<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX276119.8	1	ACAAATGTAAATGGATTGAACATAAAACAATTAAATCCTCTCCACAAAAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	184743	ACAAATGTAAATGGATTGAACATAAAACAATTAAATCCTCTCCACAAAAA	184792

BX276119.8	51	TCTCAAAAATTGTGTTGTTTCAGCACATTTTTAGTAAGTAGTTTGATAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	184793	TCTCAAAAATTGTGTTGTTTCAGCACATTTTTAGTAAGTAGTTTGATAAA	184842

BX276119.8	101	AACAGTCATTTTGAGTGTACAAAAGCATTTACTGTATGACAAAGAATATA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	184843	AACAGTCATTTTGAGTGTACAAAAGCATTTACTGTATGACAAAGAATATA	184892

BX276119.8	151	AGAAGTTATAATTTCTCTAGAATTTATGAAAGCAAGACAAATACCTGTAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	184893	AGAAGTTATAATTTCTCTAGAATTTATGAAAGCAAGACAAATACCTGTAT	184942

BX276119.8	201	GACTTTTTCTTTTTATTTACAAAATATAAAATAGGTATGAAATAAATGGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	184943	GACTTTTTCTTTTTATTTACAAAATATAAAATAGGTATGAAATAAATGGT	184992

BX276119.8	251	AGTTACAAAATAAAACTTAAACAAAACAACTATGTGACATTTAACAAAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	184993	AGTTACAAAATAAAACTTAAACAAAACAACTATGTGACATTTAACAAAAA	185042

BX276119.8	301	ATCTATTTATATTGAGCAAACACCAAGGAAAACTGAGATATATTTTTGTC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	185043	ATCTATTTATATTGAGCAAACACCAAGGAAAACTGAGATATATTTTTGTC	185092

BX276119.8	351	AATATCACACAACCCCACAGTATGCCTATTTGCATCTAACTTTGGCAATG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	185093	AATATCACACAACCCCACAGTATGCCTATTTGCATCTAACTTTGGCAATG	185142

BX276119.8	401	TAAAGTGACACCTGGTTAAGATTTCAAACAGTTTAAACTTGTTCTTAATA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	185143	TAAAGTGACACCTGGTTAAGATTTCAAACAGTTTAAACTTGTTCTTAATA	185192

BX276119.8	451	TTCCCACAGTGATGACATTATATAACTTCCTCTCAGCTTTCCATCTCGAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	185193	TTCCCACAGTGATGACATTATATAACTTCCTCTCAGCTTTCCATCTCGAA	185242

BX276119.8	501	TGAAAGTTGGGACAAGTGGATTTTCCTAAGGTAGATTAGCCAAGCATCCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	185243	TGAAAGTTGGGACAAGTGGATTTTCCTAAGGTAGATTAGCCAAGCATCCT	185292

BX276119.8	551	GAATTAAGCTAAACTGATCACTGTAACTCACTAGCACTGCAGAAAAGATA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	185293	GAATTAAGCTAAACTGATCACTGTAACTCACTAGCACTGCAGAAAAGATA	185342

BX276119.8	601	CAGTAGAAAACATTGATGCTTTGATCAGTCAACCTTCAGTAGCCAACATA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	185343	CAGTAGAAAACATTGATGCTTTGATCAGTCAACCTTCAGTAGCCAACATA	185392

BX276119.8	651	AAAATGGCTCAGAAGCAAGTCTTGAGGAAGAGAAAAGGTGTGTGGTTTTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	185393	AAAATGGCTCAGAAGCAAGTCTTGAGGAAGAGAAAAGGTGTGTGGTTTTG	185442

BX276119.8	701	TGCGGTAGACTTGTGCACCTATGTTATGAATGCAACACACTCACACACAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	185443	TGCGGTAGACTTGTGCACCTATGTTATGAATGCAACACACTCACACACAG	185492

BX276119.8	751	TTATTCAACACCAAGCAAGATTGTAATGACTTAAAAGCCTTCAGCCACCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	185493	TTATTCAACACCAAGCAAGATTGTAATGACTTAAAAGCCTTCAGCCACCA	185542

BX276119.8	801	TACACAATAAATCATCCATAAATAACAAAGCACAAAGAGTGCAGTGGATA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	185543	TACACAATAAATCATCCATAAATAACAAAGCACAAAGAGTGCAGTGGATA	185592

BX276119.8	851	GCAGTAATGAGGAGATTGTAAAAAAATTGATGCAAGGATGTCGCCAAAGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	185593	GCAGTAATGAGGAGATTGTAAAAAAATTGATGCAAGGATGTCGCCAAAGT	185642

BX276119.8	901	GGCTTTTTGGTTTCTTTTCTTGTGCATCCCAGCCTCTAGCACCCCATCTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	185643	GGCTTTTTGGTTTCTTTTCTTGTGCATCCCAGCCTCTAGCACCCCATCTG	185692

BX276119.8	951	ACAGAGTTTTAGTATAGTGGGTAATGTAGTCATCCAACTTCACAATTTGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	185693	ACAGAGTTTTAGTATAGTGGGTAATGTAGTCATCCAACTTCACAATTTGT	185742

BX276119.8	1001	AATTTTGCAGTATGTATTTGAACAATGATGGCTGATTCCTTTACCTGAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	185743	AATTTTGCAGTATGTATTTGAACAATGATGGCTGATTCCTTTACCTGAAA	185792

BX276119.8	1051	GCTCACATTTGATTATAATATTTTGATTTGTTTACAGAGTTTAACGTTTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	185793	GCTCACATTTGATTATAATATTTTGATTTGTTTACAGAGTTTAACGTTTA	185842

