<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL928800.5	151881	GACCACTGAGGCGAGCAGACAAATCCACCGACAGACAGACAAGTTTCCTA	151930
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	1	GACCACTGAGGCGAGCAGACAAATCCACCGACAGACAGACAAGTTTCCTA	50

AL928800.5	151931	AAAGTCAGGAGCCCGGGTTAGTTTGGTCAGTACAGTATTGTCTAAGGTTT	151980
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	51	AAAGTCAGGAGCCCGGGTTAGTTTGGTCAGTACAGTATTGTCTAAGGTTT	100

AL928800.5	151981	GCGTGTGTCAGATGATGGCACCGCAGGTCGTCAGCTCGCCCTTCCTCAAA	152030
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	101	GCGTGTGTCAGATGATGGCACCGCAGGTCGTCAGCTCGCCCTTCCTCAAA	150

AL928800.5	152031	CCCTTCTTCCTGAAGACACCCATCAGCGTTTCCAGTCCACGGCGGCAGAG	152080
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	151	CCCTTCTTCCTGAAGACACCCATCAGCGTTTCCAGTCCACGGCGGCAGAG	200

AL928800.5	152081	ACGACACACGTTGCCGGCCAGCGAGTTTCGAAATCTCACCCCGCAGGACG	152130
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	201	ACGACACACGTTGCCGGCCAGCGAGTTTCGAAATCTCACCCCGCAGGACG	250

AL928800.5	152131	CCATCAGTGTGTTTGAGATCGAGAGAGAAGGTGAGTGATTCTCAGACTGA	152180
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	251	CCATCAGTGTGTTTGAGATCGAGAGAGAAGGTGAGTGATTCTCAGACTGA	300

AL928800.5	152181	TGGGGTTACATTGAGTTAAATTTGGTTAAATTTTTATTTAAACTTTTTTT	152230
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	301	TGGGGTTACATTGAGTTAAATTTGGTTAAATTTTTATTTAAACTTTTTTT	350

AL928800.5	152231	GTGTTTTAATTGTCTCAAAGTGCCAGTAGTTCTAAATATATTTACTGTTC	152280
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	351	GTGTTTTAATTGTCTCAAAGTGCCAGTAGTTCTAAATATATTTACTGTTC	400

AL928800.5	152281	GCTCAATTTGATTAATAACTGAAGGCATTCTGATGAACTGTTTAGTTTTA	152330
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	401	GCTCAATTTGATTAATAACTGAAGGCATTCTGATGAACTGTTTAGTTTTA	450

AL928800.5	152331	CTTTAGTTTTTCTGTTTAAACTGGGTTTAGTTTTGCTTGACATATATGAA	152380
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	451	CTTTAGTTTTTCTGTTTAAACTGGGTTTAGTTTTGCTTGACATATATGAA	500

AL928800.5	152381	TGCATTACTATTTTTTTTAGCTTTGAATGTAGATTTATGTTTTTTTTTAG	152430
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	501	TGCATTACTATTTTTTTTAGCTTTGAATGTAGATTTATGTTTTTTTTTAG	550

AL928800.5	152431	TTGTGATTTTAAAAATGAGGGTTATTCCAACAAATCTCAGATTTCTTAAC	152480
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	551	TTGTGATTTTAAAAATGAGGGTTATTCCAACAAATCTCAGATTTCTTAAC	600

AL928800.5	152481	TCTTCTAAAAGGAAAACTTTGGTATTGTATAATCTGAAAATTATTATAAA	152530
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	601	TCTTCTAAAAGGAAAACTTTGGTATTGTATAATCTGAAAATTATTATAAA	650

AL928800.5	152531	AGCCTGAAAATTTAATTTGCAAACAAAAAGAAGCTGTGAATGACATTTCT	152580
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	651	AGCCTGAAAATTTAATTTGCAAACAAAAAGAAGCTGTGAATGACATTTCT	700

