<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL954733.12	63353	GAATTCAGCGCCTCGAAGTTACGCGTCAGAATGAACTTGTAGTATTTTCT	63402
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	1	GAATTCAGCGCCTCGAAGTTACGCGTCAGAATGAACTTGTAGTATTTTCT	50

AL954733.12	63403	GTTTACACAAAGAGTATGTATGATGTTTGTATTGTTATTATTTTTGCCTG	63452
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	51	GTTTACACAAAGAGTATGTATGATGTTTGTATTGTTATTATTTTTGCCTG	100

AL954733.12	63453	AAGTCAACACATTTTGTTAAGGATATTGAGGTTGTGGGTCTCACTTCTGC	63502
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	101	AAGTCAACACATTTTGTTAAGGATATTGAGGTTGTGGGTCTCACTTCTGC	150

AL954733.12	63503	ATGGGGCTGAGCTCCACTCGGACGATCAGCTCCGTTTTTGCTGGCATGTT	63552
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	151	ATGGGGCTGAGCTCCACTCGGACGATCAGCTCCGTTTTTGCTGGCATGTT	200

AL954733.12	63553	TTTAAACACATCAGCTTTGAGTCTCCGCAGCATGTGAGGGCCGAGCAGGT	63602
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	201	TTTAAACACATCAGCTTTGAGTCTCCGCAGCATGTGAGGGCCGAGCAGGT	250

AL954733.12	63603	CATGCAGTTTCTTGATCTGGTCCTCTTTAGAGATGTCCGCAAACTCCTCT	63652
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	251	CATGCAGTTTCTTGATCTGGTCCTCTTTAGAGATGTCCGCAAACTCCTCT	300

AL954733.12	63653	AGAAAACCCTCCAGATTGCTGAGGGATTGCAGAAACAAAGTGATTTATTA	63702
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	301	AGAAAACCCTCCAGATTGCTGAGGGATTGCAGAAACAAAGTGATTTATTA	350

AL954733.12	63703	GTGAAATTATTACAACATGTCAGTTGATGTGATGCCTACATAACTTCAGC	63752
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	351	GTGAAATTATTACAACATGTCAGTTGATGTGATGCCTACATAACTTCAGC	400

AL954733.12	63753	CACACTAAAATTGGCATATCATAGATTTAGATAACATAATACGTTTTACT	63802
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	401	CACACTAAAATTGGCATATCATAGATTTAGATAACATAATACGTTTTACT	450

AL954733.12	63803	ATGCAAATTGGGTCATTTTGAGTAAATAAGCACGCTTTTGTGTAGGGTCC	63852
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	451	ATGCAAATTGGGTCATTTTGAGTAAATAAGCACGCTTTTGTGTAGGGTCC	500

AL954733.12	63853	TACTTGAAGCGGTTGGGTGTCAGGAAGTTAAGCAGGTGGAAAAGCTCTTC	63902
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	501	TACTTGAAGCGGTTGGGTGTCAGGAAGTTAAGCAGGTGGAAAAGCTCTTC	550

AL954733.12	63903	CAGGTTGTTCTGGAGTGGAGTTCCTGTTAGCAGCAGCTTATGGTCTATCT	63952
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	551	CAGGTTGTTCTGGAGTGGAGTTCCTGTTAGCAGCAGCTTATGGTCTATCT	600

AL954733.12	63953	TATAGTCGTTCAGTCTCCTGAAGAACTAACACACCACAACAACAGACATC	64002
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	601	TATAGTCGTTCAGTCTCCTGAAGAACTAACACACCACAACAACAGACATC	650

AL954733.12	64003	AGTTAATGAAACACACAAAATCTTTATTTCAGTCAGCTAAAATTATACAT	64052
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	651	AGTTAATGAAACACACAAAATCTTTATTTCAGTCAGCTAAAATTATACAT	700

AL954733.12	64053	GGTTCTTTACAAAAACTGTATGTATAGCAAGGTTAGCATAACTTGCCAAT	64102
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	701	GGTTCTTTACAAAAACTGTATGTATAGCAAGGTTAGCATAACTTGCCAAT	750

AL954733.12	64103	AATAAAACATCATGCATCTTTTTGCAAAAGGTGTATAATAGTAGATTTAT	64152
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	751	AATAAAACATCATGCATCTTTTTGCAAAAGGTGTATAATAGTAGATTTAT	800

AL954733.12	64153	TGAGCAATTTGTTTTTGTAAGGCAATCTCTATAGTCTTTTGCTGTTTGTT	64202
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	801	TGAGCAATTTGTTTTTGTAAGGCAATCTCTATAGTCTTTTGCTGTTTGTT	850

AL954733.12	64203	TAAACTACTTATTTAAAATTGAAATAACACAATTTTTATGTTTTTTTTTT	64252
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	851	TAAACTACTTATTTAAAATTGAAATAACACAATTTTTATGTTTTTTTTTT	900

AL954733.12	64253	GGGAAACAACATAATTGTTTGATGGTTAATCCATTTAAATTTGTAAAAAC	64302
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	901	GGGAAACAACATAATTGTTTGATGGTTAATCCATTTAAATTTGTAAAAAC	950

AL954733.12	64303	GATTAAGTTAAAATTAATTTGTGTTGGGATAACATGAAGGGATTGTGTGG	64352
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	951	GATTAAGTTAAAATTAATTTGTGTTGGGATAACATGAAGGGATTGTGTGG	1000

AL954733.12	64353	AACCCAGCATTTTTTACAGTGTATGCATAGATTTTGATTATCCTTAGTTA	64402
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	1001	AACCCAGCATTTTTTACAGTGTATGCATAGATTTTGATTATCCTTAGTTA	1050

