<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX664727.7	1	AGGGGAAAAAAGGCCATTCTAATCATTCTGTTGTTTCCATGGACTCACTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	163887	AGGGGAAAAAAGGCCATTCTAATCATTCTGTTGTTTCCATGGACTCACTT	163936

BX664727.7	51	GCTGTATTATTGCCATTATAACCGGTCCTGCAATCTGATAATGATTGACC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	163937	GCTGTATTATTGCCATTATAACCGGTCCTGCAATCTGATAATGATTGACC	163986

BX664727.7	101	TTTGCCACCAGGATGCCTTCACTGATTCAGACCCCTCAGTTTTCATGGTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	163987	TTTGCCACCAGGATGCCTTCACTGATTCAGACCCCTCAGTTTTCATGGTG	164036

BX664727.7	151	ATTCATATATAGAGGTCAAAGCTACGGTGTTTATTAGTTTATGTACTTGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	164037	ATTCATATATAGAGGTCAAAGCTACGGTGTTTATTAGTTTATGTACTTGT	164086

BX664727.7	201	GCTCAGTCATTGTTCCCAGCACCCTGCTCTGGCAGCTAGGCCTCCTAGCT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	164087	GCTCAGTCATTGTTCCCAGCACCCTGCTCTGGCAGCTAGGCCTCCTAGCT	164136

BX664727.7	251	TTATCCACACAAATATTGAGCAAGTTGATGCTCACCCTACACTAAAAACC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	164137	TTATCCACACAAATATTGAGCAAGTTGATGCTCACCCTACACTAAAAACC	164186

BX664727.7	301	TTATTTGGAGCCCACGTCTTAGCTAGACTTTGCCTAGGCCTTCGTGGTAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	164187	TTATTTGGAGCCCACGTCTTAGCTAGACTTTGCCTAGGCCTTCGTGGTAT	164236

BX664727.7	351	GTTATCCTTTGAGAGCCATGTTTGTCTTTCCTTTAACCAATATTAGTTGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	164237	GTTATCCTTTGAGAGCCATGTTTGTCTTTCCTTTAACCAATATTAGTTGG	164286

BX664727.7	401	GATTGTTCTCAATAGTCAGGGATGTTCAAATAATGTTGCAGGAAGAGATC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	164287	GATTGTTCTCAATAGTCAGGGATGTTCAAATAATGTTGCAGGAAGAGATC	164336

BX664727.7	451	AGAGTTCCCTGTCTCTTTTGCTATCAGATCTGTACCTTGAGGCTTTTTTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	164337	AGAGTTCCCTGTCTCTTTTGCTATCAGATCTGTACCTTGAGGCTTTTTTA	164386

BX664727.7	501	TATCCTGTGCAGCAGCTTTGGTTAGATAGCGGAATGTTCCATGTTATCTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	164387	TATCCTGTGCAGCAGCTTTGGTTAGATAGCGGAATGTTCCATGTTATCTT	164436

BX664727.7	551	TCCACTGAGTAGTGGGAACCAGCTTGCAGTTGGCCCCTCAAGTAATGTGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	164437	TCCACTGAGTAGTGGGAACCAGCTTGCAGTTGGCCCCTCAAGTAATGTGT	164486

BX664727.7	601	CTCTATAATCATGAAAATCTCCTGGGCTACTTGCAGCTCTTCCTCAAGTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	164487	CTCTATAATCATGAAAATCTCCTGGGCTACTTGCAGCTCTTCCTCAAGTT	164536

BX664727.7	651	TTCAATATATTTTAAAATTCTACCTCACAGGAAGCCATTCAATAAAATTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	164537	TTCAATATATTTTAAAATTCTACCTCACAGGAAGCCATTCAATAAAATTC	164586

BX664727.7	701	TCTGAATCTGAAGTAAGTGAGTTGGATTTAATAGAGCTAAGCCTCATCCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	164587	TCTGAATCTGAAGTAAGTGAGTTGGATTTAATAGAGCTAAGCCTCATCCA	164636

BX664727.7	751	TGACTCATGAATATCCATGTATCAAACAGGGCTTTGTACTTATTTCAACA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	164637	TGACTCATGAATATCCATGTATCAAACAGGGCTTTGTACTTATTTCAACA	164686

BX664727.7	801	GCACATATTTTAAAATTGGATCAATACAGAGCAGATAAGCATGGCTACTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	164687	GCACATATTTTAAAATTGGATCAATACAGAGCAGATAAGCATGGCTACTG	164736

BX664727.7	851	CCTAGGGATGGCACACAAATTCAGAAAACATTCCATATTTTGCCTAGTCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	164737	CCTAGGGATGGCACACAAATTCAGAAAACATTCCATATTTTGCCTAGTCC	164786

BX664727.7	901	CAGGAAGGCCATTTGACTATTTGTTGAGTAGCTCCAAGGAAGCAGTGTGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	164787	CAGGAAGGCCATTTGACTATTTGTTGAGTAGCTCCAAGGAAGCAGTGTGA	164836

BX664727.7	951	GCAAAACCAAAACAGGTGACACGCAATATTGAAATTGTGATTATCGCTAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	164837	GCAAAACCAAAACAGGTGACACGCAATATTGAAATTGTGATTATCGCTAT	164886