BX276119.8	1101	CTGTATCATTATTATTCACACTTTTAAGGTTTGCTTTGATAGTTTAGTGT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	185843	CTGTATCATTATTATTCACACTTTTAAGGTTTGCTTTGATAGTTTAGTGT	185892

BX276119.8	1151	TTACACTTCCGCATTGCACACACTTTGTAACATTTTATTTATCAAGTTTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	185893	TTACACTTCCGCATTGCACACACTTTGTAACATTTTATTTATCAAGTTTA	185942

BX276119.8	1201	AGAGTCTCTTTAACACTTATTTAAATAAAGTAGTTAAATAAAACACATTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	185943	AGAGTCTCTTTAACACTTATTTAAATAAAGTAGTTAAATAAAACACATTT	185992

BX276119.8	1251	CTAAACTGATTATTAAAAAATAAACTATCAATATCGAATGATATGAAACA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	185993	CTAAACTGATTATTAAAAAATAAACTATCAATATCGAATGATATGAAACA	186042

BX276119.8	1301	TATTTCATGACAATTAATTTTGCAATATCATCCCTATATGTAACAATTGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	186043	TATTTCATGACAATTAATTTTGCAATATCATCCCTATATGTAACAATTGT	186092

BX276119.8	1351	TTGTCGCTACTATGGAAATTAATGGTTTTCAGCTATCTTCAAAGTATCTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	186093	TTGTCGCTACTATGGAAATTAATGGTTTTCAGCTATCTTCAAAGTATCTT	186142

BX276119.8	1401	CTTTTGTGTTTAACAGAATAAAGAAACTCATAAAGGTTTGGAATCTCATG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	186143	CTTTTGTGTTTAACAGAATAAAGAAACTCATAAAGGTTTGGAATCTCATG	186192

BX276119.8	1451	AGGGAGAATAAGTAGTGATAAAATGTTCATTTTCGGGTGATTTATCCCTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	186193	AGGGAGAATAAGTAGTGATAAAATGTTCATTTTCGGGTGATTTATCCCTT	186242

BX276119.8	1501	TAAGGACTTTTATTTCTATAATAACGCTCCACATTATAGAGTTATCCTGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	186243	TAAGGACTTTTATTTCTATAATAACGCTCCACATTATAGAGTTATCCTGG	186292

BX276119.8	1551	ATATTCAAAAGGAAAAGATTCATTTTATCTATCAGAAACTGATTGGATTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	186293	ATATTCAAAAGGAAAAGATTCATTTTATCTATCAGAAACTGATTGGATTA	186342

BX276119.8	1601	TAAAAAGCAGGCATAAAATGTCAGAACAGAGCCAGGTGGTTGTGGTTTAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	186343	TAAAAAGCAGGCATAAAATGTCAGAACAGAGCCAGGTGGTTGTGGTTTAA	186392

BX276119.8	1651	ATATAGAGTGGTTATGATGTCAGCTGGAGAAAAAAAAAACAGCCAAGAGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	186393	ATATAGAGTGGTTATGATGTCAGCTGGAGAAAAAAAAAACAGCCAAGAGA	186442

BX276119.8	1701	GTTATTACATCTTGATGAAAGATTATGAGGAAACATTTTTTTTTCTTTGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	186443	GTTATTACATCTTGATGAAAGATTATGAGGAAACATTTTTTTTTCTTTGA	186492

BX276119.8	1751	GAATAACATGCACTGATGAATTATAAACAATAAGACCAGGAACATGTTTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	186493	GAATAACATGCACTGATGAATTATAAACAATAAGACCAGGAACATGTTTT	186542

BX276119.8	1801	TAGAAAAGTACATAATGTTGACTTTAAGTTGACTCTAAAAGCCCCAATGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	186543	TAGAAAAGTACATAATGTTGACTTTAAGTTGACTCTAAAAGCCCCAATGT	186592

BX276119.8	1851	ATCTGTATATCCTAACCATTGACTTCTTGCACCTGGTTAAATGGAGCAAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	186593	ATCTGTATATCCTAACCATTGACTTCTTGCACCTGGTTAAATGGAGCAAT	186642

BX276119.8	1901	GTGCTTTTATACTGACACACCTGTGCTATTTAATCTTAAAAAGAACAGAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	186643	GTGCTTTTATACTGACACACCTGTGCTATTTAATCTTAAAAAGAACAGAA	186692

BX276119.8	1951	AAGAGGAGCATCTTACAGTTCACAGTCTTCTAATTGCCTGCAATGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928736.5	186693	AAGAGGAGCATCTTACAGTTCACAGTCTTCTAATTGCCTGCAATGAATTC	186742

Overview

Query
BX276119.8 - 38280 bps
Hit
AL928736.5 - 186742 bps
Total alignments
22
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100189920001200011847431867421
210038793796438042-1769677741
3100398037967380461769677751
48843752207722151-123982240561
595.5254671678516851-123990240561
691.07411113796538075-150840509511
798.7736813796038040150871509511
810035723796538036-151662517331
910035723796538036151662517331
1010040823796438045-155188552691
1110040833796438046155188552701
1287.74147252870112111022501025021
1310032663796538030-11198511199161
141003266379653803011198511199161
1580.711333803527435653-11211391214751
1685.492043933527435666-11518751522601
1798.8844893796438052-11544231545111
181004082379643804511544301545111
1910037773796538041-11702571703331
201003777379643804011702571703331
211004082379643804511800471801281
2210040823796438045-11800491801301
Short-link