<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL671277.5	1	GAATTCTCATGAGATCTGATGGTTTTATAAGGGGCTTTTCCCCGCTTCGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	19223	GAATTCTCATGAGATCTGATGGTTTTATAAGGGGCTTTTCCCCGCTTCGC	19272

AL671277.5	51	TCTGCATTTCTCTCTCCTGCCACCATGTGAAGAAGGACGGGTTTTCTTCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	19273	TCTGCATTTCTCTCTCCTGCCACCATGTGAAGAAGGACGGGTTTTCTTCC	19322

AL671277.5	101	ACTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGGGGTGGCCTCCTCAGCCATGCAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	19323	ACTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGGGGTGGCCTCCTCAGCCATGCAG	19372

AL671277.5	151	AACTGGGAGTCAGTTAAACCTCTTTCCTTTATAAATTACCCAGTCTCAGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	19373	AACTGGGAGTCAGTTAAACCTCTTTCCTTTATAAATTACCCAGTCTCAGG	19422

AL671277.5	201	TATTTCTTTATAGCAGTGTGAGAACAGACTAATACAACTTCTGATGGAGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	19423	TATTTCTTTATAGCAGTGTGAGAACAGACTAATACAACTTCTGATGGAGC	19472

AL671277.5	251	AATGCCGACATAACAGCTTGTGACTCTGGGTGTAGAACCTAAAACTCCCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	19473	AATGCCGACATAACAGCTTGTGACTCTGGGTGTAGAACCTAAAACTCCCT	19522

AL671277.5	301	GCAGCTTCCACCTTCTCTCTCTCTGTCTCTGGGATCATGAGCTCTGGGGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	19523	GCAGCTTCCACCTTCTCTCTCTCTGTCTCTGGGATCATGAGCTCTGGGGA	19572

AL671277.5	351	AAGTCAGCTGCTGTGCCATGAGCAGCCCTGCAGCAAGGTCCATCTGGCTA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	19573	AAGTCAGCTGCTGTGCCATGAGCAGCCCTGCAGCAAGGTCCATCTGGCTA	19622

AL671277.5	401	AGAACTGAGGCCTTCTGGGACCCAATTACAATGAACTAGGCCTTTTCCAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	19623	AGAACTGAGGCCTTCTGGGACCCAATTACAATGAACTAGGCCTTTTCCAA	19672

AL671277.5	451	CAGCCATGTGACTGATCCATGTTTCATGTGAATCCTCAGCCCCAGTGAAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	19673	CAGCCATGTGACTGATCCATGTTTCATGTGAATCCTCAGCCCCAGTGAAG	19722

AL671277.5	501	CCCTCAGATGATGCAGGCCTAGACTGACAACTGGACTGCAACCTTGTGAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	19723	CCCTCAGATGATGCAGGCCTAGACTGACAACTGGACTGCAACCTTGTGAG	19772

AL671277.5	551	AGGCCCTTAGCAAGAAGCACTCAGGGAAACTTCTCCTGGATTCCTGACAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	19773	AGGCCCTTAGCAAGAAGCACTCAGGGAAACTTCTCCTGGATTCCTGACAA	19822

AL671277.5	601	CTGGAAACTGTGGGAGATGATCAATATTTGTTATTTTGAAATGGTACATT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	19823	CTGGAAACTGTGGGAGATGATCAATATTTGTTATTTTGAAATGGTACATT	19872

AL671277.5	651	TTACATAATTTGTTATGCAATAGTAAATAACTAATACATTTTCACAAGAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	19873	TTACATAATTTGTTATGCAATAGTAAATAACTAATACATTTTCACAAGAG	19922

AL671277.5	701	AGGATGTATTATTACATGTTAATTTGCATTTGCTCTAAATTTATCATCAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	19923	AGGATGTATTATTACATGTTAATTTGCATTTGCTCTAAATTTATCATCAT	19972

AL671277.5	751	CATTATTATTATTTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	19973	CATTATTATTATTTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAG	20022

AL671277.5	801	TGCAGTGGCATGATCACCATGCACTGCAGTGTAGACCTCCTGGGCTCAAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	20023	TGCAGTGGCATGATCACCATGCACTGCAGTGTAGACCTCCTGGGCTCAAG	20072

AL671277.5	851	GGACCCTCTGACCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGAGTACAATCATGAACC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	20073	GGACCCTCTGACCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGAGTACAATCATGAACC	20122

AL671277.5	901	ACTGTGCCTGGCTAATTTTCTAATTTTTTGTAGAGATGGGGGTTTCCCCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	20123	ACTGTGCCTGGCTAATTTTCTAATTTTTTGTAGAGATGGGGGTTTCCCCA	20172

AL671277.5	951	TGTTGCCCAGGCTGATCTTGAACTTCTGGAGTCAACAAATCTGCCTTCCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	20173	TGTTGCCCAGGCTGATCTTGAACTTCTGGAGTCAACAAATCTGCCTTCCT	20222

AL671277.5	1001	CTGCCTTCCACAATGCTAGGATTGCAGGTGTGAGCCACCAAATCTGGCCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	20223	CTGCCTTCCACAATGCTAGGATTGCAGGTGTGAGCCACCAAATCTGGCCT	20272

