<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL773543.3	1	GGCCAGAAATTCCAATACCATGTTGAATAGGAGTGGTGAGAGTGGGCATT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	37180	GGCCAGAAATTCCAATACCATGTTGAATAGGAGTGGTGAGAGTGGGCATT	37229

AL773543.3	51	GTTGTTTTGTGCATGTGTTTAAGGGGAATGCTTTTGGCTTTTGCCCATTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	37230	GTTGTTTTGTGCATGTGTTTAAGGGGAATGCTTTTGGCTTTTGCCCATTC	37279

AL773543.3	101	AGTATGATATTGTCTGTGGGCTTGTCATAAGTGACTCTTATTATTATGAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	37280	AGTATGATATTGTCTGTGGGCTTGTCATAAGTGACTCTTATTATTATGAG	37329

AL773543.3	151	GTATGTTCCTTCAATACCTAGTTTATTGAGAGTTTTTAACATGAAGGGAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	37330	GTATGTTCCTTCAATACCTAGTTTATTGAGAGTTTTTAACATGAAGGGAT	37379

AL773543.3	201	GTTGAATTTTATTGAAGGCCTTTCCTGTGTCTATTGAGACAATCATGTGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	37380	GTTGAATTTTATTGAAGGCCTTTCCTGTGTCTATTGAGACAATCATGTGG	37429

AL773543.3	251	TTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTATTTAATGAATTATGTTTATTGATTTGCA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	37430	TTTTTGTCTTTAGTTCTGTTTATTTAATGAATTATGTTTATTGATTTGCA	37479

AL773543.3	301	TATGTTGAAACAGCCTGGCATCCTGGTGATGAAGCCAACTTGATCGTGGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	37480	TATGTTGAAACAGCCTGGCATCCTGGTGATGAAGCCAACTTGATCGTGGT	37529

AL773543.3	351	GGATAAACTTTTTGATATGCTGGTGGATTCGGCTTGCCATTATTTTATTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	37530	GGATAAACTTTTTGATATGCTGGTGGATTCGGCTTGCCATTATTTTATTG	37579

AL773543.3	401	AGGATTTTTTTTTATTAGTGTCCATCAGAGATATTGGCCTGAAGTTTTCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	37580	AGGATTTTTTTTTATTAGTGTCCATCAGAGATATTGGCCTGAAGTTTTCT	37629

AL773543.3	451	TTTTTTGTTGTATCTGTGTCAGGTTTTGTTATCAGGATGATGCTGGCCTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	37630	TTTTTTGTTGTATCTGTGTCAGGTTTTGTTATCAGGATGATGCTGGCCTC	37679

AL773543.3	501	ATAAAATAAGTTAGGGAGGAGTTCCTCCTTTTCAATTATTTGGAATAGCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	37680	ATAAAATAAGTTAGGGAGGAGTTCCTCCTTTTCAATTATTTGGAATAGCT	37729

AL773543.3	551	TCAGAAGAAATGGTACCAGCTCTTCTTTGTACCTCTGGTGGAATTCAGCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	37730	TCAGAAGAAATGGTACCAGCTCTTCTTTGTACCTCTGGTGGAATTCAGCT	37779

AL773543.3	601	GTAAATCTGTCTGGTCCTGGGCTTTTATTTTTGTTGGTAGGCTATTTATT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	37780	GTAAATCTGTCTGGTCCTGGGCTTTTATTTTTGTTGGTAGGCTATTTATT	37829

AL773543.3	651	ATGCCTCAATTCCAGAACTCGTTATTCGTCTATTGAGGGATTCAACTTCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	37830	ATGCCTCAATTCCAGAACTCGTTATTCGTCTATTGAGGGATTCAACTTCC	37879

AL773543.3	701	TGGTTCAATCTTGGGAAGGTGTATGTGTCTAGGAATTTCTTTTAGATTTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	37880	TGGTTCAATCTTGGGAAGGTGTATGTGTCTAGGAATTTCTTTTAGATTTT	37929

AL773543.3	751	TTTAGTTTATGTGCATAGAGGTGTTTATAGTATTCTCTGATGGTTGTTTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	37930	TTTAGTTTATGTGCATAGAGGTGTTTATAGTATTCTCTGATGGTTGTTTG	37979

AL773543.3	801	TACTTCCATGGGGTCAGTGGTGATATCCCCTTTATCATTTTTTATTGTGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	37980	TACTTCCATGGGGTCAGTGGTGATATCCCCTTTATCATTTTTTATTGTGT	38029

AL773543.3	851	CTATTTGATTTTTCTCTCTATTATTCTTTATTAGTCTAGCTGGCAGTCTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	38030	CTATTTGATTTTTCTCTCTATTATTCTTTATTAGTCTAGCTGGCAGTCTG	38079

AL773543.3	901	TCTATATTATTAATATTTTCAAAAGACCAGATTCTGGATTCGTTGATTTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	38080	TCTATATTATTAATATTTTCAAAAGACCAGATTCTGGATTCGTTGATTTT	38129

AL773543.3	951	TTGAAGAGTTTTTTGGTGTCTCTGTCTTCTTCAGTTCCAGTCTGATTTTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	38130	TTGAAGAGTTTTTTGGTGTCTCTGTCTTCTTCAGTTCCAGTCTGATTTTG	38179