AL928800.5	152581	ATTTTTAAATTAGTTGGAAATTGTATCAGTAATTTACAGAATAAAAAAAA	152630
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	701	ATTTTTAAATTAGTTGGAAATTGTATCAGTAATTTACAGAATAAAAAAAA	750

AL928800.5	152631	ACATGAACAAAACAAACAAAATTAACTAAACTAAATATCTACCCTAATAA	152680
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	751	ACATGAACAAAACAAACAAAATTAACTAAACTAAATATCTACCCTAATAA	800

AL928800.5	152681	ATAAATTGTAAGTCTTGAGAAACTGCAAATTTTTAAGTCGATTTACTGCT	152730
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	801	ATAAATTGTAAGTCTTGAGAAACTGCAAATTTTTAAGTCGATTTACTGCT	850

AL928800.5	152731	AATTCAGTTAAGAGTGCATTAAATAGATCAAAAGTAACGGTAAAACGTTT	152780
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	851	AATTCAGTTAAGAGTGCATTAAATAGATCAAAAGTAACGGTAAAACGTTT	900

AL928800.5	152781	CAAATTATTAAAATATTGAAAATGTTAGAGAATACATTTTCCAAACGAAC	152830
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	901	CAAATTATTAAAATATTGAAAATGTTAGAGAATACATTTTCCAAACGAAC	950

AL928800.5	152831	CTGAAGTTATCACAATTTCTATCAAATGATGTAAATGAAAGTGTGATAAA	152880
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	951	CTGAAGTTATCACAATTTCTATCAAATGATGTAAATGAAAGTGTGATAAA	1000

AL928800.5	152881	TATTTCTCAAGCACTAAATTGATTTAATTGAACACATGAAAAACATGGTA	152930
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	1001	TATTTCTCAAGCACTAAATTGATTTAATTGAACACATGAAAAACATGGTA	1050

AL928800.5	152931	ACACTTTACAATAAGATTCATTAGTTAATGCATTTACTAACATGAATTAA	152980
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	1051	ACACTTTACAATAAGATTCATTAGTTAATGCATTTACTAACATGAATTAA	1100

AL928800.5	152981	TCATAAAAACACTTGTACAGCATTTATTAATCATAATTGAACATTTACTA	153030
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	1101	TCATAAAAACACTTGTACAGCATTTATTAATCATAATTGAACATTTACTA	1150

AL928800.5	153031	ATGCATTATTAACATCCAGGTCCATGCTTGTTAACATTAGTTAATGCACC	153080
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	1151	ATGCATTATTAACATCCAGGTCCATGCTTGTTAACATTAGTTAATGCACC	1200

AL928800.5	153081	ATGAGTTAACATGAACTCACAATGAACTACTGTATTTTCATTAACTAACG	153130
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	1201	ATGAGTTAACATGAACTCACAATGAACTACTGTATTTTCATTAACTAACG	1250

AL928800.5	153131	TTAACTGACATCAATAAATACTGTAGTAAATGTACCGTTCATTGTTTGTT	153180
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	1251	TTAACTGACATCAATAAATACTGTAGTAAATGTACCGTTCATTGTTTGTT	1300

AL928800.5	153181	CATGTTAGTAAATGCATTAATTAACATTAACTAATGACCCTTGTTGTAAA	153230
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	1301	CATGTTAGTAAATGCATTAATTAACATTAACTAATGACCCTTGTTGTAAA	1350

AL928800.5	153231	GTGTGACAAAAATATAATAAAAAGTGAAACACTTCAGAATGTGTTTTTGA	153280
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	1351	GTGTGACAAAAATATAATAAAAAGTGAAACACTTCAGAATGTGTTTTTGA	1400

AL928800.5	153281	TAAGGCATTTACTAATTCATATCCCTTAAAAATGCCTTCGAAACTCCCTA	153330
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	1401	TAAGGCATTTACTAATTCATATCCCTTAAAAATGCCTTCGAAACTCCCTA	1450

