<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662832.5	1	GAATTCTCCGGTCTTTTTTTTAACCACTCGAGCAATGGGTTTCCCAACCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	26905	GAATTCTCCGGTCTTTTTTTTAACCACTCGAGCAATGGGTTTCCCAACCC	26954

AL662832.5	51	AGAACTTCTTCCGTGGATACCTAAGAAGATGACATACATAACAAGCTGTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	26955	AGAACTTCTTCCGTGGATACCTAAGAAGATGACATACATAACAAGCTGTT	27004

AL662832.5	101	ACTCAGCTCTTCTTACTTTCCTTCATACTTATCTCTCAATCCTCATGGCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	27005	ACTCAGCTCTTCTTACTTTCCTTCATACTTATCTCTCAATCCTCATGGCA	27054

AL662832.5	151	ATTATGAAGGGGAGAGGAAAGGTATGATTATCCCCAAACAAGTGACAGAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	27055	ATTATGAAGGGGAGAGGAAAGGTATGATTATCCCCAAACAAGTGACAGAA	27104

AL662832.5	201	AAACAGTGGCCCAAAGACACCAGCTGAACCAGGGCTTCAGAACATCAGTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	27105	AAACAGTGGCCCAAAGACACCAGCTGAACCAGGGCTTCAGAACATCAGTA	27154

AL662832.5	251	GACTCCACATCCAGGGCGCTCTGTCTACTAAGCCATGTTTCTAACCTCTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	27155	GACTCCACATCCAGGGCGCTCTGTCTACTAAGCCATGTTTCTAACCTCTC	27204

AL662832.5	301	TGCTCTGTCCCACCTCAAATAAGGCCAGTGGGCCAAGGAGCTGGGGCTAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	27205	TGCTCTGTCCCACCTCAAATAAGGCCAGTGGGCCAAGGAGCTGGGGCTAC	27254

AL662832.5	351	ACAGAGAACTCATAAGGAGGAGAGCAAGTCTCCAGTTCTCAATGATGTGT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	27255	ACAGAGAACTCATAAGGAGGAGAGCAAGTCTCCAGTTCTCAATGATGTGT	27304

AL662832.5	401	CCTGCTCCTCAGAAAGGCATCAGGATGAACCATGGGATGTGAGTACCTCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	27305	CCTGCTCCTCAGAAAGGCATCAGGATGAACCATGGGATGTGAGTACCTCT	27354

AL662832.5	451	GGCACCATACCACTCCCCATGAATTCAAATGCACCTGGTCAGAAGCGGGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	27355	GGCACCATACCACTCCCCATGAATTCAAATGCACCTGGTCAGAAGCGGGG	27404

AL662832.5	501	GAACATAAACAAGGGGGATGAGGTACGCCATGGAGAGGAGACTCTTTTAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	27405	GAACATAAACAAGGGGGATGAGGTACGCCATGGAGAGGAGACTCTTTTAC	27454

AL662832.5	551	CTGTTTAGGAAGTCTCTCGTGTCCTAGAAGGGAAAGAAAAAAGCACAAGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	27455	CTGTTTAGGAAGTCTCTCGTGTCCTAGAAGGGAAAGAAAAAAGCACAAGT	27504

AL662832.5	601	ATCAATATGAATCAAATAAGACTTCAATGCATCTGCACCCAACACTGTAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	27505	ATCAATATGAATCAAATAAGACTTCAATGCATCTGCACCCAACACTGTAG	27554

AL662832.5	651	CAGAGATGGGACATATCAGTGAACAAAACAAATGTGGTCCCTTTTTTATG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	27555	CAGAGATGGGACATATCAGTGAACAAAACAAATGTGGTCCCTTTTTTATG	27604

AL662832.5	701	GAGCTGACATTCCAGTGGGGTCACTGCATAAAACAACAAGAAAACAAACA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	27605	GAGCTGACATTCCAGTGGGGTCACTGCATAAAACAACAAGAAAACAAACA	27654

AL662832.5	751	AAATCGGCACAATGACAGAAGCCACAATGGCTGGGAGATGACATGGGCAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	27655	AAATCGGCACAATGACAGAAGCCACAATGGCTGGGAGATGACATGGGCAA	27704

AL662832.5	801	CCTCTCTGGGAGATACCTGCGCAGAGAATTGACGGATAAGAAGTACTGGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	27705	CCTCTCTGGGAGATACCTGCGCAGAGAATTGACGGATAAGAAGTACTGGC	27754

AL662832.5	851	CGGATGAAGAGAGGTAAGGTAAAACAGGAAAGGGCTTAGTGAGAACGGCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	27755	CGGATGAAGAGAGGTAAGGTAAAACAGGAAAGGGCTTAGTGAGAACGGCA	27804

AL662832.5	901	GAGGCCAGACTGCGCAGGGCTGGATATGCATGGTAAGGAGTTTCACTTTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	27805	GAGGCCAGACTGCGCAGGGCTGGATATGCATGGTAAGGAGTTTCACTTTT	27854

AL662832.5	951	GCTCCACGTACAGTGGAAACCCACCAAGGGTTTCAAGTAGGGGCATGATA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	27855	GCTCCACGTACAGTGGAAACCCACCAAGGGTTTCAAGTAGGGGCATGATA	27904