AL671277.5	1051	AAATTAATTAAAAGATATAAATATGTAACTTAGTTTTAAAAGGTAAGGAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	20273	AAATTAATTAAAAGATATAAATATGTAACTTAGTTTTAAAAGGTAAGGAG	20322

AL671277.5	1101	AATTTTCATGGCTGAAAAGGATGTATTTTATTACCGTTCACAATGATTAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	20323	AATTTTCATGGCTGAAAAGGATGTATTTTATTACCGTTCACAATGATTAC	20372

AL671277.5	1151	TTTACTTGAACTTCAATTTGCAACTGTGTCCCAAGTGAACACAAAAAGAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	20373	TTTACTTGAACTTCAATTTGCAACTGTGTCCCAAGTGAACACAAAAAGAA	20422

AL671277.5	1201	GATCCAGCCCTTGCTAGGCTGATTCTATGATGGCCTCAACAACAAGCTCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	20423	GATCCAGCCCTTGCTAGGCTGATTCTATGATGGCCTCAACAACAAGCTCC	20472

AL671277.5	1251	TGGTCATTCACCTTCCCCCCATTATTCAACCAACTCTAATATAGGTGCTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	20473	TGGTCATTCACCTTCCCCCCATTATTCAACCAACTCTAATATAGGTGCTG	20522

AL671277.5	1301	CTGTGAATGGATTTAGCAGATATAATTAAGGGCCTCAATTAGTTGACTTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	20523	CTGTGAATGGATTTAGCAGATATAATTAAGGGCCTCAATTAGTTGACTTT	20572

AL671277.5	1351	AGGCTGGGTTTATGCTGCTTGGACTGTCCTAATCAGGTGAGTCCTTGAAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	20573	AGGCTGGGTTTATGCTGCTTGGACTGTCCTAATCAGGTGAGTCCTTGAAA	20622

AL671277.5	1401	GGATTGGGTTCTTCCTGAGCATAGAGATTCACAGTGTGAGAGGGATTCAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	20623	GGATTGGGTTCTTCCTGAGCATAGAGATTCACAGTGTGAGAGGGATTCAG	20672

AL671277.5	1451	CATGAGGGGTTTCCTCCACTGTGGGCTTTGAAAATGAAGGGGCTGTACAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	20673	CATGAGGGGTTTCCTCCACTGTGGGCTTTGAAAATGAAGGGGCTGTACAG	20722

AL671277.5	1501	GGAAGAACACTGGTGGGCATCAGGAATTGAGCGCAGCCCTCCCTGTTCTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	20723	GGAAGAACACTGGTGGGCATCAGGAATTGAGCGCAGCCCTCCCTGTTCTC	20772

AL671277.5	1551	TACATTGACAGCCAGCAAGGAACAGGGACCTCAGTCTTAGAACTGCAAGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	20773	TACATTGACAGCCAGCAAGGAACAGGGACCTCAGTCTTAGAACTGCAAGA	20822

AL671277.5	1601	AACTGCATTCTGCCACCTCTGTATAAGCCTGAAGGAGGATTCAAAATGAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	20823	AACTGCATTCTGCCACCTCTGTATAAGCCTGAAGGAGGATTCAAAATGAA	20872

AL671277.5	1651	AACACAGCTTTGGGAAGCCCGGAACAGAGATTCCATCCACATCATGCCCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	20873	AACACAGCTTTGGGAAGCCCGGAACAGAGATTCCATCCACATCATGCCCA	20922

AL671277.5	1701	GATTTCTGACTAAGGTACTATAAACAGATAAATGGGTGTTGTTTGGCCAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	20923	GATTTCTGACTAAGGTACTATAAACAGATAAATGGGTGTTGTTTGGCCAG	20972

AL671277.5	1751	GCGTGGTAATGCACACCTGCAATCCTAACATCTGAGGAGCTGACACAGGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	20973	GCGTGGTAATGCACACCTGCAATCCTAACATCTGAGGAGCTGACACAGGA	21022

AL671277.5	1801	GGATCACTTGCATCCAGGAATTTGAGACCAGCCAAGATCAAACAGTGAGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	21023	GGATCACTTGCATCCAGGAATTTGAGACCAGCCAAGATCAAACAGTGAGA	21072

AL671277.5	1851	CACTCATCTCTACAATTTCTTTTTAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACTTGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	21073	CACTCATCTCTACAATTTCTTTTTAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACTTGT	21122

AL671277.5	1901	CTGCAGTCCTATCTATTCTGAAGACTGAGGCAGGAAGATCCCTTGAGCCC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	21123	CTGCAGTCCTATCTATTCTGAAGACTGAGGCAGGAAGATCCCTTGAGCCC	21172

AL671277.5	1951	AGGAGTTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATCATGTGACTGCACTTCACCCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL928614.3	21173	AGGAGTTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATCATGTGACTGCACTTCACCCT	21222

Overview

Query
AL671277.5 - 84827 bps
Hit
AL928614.3 - 21222 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link