<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2007 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX322232.4	1995	AAGCTTCTGAACTCTGGTACTGCCCCGATGGGAGCTTTGTCAAAAAGATC	2044
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	1	AAGCTTCTGAACTCTGGTACTGCCCCGATGGGAGCTTTGTCAAAAAGATC	50

BX322232.4	2045	CTAATCCATGGCCACGGCTTGGACAAACCCAAGCTGGGCTCCCGCTGCCG	2094
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	51	CTAATCCATGGCCACGGCTTGGACAAACCCAAGCTGGGCTCCCGCTGCCG	100

BX322232.4	2095	GGTACAGGTTTTGGGATTTCCTTTGGGGTCAGGGCTGCCAGAGGGCTGGA	2144
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	101	GGTACAGGTTTTGGGATTTCCTTTGGGGTCAGGGCTGCCAGAGGGCTGGA	150

BX322232.4	2145	CAGAGCTAACTATGGGGTTAGGCCCATGGAGGGAGGAAACTTGGGGAGAG	2194
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	151	CAGAGCTAACTATGGGGTTAGGCCCATGGAGGGAGGAAACTTGGGGAGAG	200

BX322232.4	2195	CTTGTAGAGAAGTGCTTGGAGTCCATGTGTCAAGGTGAGGAGGCAGAACT	2244
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	201	CTTGTAGAGAAGTGCTTGGAGTCCATGTGTCAAGGTGAGGAGGCAGAACT	250

BX322232.4	2245	TCAGCTCCCTGGGCGCTCTGGACCTCCTGTCAGGCTCAAACTGGCCTCCT	2294
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	251	TCAGCTCCCTGGGCGCTCTGGACCTCCTGTCAGGCTCAAACTGGCCTCCT	300

BX322232.4	2295	TCACTCAAGGCCGGGACTCCTGGGAGCTAGAGCCCACCGAAAAGGAGGCC	2344
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	301	TCACTCAAGGCCGGGACTCCTGGGAGCTAGAGCCCACCGAAAAGGAGGCC	350

BX322232.4	2345	CTGGCCAGGGAAGAACGTGCACGGGGCACAGAATTATTTAGAGCTGGGAA	2394
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	351	CTGGCCAGGGAAGAACGTGCACGGGGCACAGAATTATTTAGAGCTGGGAA	400

BX322232.4	2395	CCCTGAAGGGGCTGCCCGATGCTATGGACGGGCTCTTCGGCTGCTGCTGA	2444
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	401	CCCTGAAGGGGCTGCCCGATGCTATGGACGGGCTCTTCGGCTGCTGCTGA	450

BX322232.4	2445	CTTTACCTCCACCTGGCTCTCCAGAACGAACTGTCCTTCATGCCAATCTG	2494
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	451	CTTTACCTCCACCTGGCTCTCCAGAACGAACTGTCCTTCATGCCAATCTG	500

BX322232.4	2495	GCTGCCTGTCAGTTGCTGCTAGGGCAGCCCCATTTGGCAGCCCAGAGCTG	2544
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	501	GCTGCCTGTCAGTTGCTGCTAGGGCAGCCCCATTTGGCAGCCCAGAGCTG	550

BX322232.4	2545	TGACCGGGTGCTGGAGCGGGAGCCTGGCCATTTAAAGGCCTTGTACCGAA	2594
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	551	TGACCGGGTGCTGGAGCGGGAGCCTGGCCATTTAAAGGCCTTGTACCGAA	600

BX322232.4	2595	GGGGGGTTGCCCAGGCTGCTCTTGGGAACCTGGACAAAGCAACTGCTGAC	2644
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	601	GGGGGGTTGCCCAGGCTGCTCTTGGGAACCTGGACAAAGCAACTGCTGAC	650

BX322232.4	2645	CTCAAGAAAGTGCTGGCAGTAGACCCCAAAAATCGGGCAGCCCAGGAGGA	2694
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	651	CTCAAGAAAGTGCTGGCAGTAGACCCCAAAAATCGGGCAGCCCAGGAGGA	700

