<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL731683.12	1	GAATTCCATATGCACTATGGAAGCAAAAAGAAAAAGCAACTAACCCACAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	3909	GAATTCCATATGCACTATGGAAGCAAAAAGAAAAAGCAACTAACCCACAT	3958

AL731683.12	51	ACAGAAGCCAGAGAAAGGGGAGGGGATGGGGACTGCCAGGGAGGGAAATC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	3959	ACAGAAGCCAGAGAAAGGGGAGGGGATGGGGACTGCCAGGGAGGGAAATC	4008

AL731683.12	101	GACTCAGGGAAAAATTCCTGGAGGTTGTAACTCAGAAAATCCTGAAGGAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	4009	GACTCAGGGAAAAATTCCTGGAGGTTGTAACTCAGAAAATCCTGAAGGAT	4058

AL731683.12	151	GCCGTATAATTGATGATGTCATCTATCCACGAGGCTGCTCAGAAATGCCC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	4059	GCCGTATAATTGATGATGTCATCTATCCACGAGGCTGCTCAGAAATGCCC	4108

AL731683.12	201	ACCCCTGGCCAGGGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCTGAGCACTTTGGGAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	4109	ACCCCTGGCCAGGGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCTGAGCACTTTGGGAG	4158

AL731683.12	251	GCTGAGATGGGCAGATCACGAATTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	4159	GCTGAGATGGGCAGATCACGAATTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAA	4208

AL731683.12	301	CATAGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	4209	CATAGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGG	4258

AL731683.12	351	TGGCAGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGGTGAGACAGGAGAATC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	4259	TGGCAGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGGTGAGACAGGAGAATC	4308

AL731683.12	401	ACTTGAACCCGGGAGTCAAAGTTTGCAGTGAGCCGAGACCATGCCATTGC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	4309	ACTTGAACCCGGGAGTCAAAGTTTGCAGTGAGCCGAGACCATGCCATTGC	4358

AL731683.12	451	ACCTCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTACATCTCAAAAAAAAAAAAAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	4359	ACCTCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTACATCTCAAAAAAAAAAAAAAA	4408

AL731683.12	501	GAAAGAAAGAAAAAAAGAAAAGAAATGCCCACCCCTCTTGCCACTGGCAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	4409	GAAAGAAAGAAAAAAAGAAAAGAAATGCCCACCCCTCTTGCCACTGGCAG	4458

AL731683.12	551	ACATGCACACACCAGAGAAGATTCCGATTTCGTGTCCTCCCTCTATTCAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	4459	ACATGCACACACCAGAGAAGATTCCGATTTCGTGTCCTCCCTCTATTCAC	4508

AL731683.12	601	AGAACATTTCCTCAAGTCCACTCTGAGTGGAGGCTGCATCACAACAAGGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	4509	AGAACATTTCCTCAAGTCCACTCTGAGTGGAGGCTGCATCACAACAAGGG	4558

AL731683.12	651	GATTGCCCTGTCTCCTTCCAGGGCTCTTAATACAAACTCTTCAACTAGTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	4559	GATTGCCCTGTCTCCTTCCAGGGCTCTTAATACAAACTCTTCAACTAGTA	4608

AL731683.12	701	ACTGAGGTGTCATCATAGGGGATTTTTCTAATTAGCCAAAACCTGACTTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	4609	ACTGAGGTGTCATCATAGGGGATTTTTCTAATTAGCCAAAACCTGACTTG	4658

AL731683.12	751	GCAGGGTTTGGTTTGGGTGTCTTCAGATTGCCTTGTCTCGAGGTCCTCAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	4659	GCAGGGTTTGGTTTGGGTGTCTTCAGATTGCCTTGTCTCGAGGTCCTCAC	4708

AL731683.12	801	AATTGCTCTACAACTCAGAACAGCAACTGCTAAGGCTGCCTTGGGAAGAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	4709	AATTGCTCTACAACTCAGAACAGCAACTGCTAAGGCTGCCTTGGGAAGAG	4758

AL731683.12	851	GATGATCCTAAACAAAGCTCTGATGCTGGGGGCCCTTGCCCTGACCACCG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	4759	GATGATCCTAAACAAAGCTCTGATGCTGGGGGCCCTTGCCCTGACCACCG	4808

AL731683.12	901	TGATGAGCCCCTGTGGAGGTGAAGACATTGTGGGTGAGTGTATGAGTGAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	4809	TGATGAGCCCCTGTGGAGGTGAAGACATTGTGGGTGAGTGTATGAGTGAG	4858

AL731683.12	951	GGATGTTCTCTGGAGCTGGAAGAGAGGAAATTGAAGCAAAAGAGAGAAAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	4859	GGATGTTCTCTGGAGCTGGAAGAGAGGAAATTGAAGCAAAAGAGAGAAAG	4908

