<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX957354.8	1	ATTTGTCTCCAAAAAGAAAGCAAGGAAGGACATGACCAAAATATATAGAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	144060	ATTTGTCTCCAAAAAGAAAGCAAGGAAGGACATGACCAAAATATATAGAA	144109

BX957354.8	51	TAAATTAGCTGAACCATAATGACACCTGTCGCACTCAGGGTCAATAGACG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	144110	TAAATTAGCTGAACCATAATGACACCTGTCGCACTCAGGGTCAATAGACG	144159

BX957354.8	101	GGTTGATGCGAGCTAGCCTGCTCTTGGACCAATGAGCTCTATGCACTACC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	144160	GGTTGATGCGAGCTAGCCTGCTCTTGGACCAATGAGCTCTATGCACTACC	144209

BX957354.8	151	TTGCACTGTATTAGCCTGTGACGTCCACAGATTGAGGAAGAGTTAGCCCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	144210	TTGCACTGTATTAGCCTGTGACGTCCACAGATTGAGGAAGAGTTAGCCCT	144259

BX957354.8	201	GTTCAAGACAGCTGTCCATGTCTCCTCGGTAATGTCAATTCCAATGTCTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	144260	GTTCAAGACAGCTGTCCATGTCTCCTCGGTAATGTCAATTCCAATGTCTT	144309

BX957354.8	251	GAGACCAGGTGGTCCATAGGTTATCAAAAGAAAATTGCAGATTAACAATT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	144310	GAGACCAGGTGGTCCATAGGTTATCAAAAGAAAATTGCAGATTAACAATT	144359

BX957354.8	301	ATATTAAATAATTTAGAAATTGAACCTTTAGCACAGGGATCTATGCCCAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	144360	ATATTAAATAATTTAGAAATTGAACCTTTAGCACAGGGATCTATGCCCAG	144409

BX957354.8	351	TATGATGTCTAGATCTGAAGTAGGAGGTGCATTTGGAAAGTTAACAAATT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	144410	TATGATGTCTAGATCTGAAGTAGGAGGTGCATTTGGAAAGTTAACAAATT	144459

BX957354.8	401	TTTTGCTTGCAAGATCTCGAATTTGTAAATATCTGAAAAAATTTGAGTTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	144460	TTTTGCTTGCAAGATCTCGAATTTGTAAATATCTGAAAAAATTTGAGTTT	144509

BX957354.8	451	TGGACATTAATTTTTGAGGCCAACCGACCAAAAGAGGCAAAAACACCATC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	144510	TGGACATTAATTTTTGAGGCCAACCGACCAAAAGAGGCAAAAACACCATC	144559

BX957354.8	501	AATGTACAGATCACCAAAAGAAGCCAATCCCAGATCTCTCCATGAGGCAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	144560	AATGTACAGATCACCAAAAGAAGCCAATCCCAGATCTCTCCATGAGGCAT	144609

BX957354.8	551	AAGCACTGTCCAAGATAGAAGGGTAAAACAGAGGATTGGAATGTATTGGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	144610	AAGCACTGTCCAAGATAGAAGGGTAAAACAGAGGATTGGAATGTATTGGT	144659

BX957354.8	601	GATAATAAAGGTATGTTATGAAAACCAAAATGCCGTAAAAATTGGGTCCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	144660	GATAATAAAGGTATGTTATGAAAACCAAAATGCCGTAAAAATTGGGTCCA	144709

BX957354.8	651	AATTTTGAGACTGTTTTTTACAATTATATTATTTGAATATTAAATTGGGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	144710	AATTTTGAGACTGTTTTTTACAATTATATTATTTGAATATTAAATTGGGG	144759

BX957354.8	701	TCATTGTATATGGGAGGCATAAAAGAGCAGCCAAAGAGGCAGACTCAATG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	144760	TCATTGTATATGGGAGGCATAAAAGAGCAGCCAAAGAGGCAGACTCAATG	144809

BX957354.8	751	TGCAGCCAAGAGGGGGGATTCACTAAGTTGCTTAAATGTAGCCATTATAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	144810	TGCAGCCAAGAGGGGGGATTCACTAAGTTGCTTAAATGTAGCCATTATAG	144859

BX957354.8	801	AATAGAGTTTATAATTGCTTCCCAATAATATATTTGGAAATTTGGAAGAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	144860	AATAGAGTTTATAATTGCTTCCCAATAATATATTTGGAAATTTGGAAGAG	144909

BX957354.8	851	CTAGACCACCCAGTTGTTTTGTTCTCTGATGAATACTTTTACGGATCTTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	144910	CTAGACCACCCAGTTGTTTTGTTCTCTGATGAATACTTTTACGGATCTTT	144959

BX957354.8	901	GGGGTTTTTCTGTTCAAGAGAAAACTACAAATAGTGCAATCAAGTGTAAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	144960	GGGGTTTTTCTGTTCAAGAGAAAACTACAAATAGTGCAATCAAGTGTAAC	145009

BX957354.8	951	AAAAAAAGACGTTGGAATAAAAATAGAAATACATTGAAATAAGTATAGAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	145010	AAAAAAAGACGTTGGAATAAAAATAGAAATACATTGAAATAAGTATAGAA	145059

BX957354.8	1001	ATCTAGAAAGTACATTCATTCTAATACATTTAACCCTACTGATCAAAGAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	145060	ATCTAGAAAGTACATTCATTCTAATACATTTAACCCTACTGATCAAAGAT	145109

