<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX324165.10	1	TAAATGATAATACTAATAAAAACTTTGATGAAATCTAGAGTGACAAGTGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	207196	TAAATGATAATACTAATAAAAACTTTGATGAAATCTAGAGTGACAAGTGA	207245

BX324165.10	51	TATTTAGGTCAGCAAATGAGAACAGAGCGTCCCACTTTGCACAGCCAAAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	207246	TATTTAGGTCAGCAAATGAGAACAGAGCGTCCCACTTTGCACAGCCAAAT	207295

BX324165.10	101	GGGACCAAGATGATTTGCATGTATGCAAATGAAGCATGTATTAATTACAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	207296	GGGACCAAGATGATTTGCATGTATGCAAATGAAGCATGTATTAATTACAT	207345

BX324165.10	151	AACTTTACTGTAAAAGTGCAACGTTTCCTTGGTTGTTCTTTCTTATAAGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	207346	AACTTTACTGTAAAAGTGCAACGTTTCCTTGGTTGTTCTTTCTTATAAGG	207395

BX324165.10	201	AGCCTTGCTTTATTTTGGAGCTGTGAAAGTTCAAGTGCTCTGATCTTTAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	207396	AGCCTTGCTTTATTTTGGAGCTGTGAAAGTTCAAGTGCTCTGATCTTTAA	207445

BX324165.10	251	CTGAAGTGACAAAAATGTTTATGTTTGGCCTCATGGAACATGTTTGATAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	207446	CTGAAGTGACAAAAATGTTTATGTTTGGCCTCATGGAACATGTTTGATAC	207495

BX324165.10	301	ACAATGAGTGCTTTTTCAGCAATCTGATAGCAATTTGCTATTATTCTATT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	207496	ACAATGAGTGCTTTTTCAGCAATCTGATAGCAATTTGCTATTATTCTATT	207545

BX324165.10	351	GCTTTGTGATAGTACAAATATGTTATTCTAACAGAACAAAACATACCGTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	207546	GCTTTGTGATAGTACAAATATGTTATTCTAACAGAACAAAACATACCGTT	207595

BX324165.10	401	TTTTGAGGGCATTAAAATGTTGCTATGAAGATCTTTTTTGTTATAAGAAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	207596	TTTTGAGGGCATTAAAATGTTGCTATGAAGATCTTTTTTGTTATAAGAAA	207645

BX324165.10	451	ACTTTTAATGCCACTGCTCTTACAAAACATTTTGGTTTCACAACTCAATC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	207646	ACTTTTAATGCCACTGCTCTTACAAAACATTTTGGTTTCACAACTCAATC	207695

BX324165.10	501	ATGAAATAAAACTATTATTTTTTGGCTAGAATTACACATTTAACACACTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	207696	ATGAAATAAAACTATTATTTTTTGGCTAGAATTACACATTTAACACACTA	207745

BX324165.10	551	CAATAACACTTGTTTTTTCCATTATTATGTTTTATTACTTAATATAAAAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	207746	CAATAACACTTGTTTTTTCCATTATTATGTTTTATTACTTAATATAAAAG	207795

BX324165.10	601	TAATCATTGGATTCAGTGATGCTTGAACACATTTAGTTTTGAAATATCGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	207796	TAATCATTGGATTCAGTGATGCTTGAACACATTTAGTTTTGAAATATCGT	207845

BX324165.10	651	CCACAGATCCACAAAAGAAAGAATTTGACTGCCATGAGGGTAAGTAAATT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	207846	CCACAGATCCACAAAAGAAAGAATTTGACTGCCATGAGGGTAAGTAAATT	207895

BX324165.10	701	ATTATATAATATGTATTTTGAAATATGAAATGAATTCACCAGTTTAAATA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	207896	ATTATATAATATGTATTTTGAAATATGAAATGAATTCACCAGTTTAAATA	207945

BX324165.10	751	TGATGTTTTGGTTTCGAAATTTTTTTTGTAAGGCCAAACTTTGTTTTTGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	207946	TGATGTTTTGGTTTCGAAATTTTTTTTGTAAGGCCAAACTTTGTTTTTGA	207995

BX324165.10	801	AAATGCACTTGATGAAGATGATGATGCAGTGGATCATTTAAATACGAAGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	207996	AAATGCACTTGATGAAGATGATGATGCAGTGGATCATTTAAATACGAAGA	208045

BX324165.10	851	GTAAGAAATTTTAACGTGTTTATATTGAAGATCATTATTTGAGAAATATG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	208046	GTAAGAAATTTTAACGTGTTTATATTGAAGATCATTATTTGAGAAATATG	208095

BX324165.10	901	CACATACCCATTTAGCACTGAAAAAAAGTTTAGAAACATTTCAGAAATTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	208096	CACATACCCATTTAGCACTGAAAAAAAGTTTAGAAACATTTCAGAAATTG	208145

BX324165.10	951	CTAGTAACTTAAGTTACTTGTCAGCGTGGCATTTTGATGTAGAAAAACTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	208146	CTAGTAACTTAAGTTACTTGTCAGCGTGGCATTTTGATGTAGAAAAACTT	208195

BX324165.10	1001	AAATTGTGTTTTCTATGGAACTAAATCAGTGCCAAAAGTATTAAAATAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	208196	AAATTGTGTTTTCTATGGAACTAAATCAGTGCCAAAAGTATTAAAATAAA	208245

BX324165.10	1051	AGCTTGTCGAATAGCACTAGCTGAAAAAAAATGAATGCATTGAATTAACA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	208246	AGCTTGTCGAATAGCACTAGCTGAAAAAAAATGAATGCATTGAATTAACA	208295

