGGC	33233
			||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	73430	TCGTGGCCATCCTGCAGATGAGCACCGTGTCCAGTGCCACAGCACAAGGC	73479

C  AC239872.3	33232	GCCTCCCCGCCCCACCGCCCCACACCTCTCCCCTTTGGGCTGGACGGGAA	33183
			||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	73480	GCCTCCCCGCCCCGCCGCCCCACACCTCTCCCCTTTGGGCTGGACGGGAA	73529

skip 700 bps 100% identity alignment

C  AC239872.3	32482	GGAAGGACGCCTCTGTGTGGTCAGGAAGTGAAGGGGCCATTGGCCGCATG	32433
			||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	74230	GGAGGGACGCCTCTGTGTGGTCAGGAAGTGAAGGGGCCATTGGCCGCATG	74279

skip 250 bps 100% identity alignment

C  AC239872.3	32182	GTTGCCTGCTGTGCGGGTCCCTGGGGCAGCTGCAGGGGCTCACGGACCCA	32133
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
  AP006477.2	74530	GTTGCCTGCTGTGCGGGTCCCTGGGGCAGCTGCAGGGGCTCATGGACCCA	74579

skip 600 bps 100% identity alignment

C  AC239872.3	31532	CTCAGGTCATGCGGGAACCCCTCCAGCGTGGCCGCAGGGCTCCCCACTGT	31483
			||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
  AP006477.2	75180	CTCAGGTCATGCGGGAACCCCTCCAGCCTGGCCGCAGGGCTCCCCACTGT	75229

skip 650 bps 100% identity alignment

C  AC239872.3	30832	GCCAAGTTCAGGGGCTGGGAGGTGTTGGACAGTGGGCAGGGGTGGTCGGG	30783
			|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
  AP006477.2	75880	GCCAAGTTCAGGGGCTGGGAGGTGTTGGACGGTGGGCAGGGGTGGTCGGG	75929

skip 1403 bps 100% identity alignment

Overview

Query
AC239872.3 - 35132 bps
Hit
AP006477.2 - 77332 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 5753 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
199.8262057532938035132-171580773321
Short-link