BX322232.4	2695	GCTGGGAAAGGTGATCATTCAAGGGAAGAAACAAGATGCAGGACTGGCTC	2744
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	701	GCTGGGAAAGGTGATCATTCAAGGGAAGAAACAAGATGCAGGACTGGCTC	750

BX322232.4	2745	AGGGACTGCGCAAGATGTTTGGCTAATTAAAAGTTAAACCTTAAAAGAGA	2794
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	751	AGGGACTGCGCAAGATGTTTGGCTAATTAAAAGTTAAACCTTAAAAGAGA	800

BX322232.4	2795	CAGGAACCTGTGAATTGTGGTCTATGTTGTGAGTTTTGGGGGGAGGGGCC	2844
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	801	CAGGAACCTGTGAATTGTGGTCTATGTTGTGAGTTTTGGGGGGAGGGGCC	850

BX322232.4	2845	AGTGGGAGGATTTCACCCACATACTTTTACCAGCTTTTGCCTTCCTAGGG	2894
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	851	AGTGGGAGGATTTCACCCACATACTTTTACCAGCTTTTGCCTTCCTAGGG	900

BX322232.4	2895	AAGGTAGCAGTGGTCTTAGTGTATGTACCTCTTTACCGTTTTACCATGAA	2944
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	901	AAGGTAGCAGTGGTCTTAGTGTATGTACCTCTTTACCGTTTTACCATGAA	950

BX322232.4	2945	AAAGCCTTATGGTCACGTGTGGTATATTTTGCGGGGCTTATCTATCTCCA	2994
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	951	AAAGCCTTATGGTCACGTGTGGTATATTTTGCGGGGCTTATCTATCTCCA	1000

BX322232.4	2995	AAGATGAACACAAGCTATCTAAACTTCTAAATTCAGTACTGTTTGGGGGA	3044
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	1001	AAGATGAACACAAGCTATCTAAACTTCTAAATTCAGTACTGTTTGGGGGA	1050

BX322232.4	3045	GACGGCGAACCTTCAAAACCCGGTACCTACGTTTCCTAGGCGCTTTCAGG	3094
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	1051	GACGGCGAACCTTCAAAACCCGGTACCTACGTTTCCTAGGCGCTTTCAGG	1100

BX322232.4	3095	CTGGGTCCGGCTTGGCGCACGCGCAAACTTCACTGCCTGGTATTGCGGAG	3144
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	1101	CTGGGTCCGGCTTGGCGCACGCGCAAACTTCACTGCCTGGTATTGCGGAG	1150

BX322232.4	3145	GTGCTAGCCTCCGGGGCGCTCGTATTGGCCGGTCCTGTACAGCCACCGCC	3194
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	1151	GTGCTAGCCTCCGGGGCGCTCGTATTGGCCGGTCCTGTACAGCCACCGCC	1200

BX322232.4	3195	TCTATTGTCTCACGTGCTCAATACCCAGGTCTCTTACTGGTTGGGAGAGC	3244
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	1201	TCTATTGTCTCACGTGCTCAATACCCAGGTCTCTTACTGGTTGGGAGAGC	1250

BX322232.4	3245	TTCCGGGGCGTTCCCCCACTTTTGAGGAGCCAGCCGATTAGTTGATGATG	3294
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	1251	TTCCGGGGCGTTCCCCCACTTTTGAGGAGCCAGCCGATTAGTTGATGATG	1300

BX322232.4	3295	GGAGAGGCGGGCCTTGGGAACTGTCTCGTGGTTGGGGGGTGGGGGGGAAA	3344
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	1301	GGAGAGGCGGGCCTTGGGAACTGTCTCGTGGTTGGGGGGTGGGGGGGAAA	1350

