<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL805934.3	1	GGCCAACATGGTGAAACCTCGTCTCCACTAAAATTACAAAAATTAGTTGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	59359	GGCCAACATGGTGAAACCTCGTCTCCACTAAAATTACAAAAATTAGTTGA	59408

AL805934.3	51	ACATGGTGGTGCGCACCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	59409	ACATGGTGGTGCGCACCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGG	59458

AL805934.3	101	AGAGTCGCTTGAACCCAGGATGTGGAGGTTGAAGTGAGCCAAGATCGTGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	59459	AGAGTCGCTTGAACCCAGGATGTGGAGGTTGAAGTGAGCCAAGATCGTGC	59508

AL805934.3	151	CACTGCACTCCAGTCTAGCGACAGATGGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	59509	CACTGCACTCCAGTCTAGCGACAGATGGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAA	59558

AL805934.3	201	AAATAAGTATTTTTCTTTCTAGCCGTATATCCACCTTACATGGTCCCTCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	59559	AAATAAGTATTTTTCTTTCTAGCCGTATATCCACCTTACATGGTCCCTCA	59608

AL805934.3	251	ACTCCCCAAGCCCACTCTGCCTGCCCCATCTCCTCCTTCCACATCCTCTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	59609	ACTCCCCAAGCCCACTCTGCCTGCCCCATCTCCTCCTTCCACATCCTCTC	59658

AL805934.3	301	CTCAACCTAGCACTTGGTTGGCAATGCCTTCCTCGATCCTCTGCCAAAGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	59659	CTCAACCTAGCACTTGGTTGGCAATGCCTTCCTCGATCCTCTGCCAAAGA	59708

AL805934.3	351	CCCTCTAGCCAGTGCTTACCCTGTCTGTTCTCTCTCTTTACCCAAAGAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	59709	CCCTCTAGCCAGTGCTTACCCTGTCTGTTCTCTCTCTTTACCCAAAGAAA	59758

AL805934.3	401	TACATAAAGTTTGACCAGAATGGAAACAGAGATATCAGTGAAAAAAGGTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	59759	TACATAAAGTTTGACCAGAATGGAAACAGAGATATCAGTGAAAAAAGGTG	59808

AL805934.3	451	ATTTGGGGAAGTGTGCAGGCCTAGGAAGACAGAGGCTTGTTCCTTTGCTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	59809	ATTTGGGGAAGTGTGCAGGCCTAGGAAGACAGAGGCTTGTTCCTTTGCTT	59858

AL805934.3	501	GCTTAAAATCTTTGATCAAACGGCCAGGCGTGGTGGCTCACACCTGTAAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	59859	GCTTAAAATCTTTGATCAAACGGCCAGGCGTGGTGGCTCACACCTGTAAT	59908

AL805934.3	551	CCCAGCACTTTGGGAGGGCGAGGTGGGCGAATCATGAGATCAGGAGTTCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	59909	CCCAGCACTTTGGGAGGGCGAGGTGGGCGAATCATGAGATCAGGAGTTCA	59958

AL805934.3	601	AGACCAGCCTGGCCAACATAGTAAAACCCCGTCTCACTAAAAATACAAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	59959	AGACCAGCCTGGCCAACATAGTAAAACCCCGTCTCACTAAAAATACAAAA	60008

AL805934.3	651	AATTAGCCAGCTGGGCGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	60009	AATTAGCCAGCTGGGCGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCTG	60058

AL805934.3	701	GAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	60059	GAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTG	60108

AL805934.3	751	AGTGGAGATTGCACCACTGCACTCTAGCCTGAGTGACAGAGTGAGACTCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	60109	AGTGGAGATTGCACCACTGCACTCTAGCCTGAGTGACAGAGTGAGACTCC	60158

AL805934.3	801	ATCTCAAAAAAAAGAAAAGAAATCTTTGCTCAAATATCACTTTTTCAGAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	60159	ATCTCAAAAAAAAGAAAAGAAATCTTTGCTCAAATATCACTTTTTCAGAG	60208

AL805934.3	851	AACGCTTCTCTAACCACTCTATTTATTTTATTATTTTATTGTATTTTTTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	60209	AACGCTTCTCTAACCACTCTATTTATTTTATTATTTTATTGTATTTTTTG	60258

