<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL805909.5	1	ACAAGGAAGAATGCTAGCAATGAGTCCCTTAAGCCCAGAATTACATACTG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	101781	ACAAGGAAGAATGCTAGCAATGAGTCCCTTAAGCCCAGAATTACATACTG	101830

AL805909.5	51	CATTAGGCTCTGTTATGACGTGAACAAACAAAGGATACCACCTGACCCTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	101831	CATTAGGCTCTGTTATGACGTGAACAAACAAAGGATACCACCTGACCCTC	101880

AL805909.5	101	TCCAACTCCAGCACCTGACATGGTAAGCATCCAGATGATGCTTGGTGTAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	101881	TCCAACTCCAGCACCTGACATGGTAAGCATCCAGATGATGCTTGGTGTAC	101930

AL805909.5	151	AGAGGACTCCAGCAGGGGAAACCGCTGTTCTTGGACCGCTGTTGCTACAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	101931	AGAGGACTCCAGCAGGGGAAACCGCTGTTCTTGGACCGCTGTTGCTACAC	101980

AL805909.5	201	AGCCACAAACTGATACAATCTGGTTTGATACAGGTGGGCATCAGAGGAGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	101981	AGCCACAAACTGATACAATCTGGTTTGATACAGGTGGGCATCAGAGGAGC	102030

AL805909.5	251	CACTGGGATGAGTTGCAAGCAGCCTGGTTAATAGTCACATATGAGCCTGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	102031	CACTGGGATGAGTTGCAAGCAGCCTGGTTAATAGTCACATATGAGCCTGG	102080

AL805909.5	301	CCCCTGGTTCTTTGCACTGATAGCTGAGCTGTATTCAAAGGCCTAATTAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	102081	CCCCTGGTTCTTTGCACTGATAGCTGAGCTGTATTCAAAGGCCTAATTAT	102130

AL805909.5	351	GTGGCTGGCTCAACAGGAACTAGAAAAGTGGATGATTATGCACAAACCTA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	102131	GTGGCTGGCTCAACAGGAACTAGAAAAGTGGATGATTATGCACAAACCTA	102180

AL805909.5	401	TATGGGGCATGAACATGTGGCAAGACATACGGAAAAAGCCGCAAAGCCTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	102181	TATGGGGCATGAACATGTGGCAAGACATACGGAAAAAGCCGCAAAGCCTT	102230

AL805909.5	451	GTGGCTGATTTAACTGTATTTCAGGTGACTGCACATAAAAACCACTCAGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	102231	GTGGCTGATTTAACTGTATTTCAGGTGACTGCACATAAAAACCACTCAGT	102280

AL805909.5	501	TCCACAAAACATGGAAGCTAAAACCCTAAAAAAAATTAGAAGCATCATGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	102281	TCCACAAAACATGGAAGCTAAAACCCTAAAAAAAATTAGAAGCATCATGC	102330

AL805909.5	551	CAGCTCAGGCCTCTGAACTATTGACCTGGGTACATAACAAAAGTGGTCAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	102331	CAGCTCAGGCCTCTGAACTATTGACCTGGGTACATAACAAAAGTGGTCAC	102380

AL805909.5	601	AGAAGTGCAAGAGTAGGCTGGGAGACAGTCAAGGAAGCAGGATTACTCTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	102381	AGAAGTGCAAGAGTAGGCTGGGAGACAGTCAAGGAAGCAGGATTACTCTT	102430

AL805909.5	651	AAAATGTAGTGACCAGGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	102431	AAAATGTAGTGACCAGGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGC	102480

AL805909.5	701	ACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAAATCACCTGAGGTTGGGAGTTCGAGAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	102481	ACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAAATCACCTGAGGTTGGGAGTTCGAGAC	102530

AL805909.5	751	CAGCTTGACCAACATGGAGAAACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	102531	CAGCTTGACCAACATGGAGAAACCTGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAG	102580

AL805909.5	801	CTGGGCGTGGTGGCATGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	102581	CTGGGCGTGGTGGCATGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGG	102630

AL805909.5	851	CAGGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	102631	CAGGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATC	102680

AL805909.5	901	ACGCCATTGCACTCCAGCCAGGGCAATAAGAGCAAAACTCCGTCTCAAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	102681	ACGCCATTGCACTCCAGCCAGGGCAATAAGAGCAAAACTCCGTCTCAAAA	102730

AL805909.5	951	AAAAAAAAAAAAATATATATATATATATATATATAGTGACCTAGTCCTGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	102731	AAAAAAAAAAAAATATATATATATATATATATATAGTGACCTAGTCCTGG	102780

AL805909.5	1001	TACAGTGGCTCACACATGGGGAGGCCATGGTGGGACGATTGCTTGGGGCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	102781	TACAGTGGCTCACACATGGGGAGGCCATGGTGGGACGATTGCTTGGGGCC	102830