AL662832.5	1001	TGTGTGATCCGCTCTACATGTGGCTGAGACTGCTGTGTAACCTCCAGAGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	27905	TGTGTGATCCGCTCTACATGTGGCTGAGACTGCTGTGTAACCTCCAGAGT	27954

AL662832.5	1051	CCACTCTCCCCTTCCTCCTTTTAATAATAGAACCCCCGGAGTTATTGCTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	27955	CCACTCTCCCCTTCCTCCTTTTAATAATAGAACCCCCGGAGTTATTGCTG	28004

AL662832.5	1101	GTCAGGCGGCCACCTGGGAAGACTACATTTTCCAGATCCCCTACGACAAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	28005	GTCAGGCGGCCACCTGGGAAGACTACATTTTCCAGATCCCCTACGACAAG	28054

AL662832.5	1151	GTCTGGTCATGAGACTAAGTTCCAGCCAATGGAATGTGATAGAAAGCAAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	28055	GTCTGGTCATGAGACTAAGTTCCAGCCAATGGAATGTGATAGAAAGCAAT	28104

AL662832.5	1201	GACCATAATTCTGGGCATTGTCCTTTAAAAAAAGAAAATTGCTTTCTACT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	28105	GACCATAATTCTGGGCATTGTCCTTTAAAAAAAGAAAATTGCTTTCTACT	28154

AL662832.5	1251	TCCTTTTTACCCCAACTGAATTTTGGACATGGTGGTGGTGAGCCCAACTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	28155	TCCTTTTTACCCCAACTGAATTTTGGACATGGTGGTGGTGAGCCCAACTT	28204

AL662832.5	1301	TGACCACGCAGCAGAGGACAACATCCCTAGAAGCTGGTGGAAGAACCACA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	28205	TGACCACGCAGCAGAGGACAACATCCCTAGAAGCTGGTGGAAGAACCACA	28254

AL662832.5	1351	TGGAAGTAACCCAGTCCCTTGGATAAGCTTATGTACAGCTACTGTGATAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	28255	TGGAAGTAACCCAGTCCCTTGGATAAGCTTATGTACAGCTACTGTGATAG	28304

AL662832.5	1401	CTCTAGACCCTGCACCTCTGAACTGTTAACTGAGGCAGAAATAAACTTCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	28305	CTCTAGACCCTGCACCTCTGAACTGTTAACTGAGGCAGAAATAAACTTCT	28354

AL662832.5	1451	ATTCTGTTTGCGTCACTGTACAGCAGTGAGCCAAAACCCTAAGTGACCAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	28355	ATTCTGTTTGCGTCACTGTACAGCAGTGAGCCAAAACCCTAAGTGACCAC	28404

AL662832.5	1501	TCACTTGGCTGCCCCACAGAGAAGGGACTAAGGAGGCAAGAGGAACATGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	28405	TCACTTGGCTGCCCCACAGAGAAGGGACTAAGGAGGCAAGAGGAACATGG	28454

AL662832.5	1551	GGAGGTTGGTCCGGAGGCTTTTGCCGTGGACCAGGGGAGAGCTAAAGATG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	28455	GGAGGTTGGTCCGGAGGCTTTTGCCGTGGACCAGGGGAGAGCTAAAGATG	28504

AL662832.5	1601	GCCTGAACTAAGGTGGTGGCAGTAGGGAGAAAAAGAGAGAAGCAATACAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	28505	GCCTGAACTAAGGTGGTGGCAGTAGGGAGAAAAAGAGAGAAGCAATACAT	28554

AL662832.5	1651	TCCAGGTATTTTAGAGACAGATTCAACTGGACATACTGGTCAAGGATAAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	28555	TCCAGGTATTTTAGAGACAGATTCAACTGGACATACTGGTCAAGGATAAA	28604

AL662832.5	1701	CAAGAACAGAGCATGGTTTGTACAGGGGGGAGAATGGTGGTGCTATCTCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	28605	CAAGAACAGAGCATGGTTTGTACAGGGGGGAGAATGGTGGTGCTATCTCT	28654

AL662832.5	1751	GTGACAGACAGGTGGTAGGGCAGGGTGAGTGGGAAGAGGGCTATTCTGAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	28655	GTGACAGACAGGTGGTAGGGCAGGGTGAGTGGGAAGAGGGCTATTCTGAG	28704

AL662832.5	1801	ATGCTCAGATTCCCTTTTGTGAGTCAAAAGCCTCCTTAATACCCTGTATT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	28705	ATGCTCAGATTCCCTTTTGTGAGTCAAAAGCCTCCTTAATACCCTGTATT	28754

AL662832.5	1851	AATTGATTTTTGCCTTCCTTTCACTCATTCCACAAATATTTATTAAGTGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	28755	AATTGATTTTTGCCTTCCTTTCACTCATTCCACAAATATTTATTAAGTGC	28804

AL662832.5	1901	TTCCTAGGTACCAGGCACTCATCTAGAAGCCTCAGAACAGTTAAAAAAAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	28805	TTCCTAGGTACCAGGCACTCATCTAGAAGCCTCAGAACAGTTAAAAAAAA	28854

AL662832.5	1951	AAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGACAAATCCCTACTTCTGTAGAGCTGACAT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL845450.3	28855	AAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGACAAATCCCTACTTCTGTAGAGCTGACAT	28904

Overview

Query
AL662832.5 - 161348 bps
Hit
AL845450.3 - 28904 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link