<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX119991.17	1	CATTGTGTTGGATTGTCAATGCAACCCTCTTCTCCCACTGTTTACACACT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	168232	CATTGTGTTGGATTGTCAATGCAACCCTCTTCTCCCACTGTTTACACACT	168281

BX119991.17	51	AATAGCAAGACCACTTGTGAAATGCCAGCACAGGCTTCCAGTATCCGTAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	168282	AATAGCAAGACCACTTGTGAAATGCCAGCACAGGCTTCCAGTATCCGTAG	168331

BX119991.17	101	TTTCAGGTGCTGCACATCTTGTATCTTCACACCATAGACCATTGCCTTTA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	168332	TTTCAGGTGCTGCACATCTTGTATCTTCACACCATAGACCATTGCCTTTA	168381

BX119991.17	151	TATGAAACTAAATATAAAAGTCTAAGGGGGTCAGATCGGAGGACCTTGGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	168382	TATGAAACTAAATATAAAAGTCTAAGGGGGTCAGATCGGAGGACCTTGGG	168431

BX119991.17	201	GGCCATTCAACTGGCCCACAACGATCAATCCACTTTTCAGGAAACTGTTC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	168432	GGCCATTCAACTGGCCCACAACGATCAATCCACTTTTCAGGAAACTGTTC	168481

BX119991.17	251	ATCTAGGAATGCTTGGACCTGACACCCATAATATGGTGGTGCACCATCTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	168482	ATCTAGGAATGCTTGGACCTGACACCCATAATATGGTGGTGCACCATCTT	168531

BX119991.17	301	GCTGGAAAAACTCAGTCAACGTGCCAGCTTCAGTGCATAAAGAGGGAAAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	168532	GCTGGAAAAACTCAGTCAACGTGCCAGCTTCAGTGCATAAAGAGGGAAAA	168581

BX119991.17	351	ACATCATCATGTAGCAATTTCGAATATCCAGTGGTCTCTAGGTTTCCATT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	168582	ACATCATCATGTAGCAATTTCGAATATCCAGTGGTCTCTAGGTTTCCATT	168631

BX119991.17	401	GATGAAGAATTTTCCCACTAACTTTGTTGTCTATGGTGTGAAGATACAAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	168632	GATGAAGAATTTTCCCACTAACTTTGTTGTCTATGGTGTGAAGATACAAG	168681

BX119991.17	451	ACGTGCAGCACCTGAAACTACAGATACCATGGTGGAATGAACAGCCAACT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	168682	ACGTGCAGCACCTGAAACTACAGATACCATGGTGGAATGAACAGCCAACT	168731

BX119991.17	501	ATTCCAGCATATGTTTTTACGCAGCAAATGCCCTTCCAGCCACAACCCAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	168732	ATTCCAGCATATGTTTTTACGCAGCAAATGCCCTTCCAGCCACAACCCAG	168781

BX119991.17	551	TACTGGGAAACATTCAATTCAATTAAATTCGATTCAGCTTTATTTGTATA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	168782	TACTGGGAAACATTCAATTCAATTAAATTCGATTCAGCTTTATTTGTATA	168831

BX119991.17	601	GCGCTTTTACAATGTAGATTGTGTCAAAGCAGCTTCACATAAATGGTCAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	168832	GCGCTTTTACAATGTAGATTGTGTCAAAGCAGCTTCACATAAATGGTCAT	168881

BX119991.17	651	AGTAACTGGAACAGTGTAGTTCAGTTTTTTTTGTGTAAAAACATCCATAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	168882	AGTAACTGGAACAGTGTAGTTCAGTTTTTTTTGTGTAAAAACATCCATAC	168931

BX119991.17	701	ACACACACTCATACACTATGGCCTATTTAGTTTATTACACAGCTTGTCTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	168932	ACACACACTCATACACTATGGCCTATTTAGTTTATTACACAGCTTGTCTT	168981

BX119991.17	751	TGGACTGTGGGGGAAACCCATGCAAACATGTGGAGATGCTGCAAACTCCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	168982	TGGACTGTGGGGGAAACCCATGCAAACATGTGGAGATGCTGCAAACTCCA	169031

BX119991.17	801	CATAGAAATGCCAACTAGCCCAGCCCTATTTGCTGTGAGCTGACAGTGCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	169032	CATAGAAATGCCAACTAGCCCAGCCCTATTTGCTGTGAGCTGACAGTGCT	169081

BX119991.17	851	AACCACTGAGCCACCGTGCTGCTATAAAAATATACATGTTACGTATATGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	169082	AACCACTGAGCCACCGTGCTGCTATAAAAATATACATGTTACGTATATGA	169131

BX119991.17	901	CTTTTTCATGCTTTGAAGATAGGACAGTAGAGATAGTAAATTTGATATTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	169132	CTTTTTCATGCTTTGAAGATAGGACAGTAGAGATAGTAAATTTGATATTT	169181

BX119991.17	951	TAAAGAATATTTACACAGTATAATCCTCAAAGTACATATTACTTTAGTCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	169182	TAAAGAATATTTACACAGTATAATCCTCAAAGTACATATTACTTTAGTCT	169231

BX119991.17	1001	GTACGACCAAAAATCTATTTTGTGTTTTTTTCTCATGTATCTGTATCTTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	169232	GTACGACCAAAAATCTATTTTGTGTTTTTTTCTCATGTATCTGTATCTTT	169281

BX119991.17	1051	TTTAGATACATGTTCAGCATCTGCGTGCACATTTATCTGCATCTGCTGTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	169282	TTTAGATACATGTTCAGCATCTGCGTGCACATTTATCTGCATCTGCTGTT	169331