BX664727.7	1001	GAAACTATTGATGTATGGTGATCTCTGAAATGGGAACAGAGCTGAGTAAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	164887	GAAACTATTGATGTATGGTGATCTCTGAAATGGGAACAGAGCTGAGTAAT	164936

BX664727.7	1051	AAGGGGATGTTACATGTTGTTAGTACATGTCTTGGAAATGAGAAAATGTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	164937	AAGGGGATGTTACATGTTGTTAGTACATGTCTTGGAAATGAGAAAATGTC	164986

BX664727.7	1101	AACTTGTATTTCCTTCATGGAACTGAAAAACAATCAAAGCAGGGTTTTGT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	164987	AACTTGTATTTCCTTCATGGAACTGAAAAACAATCAAAGCAGGGTTTTGT	165036

BX664727.7	1151	CTTGTCTGTTAGTTGGAGAGGACCATGGAGATCCAGCAGCCAAGCACAGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	165037	CTTGTCTGTTAGTTGGAGAGGACCATGGAGATCCAGCAGCCAAGCACAGA	165086

BX664727.7	1201	TCTGCTGGCTCAGAGTTTGAGGAGGTAGAGAAGGAGTGGTAGTTGTCCAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	165087	TCTGCTGGCTCAGAGTTTGAGGAGGTAGAGAAGGAGTGGTAGTTGTCCAA	165136

BX664727.7	1251	GCCAGGTTTTGACACCTATTAGTTTTCTGCCCTTGGTGTGATTGATGAGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	165137	GCCAGGTTTTGACACCTATTAGTTTTCTGCCCTTGGTGTGATTGATGAGC	165186

BX664727.7	1301	TCAGTGATGAGCTCACTAAATTTATATATATAGAAATTTAGTAATAAGTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	165187	TCAGTGATGAGCTCACTAAATTTATATATATAGAAATTTAGTAATAAGTT	165236

BX664727.7	1351	ATGAATTAGGTAAAATGCCCTGAATTACAAGCCACAATGAATACAAGTAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	165237	ATGAATTAGGTAAAATGCCCTGAATTACAAGCCACAATGAATACAAGTAA	165286

BX664727.7	1401	TAACCAAAATTAGCACTTAATAACATTTTCTGAAAACTGCAACATTTGAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	165287	TAACCAAAATTAGCACTTAATAACATTTTCTGAAAACTGCAACATTTGAG	165336

BX664727.7	1451	TATTAGAACTTACAGAAAAACACACACCGAGCATTATTTGGGATTCCAAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	165337	TATTAGAACTTACAGAAAAACACACACCGAGCATTATTTGGGATTCCAAA	165386

BX664727.7	1501	ATGGTTTCAGCAATAAAGTTCAAGAATAAATTATTCCATTGCTTTACTAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	165387	ATGGTTTCAGCAATAAAGTTCAAGAATAAATTATTCCATTGCTTTACTAT	165436

BX664727.7	1551	TTCTCTGAACATATAAACATGTAATCTCATTACATCTTCCAAACAACCTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	165437	TTCTCTGAACATATAAACATGTAATCTCATTACATCTTCCAAACAACCTA	165486

BX664727.7	1601	GTGAAGTAAGGTAGCAGAATCCTTGTTTTTTAGAAGAAACCATGGAGCCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	165487	GTGAAGTAAGGTAGCAGAATCCTTGTTTTTTAGAAGAAACCATGGAGCCT	165536

BX664727.7	1651	AAGAGAAGCAACTTGTCTGAAGACAAAATACCTACAGAGCGAGGTATTTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	165537	AAGAGAAGCAACTTGTCTGAAGACAAAATACCTACAGAGCGAGGTATTTT	165586

BX664727.7	1701	GGTTACAGAGCAAGGACTTACTCTGAGTGCAGGACACTTTGCATGATATC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	165587	GGTTACAGAGCAAGGACTTACTCTGAGTGCAGGACACTTTGCATGATATC	165636

BX664727.7	1751	CAGCTAACTAGAGTTCATTTACTGAGCTGTGCTTCCTCCATTTATGAGTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	165637	CAGCTAACTAGAGTTCATTTACTGAGCTGTGCTTCCTCCATTTATGAGTA	165686

BX664727.7	1801	CTTCACTTTCTTTTCTTCTTTAATTATAAGCTTAATAAGCTTGTAAGGTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	165687	CTTCACTTTCTTTTCTTCTTTAATTATAAGCTTAATAAGCTTGTAAGGTT	165736

BX664727.7	1851	TACAAATTTGAAGTGTATGGGACATTAAAATTCTGATATTAGGTCTGATA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	165737	TACAAATTTGAAGTGTATGGGACATTAAAATTCTGATATTAGGTCTGATA	165786

BX664727.7	1901	TTGCTTGAAAGTGTTTTGGAATTTAATATGTTTGGTGAATATTTTTTATT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	165787	TTGCTTGAAAGTGTTTTGGAATTTAATATGTTTGGTGAATATTTTTTATT	165836

BX664727.7	1951	TCATTATAAAAATGGCAATTTTATTTATTACTTTTGTATACATAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773545.13	165837	TCATTATAAAAATGGCAATTTTATTTATTACTTTTGTATACATAGAATTC	165886

Overview

Query
BX664727.7 - 105929 bps
Hit
AL773545.13 - 165886 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link