BX324165.10	1101	ACTGCTTGCATTTTAATGACTTTAATTGCCAGGGTTTGTAATTTTAGGTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	208296	ACTGCTTGCATTTTAATGACTTTAATTGCCAGGGTTTGTAATTTTAGGTG	208345

BX324165.10	1151	CTGGACTTTAACATAACCAGAAACTCCAGGAAAAGCAATAGATTGTAGAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	208346	CTGGACTTTAACATAACCAGAAACTCCAGGAAAAGCAATAGATTGTAGAT	208395

BX324165.10	1201	TGATCTCTTAAATTGCTCCATCTCCACCTGAGAGCTAATGTTGAATATTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	208396	TGATCTCTTAAATTGCTCCATCTCCACCTGAGAGCTAATGTTGAATATTT	208445

BX324165.10	1251	TAACTGCTGAATTTGAGCCACTGAAATTCTGGAAGTAAATTTTTGAACTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	208446	TAACTGCTGAATTTGAGCCACTGAAATTCTGGAAGTAAATTTTTGAACTG	208495

BX324165.10	1301	AATTAAAATGAGATGAAAATTGCTTTCAAAATTACTTTTGAATACACCTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	208496	AATTAAAATGAGATGAAAATTGCTTTCAAAATTACTTTTGAATACACCTC	208545

BX324165.10	1351	GTATTTTAAACAGAACTGAACATTTTGGAGGTGAAATCTGGAAGTTGAAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	208546	GTATTTTAAACAGAACTGAACATTTTGGAGGTGAAATCTGGAAGTTGAAT	208595

BX324165.10	1401	ATGAAGTATTGAATTTAACTTTGAAAATGTGGTTTGAATTGAAAAATTCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	208596	ATGAAGTATTGAATTTAACTTTGAAAATGTGGTTTGAATTGAAAAATTCA	208645

BX324165.10	1451	CACATTAAAATAAACAGCTATGTTAAATTTCAGGACCTAAAATTACAAAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	208646	CACATTAAAATAAACAGCTATGTTAAATTTCAGGACCTAAAATTACAAAC	208695

BX324165.10	1501	CCTGGCAATTCAAGTCATTAAAATGCAAGCAATCTTTAATTCAACATATT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	208696	CCTGGCAATTCAAGTCATTAAAATGCAAGCAATCTTTAATTCAACATATT	208745

BX324165.10	1551	TTTTTCAGTTAGTGCCATTCGACAAGCTTTTTATTTCAATGCTTTTGGCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	208746	TTTTTCAGTTAGTGCCATTCGACAAGCTTTTTATTTCAATGCTTTTGGCA	208795

BX324165.10	1601	CTGATTTTGTTCCATAGTTTTCTATCATGTAAAACATAATATACATACAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	208796	CTGATTTTGTTCCATAGTTTTCTATCATGTAAAACATAATATACATACAT	208845

BX324165.10	1651	ATATTATATGTTTAAATTAATTTTCATATGCATGTATTATTATACAGCAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	208846	ATATTATATGTTTAAATTAATTTTCATATGCATGTATTATTATACAGCAG	208895

BX324165.10	1701	ATAAAATAAGTATTGAACAGATCAGGATTTTTCCTGGTAAATATATTTCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	208896	ATAAAATAAGTATTGAACAGATCAGGATTTTTCCTGGTAAATATATTTCT	208945

BX324165.10	1751	AAAGGTGCTGCTGACATTAAATTGTTCCAGATTTTGGTAAAAACTGTTTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	208946	AAAGGTGCTGCTGACATTAAATTGTTCCAGATTTTGGTAAAAACTGTTTT	208995

BX324165.10	1801	TTTCTAAATAAATTGCATTATGAGTAATAAAAATGGGATGGCATAAGGAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	208996	TTTCTAAATAAATTGCATTATGAGTAATAAAAATGGGATGGCATAAGGAG	209045

BX324165.10	1851	AAAGTACAGAAATCCTGAAATGTACTTAAAAGATTTCCTCCTTATTTCAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	209046	AAAGTACAGAAATCCTGAAATGTACTTAAAAGATTTCCTCCTTATTTCAA	209095

BX324165.10	1901	CAGTCTTCAGATCTTGATGATTCTGTCAATCTCTATGAACTGTGATCTTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	209096	CAGTCTTCAGATCTTGATGATTCTGTCAATCTCTATGAACTGTGATCTTT	209145

BX324165.10	1951	ATTTCTTTAGTTTAGTAAGAGGAGGGTTGCTTTATGAAAACAGAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL954309.11	209146	ATTTCTTTAGTTTAGTAAGAGGAGGGTTGCTTTATGAAAACAGAGAATTC	209195

Overview

Query
BX324165.10 - 15863 bps
Hit
AL954309.11 - 209195 bps
Total alignments
22
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100187120001200012071962091951
298.6332731551715589-186513865851
397.431771552015596186513865891
410036751551715591186616866901
510036751551715591-186619866931
610041771551515591190573906491
710036751551715591-190580906541
81004780155121559111086821087611
910036751551715591-11087081087821
101004178155171559411300351301121
1197.5343811551115591-11300361301161
121003675155171559111413421414161
1310041771551515591-11413511414271
1496.885496154971559211418761419711
1510036741551815591-11418971419701
1691.924399154751557311419901420881
1796.923165155171558111510151510791
1897.2271108154671557411510811511881
1992.31631301546115590-11889401890691
2097.33674155171559011889401890131
2198.673375155171559111890701891441
2290.78641411545115591-11890891892291
Short-link