<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL845509.6	1	GGCCACTTTTCAGCACCTACACAGTGCCTGGCACATAGTAGGTGCCCAAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	54748	GGCCACTTTTCAGCACCTACACAGTGCCTGGCACATAGTAGGTGCCCAAT	54797

AL845509.6	51	AAATATTTGTCAGCCATTTGTGGGCAGTGGGGACAATGGATCATAGGGGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	54798	AAATATTTGTCAGCCATTTGTGGGCAGTGGGGACAATGGATCATAGGGGC	54847

AL845509.6	101	ACCCTTTGGAAACCATATATAGGAAAGAACATCTTACATCCCATATGCCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	54848	ACCCTTTGGAAACCATATATAGGAAAGAACATCTTACATCCCATATGCCT	54897

AL845509.6	151	GCAATTCTTGGTTCCAACTTAGGGGTATTTCCACTCCACTCTGCCCTCCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	54898	GCAATTCTTGGTTCCAACTTAGGGGTATTTCCACTCCACTCTGCCCTCCT	54947

AL845509.6	201	GTGGCCTGTCTTATTTTCTGGAGGAGGACTGGGCCTGCCTCATCCTAGCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	54948	GTGGCCTGTCTTATTTTCTGGAGGAGGACTGGGCCTGCCTCATCCTAGCA	54997

AL845509.6	251	TCTTAAACCCTCTTTCCAGAGCTGCAGCTTCTCCACGTGGAAGATGTCTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	54998	TCTTAAACCCTCTTTCCAGAGCTGCAGCTTCTCCACGTGGAAGATGTCTG	55047

AL845509.6	301	CTCTGGTGGGCATACATTCATTTTAGGAGAGAAACTAAACTCACAACCCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	55048	CTCTGGTGGGCATACATTCATTTTAGGAGAGAAACTAAACTCACAACCCT	55097

AL845509.6	351	TCATTTTGGGGGATCCATCTTAAAACCAGGAAGGCCTTCCAGCCTGCCTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	55098	TCATTTTGGGGGATCCATCTTAAAACCAGGAAGGCCTTCCAGCCTGCCTT	55147

AL845509.6	401	TTAATGGGTAATCATTTTTGGAATTCCTCCCTACCATGTATTCTTCTATT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	55148	TTAATGGGTAATCATTTTTGGAATTCCTCCCTACCATGTATTCTTCTATT	55197

AL845509.6	451	TTTTACCCTCTCCTCCTTGGTTTATGGGCATTTCTTGGAGGGCTGGGGGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	55198	TTTTACCCTCTCCTCCTTGGTTTATGGGCATTTCTTGGAGGGCTGGGGGA	55247

AL845509.6	501	CCACAGTCAAGTTGAGGTGATCCCCGCTCCGGGGACGGAGTAAGGCAAGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	55248	CCACAGTCAAGTTGAGGTGATCCCCGCTCCGGGGACGGAGTAAGGCAAGG	55297

AL845509.6	551	AGGCGGGATCGGAATGTTGGAGGCAGAACCGCAAGCTCCCAGGGCCACCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	55298	AGGCGGGATCGGAATGTTGGAGGCAGAACCGCAAGCTCCCAGGGCCACCC	55347

AL845509.6	601	AATCACAGGGCCAGTCATCCGTTGAGACCCTGCCTCCGCGCCCGGCAGCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	55348	AATCACAGGGCCAGTCATCCGTTGAGACCCTGCCTCCGCGCCCGGCAGCC	55397

AL845509.6	651	ACTCCGTATCTTCCTCGCATTATCGCAGGGTTGGGCCGAGGCCCGCGCAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	55398	ACTCCGTATCTTCCTCGCATTATCGCAGGGTTGGGCCGAGGCCCGCGCAT	55447

AL845509.6	701	GCCTGCAGAAAACCTACGGCCGCGAGGGGTCGGGCCTCCTCCTGCTCCTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	55448	GCCTGCAGAAAACCTACGGCCGCGAGGGGTCGGGCCTCCTCCTGCTCCTA	55497

AL845509.6	751	CTCCCGAGAGGCTCCGGCAATGAGAATAGGCCCCGCCCCCCCGCGCAGCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	55498	CTCCCGAGAGGCTCCGGCAATGAGAATAGGCCCCGCCCCCCCGCGCAGCC	55547

AL845509.6	801	AAGTCTACGGACCAAGTCCGAGCCTGCAGACAAGCTCCGCCCCCACGAGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	55548	AAGTCTACGGACCAAGTCCGAGCCTGCAGACAAGCTCCGCCCCCACGAGG	55597

AL845509.6	851	GCCTGCTCCGGCTGACAGCGTCCGGCAGCGCGGCAGAGCCCCGCCCCCAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	55598	GCCTGCTCCGGCTGACAGCGTCCGGCAGCGCGGCAGAGCCCCGCCCCCAT	55647

AL845509.6	901	GCGGGGGCACGCTTACTGACACCGTCCGTGCGCGCGGGAAGGGCCCAGCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	55648	GCGGGGGCACGCTTACTGACACCGTCCGTGCGCGCGGGAAGGGCCCAGCC	55697

AL845509.6	951	TCGCGGCCCGGCGTGGCTTTGTGACGGGCCTCTGGTGGCCCAGCCCCTTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	55698	TCGCGGCCCGGCGTGGCTTTGTGACGGGCCTCTGGTGGCCCAGCCCCTTC	55747

