<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL354718.10	173272	TGGCCTAAGAGTATCACTCTATAGGAATTATAAAAAGTTGTATTTATGCC	173321
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	1	TGGCCTAAGAGTATCACTCTATAGGAATTATAAAAAGTTGTATTTATGCC	50

AL354718.10	173322	CTGAGATTATACCCTATAATGTGCAAATATTATAGGATAGACAAGTGGAT	173371
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	51	CTGAGATTATACCCTATAATGTGCAAATATTATAGGATAGACAAGTGGAT	100

AL354718.10	173372	ATAAGGTTTCTTTCTAGGTTTCCTTATATACTCCAAATGGTAAAACTAGA	173421
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	101	ATAAGGTTTCTTTCTAGGTTTCCTTATATACTCCAAATGGTAAAACTAGA	150

AL354718.10	173422	TGGAAGATTAAAATTCTAAATGTTGTTAATTTTAGAACCTTCAATGTCAG	173471
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	151	TGGAAGATTAAAATTCTAAATGTTGTTAATTTTAGAACCTTCAATGTCAG	200

AL354718.10	173472	AGTTACTTTGTATGAATGAGTTTAGCTAATTTTCCACACTATGCATATCT	173521
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	201	AGTTACTTTGTATGAATGAGTTTAGCTAATTTTCCACACTATGCATATCT	250

AL354718.10	173522	AATAGATATTACTATTGCACAGGTGAGAAAACTGCATCTCTGATTATTAT	173571
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	251	AATAGATATTACTATTGCACAGGTGAGAAAACTGCATCTCTGATTATTAT	300

AL354718.10	173572	TATTCACTCTAGTCACAGAGATAAGAAAGGGCAAAATATCATAATAGAAG	173621
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	301	TATTCACTCTAGTCACAGAGATAAGAAAGGGCAAAATATCATAATAGAAG	350

AL354718.10	173622	CCCAAATAGGTCTTATTTTAATGGAATATTTTTCCACTGGACTTCAACTG	173671
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	351	CCCAAATAGGTCTTATTTTAATGGAATATTTTTCCACTGGACTTCAACTG	400

AL354718.10	173672	GTTTATCTTATTTATCCATCCATCTAAGATCAGTTGAAAAAAGAGACTTG	173721
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	401	GTTTATCTTATTTATCCATCCATCTAAGATCAGTTGAAAAAAGAGACTTG	450

AL354718.10	173722	CAGATGCAATATTTTAGCTAATATATCCAATCTCCTATTTGAAATCTCCT	173771
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	451	CAGATGCAATATTTTAGCTAATATATCCAATCTCCTATTTGAAATCTCCT	500

AL354718.10	173772	GCGTATCTAACAGAAAACTCAAATTTAGTATGTCTGAAATCAAGCTGACT	173821
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	501	GCGTATCTAACAGAAAACTCAAATTTAGTATGTCTGAAATCAAGCTGACT	550

AL354718.10	173822	GCTGCACGTGTTCGCACTGAAACGAAGCAAAACAAAATTCCTTCAACAGC	173871
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	551	GCTGCACGTGTTCGCACTGAAACGAAGCAAAACAAAATTCCTTCAACAGC	600

AL354718.10	173872	TTTTCTCATCCCAATAAATGGTACTACACTGTGCCTGTATGACTCATGCC	173921
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	601	TTTTCTCATCCCAATAAATGGTACTACACTGTGCCTGTATGACTCATGCC	650

AL354718.10	173922	CAAAACCTAGAGGTCGACCTAGGTTCTTTTTTTCCCCATGACTCTCCATT	173971
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	651	CAAAACCTAGAGGTCGACCTAGGTTCTTTTTTTCCCCATGACTCTCCATT	700

AL354718.10	173972	TCCAAGATTTCCATTTCTTCCGTGAACACTTCTCAAAGCCACACCCATCT	174021
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	701	TCCAAGATTTCCATTTCTTCCGTGAACACTTCTCAAAGCCACACCCATCT	750

AL354718.10	174022	CTCTGTCAGAATACCACAATGCATTGCAAATCTGCCTCCCTTCTTGTCAT	174071
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	751	CTCTGTCAGAATACCACAATGCATTGCAAATCTGCCTCCCTTCTTGTCAT	800

AL354718.10	174072	CTCCTCCCTAAATGCTCTATTTTCACAGTAGTCAGAGTGGCTTTTTTTTT	174121
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	801	CTCCTCCCTAAATGCTCTATTTTCACAGTAGTCAGAGTGGCTTTTTTTTT	850

AL354718.10	174122	TTTAAAGCACACAAGATCTTGACTCTTCATTCCCTACTTTCTGCTTTAAG	174171
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	851	TTTAAAGCACACAAGATCTTGACTCTTCATTCCCTACTTTCTGCTTTAAG	900

AL354718.10	174172	TCCTTGTTTGGCTTTCCTCTGCTAATATAAAGAAAAATTTCCAACTTCTT	174221
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	901	TCCTTGTTTGGCTTTCCTCTGCTAATATAAAGAAAAATTTCCAACTTCTT	950

AL354718.10	174222	TTTAATGACCATAGATCCTGACTTGATGTTTTCTACCTACCTCTCCAACC	174271
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	951	TTTAATGACCATAGATCCTGACTTGATGTTTTCTACCTACCTCTCCAACC	1000

