<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL929581.5	1	GGCCATTTTCATGATATTGATTCTTCCTACCCATGAGCATGGAATATTCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	93264	GGCCATTTTCATGATATTGATTCTTCCTACCCATGAGCATGGAATATTCT	93313

AL929581.5	51	TCCATTTGTTTGTGTCCTCTTTTATTTCATTGAGCAGCAGTTTGTAGTTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	93314	TCCATTTGTTTGTGTCCTCTTTTATTTCATTGAGCAGCAGTTTGTAGTTC	93363

AL929581.5	101	TCCTTGAAGAGATCCTTCACATCCCTTGTAAGTTGGATTCTTAGATATTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	93364	TCCTTGAAGAGATCCTTCACATCCCTTGTAAGTTGGATTCTTAGATATTT	93413

AL929581.5	151	TATTCTCTTTGAAGCAATTGTGAATGGGAGTTCACTCATGATTTGGCTCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	93414	TATTCTCTTTGAAGCAATTGTGAATGGGAGTTCACTCATGATTTGGCTCT	93463

AL929581.5	201	CTGTCTGTTATTGGTGTATAAGAATGCTTGTGATTTTTGCACATTGATTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	93464	CTGTCTGTTATTGGTGTATAAGAATGCTTGTGATTTTTGCACATTGATTT	93513

AL929581.5	251	TGTATCCTGAGACTTTGCTGAAGTTGCTTATCAGCTTAAGGAGATTTTGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	93514	TGTATCCTGAGACTTTGCTGAAGTTGCTTATCAGCTTAAGGAGATTTTGG	93563

AL929581.5	301	GCTGAGACGATGGGGTTTTCTAGATATACAATCATGTCATCTGCAAACAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	93564	GCTGAGACGATGGGGTTTTCTAGATATACAATCATGTCATCTGCAAACAG	93613

AL929581.5	351	GGACAATTTGACTTCCTCTTTTCCTAATTGAATACCCTTTATTTCCTTCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	93614	GGACAATTTGACTTCCTCTTTTCCTAATTGAATACCCTTTATTTCCTTCT	93663

AL929581.5	401	CCTGCCTGATTGCCCTGGCTAGAACTTCCAACACTATGTTGAATAGGAGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	93664	CCTGCCTGATTGCCCTGGCTAGAACTTCCAACACTATGTTGAATAGGAGT	93713

AL929581.5	451	GGTGAGAGAGGGCATCTTTGTCTTGTGCCCGTTTTCAAAGGGAAAGCTTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	93714	GGTGAGAGAGGGCATCTTTGTCTTGTGCCCGTTTTCAAAGGGAAAGCTTT	93763

AL929581.5	501	CAGTTTTTGCCCATTCAGTATGATATTGGCTGTGGGTTTGTCATAAATAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	93764	CAGTTTTTGCCCATTCAGTATGATATTGGCTGTGGGTTTGTCATAAATAG	93813

AL929581.5	551	CTCTTATTATTTTGAGATACATCCCATCAATACCTAATTTATTGAGAGTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	93814	CTCTTATTATTTTGAGATACATCCCATCAATACCTAATTTATTGAGAGTT	93863

AL929581.5	601	TTTAGCATGAAGGGTTGTTGAATTTTGTCAAAGGCCTTTTCTGCATCTAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	93864	TTTAGCATGAAGGGTTGTTGAATTTTGTCAAAGGCCTTTTCTGCATCTAT	93913

AL929581.5	651	TGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCGTTGGTTCTGTTTATGTGCTGGATTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	93914	TGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCGTTGGTTCTGTTTATGTGCTGGATTA	93963

AL929581.5	701	CCTTTATTGATTAGCATTTGTTGAACCAGCCTTGCATCCCAGGGATGAAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	93964	CCTTTATTGATTAGCATTTGTTGAACCAGCCTTGCATCCCAGGGATGAAG	94013

AL929581.5	751	CCCACTTGATCATGGTGGATAAGCTTTTTGATGTGCTGGTGGATTCGGTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	94014	CCCACTTGATCATGGTGGATAAGCTTTTTGATGTGCTGGTGGATTCGGTT	94063

AL929581.5	801	TGCCAGTATTTTATTGAGGATCTTTGCATCGATGTTCATCAGGGATATTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	94064	TGCCAGTATTTTATTGAGGATCTTTGCATCGATGTTCATCAGGGATATTG	94113

AL929581.5	851	GTCTAAAATTCTCTTTTTTTTTCGTTGTGTCTCTGCCCGGCTTTGGTATC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	94114	GTCTAAAATTCTCTTTTTTTTTCGTTGTGTCTCTGCCCGGCTTTGGTATC	94163

AL929581.5	901	AGGATGATGCTGGCCTCATAAAATGAGTTAGGGAGGATTCCCTCTTTTTC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	94164	AGGATGATGCTGGCCTCATAAAATGAGTTAGGGAGGATTCCCTCTTTTTC	94213

AL929581.5	951	TATTGATTGGAATAGTTTCAGAAGGAATGGTACCAGTTCCTCCTTGTACC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	94214	TATTGATTGGAATAGTTTCAGAAGGAATGGTACCAGTTCCTCCTTGTACC	94263