AL845509.6	1001	CAGCAGCGTCAGCAGATCCCAGTGGTTACGTTGGTGAGCGACGTCCGCCG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	55748	CAGCAGCGTCAGCAGATCCCAGTGGTTACGTTGGTGAGCGACGTCCGCCG	55797

AL845509.6	1051	GCGCTAGCCCAGCCTGGTCCCGCAGCTCTCGGGCTGCCCCCAGCCCCAGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	55798	GCGCTAGCCCAGCCTGGTCCCGCAGCTCTCGGGCTGCCCCCAGCCCCAGC	55847

AL845509.6	1101	AGTAGCTGGGCTACTTCCACCGCTCCTTCCCGCGCCGCCAGGAATAGCGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	55848	AGTAGCTGGGCTACTTCCACCGCTCCTTCCCGCGCCGCCAGGAATAGCGG	55897

AL845509.6	1151	CGTCTGCTCCTGTACAGAAGAGCCAGGGCCGATATCAGGGAAGGCCACGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	55898	CGTCTGCTCCTGTACAGAAGAGCCAGGGCCGATATCAGGGAAGGCCACGC	55947

AL845509.6	1201	CCACAGGACTGGGCCTTTCTGCCTTCACTTGCGCGACCACTGGCCCCTAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	55948	CCACAGGACTGGGCCTTTCTGCCTTCACTTGCGCGACCACTGGCCCCTAT	55997

AL845509.6	1251	CCCTTCAGGCTTTGCGGGTTACCGCACTTTCCATCTCTCGTGCGCCTGAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	55998	CCCTTCAGGCTTTGCGGGTTACCGCACTTTCCATCTCTCGTGCGCCTGAC	56047

AL845509.6	1301	TGTTTTGTGGGAAGCCCTCTGTCCCATCTAACCCTGTTGTCCTGGGCATC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	56048	TGTTTTGTGGGAAGCCCTCTGTCCCATCTAACCCTGTTGTCCTGGGCATC	56097

AL845509.6	1351	TTTATCGGCTCCGGCCTGGAGAAGCGAGCGGGCGGCTCGGGCGTTGTTCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	56098	TTTATCGGCTCCGGCCTGGAGAAGCGAGCGGGCGGCTCGGGCGTTGTTCA	56147

AL845509.6	1401	CGGCAGCAGCCCAGTGCAGCGCAGTTTTCCCTAGGGGACGACGTGGGAGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	56148	CGGCAGCAGCCCAGTGCAGCGCAGTTTTCCCTAGGGGACGACGTGGGAGG	56197

AL845509.6	1451	TTGTTACCCCAGTTGGGGGCCAGACGCCTGGGTTCCGGTTTCCCACGGGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	56198	TTGTTACCCCAGTTGGGGGCCAGACGCCTGGGTTCCGGTTTCCCACGGGT	56247

AL845509.6	1501	TCTGGCCTTGGGGGAAGGGCTATTCGGGCCGGCTGGTCCCTCAAAGGCGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	56248	TCTGGCCTTGGGGGAAGGGCTATTCGGGCCGGCTGGTCCCTCAAAGGCGG	56297

AL845509.6	1551	GAAGCGTTGCCCAGGAGACCACCGGCCTGCAGGAAGTGTTGCCCTGGTGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	56298	GAAGCGTTGCCCAGGAGACCACCGGCCTGCAGGAAGTGTTGCCCTGGTGA	56347

AL845509.6	1601	CGTCACCAGTGCGCGGGAGGGACAATGGGGCATTGTTCTGGGGTCGGTGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	56348	CGTCACCAGTGCGCGGGAGGGACAATGGGGCATTGTTCTGGGGTCGGTGA	56397

AL845509.6	1651	GACCGGGAGACAGTCTCCCCCCACGAGATTCCCCCCCCTTTCCACAGACA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	56398	GACCGGGAGACAGTCTCCCCCCACGAGATTCCCCCCCCTTTCCACAGACA	56447

AL845509.6	1701	CTGTGTTCCATGCCAGTTCCCCAGTAAGCTGGAGCGGAGGGCCAGTGTGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	56448	CTGTGTTCCATGCCAGTTCCCCAGTAAGCTGGAGCGGAGGGCCAGTGTGG	56497

AL845509.6	1751	TGTTGAGGGTGGGAGTTGGGGGGGGAAACTCACGCGGCCCGTACTTCCAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	56498	TGTTGAGGGTGGGAGTTGGGGGGGGAAACTCACGCGGCCCGTACTTCCAC	56547

AL845509.6	1801	CGCATCTCAGATTGACCGCCGTAACAGCAGGATGAGAGGGAATGCCCCTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	56548	CGCATCTCAGATTGACCGCCGTAACAGCAGGATGAGAGGGAATGCCCCTC	56597

AL845509.6	1851	TGCTGCACCTATATTTTGCACGCTATCTCCCACCCCATCTGCTCAACTCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	56598	TGCTGCACCTATATTTTGCACGCTATCTCCCACCCCATCTGCTCAACTCT	56647

AL845509.6	1901	CTATAGCATACATCACCCCTTCCTCTACATACCCCATTTATCTCTGGCCC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	56648	CTATAGCATACATCACCCCTTCCTCTACATACCCCATTTATCTCTGGCCC	56697

AL845509.6	1951	CCACGTCTGCTTGGGCTGCAATCAGTTCTTCAACCAGGTCTTCCACCGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845464.5	56698	CCACGTCTGCTTGGGCTGCAATCAGTTCTTCAACCAGGTCTTCCACCGCC	56747

Overview

Query
AL845509.6 - 126404 bps
Hit
AL845464.5 - 56747 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link