AL731683.12	1001	CGATTTGCAGAGAAATTGTAGAGATTTCCTAAGGGTCCCTTCAGTATTAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	4909	CGATTTGCAGAGAAATTGTAGAGATTTCCTAAGGGTCCCTTCAGTATTAA	4958

AL731683.12	1051	GAGATTTAAAAATTATGGCTGTTCCTCCTTCAGGAAACCAGAGTCCCAAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	4959	GAGATTTAAAAATTATGGCTGTTCCTCCTTCAGGAAACCAGAGTCCCAAC	5008

AL731683.12	1101	CTACTCTTTTTGTTATCTATGCTGTTGGCGTTCACTAAGGATGCTATTCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	5009	CTACTCTTTTTGTTATCTATGCTGTTGGCGTTCACTAAGGATGCTATTCT	5058

AL731683.12	1151	GTTTATATTGTATTCAGTGACTATAGCCTGGAGGTCTCTATGTCATTCCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	5059	GTTTATATTGTATTCAGTGACTATAGCCTGGAGGTCTCTATGTCATTCCA	5108

AL731683.12	1201	TCATGATTGCCTCAAAAATTAGTGAGGTTTCCATCAATGGATAATTTTTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	5109	TCATGATTGCCTCAAAAATTAGTGAGGTTTCCATCAATGGATAATTTTTT	5158

AL731683.12	1251	ATTATTAAAAATTTGTGAAGTATCATTCTCAAATTTCCCTGAACAACTTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	5159	ATTATTAAAAATTTGTGAAGTATCATTCTCAAATTTCCCTGAACAACTTT	5208

AL731683.12	1301	TGAAGCTTTTCGGATGTCTCCTGTAGTAGCGCTTGGGGTAAATGATTCCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	5209	TGAAGCTTTTCGGATGTCTCCTGTAGTAGCGCTTGGGGTAAATGATTCCA	5258

AL731683.12	1351	TCAATTATATACTCTATAGATATTAAGAAAGATGCCCTTTTCTTTCTCTC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	5259	TCAATTATATACTCTATAGATATTAAGAAAGATGCCCTTTTCTTTCTCTC	5308

AL731683.12	1401	AGACTTACTAACATTTCCACGTGGGAACTGGCACAGGTGGGGAGTGGGTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	5309	AGACTTACTAACATTTCCACGTGGGAACTGGCACAGGTGGGGAGTGGGTA	5358

AL731683.12	1451	AAGGAGTCCAGCAGGCTGAATGCCTTCAACAATCATTTTACCACATGGTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	5359	AAGGAGTCCAGCAGGCTGAATGCCTTCAACAATCATTTTACCACATGGTC	5408

AL731683.12	1501	CTCATTTACTCTCAGCTGCCTCATATGTGTCACCTCACAAATAATCAAAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	5409	CTCATTTACTCTCAGCTGCCTCATATGTGTCACCTCACAAATAATCAAAT	5458

AL731683.12	1551	AAAATTGGCATGTAGCTAAGCTTTGTAAATAGTGAAAACATGAATGTCAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	5459	AAAATTGGCATGTAGCTAAGCTTTGTAAATAGTGAAAACATGAATGTCAA	5508

AL731683.12	1601	TTTTATTTTTACATATTTCTATTATAGGTATAGCTTCACATTTCTTTTCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	5509	TTTTATTTTTACATATTTCTATTATAGGTATAGCTTCACATTTCTTTTCT	5558

AL731683.12	1651	TTTGCAAAATAAGGTATCCTTTTATTTTAAAATTGAGAATTTATAGTAGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	5559	TTTGCAAAATAAGGTATCCTTTTATTTTAAAATTGAGAATTTATAGTAGA	5608

AL731683.12	1701	AAAACTTGGTAAATTAAATCATTTTATTCTCAAATTATCAACCCAAATTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	5609	AAAACTTGGTAAATTAAATCATTTTATTCTCAAATTATCAACCCAAATTA	5658

AL731683.12	1751	CCTGTTCTTCAACTCATCTAATGAAGTCCTATAAAAAGAAAAGTGGGCCA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	5659	CCTGTTCTTCAACTCATCTAATGAAGTCCTATAAAAAGAAAAGTGGGCCA	5708

AL731683.12	1801	GACATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	5709	GACATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAG	5758

AL731683.12	1851	GAGGATCCTTTGAGCCCAGGAGTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGCAAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	5759	GAGGATCCTTTGAGCCCAGGAGTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGCAAG	5808

AL731683.12	1901	ACCTCATCTCTACAAAAAATAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGCATGCC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	5809	ACCTCATCTCTACAAAAAATAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGCATGCC	5858

AL731683.12	1951	TGTGGTGCCAGCTACTCAGAAGGCTGCAGTGGGAGGACTGCTTGAGTCCA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928759.1	5859	TGTGGTGCCAGCTACTCAGAAGGCTGCAGTGGGAGGACTGCTTGAGTCCA	5908

Overview

Query
AL731683.12 - 83878 bps
Hit
AL928759.1 - 5908 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link