<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL845446.7	1	CCTCATGAAGGATAAGATCCTCAAAAAGAGGACCAACAAGTTCATGAGGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	104729	CCTCATGAAGGATAAGATCCTCAAAAAGAGGACCAACAAGTTCATGAGGC	104778

AL845446.7	51	ACCAATCAGACTGAAATGTCAAAATTAAGCATAACTGGCGGAAACCCAGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	104779	ACCAATCAGACTGAAATGTCAAAATTAAGCATAACTGGCGGAAACCCAGA	104828

AL845446.7	101	GGTCTTAACAGTAGGGTTCGTAGAAGGTCCAAGGGCCAGATCTTGATGCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	104829	GGTCTTAACAGTAGGGTTCGTAGAAGGTCCAAGGGCCAGATCTTGATGCC	104878

AL845446.7	151	CAACATTGCTTATGGGAGCAACAACAACAACAAAAAAAACATGCTGCCCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	104879	CAACATTGCTTATGGGAGCAACAACAACAACAAAAAAAACATGCTGCCCA	104928

AL845446.7	201	GTGGCTTCCAGAAGTTTCTGGTCCACAGCCTCAAGGAGCTGAAAGTGCTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	104929	GTGGCTTCCAGAAGTTTCTGGTCCACAGCCTCAAGGAGCTGAAAGTGCTG	104978

AL845446.7	251	CTGATGTGCAACAAATCTTACTGTGCTGAGATCGCTCACAAAATTTCCTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	104979	CTGATGTGCAACAAATCTTACTGTGCTGAGATCGCTCACAAAATTTCCTC	105028

AL845446.7	301	CAGAACTGCAAAGTCATCATGGAAAGAGTCACCCAGCCGGCCATCAGAGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	105029	CAGAACTGCAAAGTCATCATGGAAAGAGTCACCCAGCCGGCCATCAGAGT	105078

AL845446.7	351	CACCAACCCCAGTACCAGGGTGCACAGCTAAGAAAATGAGTAGAAAGTTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	105079	CACCAACCCCAGTACCAGGGTGCACAGCTAAGAAAATGAGTAGAAAGTTC	105128

AL845446.7	401	ATGTCCACGTTTTGTGTGTAAATAAAACCATAAAAACTGCCAAAAAAAAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	105129	ATGTCCACGTTTTGTGTGTAAATAAAACCATAAAAACTGCCAAAAAAAAT	105178

AL845446.7	451	TACATCAATGCCTCTAAACCCAAAGGACTCTACCCCCACAGGTCCCTGGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	105179	TACATCAATGCCTCTAAACCCAAAGGACTCTACCCCCACAGGTCCCTGGT	105228

AL845446.7	501	TGTTGTGGTGATTTTCATTGTGTAAAATACTTTCCACATCTTTTGACACC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	105229	TGTTGTGGTGATTTTCATTGTGTAAAATACTTTCCACATCTTTTGACACC	105278

AL845446.7	551	AAGTCTTTCTGCAGCCATGTTTGAAAATTAACTTTCAGGCTACAGAGTCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	105279	AAGTCTTTCTGCAGCCATGTTTGAAAATTAACTTTCAGGCTACAGAGTCT	105328

AL845446.7	601	TTCTTATACCAAAGTTGAAGAAAGTTTTAAGAAATATATTTCTACATCTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	105329	TTCTTATACCAAAGTTGAAGAAAGTTTTAAGAAATATATTTCTACATCTC	105378

AL845446.7	651	CTACATGCAAAACAACAGGAGCAAGTTGAGGAATTCTCAAGAAACTGGTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	105379	CTACATGCAAAACAACAGGAGCAAGTTGAGGAATTCTCAAGAAACTGGTC	105428

AL845446.7	701	GAGAAGAGAGAGCGCTTAGCTATGGAAAAGAGAAAGAAGGAAGGGAGGGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	105429	GAGAAGAGAGAGCGCTTAGCTATGGAAAAGAGAAAGAAGGAAGGGAGGGC	105478

AL845446.7	751	TTCCTGGAGGAGGTGGCATTTGAACCAGGACTGACATCAGGATGGAAATG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	105479	TTCCTGGAGGAGGTGGCATTTGAACCAGGACTGACATCAGGATGGAAATG	105528

AL845446.7	801	TCAGTCAGGGAGTTAAGTAGGGGGAGCAGCTCCGCCCTCCACGTCCCCAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	105529	TCAGTCAGGGAGTTAAGTAGGGGGAGCAGCTCCGCCCTCCACGTCCCCAG	105578

AL845446.7	851	CTCCTCCCGCCCCTGTTTTTTCTCCCAGTGACCCCACGTGAAACGTCTCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	105579	CTCCTCCCGCCCCTGTTTTTTCTCCCAGTGACCCCACGTGAAACGTCTCC	105628

AL845446.7	901	GCCTCCTCCAGCCACCAGCAGAAGGGACTGCCTTCCCCTCAGTGCTCGCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	105629	GCCTCCTCCAGCCACCAGCAGAAGGGACTGCCTTCCCCTCAGTGCTCGCC	105678

AL845446.7	951	CCTCCCTAGTGATCACTCAGTGCCCCTGAGCTCATTCTTTTCAGTAAATT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	105679	CCTCCCTAGTGATCACTCAGTGCCCCTGAGCTCATTCTTTTCAGTAAATT	105728