AL773543.3	1001	GTTATTTCTTGTCTTCTGCTAGCTTTGGGGTTTGTTTGTTCTTGGTTCTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	38180	GTTATTTCTTGTCTTCTGCTAGCTTTGGGGTTTGTTTGTTCTTGGTTCTG	38229

AL773543.3	1051	TAGTTCTTCCAGTTGTGATGTTACGATGTCGACTTGAAATCTTTCTAGCT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	38230	TAGTTCTTCCAGTTGTGATGTTACGATGTCGACTTGAAATCTTTCTAGCT	38279

AL773543.3	1101	TTTTGATGTGTGCATTTAGTACTATAAATTTCCCACTTAACACTGCTTTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	38280	TTTTGATGTGTGCATTTAGTACTATAAATTTCCCACTTAACACTGCTTTA	38329

AL773543.3	1151	GCTGCATCCCAGAGATTCTGATACATTGTCTCTTTCTTCTCATTGGTTTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	38330	GCTGCATCCCAGAGATTCTGATACATTGTCTCTTTCTTCTCATTGGTTTC	38379

AL773543.3	1201	AAAGAACTTCCTGATTTCTGCATTAATTTCATTATTTACCCAGGAGTCAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	38380	AAAGAACTTCCTGATTTCTGCATTAATTTCATTATTTACCCAGGAGTCAT	38429

AL773543.3	1251	ACAGGAGTAGGTTGTTCAATTTCCATGTAGTTGTGTGGTTTTGAATGAAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	38430	ACAGGAGTAGGTTGTTCAATTTCCATGTAGTTGTGTGGTTTTGAATGAAT	38479

AL773543.3	1301	TTCTTAATCCTGAGTTCTAATTTGATTTCACTATGGTTTGAGAGACTGTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	38480	TTCTTAATCCTGAGTTCTAATTTGATTTCACTATGGTTTGAGAGACTGTT	38529

AL773543.3	1351	TGTTATGATTTCGGTTCTTTTGCATTTGCTGAGGAGTGTTTTACTTCCAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	38530	TGTTATGATTTCGGTTCTTTTGCATTTGCTGAGGAGTGTTTTACTTCCAA	38579

AL773543.3	1401	ATATGTGAACAATTTTAGAATAAGTGCCATGTGGCACCAAGAAGAATGTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	38580	ATATGTGAACAATTTTAGAATAAGTGCCATGTGGCACCAAGAAGAATGTA	38629

AL773543.3	1451	TATTCCGTTTTTTTGGGCGGAGAGTTCTGTAGATATCTCTCAGGTCCACT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	38630	TATTCCGTTTTTTTGGGCGGAGAGTTCTGTAGATATCTCTCAGGTCCACT	38679

AL773543.3	1501	TGATCCAGTGCTGAGTTCAAGTCCTGAATATCTTTGTTTTTTTTTAATTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	38680	TGATCCAGTGCTGAGTTCAAGTCCTGAATATCTTTGTTTTTTTTTAATTT	38729

AL773543.3	1551	TATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGTGCAGGT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	38730	TATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGTGCAGGT	38779

AL773543.3	1601	TTGTTATGTATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	38780	TTGTTATGTATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACT	38829

AL773543.3	1651	CGTCATTTAGCATTAGGTATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCTCTCCCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	38830	CGTCATTTAGCATTAGGTATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCTCTCCCC	38879

AL773543.3	1701	CCCACCCCACAACAGTCCCCGGTGTGTGATGTTCCCCTTCCTGTGTCCAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	38880	CCCACCCCACAACAGTCCCCGGTGTGTGATGTTCCCCTTCCTGTGTCCAT	38929

AL773543.3	1751	GTGTTCTCATTGTTCAATTCCCACCTATGAATATCTTTGTTAATTTCCTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	38930	GTGTTCTCATTGTTCAATTCCCACCTATGAATATCTTTGTTAATTTCCTG	38979

AL773543.3	1801	TCTCAATGATCTGTCTAATATTGATAGTGGGGTGTTAAAGTCTCCCACTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	38980	TCTCAATGATCTGTCTAATATTGATAGTGGGGTGTTAAAGTCTCCCACTA	39029

AL773543.3	1851	TTATTGTGTGAGAATCTGAGTGTCTCTATAGGTCTCTAAGAATTTGTTTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	39030	TTATTGTGTGAGAATCTGAGTGTCTCTATAGGTCTCTAAGAATTTGTTTC	39079

AL773543.3	1901	ATGAATCTGGGTGCTCTTGTGTTGGCGGATGTATATCTAGGTTAGTTAGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	39080	ATGAATCTGGGTGCTCTTGTGTTGGCGGATGTATATCTAGGTTAGTTAGC	39129

AL773543.3	1951	TCTTCTTGTTGAATTGAACCCTTTACCATTATATAATGCTCTTCTTTGTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL935026.4	39130	TCTTCTTGTTGAATTGAACCCTTTACCATTATATAATGCTCTTCTTTGTC	39179

Overview

Query
AL773543.3 - 117303 bps
Hit
AL935026.4 - 39179 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link