AL805934.3	901	AGACAGGGTCTCACTCTGTTGCCCAGACTGGAGTGTAATGGCACGGTCAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	60259	AGACAGGGTCTCACTCTGTTGCCCAGACTGGAGTGTAATGGCACGGTCAT	60308

AL805934.3	951	GGCTCACTGCAGCCTTGATCTCCTGGGCTCAAGCGATCCTCTCACTTCAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	60309	GGCTCACTGCAGCCTTGATCTCCTGGGCTCAAGCGATCCTCTCACTTCAG	60358

AL805934.3	1001	CCTCCCAAGTGGCTAGGACCACAGGCGTAAGCCACCGTGTCTGGCCAGAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	60359	CCTCCCAAGTGGCTAGGACCACAGGCGTAAGCCACCGTGTCTGGCCAGAC	60408

AL805934.3	1051	CACCATATTTAAAACTGGGGACAAGTCAGGCTCACACCTGTAATCCCAGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	60409	CACCATATTTAAAACTGGGGACAAGTCAGGCTCACACCTGTAATCCCAGC	60458

AL805934.3	1101	ACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACAAGGTTAGGAGTTCAAGACCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	60459	ACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACAAGGTTAGGAGTTCAAGACCA	60508

AL805934.3	1151	GCCTGGCCAACTTGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	60509	GCCTGGCCAACTTGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAG	60558

AL805934.3	1201	CCGGGTATAGTGGTGATCGCCTGTAATCCCAGCTATTCGTTAGGCTGAGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	60559	CCGGGTATAGTGGTGATCGCCTGTAATCCCAGCTATTCGTTAGGCTGAGG	60608

AL805934.3	1251	CAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	60609	CAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATT	60658

AL805934.3	1301	GTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGATTCTGTCTCAACAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	60659	GTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGATTCTGTCTCAACAA	60708

AL805934.3	1351	AAAAAGCTGGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	60709	AAAAAGCTGGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGT	60758

AL805934.3	1401	CCGAGGTGGGTAGATCACCTAAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGTCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	60759	CCGAGGTGGGTAGATCACCTAAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGTCA	60808

AL805934.3	1451	ACATGGTGAAACCCCGCCTCTACAAAAATACAAAAATTAGCTAGGTATGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	60809	ACATGGTGAAACCCCGCCTCTACAAAAATACAAAAATTAGCTAGGTATGA	60858

AL805934.3	1501	TGGCAGGTGGCTGTAATCCCAGCTACTCGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	60859	TGGCAGGTGGCTGTAATCCCAGCTACTCGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATC	60908

AL805934.3	1551	GCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTACAGTGAGCTGAGATCAAGCCATTGC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	60909	GCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTACAGTGAGCTGAGATCAAGCCATTGC	60958

AL805934.3	1601	ACTCTAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCCGTTTAAAAAAAAAACAAAAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	60959	ACTCTAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCCGTTTAAAAAAAAAACAAAAA	61008

AL805934.3	1651	ACAAAAAACAAAAAACTGGGGACCATTGGCAATAATACTCCTATGTCCCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	61009	ACAAAAAACAAAAAACTGGGGACCATTGGCAATAATACTCCTATGTCCCC	61058

AL805934.3	1701	TCTTCCCTACTTTGTTTTCCTCCATAGGCACCTGGCGCCTTTTTTTTTTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	61059	TCTTCCCTACTTTGTTTTCCTCCATAGGCACCTGGCGCCTTTTTTTTTTT	61108

AL805934.3	1751	TTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	61109	TTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGT	61158

AL805934.3	1801	GCAATGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTTAAGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	61159	GCAATGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTTAAGC	61208

AL805934.3	1851	GATTCGCCTGCGTCAGCCTCCTGAGCAGCTGGGATTACAGGCACGCACCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	61209	GATTCGCCTGCGTCAGCCTCCTGAGCAGCTGGGATTACAGGCACGCACCA	61258

AL805934.3	1901	CCAGGCCCTGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	61259	CCAGGCCCTGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATG	61308

AL805934.3	1951	TTGGTCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGACCTTGTGATCCGCCTGCCCCAGC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929587.5	61309	TTGGTCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGACCTTGTGATCCGCCTGCCCCAGC	61358

Overview

Query
AL805934.3 - 99109 bps
Hit
AL929587.5 - 61358 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link