AL845446.7	1001	CTCTCTCTGCGTGGTGAGAAAACAGGCCTGGAGAGGCTCTGCGACCCGCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	105729	CTCTCTCTGCGTGGTGAGAAAACAGGCCTGGAGAGGCTCTGCGACCCGCT	105778

AL845446.7	1051	TAGGACCACAGAACTCGGTACTAGGAAAACTCCTATTTTAAAATCCAGCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	105779	TAGGACCACAGAACTCGGTACTAGGAAAACTCCTATTTTAAAATCCAGCC	105828

AL845446.7	1101	CTGGGTGGGAAGATTTGGGAAGAATCGTTAATATTGAGAGAGAGAGGGAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	105829	CTGGGTGGGAAGATTTGGGAAGAATCGTTAATATTGAGAGAGAGAGGGAG	105878

AL845446.7	1151	AAAGAGGATTAGATGAGAGTGGCGCCTCCGCTCATGTCCGCCCCCTCCCC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	105879	AAAGAGGATTAGATGAGAGTGGCGCCTCCGCTCATGTCCGCCCCCTCCCC	105928

AL845446.7	1201	GCAGAGAATTACCTTTTCCAGGGACGGCAGGAATGCTACGCGTTTAATGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	105929	GCAGAGAATTACCTTTTCCAGGGACGGCAGGAATGCTACGCGTTTAATGG	105978

AL845446.7	1251	GACACAGCGCTTCCTGGAGAGATACATCTACAACCGGGAGGAGCTCGTGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	105979	GACACAGCGCTTCCTGGAGAGATACATCTACAACCGGGAGGAGCTCGTGC	106028

AL845446.7	1301	GCTTCGACAGCGACGTGGGGGAGTTCCGGGCGGTGACGGAGCTGGGGCGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	106029	GCTTCGACAGCGACGTGGGGGAGTTCCGGGCGGTGACGGAGCTGGGGCGG	106078

AL845446.7	1351	CCTGAGGCGGAGTACTGGAACAGCCAGAAGGACATCCTGGAGGAGGAGCG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	106079	CCTGAGGCGGAGTACTGGAACAGCCAGAAGGACATCCTGGAGGAGGAGCG	106128

AL845446.7	1401	GGCAGTGCCGGACAGGATGTGCAGACACAACTACGAGCTGGGCGGGCCCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	106129	GGCAGTGCCGGACAGGATGTGCAGACACAACTACGAGCTGGGCGGGCCCA	106178

AL845446.7	1451	TGACCCTGCAGCGCCGAGGTGAGTGAGGGCTTTGGGCCGGCGGTCCCAGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	106179	TGACCCTGCAGCGCCGAGGTGAGTGAGGGCTTTGGGCCGGCGGTCCCAGG	106228

AL845446.7	1501	GCAGCCCCGCGGGCCCGTGCCCAGGGCGCAGGAGCAGCCGGGTTGGCCTA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	106229	GCAGCCCCGCGGGCCCGTGCCCAGGGCGCAGGAGCAGCCGGGTTGGCCTA	106278

AL845446.7	1551	AGGGACCTTAGTGCCGGGCGGAAAGGGGACTTTGGGTTGGGGATTCATGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	106279	AGGGACCTTAGTGCCGGGCGGAAAGGGGACTTTGGGTTGGGGATTCATGG	106328

AL845446.7	1601	GGGGAGCCCATCTGGAGCTTGTCAGGGGAGCGAGCGCGGGGACCTGGACT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	106329	GGGGAGCCCATCTGGAGCTTGTCAGGGGAGCGAGCGCGGGGACCTGGACT	106378

AL845446.7	1651	GGGCTGAGCATGGAGTGAGGAGGACGAGAGCAGAGAGACCCCCGGGACTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	106379	GGGCTGAGCATGGAGTGAGGAGGACGAGAGCAGAGAGACCCCCGGGACTT	106428

AL845446.7	1701	CATCAGGCCTGGCAGCTGACTGCATGTGGGGTGAAAAAAGGAAGCCACAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	106429	CATCAGGCCTGGCAGCTGACTGCATGTGGGGTGAAAAAAGGAAGCCACAG	106478

AL845446.7	1751	GACAGCGCACAAGGGTATGGTGTGGAGATGGAGGTGGAGATGGCACAGCA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	106479	GACAGCGCACAAGGGTATGGTGTGGAGATGGAGGTGGAGATGGCACAGCA	106528

AL845446.7	1801	GGCCACACAGAGAAGAAACCTACAGGGAGGTAGCTGGGTTTGAGGTGCTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	106529	GGCCACACAGAGAAGAAACCTACAGGGAGGTAGCTGGGTTTGAGGTGCTT	106578

AL845446.7	1851	GAGGGGCAGATGGGTGGTCTGATGGGCAGGTAGACAGAAGGGTCTGCAGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	106579	GAGGGGCAGATGGGTGGTCTGATGGGCAGGTAGACAGAAGGGTCTGCAGC	106628

AL845446.7	1901	CGGGGAGGAGACTGAGATACATGAGACCATCCAGGGAGAGGGGACCCAGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	106629	CGGGGAGGAGACTGAGATACATGAGACCATCCAGGGAGAGGGGACCCAGG	106678

AL845446.7	1951	GGGAAGAGCAAAGGACCGGATCCTGGGAACTGGACAGTTGTGATTTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL805913.4	106679	GGGAAGAGCAAAGGACCGGATCCTGGGAACTGGACAGTTGTGATTTGGCC	106728

Overview

Query
AL845446.7 - 93842 bps
Hit
AL805913.4 - 106728 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link