AL929581.5	1001	TCTGATAGAATTCGGCTGTGAATCTGTCTGGTCCTGGACTTTTTGGTTGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	94264	TCTGATAGAATTCGGCTGTGAATCTGTCTGGTCCTGGACTTTTTGGTTGG	94313

AL929581.5	1051	TAAGCTATTAATTATTGCCTCAATTTCAGAGCCTGTTATTGGTCTATTCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	94314	TAAGCTATTAATTATTGCCTCAATTTCAGAGCCTGTTATTGGTCTATTCA	94363

AL929581.5	1101	GAGATTCAACTTCTTCCTGGTTTAGTCTTGGGAGAGTGTATGTGTCGAGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	94364	GAGATTCAACTTCTTCCTGGTTTAGTCTTGGGAGAGTGTATGTGTCGAGG	94413

AL929581.5	1151	AATTTATCCATTTCTTCTAGATTTTCAAGTTTATTTGCGTAGAGGTGTTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	94414	AATTTATCCATTTCTTCTAGATTTTCAAGTTTATTTGCGTAGAGGTGTTT	94463

AL929581.5	1201	ATAGTATTCTCTGATGGTAGTTTGTATTTCTGTGGGATCGGTGGTGATAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	94464	ATAGTATTCTCTGATGGTAGTTTGTATTTCTGTGGGATCGGTGGTGATAC	94513

AL929581.5	1251	CCCTTTATCATTTTTTATTGCATCTATTTGATTCTTCTCTCTTTTCTTCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	94514	CCCTTTATCATTTTTTATTGCATCTATTTGATTCTTCTCTCTTTTCTTCT	94563

AL929581.5	1301	TTATTAGTCTTATTAGCGGTCTATCAATTTTGTTGATCTTTTCAAAAAAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	94564	TTATTAGTCTTATTAGCGGTCTATCAATTTTGTTGATCTTTTCAAAAAAC	94613

AL929581.5	1351	AAGCTCCTGGATTCATTGACTTTTTTGAAGGGTTTTTTGTGTCTCTATTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	94614	AAGCTCCTGGATTCATTGACTTTTTTGAAGGGTTTTTTGTGTCTCTATTT	94663

AL929581.5	1401	CCTTCAGTTCTGCTCCGATCTTAGTTATTTCTTGCCTTCTGCTAGCTTTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	94664	CCTTCAGTTCTGCTCCGATCTTAGTTATTTCTTGCCTTCTGCTAGCTTTT	94713

AL929581.5	1451	GAATGTGATCGCTCTTGCTTCTCTAGTTATTTTAATTTTGATGTTAGGTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	94714	GAATGTGATCGCTCTTGCTTCTCTAGTTATTTTAATTTTGATGTTAGGTT	94763

AL929581.5	1501	GTCAGTTTTAGATCTTTCCTGCTTTCTCTTGTGGGCATTTAGTGCTATAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	94764	GTCAGTTTTAGATCTTTCCTGCTTTCTCTTGTGGGCATTTAGTGCTATAA	94813

AL929581.5	1551	ATTTCCCTCTACTTTAAAGCTAGAATTAGTTTCTAAAACTGAACATGAAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	94814	ATTTCCCTCTACTTTAAAGCTAGAATTAGTTTCTAAAACTGAACATGAAT	94863

AL929581.5	1601	TGACTCTCCTTGTAACCATCCAGTAGTGTCTCACATCTATTTAAATAAAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	94864	TGACTCTCCTTGTAACCATCCAGTAGTGTCTCACATCTATTTAAATAAAA	94913

AL929581.5	1651	TTCAGGCTGGGTACGGAGACTAATGACTGTAATCCCAGCAGTTTGGGAAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	94914	TTCAGGCTGGGTACGGAGACTAATGACTGTAATCCCAGCAGTTTGGGAAG	94963

AL929581.5	1701	CCAAGGCAGGCAGATTACCGGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCGTGGCCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	94964	CCAAGGCAGGCAGATTACCGGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCGTGGCCA	95013

AL929581.5	1751	ACATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACTAAAAAATTAGCCTGGCA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	95014	ACATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACTAAAAAATTAGCCTGGCA	95063

AL929581.5	1801	TGGTGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	95064	TGGTGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAAA	95113

AL929581.5	1851	ATCACGTGAGCCCAGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGGCCACGCCAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	95114	ATCACGTGAGCCCAGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGGCCACGCCAT	95163

AL929581.5	1901	TGCATCCAGCCTGGGCAACAAGAACGAAACTCCATCTCAAAAAATAAATA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	95164	TGCATCCAGCCTGGGCAACAAGAACGAAACTCCATCTCAAAAAATAAATA	95213

AL929581.5	1951	ATGAAATAAAAAAATGAAAATAAATAAAATAAAATTCAAATTTCTTACCA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935032.13	95214	ATGAAATAAAAAAATGAAAATAAATAAAATAAAATTCAAATTTCTTACCA	95263

Overview

Query
AL929581.5 - 118771 bps
Hit
AL935032.13 - 95263 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link