AL354718.10	174272	ACATGTCATACACTTCCCTTCTTTTCTTATCACACCCAAAACATTCTTAA	174321
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	1001	ACATGTCATACACTTCCCTTCTTTTCTTATCACACCCAAAACATTCTTAA	1050

AL354718.10	174322	TTATTTCCACAGTCTTTGTATATGCCAACCCTTTTTCTGCCTCTAGAATT	174371
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	1051	TTATTTCCACAGTCTTTGTATATGCCAACCCTTTTTCTGCCTCTAGAATT	1100

AL354718.10	174372	TTGTGCTTGTTTCTCTTTCTTTCTAAAATAAGCTTTCTGTGGCTTTTTGT	174421
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	1101	TTGTGCTTGTTTCTCTTTCTTTCTAAAATAAGCTTTCTGTGGCTTTTTGT	1150

AL354718.10	174422	AAAATTAGATCATTGTTCTTTGAAATCTCGGCTAAGAAGTTTTCTGAAAT	174471
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	1151	AAAATTAGATCATTGTTCTTTGAAATCTCGGCTAAGAAGTTTTCTGAAAT	1200

AL354718.10	174472	ACCTTAATTAAAGTTCCTTCCCTGGTTATTAGCAGTCTCCTCACTTCGTT	174521
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	1201	ACCTTAATTAAAGTTCCTTCCCTGGTTATTAGCAGTCTCCTCACTTCGTT	1250

AL354718.10	174522	TATTTTTATTGTAATCTTTAATGATTGCTTTCTATTTGTTTGACTTCTTG	174571
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	1251	TATTTTTATTGTAATCTTTAATGATTGCTTTCTATTTGTTTGACTTCTTG	1300

AL354718.10	174572	ATCAACTCAAATTTGTATCCTCAGCTCTTATCAAAATACTAGGTAACTAC	174621
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	1301	ATCAACTCAAATTTGTATCCTCAGCTCTTATCAAAATACTAGGTAACTAC	1350

AL354718.10	174622	ACACCTATTGAAACAACTAAACATAAAAATAGTGACAACAAAAGCTGGCA	174671
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	1351	ACACCTATTGAAACAACTAAACATAAAAATAGTGACAACAAAAGCTGGCA	1400

AL354718.10	174672	ATGATGAAGAAACTGTATCATTCATACATTATTTGAATTGTAAAATGTTA	174721
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	1401	ATGATGAAGAAACTGTATCATTCATACATTATTTGAATTGTAAAATGTTA	1450

AL354718.10	174722	TAATACTCTGGAAATAATTTATCAGTTTCTTTAAAAACTAAACATATATT	174771
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	1451	TAATACTCTGGAAATAATTTATCAGTTTCTTTAAAAACTAAACATATATT	1500

AL354718.10	174772	TATAATAAGATCCAGCAATTGCACCCCTGGAAATTTATCTAAGAGAAATG	174821
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	1501	TATAATAAGATCCAGCAATTGCACCCCTGGAAATTTATCTAAGAGAAATG	1550

AL354718.10	174822	TAAACCTATATGCGATCTTTAATATCTTTCATAGCACCTTTAATTCTAAC	174871
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	1551	TAAACCTATATGCGATCTTTAATATCTTTCATAGCACCTTTAATTCTAAC	1600

AL354718.10	174872	AGAGAAAAACTGGAAACATCCAAGATGTTGGACAGGTGACTGGTTGAATA	174921
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	1601	AGAGAAAAACTGGAAACATCCAAGATGTTGGACAGGTGACTGGTTGAATA	1650

AL354718.10	174922	AACTGTGGTATATCCATATGATTAAATACTACCCAGAAATAAAAAAGAAT	174971
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	1651	AACTGTGGTATATCCATATGATTAAATACTACCCAGAAATAAAAAAGAAT	1700

AL354718.10	174972	ATACTTTCGACACATGCAATAACTTGCATGGATCTGAAGGGCATTATGCT	175021
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	1701	ATACTTTCGACACATGCAATAACTTGCATGGATCTGAAGGGCATTATGCT	1750

AL354718.10	175022	TAGTGAAAAAAAGCAAATATCAAAAGGACACATGGCATATTATTTCATGT	175071
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	1751	TAGTGAAAAAAAGCAAATATCAAAAGGACACATGGCATATTATTTCATGT	1800

AL354718.10	175072	ATATAACTTTAATAAAATAACATACATATAGAAAACAGATTAGTGATTTC	175121
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	1801	ATATAACTTTAATAAAATAACATACATATAGAAAACAGATTAGTGATTTC	1850

AL354718.10	175122	CAGAGGTTAGTGATGGTATGGGAGTGTGAGATGAATATGGCTATAAAATG	175171
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	1851	CAGAGGTTAGTGATGGTATGGGAGTGTGAGATGAATATGGCTATAAAATG	1900

AL354718.10	175172	TGAGGAAGACACTTTTAGTGATGGAAGAGTTCTGTAACTTAATTGTAATA	175221
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	1901	TGAGGAAGACACTTTTAGTGATGGAAGAGTTCTGTAACTTAATTGTAATA	1950

AL354718.10	175222	ATGGTCACATTAATCAACACGTGATAAAATTGGCATAGACCTATGAATTC	175271
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845472.3	1951	ATGGTCACATTAATCAACACGTGATAAAATTGGCATAGACCTATGAATTC	2000

Overview

Query
AL354718.10 - 175271 bps
Hit
AL845472.3 - 42569 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link