BX119991.17	1101	ATCATCCATCTGCTGTTATCCTTAATCAAATTTGGTTCGGTTTTACAGTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	169332	ATCATCCATCTGCTGTTATCCTTAATCAAATTTGGTTCGGTTTTACAGTC	169381

BX119991.17	1151	CTTTTCAGACTGCAACTTAAATCTTTATTTTGTTTACATCTACATGTTGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	169382	CTTTTCAGACTGCAACTTAAATCTTTATTTTGTTTACATCTACATGTTGA	169431

BX119991.17	1201	ATATATCATTTACTGCAGAGGCATTGCAGATAATCAGTCTGCTTTGGTCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	169432	ATATATCATTTACTGCAGAGGCATTGCAGATAATCAGTCTGCTTTGGTCT	169481

BX119991.17	1251	GACATTAACGTGATTTTTCCAGAAACTATTAATTATTTTCACAGATTCAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	169482	GACATTAACGTGATTTTTCCAGAAACTATTAATTATTTTCACAGATTCAA	169531

BX119991.17	1301	GTCACAAACTCTCACTAGATGGGAAGTTAATTGTAAATCACAATGTCTAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	169532	GTCACAAACTCTCACTAGATGGGAAGTTAATTGTAAATCACAATGTCTAC	169581

BX119991.17	1351	AATATAATATGACTTAAAAAGACTTGAGATCACAATTATGGTGTTTTGTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	169582	AATATAATATGACTTAAAAAGACTTGAGATCACAATTATGGTGTTTTGTT	169631

BX119991.17	1401	CAATCTTTTTGGGCGGCATGGTGGCTCAATGGTTTGAGTCCCGGCTGTAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	169632	CAATCTTTTTGGGCGGCATGGTGGCTCAATGGTTTGAGTCCCGGCTGTAC	169681

BX119991.17	1451	CAGTTGGCATTTTTGTGTGGAGATTGCACGTTGTCCCTGTATTGGCATGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	169682	CAGTTGGCATTTTTGTGTGGAGATTGCACGTTGTCCCTGTATTGGCATGT	169731

BX119991.17	1501	GTTTCTTCTGGGTGCTCTTGTTTCCCCACAGTTCAAAGGCATGCGGTATA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	169732	GTTTCTTCTGGGTGCTCTTGTTTCCCCACAGTTCAAAGGCATGCGGTATA	169781

BX119991.17	1551	GATGAACTGAATAAACTGTGAATTTGAGAGTGTATAGGTGTTTCCCAGTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	169782	GATGAACTGAATAAACTGTGAATTTGAGAGTGTATAGGTGTTTCCCAGTG	169831

BX119991.17	1601	TTGGGTTGCAGCTGGAAGGTCATCCGCTGCGTGAAACATATGCTGAATAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	169832	TTGGGTTGCAGCTGGAAGGTCATCCGCTGCGTGAAACATATGCTGAATAA	169881

BX119991.17	1651	GTTGGTGGTTCATTCCGCTGTGGCGGCCCCTGATGAATAAAGGAATTAAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	169882	GTTGGTGGTTCATTCCGCTGTGGCGGCCCCTGATGAATAAAGGAATTAAG	169931

BX119991.17	1701	CCGAAGGAAAATGAATGATTGAATGAATCATTTATCAGCTGTTACGTGGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	169932	CCGAAGGAAAATGAATGATTGAATGAATCATTTATCAGCTGTTACGTGGA	169981

BX119991.17	1751	AAACGTGTTTCATAAGCAAATAAAATAACAGAATACAAGTTTGGAAAAAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	169982	AAACGTGTTTCATAAGCAAATAAAATAACAGAATACAAGTTTGGAAAAAC	170031

BX119991.17	1801	ATGAGGGTGGATAAATAATGACATAAGTTTCATTCTTGGCAAAAAAACCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	170032	ATGAGGGTGGATAAATAATGACATAAGTTTCATTCTTGGCAAAAAAACCT	170081

BX119991.17	1851	TCAGTAAATGAGATAAAATATAGTGAGAAAAGGACATTACCATAATGCTA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	170082	TCAGTAAATGAGATAAAATATAGTGAGAAAAGGACATTACCATAATGCTA	170131

BX119991.17	1901	ATCGGTGGAAAGTCACTCTCGGTGACTCACGTAACGGTTGTCTTGTTTGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	170132	ATCGGTGGAAAGTCACTCTCGGTGACTCACGTAACGGTTGTCTTGTTTGT	170181

BX119991.17	1951	TTTGCATCGCATCCCTTATTTTACACCTACTTGCTATTCTTCATGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL807377.10	170182	TTTGCATCGCATCCCTTATTTTACACCTACTTGCTATTCTTCATGAATTC	170231

Overview

Query
BX119991.17 - 101348 bps
Hit
AL807377.10 - 170231 bps
Total alignments
20
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100196220001200011682321702311
294.361621957469374887-119013192071
388.5522836957276095-119457198141
488.422243569607296427-119457198101
584.441513419517695516119459198181
686.391091932651926711120567207571
792.74941309517995308134443345661
887.483014965438954884139329398231
992.07891648726187424145444456071
1082.261443269318693511165252655781
1183.031032299328493512-179883801061
1280.8513445049615410-182632830801
1387.021462921723817529-182796830801
1484.771453015454354843-186451867391
1588.96175299172351753311054741057721
1692991502605026199-11055251056741
1790.811231853454134725-11055771057611
1884.66982372581226048-11057391059791
1986.991282481729117538-11181361183811
2087.3102182345423472311181531183331
Short-link