BX957354.8	1051	AAAGGGAGGAGAGACCAGTTGTTAAAATCCTGTGTGAGGGGATTCACTAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	145110	AAAGGGAGGAGAGACCAGTTGTTAAAATCCTGTGTGAGGGGATTCACTAA	145159

BX957354.8	1101	TGGGACAAAGTTGTGGTCAAATAAGTCTGAAAAGCATTTTGTGACATTTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	145160	TGGGACAAAGTTGTGGTCAAATAAGTCTGAAAAGCATTTTGTGACATTTA	145209

BX957354.8	1151	TGCCCAAATATTTGAAACTTTGTAAGGATTTGAAAGGTAAAGAACCTAAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	145210	TGCCCAAATATTTGAAACTTTGTAAGGATTTGAAAGGTAAAGAACCTAAT	145259

BX957354.8	1201	GGGTAATCTAAGGCTGCTGTATTAATGGGCATCAATTCACTTTTACTCAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	145260	GGGTAATCTAAGGCTGCTGTATTAATGGGCATCAATTCACTTTTACTCAA	145309

BX957354.8	1251	ATTTAACTTATATCCTGAAATCAGGTCGAAGTCTGCTAACAATTTCAACA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	145310	ATTTAACTTATATCCTGAAATCAGGTCGAAGTCTGCTAACAATTTCAACA	145359

BX957354.8	1301	CCAAAGGAATAGAGGTACAAGGGTCAGACACGTATAACAAGAGATCATCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	145360	CCAAAGGAATAGAGGTACAAGGGTCAGACACGTATAACAAGAGATCATCA	145409

BX957354.8	1351	GCGTATAAAGACAGTTTGTGCTCCAACTCCCCCCTGCCAGCCATTGCACT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	145410	GCGTATAAAGACAGTTTGTGCTCCAACTCCCCCCTGCCAGCCATTGCACT	145459

BX957354.8	1401	GGCTCTTAAAGCAATTGCCAACAGCTCAATGGCAAATAGTAGAGGGGAGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	145460	GGCTCTTAAAGCAATTGCCAACAGCTCAATGGCAAATAGTAGAGGGGAGA	145509

BX957354.8	1451	GTGGGCAGCGTTGTCTAGGATCGCGACCAAGTGAGAAATATTTAGAATAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	145510	GTGGGCAGCGTTGTCTAGGATCGCGACCAAGTGAGAAATATTTAGAATAA	145559

BX957354.8	1501	TTGTTATTTGTTTGTGCACAGGCCATCGGAGAGGTGTATAAAAGTCTAAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	145560	TTGTTATTTGTTTGTGCACAGGCCATCGGAGAGGTGTATAAAAGTCTAAT	145609

BX957354.8	1551	CCAAGCTATAATTTGATCAGGAAACCCAAGTTTTTTCAGTGTGTAAAGCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	145610	CCAAGCTATAATTTGATCAGGAAACCCAAGTTTTTTCAGTGTGTAAAGCA	145659

BX957354.8	1601	GATACATCCACTCGACTCTATCAAATGCCTTTTCAGCATCTATAGAAATA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	145660	GATACATCCACTCGACTCTATCAAATGCCTTTTCAGCATCTATAGAAATA	145709

BX957354.8	1651	ACTAATTCTGGAGATGCATTTGAAGAAGAAGAGTAGAGAATATTCAAAAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	145710	ACTAATTCTGGAGATGCATTTGAAGAAGAAGAGTAGAGAATATTCAAAAG	145759

BX957354.8	1701	GTGACTAACATTATGAAAAGAGTGTCTATTTTTAACAATACCTGTTTGGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	145760	GTGACTAACATTATGAAAAGAGTGTCTATTTTTAACAATACCTGTTTGGT	145809

BX957354.8	1751	CTGGTGAAATTATAGCTGGGAGAAGTCTCTAAACATCTTGCTAAAACTTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	145810	CTGGTGAAATTATAGCTGGGAGAAGTCTCTAAACATCTTGCTAAAACTTT	145859

BX957354.8	1801	AGCTAACATCTTTGACATCAGAACAAGGTAAAGAGATGGGATGATAGCTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	145860	AGCTAACATCTTTGACATCAGAACAAGGTAAAGAGATGGGATGATAGCTA	145909

BX957354.8	1851	CTGCACTGGGAGGAATCTTTATCTTTTTTAAGAATAAGGGAAATAATAGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	145910	CTGCACTGGGAGGAATCTTTATCTTTTTTAAGAATAAGGGAAATAATAGC	145959

BX957354.8	1901	CTGCGGAGAGGGAAGGAGGAAGGATACCTGAACTGTGAGACTCATTAAAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	145960	CTGCGGAGAGGGAAGGAGGAAGGATACCTGAACTGTGAGACTCATTAAAC	146009

BX957354.8	1951	ATGTTAAGTAAAAGAGGAGACAATTTGCCAGAAAATGTCTTAAAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL929549.16	146010	ATGTTAAGTAAAAGAGGAGACAATTTGCCAGAAAATGTCTTAAAGAATTC	146059

Overview

Query
BX957354.8 - 6835 bps
Hit
AL929549.16 - 146059 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100193920001200011440601460591
Short-link