AL805909.5	1051	AGGAGTTTGAGTCCAGCCTGGGCAACATATCGAGATCCCATCTCCACAAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	102831	AGGAGTTTGAGTCCAGCCTGGGCAACATATCGAGATCCCATCTCCACAAC	102880

AL805909.5	1101	AACAACAAAAAATATATAGTGCCTTCCCAACAGCTCTTACAAATTGTTTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	102881	AACAACAAAAAATATATAGTGCCTTCCCAACAGCTCTTACAAATTGTTTA	102930

AL805909.5	1151	CCATGTTCTCTATTGTAGATCATATTGAGCAGGACACATTCAGATATTCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	102931	CCATGTTCTCTATTGTAGATCATATTGAGCAGGACACATTCAGATATTCA	102980

AL805909.5	1201	GAAGGCTGTCCACCATGTAACAGATTGGCAAGTGGATTATTTAGATACTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	102981	GAAGGCTGTCCACCATGTAACAGATTGGCAAGTGGATTATTTAGATACTG	103030

AL805909.5	1251	TCCCTGTAAGCCAAGGAAATAAATACATGTTAACCTGCATGGACACCGCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	103031	TCCCTGTAAGCCAAGGAAATAAATACATGTTAACCTGCATGGACACCGCT	103080

AL805909.5	1301	ACTGGACTGCTGCAAGATTCTCCCTATAAGCAAGCTAATCAAGCCAGTAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	103081	ACTGGACTGCTGCAAGATTCTCCCTATAAGCAAGCTAATCAAGCCAGTAC	103130

AL805909.5	1351	TATTAAAGGCTTAGAGGCTCTCAGTGCTATGTATGGATATATCTGGCACA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	103131	TATTAAAGGCTTAGAGGCTCTCAGTGCTATGTATGGATATATCTGGCACA	103180

AL805909.5	1401	TTGACAGTGACCGAGGGACCCATTTCGCTGGATATGACGTGCAGGACTGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	103181	TTGACAGTGACCGAGGGACCCATTTCGCTGGATATGACGTGCAGGACTGG	103230

AL805909.5	1451	GCCAGGAAACGTGATACACTATGGCACTTTTATCTCCCATAGAACCTCCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	103231	GCCAGGAAACGTGATACACTATGGCACTTTTATCTCCCATAGAACCTCCA	103280

AL805909.5	1501	AGCAGCAGGGTTAATTGAAAGAAATACCAGTCTGTTGAAAGCACAAATTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	103281	AGCAGCAGGGTTAATTGAAAGAAATACCAGTCTGTTGAAAGCACAAATTC	103330

AL805909.5	1551	AAACTCTAATTTGGGAAACCTACCTTGCATAGGCAGATGAATGTGTTATC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	103331	AAACTCTAATTTGGGAAACCTACCTTGCATAGGCAGATGAATGTGTTATC	103380

AL805909.5	1601	TCCAACCTTCATTTCTTTAAATTCAGCCAAAGCAGGGACGCCTGCCCCAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	103381	TCCAACCTTCATTTCTTTAAATTCAGCCAAAGCAGGGACGCCTGCCCCAT	103430

AL805909.5	1651	GTGACCGTCTAGGACAACGGTCCCCCAAGCCTACCACTGTTCCCATAGGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	103431	GTGACCGTCTAGGACAACGGTCCCCCAAGCCTACCACTGTTCCCATAGGG	103480

AL805909.5	1701	GTAATTGAGACGACTGCTTTGCTTGCTCCCAGACCTCATTGACAACCAGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	103481	GTAATTGAGACGACTGCTTTGCTTGCTCCCAGACCTCATTGACAACCAGT	103530

AL805909.5	1751	GTCTTTTGCACATGAAGATGCCAGCAGATATACTACCGAGGAGGAAACAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	103531	GTCTTTTGCACATGAAGATGCCAGCAGATATACTACCGAGGAGGAAACAC	103580

AL805909.5	1801	ACCGAGCTTGGAACGACAAATAGCCCCAGGCTGGATAGGCTATTTCCTGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	103581	ACCGAGCTTGGAACGACAAATAGCCCCAGGCTGGATAGGCTATTTCCTGC	103630

AL805909.5	1851	TAGAGAGTGACAACACCCTAAATAAAGAACAAAACAACCTGATACCCAAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	103631	TAGAGAGTGACAACACCCTAAATAAAGAACAAAACAACCTGATACCCAAA	103680

AL805909.5	1901	AACAGGCTGGGTTTATTTGGTTAATTCCGTCTTTTGGCCATGTTAGTCAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	103681	AACAGGCTGGGTTTATTTGGTTAATTCCGTCTTTTGGCCATGTTAGTCAA	103730

AL805909.5	1951	CTTGCTCCTCAGTCTTGGGAACAAATGAATCATTCTAAAGATACTTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773541.6	103731	CTTGCTCCTCAGTCTTGGGAACAAATGAATCATTCTAAAGATACTTGGCC	103780

Overview

Query
AL805909.5 - 85801 bps
Hit
AL773541.6 - 103780 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link