AL928800.5	153331	AAGACTTCCGAAGTTCTAAATAGACATGAGTCAGCGTGTTGATTTGATTG	153380
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	1451	AAGACTTCCGAAGTTCTAAATAGACATGAGTCAGCGTGTTGATTTGATTG	1500

AL928800.5	153381	TGATAAAGCTGATAATCTGCAGATAATCTTTTGTTTGTGCTGGTTTGAGG	153430
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	1501	TGATAAAGCTGATAATCTGCAGATAATCTTTTGTTTGTGCTGGTTTGAGG	1550

AL928800.5	153431	GTCAACTCACCTCTGCTCTTCTCTCCCCGTCTGCAGCGTTTATCTCGGTG	153480
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	1551	GTCAACTCACCTCTGCTCTTCTCTCCCCGTCTGCAGCGTTTATCTCGGTG	1600

AL928800.5	153481	TCCGGTGAATGTCCTCTAACCCTTGATGAGGTACTTGTTTTCCTGGGCCA	153530
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	1601	TCCGGTGAATGTCCTCTAACCCTTGATGAGGTACTTGTTTTCCTGGGCCA	1650

AL928800.5	153531	GTGTCCTGAGCTGTCCATGGGCTGGTTCGAAGAGGGGCAGCTGGTGGCCT	153580
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	1651	GTGTCCTGAGCTGTCCATGGGCTGGTTCGAAGAGGGGCAGCTGGTGGCCT	1700

AL928800.5	153581	TCATCATTGGATCTGGCTGGGATAAAGAGAAACTAGAACAGGTGAGAGGT	153630
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	1701	TCATCATTGGATCTGGCTGGGATAAAGAGAAACTAGAACAGGTGAGAGGT	1750

AL928800.5	153631	CATGTGAAGGTGCGTTTAAGTCTTCCTTTGGCCAAACTTTGGCTGGAGTA	153680
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	1751	CATGTGAAGGTGCGTTTAAGTCTTCCTTTGGCCAAACTTTGGCTGGAGTA	1800

AL928800.5	153681	AGATGGTGATGTGCCTTTCGGGAATCAAGTTAATTAACACCTGTGCGCCA	153730
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	1801	AGATGGTGATGTGCCTTTCGGGAATCAAGTTAATTAACACCTGTGCGCCA	1850

AL928800.5	153731	GTTAATACATTTTAAGCACTGACTGACATAGACTGCTTTATTAGCATCAG	153780
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	1851	GTTAATACATTTTAAGCACTGACTGACATAGACTGCTTTATTAGCATCAG	1900

AL928800.5	153781	TTCTGACGAGGGCTGCAGGATATTAGGAAAAACAGACATTGCAATGGTTT	153830
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	1901	TTCTGACGAGGGCTGCAGGATATTAGGAAAAACAGACATTGCAATGGTTT	1950

AL928800.5	153831	CTATTTCTGCAATTTATATTGCGATATTAATATAATTTTGATAAGAATTC	153880
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954661.10	1951	CTATTTCTGCAATTTATATTGCGATATTAATATAATTTTGATAAGAATTC	2000

Overview

Query
AL928800.5 - 153880 bps
Hit
AL954661.10 - 65786 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100193120001518811538801120001
294.441201447581275955-1734274851
386.9186346119072119417-112281126311
486.9818834617732118112293126301
589.3414422514761700112406126301
690.131492222202922250-112408126301
788.741392294683747065-112409126301
892.57129174127928128101112417125911
990.11422126037360584112419126301
1086.19115216106982107197112421126301
1179.42121378147901148278113359137321
1280.671163288716487491113363136931
1380.54105293127787128079113366136581
1496.7220523885288765140443406861
1584.352305467310973654156463570181
1684.461784181711017527-156587570171
1788.481422439161291854156639568811
1885.151383064404744352156715570171
1984.83369758126201126958157533582901
2091.461452007455874757160322605201
2186.969820285448745164711648941
Short-link