BX322232.4	3345	GATGGCGGAGCTGATGCTCCTCAGCGAGATTGCGGACCCGACGCGTTTTT	3394
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	1351	GATGGCGGAGCTGATGCTCCTCAGCGAGATTGCGGACCCGACGCGTTTTT	1400

BX322232.4	3395	TCACCGACAACTTGCTGAGCCCGGAGGACTGGGGTGTGCGGAGTGAGGCC	3444
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	1401	TCACCGACAACTTGCTGAGCCCGGAGGACTGGGGTGTGCGGAGTGAGGCC	1450

BX322232.4	3445	TCGGGGAGGGGAGGGGGCTGTGGCATATTGTGCCCCTGAGGCACGCAGGA	3494
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	1451	TCGGGGAGGGGAGGGGGCTGTGGCATATTGTGCCCCTGAGGCACGCAGGA	1500

BX322232.4	3495	GGAAGCGGAGGCCCAAAGAGGAAGGCTGGACAGATACGGAATCCATCATT	3544
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	1501	GGAAGCGGAGGCCCAAAGAGGAAGGCTGGACAGATACGGAATCCATCATT	1550

BX322232.4	3545	CTGAGGAAGGCGGAACAGGGGGGCTGGTGGTGCTTTCGGGGAGATGCGGG	3594
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	1551	CTGAGGAAGGCGGAACAGGGGGGCTGGTGGTGCTTTCGGGGAGATGCGGG	1600

BX322232.4	3595	AGTTGGGGCAGACCTCCCCTCCCTGCGGAAATATGGAGTTGTTCCGGGGT	3644
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	1601	AGTTGGGGCAGACCTCCCCTCCCTGCGGAAATATGGAGTTGTTCCGGGGT	1650

BX322232.4	3645	CGGGGAAGGAGGGGCTGGAGTTCTCTGGCTGGATCACTTTTCAAGTGGGC	3694
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	1651	CGGGGAAGGAGGGGCTGGAGTTCTCTGGCTGGATCACTTTTCAAGTGGGC	1700

BX322232.4	3695	GGGCGGTGGATCTGGCCGCGCAGAGGCAGTGAGCGACGGGGCGAGGGCTG	3744
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	1701	GGGCGGTGGATCTGGCCGCGCAGAGGCAGTGAGCGACGGGGCGAGGGCTG	1750

BX322232.4	3745	TTGTGGGGTTCCGAAGGCTGCGCTAGCGGACGACTCCGCTGACCCTCCGC	3794
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	1751	TTGTGGGGTTCCGAAGGCTGCGCTAGCGGACGACTCCGCTGACCCTCCGC	1800

BX322232.4	3795	CCCTCTTGCAGACAGCACCTTGTACGCCGGCCTGGATGAAGTGGCCGAGG	3844
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	1801	CCCTCTTGCAGACAGCACCTTGTACGCCGGCCTGGATGAAGTGGCCGAGG	1850

BX322232.4	3845	AGCCGACGCAGCTTTTCCGTTGCCCGGAGGAAGATGTCCCGGTATCGCTC	3894
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	1851	AGCCGACGCAGCTTTTCCGTTGCCCGGAGGAAGATGTCCCGGTATCGCTC	1900

BX322232.4	3895	CCCGGGCCTTGGCCTTGACTCTTACCCTTGGTGGGTGGAAGTGGTCTCAG	3944
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	1901	CCCGGGCCTTGGCCTTGACTCTTACCCTTGGTGGGTGGAAGTGGTCTCAG	1950

BX322232.4	3945	AACTGGGGCTTATCCCCAGGCCAGAGCTCATCCGGAGCCATCCCTTCAGC	3994
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773560.9	1951	AACTGGGGCTTATCCCCAGGCCAGAGCTCATCCGGAGCCATCCCTTCAGC	2000

BX322232.4	3995	CTCACAC	4001
			|||||||
AL773560.9	2001	CTCACAC	2007

Overview

Query
BX322232.4 - 4001 bps
Hit
AL773560.9 - 107413 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2007 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link