AL954733.12	64403	ACATACAGCATAACAATTGAAACATTTGAGGTTGGAAAGAGTTTTAGTAC	64452
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	1051	ACATACAGCATAACAATTGAAACATTTGAGGTTGGAAAGAGTTTTAGTAC	1100

AL954733.12	64453	TGAAAGTAATTACAACAATTTTGTAGAAAGGACTCTATAAAGTAATTAAG	64502
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	1101	TGAAAGTAATTACAACAATTTTGTAGAAAGGACTCTATAAAGTAATTAAG	1150

AL954733.12	64503	AGTCACTTGAAAGAAAAATGACACTCATTCATTTAATTTTCATCAAAGAA	64552
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	1151	AGTCACTTGAAAGAAAAATGACACTCATTCATTTAATTTTCATCAAAGAA	1200

AL954733.12	64553	TCCTGACAAAATATATTACAGTTTTCACAAAAAAATATTCAGCAGCACAA	64602
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	1201	TCCTGACAAAATATATTACAGTTTTCACAAAAAAATATTCAGCAGCACAA	1250

AL954733.12	64603	CTCTAGCAAACATTAATAACATTACGGAAAGTTTGTTCAACACCAAGTCT	64652
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	1251	CTCTAGCAAACATTAATAACATTACGGAAAGTTTGTTCAACACCAAGTCT	1300

AL954733.12	64653	CCATATTTGAATAGACTTAAAGATCATGTGTTATGTTCAATTTACTTAAA	64702
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	1301	CCATATTTGAATAGACTTAAAGATCATGTGTTATGTTCAATTTACTTAAA	1350

AL954733.12	64703	TTTGTAAAAACTATTGGGTTAACTTAATCAATTTGTGTTTGGACAACATA	64752
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	1351	TTTGTAAAAACTATTGGGTTAACTTAATCAATTTGTGTTTGGACAACATA	1400

AL954733.12	64753	AAGGAACTGTGTGGAACCCAGTTGGTCTTTTTTACAGTGTATGCTGAGAT	64802
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	1401	AAGGAACTGTGTGGAACCCAGTTGGTCTTTTTTACAGTGTATGCTGAGAT	1450

AL954733.12	64803	TATTCCCAGTATACTGAAGTCAATCATCTGATTGTGAAACATCTCCATCA	64852
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	1451	TATTCCCAGTATACTGAAGTCAATCATCTGATTGTGAAACATCTCCATCA	1500

AL954733.12	64853	AATTTGTCCTAAAACTATTCAACAACACCTATTCCTGTTTTAGGACCATA	64902
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	1501	AATTTGTCCTAAAACTATTCAACAACACCTATTCCTGTTTTAGGACCATA	1550

AL954733.12	64903	CTGAAAAACCTTATTTGATCCACTTCAAATGTTGAATACTGTACAACATT	64952
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	1551	CTGAAAAACCTTATTTGATCCACTTCAAATGTTGAATACTGTACAACATT	1600

AL954733.12	64953	TGGGTTTAGAAAGATATTTAGTACTGAAAGTAATTACTACAAATTTTCTA	65002
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	1601	TGGGTTTAGAAAGATATTTAGTACTGAAAGTAATTACTACAAATTTTCTA	1650

AL954733.12	65003	AAAGGACTCTTTAAATTGATTAAAAGTCACCTGAAAGAAAAATTAAAAAT	65052
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	1651	AAAGGACTCTTTAAATTGATTAAAAGTCACCTGAAAGAAAAATTAAAAAT	1700

AL954733.12	65053	ACATTTTTCATTAATTTATGAAATTTTCATCAAAAAATCCTGACAAAATG	65102
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	1701	ACATTTTTCATTAATTTATGAAATTTTCATCAAAAAATCCTGACAAAATG	1750

AL954733.12	65103	TATAACTGTTTCCGCAAAACAATATTAAGTAGCACAACTCTAGCAAACAT	65152
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	1751	TATAACTGTTTCCGCAAAACAATATTAAGTAGCACAACTCTAGCAAACAT	1800

AL954733.12	65153	TGATAGCATTGATAACAGAAATGTTTGTTCAACACCAAATATGCATAGTC	65202
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	1801	TGATAGCATTGATAACAGAAATGTTTGTTCAACACCAAATATGCATAGTC	1850

AL954733.12	65203	TGGAGTCTGGAGTAAATGGCTGTTAAATTGCCACCTTTACATTTAAACAC	65252
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	1851	TGGAGTCTGGAGTAAATGGCTGTTAAATTGCCACCTTTACATTTAAACAC	1900

AL954733.12	65253	ATTACAATATAAAGCAGCTATATTAAATTCTAATATTTGACATTATTACT	65302
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	1901	ATTACAATATAAAGCAGCTATATTAAATTCTAATATTTGACATTATTACT	1950

AL954733.12	65303	TTTTTTATTTGTGTATTTTCAATCAAACTGAATACACACGGGACAGAAAG	65352
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928637.7	1951	TTTTTTATTTGTGTATTTTCAATCAAACTGAATACACACGGGACAGAAAG	2000

Overview

Query
AL954733.12 - 65352 bps
Hit
AL928637.7 - 163121 bps
Total alignments
16
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001908200063353653521120001
282.492425482139521942-1603565821
382.2952285793158158-1660168191
410034625752257583-1772077811
583.71581385526455401-126628267621
682.63691776192562101144273444621
791.11031452025320397-144291444361
886.7639686180461871162922629891
9801193595526755625-168969693231
1083.23751675831558481169118692841
1185.07821972948229678-196999971991
1294.7932965748757582-11039511040461
1377.35581815685957039-11075251077051
1482.614292617806187111178341179251
1595.5636455784957893-11222021222461
1680.8229887416562529-11495121503871
Short-link